RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513325.5

HERC3-211, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 5

Gene HERC3, Length 582 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-211ENST00000513325 PTGISQ16647 500 aa19.68■□□□□ 0.74
HERC3-211ENST00000513325 RUFY2Q8WXA3 655 aa19.68■□□□□ 0.74
HERC3-211ENST00000513325 KAT2BQ92831 832 aa19.68■□□□□ 0.74
HERC3-211ENST00000513325 PRDM6Q9NQX0 595 aa19.68■□□□□ 0.74
HERC3-211ENST00000513325 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa19.68■□□□□ 0.74
HERC3-211ENST00000513325 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa19.68■□□□□ 0.74
HERC3-211ENST00000513325 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP19.68■□□□□ 0.74
HERC3-211ENST00000513325 SCN5AQ14524 2016 aa19.68■□□□□ 0.74
HERC3-211ENST00000513325 ACTN1P12814 892 aa19.67■□□□□ 0.74
HERC3-211ENST00000513325 IGFBP4P22692 258 aa19.67■□□□□ 0.74
HERC3-211ENST00000513325 CHMLP26374 656 aa19.67■□□□□ 0.74
HERC3-211ENST00000513325 GHRHRQ02643 423 aa19.67■□□□□ 0.74
HERC3-211ENST00000513325 PPP2R2DQ66LE6 453 aa19.67■□□□□ 0.74
HERC3-211ENST00000513325 HOMER1Q86YM7 354 aa19.67■□□□□ 0.74
HERC3-211ENST00000513325 SENP2Q9HC62 589 aa19.67■□□□□ 0.74
HERC3-211ENST00000513325 MRVI1Q9Y6F6 885 aa19.67■□□□□ 0.74
HERC3-211ENST00000513325 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP19.66■□□□□ 0.74
HERC3-211ENST00000513325 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP19.66■□□□□ 0.74
HERC3-211ENST00000513325 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP19.66■□□□□ 0.74
HERC3-211ENST00000513325 GRM4Q14833 912 aa19.66■□□□□ 0.74
HERC3-211ENST00000513325 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP19.66■□□□□ 0.74
HERC3-211ENST00000513325 DGKDQ16760 1214 aa19.66■□□□□ 0.74
HERC3-211ENST00000513325 SLC35G1Q2M3R5 365 aa19.66■□□□□ 0.74
HERC3-211ENST00000513325 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP19.66■□□□□ 0.74
HERC3-211ENST00000513325 SESTD1Q86VW0 696 aa19.66■□□□□ 0.74
HERC3-211ENST00000513325 CTAGE1Q96RT6 745 aa19.66■□□□□ 0.74
HERC3-211ENST00000513325 PIGSQ96S52 555 aa19.66■□□□□ 0.74
HERC3-211ENST00000513325 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP19.66■□□□□ 0.74
HERC3-211ENST00000513325 TAF6LQ9Y6J9 622 aa19.66■□□□□ 0.74
HERC3-211ENST00000513325 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa19.66■□□□□ 0.74
HERC3-211ENST00000513325 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP19.65■□□□□ 0.74
HERC3-211ENST00000513325 LAMC2Q13753 1193 aa19.65■□□□□ 0.74
HERC3-211ENST00000513325 STOX1Q6ZVD7 989 aa19.65■□□□□ 0.74
HERC3-211ENST00000513325 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP19.65■□□□□ 0.74
HERC3-211ENST00000513325 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP19.65■□□□□ 0.74
HERC3-211ENST00000513325 PDCD2LQ9BRP1 358 aa19.65■□□□□ 0.74
HERC3-211ENST00000513325 RIOX1Q9H6W3 641 aa19.65■□□□□ 0.74
HERC3-211ENST00000513325 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP19.65■□□□□ 0.74
HERC3-211ENST00000513325 ERICH2A1L162 156 aa19.64■□□□□ 0.73
HERC3-211ENST00000513325 E7EWF7 191 aa19.64■□□□□ 0.73
HERC3-211ENST00000513325 RGS20O76081 388 aa19.64■□□□□ 0.73
HERC3-211ENST00000513325 TMEM67Q5HYA8 995 aa19.64■□□□□ 0.73
HERC3-211ENST00000513325 TJAP1Q5JTD0 557 aa19.64■□□□□ 0.73
HERC3-211ENST00000513325 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP19.64■□□□□ 0.73
HERC3-211ENST00000513325 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP19.64■□□□□ 0.73
HERC3-211ENST00000513325 NCOA7Q8NI08 942 aa19.64■□□□□ 0.73
