RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000499038.2

UBE2B-202, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 B, humanhuman

TSL 3

Gene UBE2B, Length 682 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2B-202ENST00000499038 PCDH18Q9HCL0 1135 aa6.75□□□□□ -1.33
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UBE2B-202ENST00000499038 COA3Q9Y2R0 106 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
UBE2B-202ENST00000499038 AGRPO00253 132 aa6.74□□□□□ -1.33
UBE2B-202ENST00000499038 CPP00450 1065 aa6.74□□□□□ -1.33
UBE2B-202ENST00000499038 C8BP07358 591 aa6.74□□□□□ -1.33
UBE2B-202ENST00000499038 DNAJA1P31689 397 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
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UBE2B-202ENST00000499038 SLC6A11P48066 632 aa6.74□□□□□ -1.33
UBE2B-202ENST00000499038 GJA9P57773 515 aa6.74□□□□□ -1.33
UBE2B-202ENST00000499038 CYP4F3Q08477 520 aa6.74□□□□□ -1.33
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UBE2B-202ENST00000499038 CD300LDQ6UXZ3 194 aa6.74□□□□□ -1.33
UBE2B-202ENST00000499038 EEPD1Q7L9B9 569 aa6.74□□□□□ -1.33
UBE2B-202ENST00000499038 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa6.74□□□□□ -1.33
UBE2B-202ENST00000499038 TMEM169Q96HH4 297 aa6.74□□□□□ -1.33
UBE2B-202ENST00000499038 CHAMP1Q96JM3 812 aa6.74□□□□□ -1.33
UBE2B-202ENST00000499038 YIPF4Q9BSR8 244 aa6.74□□□□□ -1.33
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UBE2B-202ENST00000499038 FGRP09769 529 aa6.73□□□□□ -1.33
UBE2B-202ENST00000499038 SARSP49591 514 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
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UBE2B-202ENST00000499038 PRSS53Q2L4Q9 553 aa6.73□□□□□ -1.33
UBE2B-202ENST00000499038 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
UBE2B-202ENST00000499038 UBXN11Q5T124 520 aa6.73□□□□□ -1.33
UBE2B-202ENST00000499038 ACBD5Q5T8D3 534 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
UBE2B-202ENST00000499038 LCE5AQ5TCM9 118 aa6.73□□□□□ -1.33
UBE2B-202ENST00000499038 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa6.73□□□□□ -1.33
UBE2B-202ENST00000499038 MILR1Q7Z6M3 343 aa6.73□□□□□ -1.33
UBE2B-202ENST00000499038 RIOX2Q8IUF8 465 aa6.73□□□□□ -1.33
UBE2B-202ENST00000499038 CCDC103Q8IW40 242 aa6.73□□□□□ -1.33
UBE2B-202ENST00000499038 TINF2Q9BSI4 451 aa6.73□□□□□ -1.33
UBE2B-202ENST00000499038 PALD1Q9ULE6 856 aa6.73□□□□□ -1.33
UBE2B-202ENST00000499038 GJB6O95452 261 aa6.72□□□□□ -1.33
UBE2B-202ENST00000499038 LTBRP36941 435 aa6.72□□□□□ -1.33
UBE2B-202ENST00000499038 PLP2Q04941 152 aa6.72□□□□□ -1.33
UBE2B-202ENST00000499038 RTP5Q14D33 572 aa6.72□□□□□ -1.33
UBE2B-202ENST00000499038 SF1Q15637 639 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
UBE2B-202ENST00000499038 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
UBE2B-202ENST00000499038 NLRP10Q86W26 655 aa6.72□□□□□ -1.33
UBE2B-202ENST00000499038 MIB1Q86YT6 1006 aa6.72□□□□□ -1.33
UBE2B-202ENST00000499038 GORASP1Q9BQQ3 440 aa6.72□□□□□ -1.33
UBE2B-202ENST00000499038 GFRA1P56159 465 aa6.71□□□□□ -1.34
UBE2B-202ENST00000499038 CHRNA2Q15822 529 aa6.71□□□□□ -1.34
UBE2B-202ENST00000499038 MCF2L2Q86YR7 1114 aa6.71□□□□□ -1.34
