RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000509355.5

PDE4D-217, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PDE4D, Length 847 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-217ENST00000509355 RTEL1Q9NZ71 1219 aa7.51□□□□□ -1.21
PDE4D-217ENST00000509355 KIF21BO75037 1637 aa7.51□□□□□ -1.21
PDE4D-217ENST00000509355 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa7.51□□□□□ -1.21
PDE4D-217ENST00000509355 CD109Q6YHK3 1445 aa7.51□□□□□ -1.21
PDE4D-217ENST00000509355 UACAQ9BZF9 1416 aa7.51□□□□□ -1.21
PDE4D-217ENST00000509355 FGRP09769 529 aa7.5□□□□□ -1.21
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PDE4D-217ENST00000509355 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa7.5□□□□□ -1.21
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PDE4D-217ENST00000509355 ETFBP38117 255 aa7.49□□□□□ -1.21
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PDE4D-217ENST00000509355 SLC9A5Q14940 896 aa7.48□□□□□ -1.21
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PDE4D-217ENST00000509355 WWC2Q6AWC2 1192 aa7.48□□□□□ -1.21
PDE4D-217ENST00000509355 MRM1Q6IN84 353 aaKnown RBP7.48□□□□□ -1.21
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PDE4D-217ENST00000509355 VPS37DQ86XT2 251 aa7.48□□□□□ -1.21
PDE4D-217ENST00000509355 SYT8Q8NBV8 401 aa7.48□□□□□ -1.21
PDE4D-217ENST00000509355 KREMEN2Q8NCW0 462 aa7.48□□□□□ -1.21
PDE4D-217ENST00000509355 PEX11GQ96HA9 241 aa7.48□□□□□ -1.21
PDE4D-217ENST00000509355 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa7.48□□□□□ -1.21
PDE4D-217ENST00000509355 BCAS3Q9H6U6 928 aa7.48□□□□□ -1.21
PDE4D-217ENST00000509355 ACTR10Q9NZ32 417 aa7.48□□□□□ -1.21
PDE4D-217ENST00000509355 SH3D21A4FU49 640 aa7.47□□□□□ -1.21
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PDE4D-217ENST00000509355 ZBTB7AO95365 584 aa7.47□□□□□ -1.21
PDE4D-217ENST00000509355 RBM10P98175 930 aaKnown RBP7.47□□□□□ -1.21
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PDE4D-217ENST00000509355 SP8Q8IXZ3 490 aa7.47□□□□□ -1.21
PDE4D-217ENST00000509355 Q8N1Y9 231 aa7.47□□□□□ -1.21
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PDE4D-217ENST00000509355 CXorf38Q8TB03 319 aa7.46□□□□□ -1.22
PDE4D-217ENST00000509355 ZNF428Q96B54 188 aa7.46□□□□□ -1.22
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PDE4D-217ENST00000509355 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa7.46□□□□□ -1.22
PDE4D-217ENST00000509355 ADAMTSL3P82987 1691 aa7.45□□□□□ -1.22
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PDE4D-217ENST00000509355 ZNF408Q9H9D4 720 aa7.45□□□□□ -1.22
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PDE4D-217ENST00000509355 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP7.44□□□□□ -1.22
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PDE4D-217ENST00000509355 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP7.44□□□□□ -1.22
PDE4D-217ENST00000509355 C1orf159Q96HA4 380 aa7.44□□□□□ -1.22
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PDE4D-217ENST00000509355 GMLQ99445 158 aa7.44□□□□□ -1.22
PDE4D-217ENST00000509355 SGSM2O43147 1006 aa7.43□□□□□ -1.22
PDE4D-217ENST00000509355 SF1Q15637 639 aaKnown RBP7.43□□□□□ -1.22
PDE4D-217ENST00000509355 FXNQ16595 210 aa7.43□□□□□ -1.22
PDE4D-217ENST00000509355 ACBD5Q5T8D3 534 aaPredicted RBP7.43□□□□□ -1.22
PDE4D-217ENST00000509355 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP7.43□□□□□ -1.22
PDE4D-217ENST00000509355 DENND5AQ6IQ26 1287 aa7.43□□□□□ -1.22
PDE4D-217ENST00000509355 FRMD5Q7Z6J6 570 aa7.43□□□□□ -1.22
PDE4D-217ENST00000509355 RIOX2Q8IUF8 465 aa7.43□□□□□ -1.22
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