HERC3-211ENST00000513325 CAGE1Q8TC20 777 aa19.64■□□□□ 0.73
HERC3-211ENST00000513325 SLC9A7Q96T83 725 aa19.64■□□□□ 0.73
HERC3-211ENST00000513325 HDAC6Q9UBN7 1215 aa19.64■□□□□ 0.73
HERC3-211ENST00000513325 MYO9BQ13459 2157 aa19.64■□□□□ 0.73
HERC3-211ENST00000513325 CHD9Q3L8U1 2897 aa19.63■□□□□ 0.73
HERC3-211ENST00000513325 CYTH3O43739 400 aa19.63■□□□□ 0.73
HERC3-211ENST00000513325 CA3P07451 260 aa19.63■□□□□ 0.73
HERC3-211ENST00000513325 ZNF286BP0CG31 522 aa19.63■□□□□ 0.73
HERC3-211ENST00000513325 PSEN2P49810 448 aa19.63■□□□□ 0.73
HERC3-211ENST00000513325 TROAPQ12815 778 aa19.63■□□□□ 0.73
HERC3-211ENST00000513325 WTAPQ15007 396 aa19.63■□□□□ 0.73
HERC3-211ENST00000513325 PGM5Q15124 567 aa19.63■□□□□ 0.73
HERC3-211ENST00000513325 VSIG10LQ86VR7 867 aa19.63■□□□□ 0.73
HERC3-211ENST00000513325 SAMD3Q8N6K7 520 aa19.63■□□□□ 0.73
HERC3-211ENST00000513325 CCDC155Q8N6L0 562 aa19.63■□□□□ 0.73
HERC3-211ENST00000513325 C7orf31Q8N865 590 aa19.63■□□□□ 0.73
HERC3-211ENST00000513325 IL31RAQ8NI17 732 aa19.63■□□□□ 0.73
HERC3-211ENST00000513325 PPTC7Q8NI37 304 aa19.63■□□□□ 0.73
HERC3-211ENST00000513325 AFAP1L1Q8TED9 768 aa19.63■□□□□ 0.73
HERC3-211ENST00000513325 ALG1Q9BT22 464 aa19.63■□□□□ 0.73
HERC3-211ENST00000513325 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa19.63■□□□□ 0.73
HERC3-211ENST00000513325 VCANP13611 3396 aa19.63■□□□□ 0.73
HERC3-211ENST00000513325 TANC1Q9C0D5 1861 aa19.62■□□□□ 0.73
HERC3-211ENST00000513325 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP19.62■□□□□ 0.73
HERC3-211ENST00000513325 SGSM2O43147 1006 aa19.62■□□□□ 0.73
HERC3-211ENST00000513325 SORBS3O60504 671 aa19.62■□□□□ 0.73
HERC3-211ENST00000513325 POLR2MP0CAP2 368 aa19.62■□□□□ 0.73
HERC3-211ENST00000513325 TRAF1Q13077 416 aa19.62■□□□□ 0.73
HERC3-211ENST00000513325 MFSD10Q14728 455 aa19.62■□□□□ 0.73
HERC3-211ENST00000513325 GPNMBQ14956 572 aa19.62■□□□□ 0.73
HERC3-211ENST00000513325 KIAA0753Q2KHM9 967 aa19.62■□□□□ 0.73
HERC3-211ENST00000513325 MYSM1Q5VVJ2 828 aa19.62■□□□□ 0.73
HERC3-211ENST00000513325 FCHSD1Q86WN1 690 aa19.62■□□□□ 0.73
HERC3-211ENST00000513325 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa19.62■□□□□ 0.73
HERC3-211ENST00000513325 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP19.62■□□□□ 0.73
HERC3-211ENST00000513325 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP19.62■□□□□ 0.73
HERC3-211ENST00000513325 KATNAL1Q9BW62 490 aa19.62■□□□□ 0.73
HERC3-211ENST00000513325 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa19.61■□□□□ 0.73
HERC3-211ENST00000513325 HAS3O00219 553 aa19.61■□□□□ 0.73
HERC3-211ENST00000513325 F2P00734 622 aa19.61■□□□□ 0.73
HERC3-211ENST00000513325 SELPP16109 830 aa19.61■□□□□ 0.73
HERC3-211ENST00000513325 SP2Q02086 613 aa19.61■□□□□ 0.73
HERC3-211ENST00000513325 SART3Q15020 963 aaKnown RBP19.61■□□□□ 0.73
HERC3-211ENST00000513325 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP19.61■□□□□ 0.73
HERC3-211ENST00000513325 KCNV1Q6PIU1 500 aa19.61■□□□□ 0.73
HERC3-211ENST00000513325 LRRC8DQ7L1W4 858 aa19.61■□□□□ 0.73
HERC3-211ENST00000513325 HERC6Q8IVU3 1022 aa19.61■□□□□ 0.73
HERC3-211ENST00000513325 SPATA33Q96N06 139 aa19.61■□□□□ 0.73
HERC3-211ENST00000513325 THEGQ9P2T0 379 aa19.61■□□□□ 0.73
HERC3-211ENST00000513325 RFXAPO00287 272 aa19.6■□□□□ 0.73
HERC3-211ENST00000513325 PPFIA4O75335 1185 aa19.6■□□□□ 0.73
HERC3-211ENST00000513325 BAIAP3O94812 1187 aa19.6■□□□□ 0.73
HERC3-211ENST00000513325 GGPS1O95749 300 aa19.6■□□□□ 0.73
HERC3-211ENST00000513325 CKBP12277 381 aa19.6■□□□□ 0.73
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