UBE2B-202ENST00000499038 TMEM145Q8NBT3 493 aa6.71□□□□□ -1.34
UBE2B-202ENST00000499038 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
UBE2B-202ENST00000499038 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
UBE2B-202ENST00000499038 EPN3Q9H201 632 aa6.71□□□□□ -1.34
UBE2B-202ENST00000499038 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
UBE2B-202ENST00000499038 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa6.71□□□□□ -1.34
UBE2B-202ENST00000499038 X6R8D5 127 aa6.71□□□□□ -1.34
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UBE2B-202ENST00000499038 SLC10A6Q3KNW5 377 aa6.7□□□□□ -1.34
UBE2B-202ENST00000499038 FERMT3Q86UX7 667 aa6.7□□□□□ -1.34
UBE2B-202ENST00000499038 FAM126BQ8IXS8 530 aa6.7□□□□□ -1.34
UBE2B-202ENST00000499038 Q8N1Y9 231 aa6.7□□□□□ -1.34
UBE2B-202ENST00000499038 FAM26EQ8N5C1 309 aa6.7□□□□□ -1.34
UBE2B-202ENST00000499038 LINC00482Q8N8I6 264 aa6.7□□□□□ -1.34
UBE2B-202ENST00000499038 KREMEN2Q8NCW0 462 aa6.7□□□□□ -1.34
UBE2B-202ENST00000499038 RCBTB1Q8NDN9 531 aa6.7□□□□□ -1.34
UBE2B-202ENST00000499038 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
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UBE2B-202ENST00000499038 H7BY64 318 aa6.69□□□□□ -1.34
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UBE2B-202ENST00000499038 THBS2P35442 1172 aa6.69□□□□□ -1.34
UBE2B-202ENST00000499038 STAT5AP42229 794 aa6.69□□□□□ -1.34
UBE2B-202ENST00000499038 LSAMPQ13449 338 aa6.69□□□□□ -1.34
UBE2B-202ENST00000499038 TESK1Q15569 626 aa6.69□□□□□ -1.34
UBE2B-202ENST00000499038 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa6.69□□□□□ -1.34
UBE2B-202ENST00000499038 STK32CQ86UX6 486 aa6.69□□□□□ -1.34
UBE2B-202ENST00000499038 ZNF761Q86XN6 746 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
UBE2B-202ENST00000499038 TTLL6Q8N841 843 aa6.69□□□□□ -1.34
UBE2B-202ENST00000499038 KYQ8NBH2 561 aa6.69□□□□□ -1.34
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UBE2B-202ENST00000499038 KCTD13Q8WZ19 329 aa6.69□□□□□ -1.34
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UBE2B-202ENST00000499038 CLDND1Q9NY35 253 aa6.69□□□□□ -1.34
UBE2B-202ENST00000499038 ARNTLO00327 626 aa6.68□□□□□ -1.34
UBE2B-202ENST00000499038 NOBOXO60393 691 aa6.68□□□□□ -1.34
UBE2B-202ENST00000499038 LCP1P13796 627 aa6.68□□□□□ -1.34
UBE2B-202ENST00000499038 RPL13P26373 211 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
UBE2B-202ENST00000499038 RBM25P49756 843 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
UBE2B-202ENST00000499038 PPP2R2AP63151 447 aa6.68□□□□□ -1.34
UBE2B-202ENST00000499038 NKX3-2P78367 333 aa6.68□□□□□ -1.34
UBE2B-202ENST00000499038 ANKS3Q6ZW76 656 aa6.68□□□□□ -1.34
UBE2B-202ENST00000499038 SYT3Q9BQG1 590 aa6.68□□□□□ -1.34
UBE2B-202ENST00000499038 ZNF652Q9Y2D9 606 aa6.68□□□□□ -1.34
UBE2B-202ENST00000499038 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa6.68□□□□□ -1.34
UBE2B-202ENST00000499038 HGSO14964 777 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
UBE2B-202ENST00000499038 ITGA1P56199 1179 aa6.67□□□□□ -1.34
UBE2B-202ENST00000499038 MAP4K2Q12851 820 aa6.67□□□□□ -1.34
UBE2B-202ENST00000499038 DDR2Q16832 855 aa6.67□□□□□ -1.34
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