RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495350.5

CBX1-205, Transcript of chromobox 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CBX1, Length 550 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1-205ENST00000495350 GH1P01241 217 aa7.27□□□□□ -1.25
CBX1-205ENST00000495350 MMP3P08254 477 aa7.27□□□□□ -1.25
CBX1-205ENST00000495350 TFAP4Q01664 338 aa7.27□□□□□ -1.25
CBX1-205ENST00000495350 PTK7Q13308 1070 aa7.27□□□□□ -1.25
CBX1-205ENST00000495350 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
CBX1-205ENST00000495350 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
CBX1-205ENST00000495350 DGKDQ16760 1214 aa7.27□□□□□ -1.25
CBX1-205ENST00000495350 RCSD1Q6JBY9 416 aa7.27□□□□□ -1.25
CBX1-205ENST00000495350 RNF207Q6ZRF8 634 aa7.27□□□□□ -1.25
CBX1-205ENST00000495350 CHST3Q7LGC8 479 aa7.27□□□□□ -1.25
CBX1-205ENST00000495350 BMP8AQ7Z5Y6 402 aa7.27□□□□□ -1.25
CBX1-205ENST00000495350 FBXO11Q86XK2 927 aa7.27□□□□□ -1.25
CBX1-205ENST00000495350 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
CBX1-205ENST00000495350 TMEM192Q8IY95 271 aa7.27□□□□□ -1.25
CBX1-205ENST00000495350 DNERQ8NFT8 737 aa7.27□□□□□ -1.25
CBX1-205ENST00000495350 AFG1LQ8WV93 481 aa7.27□□□□□ -1.25
CBX1-205ENST00000495350 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
CBX1-205ENST00000495350 ANKS1AQ92625 1134 aa7.27□□□□□ -1.25
CBX1-205ENST00000495350 ATOH1Q92858 354 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
CBX1-205ENST00000495350 PPP2R3CQ969Q6 453 aa7.27□□□□□ -1.25
CBX1-205ENST00000495350 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa7.27□□□□□ -1.25
CBX1-205ENST00000495350 TECTAO75443 2155 aa7.27□□□□□ -1.25
CBX1-205ENST00000495350 MYO7AQ13402 2215 aa7.27□□□□□ -1.25
CBX1-205ENST00000495350 PTPRSQ13332 1948 aa7.27□□□□□ -1.25
CBX1-205ENST00000495350 GPAA1O43292 621 aa7.26□□□□□ -1.25
CBX1-205ENST00000495350 MBTPS2O43462 519 aa7.26□□□□□ -1.25
CBX1-205ENST00000495350 UPP2O95045 317 aa7.26□□□□□ -1.25
CBX1-205ENST00000495350 CHGBP05060 677 aa7.26□□□□□ -1.25
CBX1-205ENST00000495350 CTNNB1P35222 781 aa7.26□□□□□ -1.25
CBX1-205ENST00000495350 NDUFV1P49821 464 aa7.26□□□□□ -1.25
CBX1-205ENST00000495350 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
CBX1-205ENST00000495350 GPNMBQ14956 572 aa7.26□□□□□ -1.25
CBX1-205ENST00000495350 ZNF618Q5T7W0 954 aa7.26□□□□□ -1.25
CBX1-205ENST00000495350 IER5LQ5T953 404 aa7.26□□□□□ -1.25
CBX1-205ENST00000495350 SYDE2Q5VT97 1194 aa7.26□□□□□ -1.25
CBX1-205ENST00000495350 SLC30A10Q6XR72 485 aa7.26□□□□□ -1.25
CBX1-205ENST00000495350 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP7.26□□□□□ -1.25
CBX1-205ENST00000495350 TRIM67Q6ZTA4 783 aa7.26□□□□□ -1.25
CBX1-205ENST00000495350 FBXL6Q8N531 539 aa7.26□□□□□ -1.25
CBX1-205ENST00000495350 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
CBX1-205ENST00000495350 DCAF4Q8WV16 495 aa7.26□□□□□ -1.25
CBX1-205ENST00000495350 SEPT8Q92599 483 aa7.26□□□□□ -1.25
CBX1-205ENST00000495350 APPBP2Q92624 585 aa7.26□□□□□ -1.25
CBX1-205ENST00000495350 ALG1Q9BT22 464 aa7.26□□□□□ -1.25
CBX1-205ENST00000495350 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
CBX1-205ENST00000495350 NAPBQ9H115 298 aa7.26□□□□□ -1.25
CBX1-205ENST00000495350 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
CBX1-205ENST00000495350 FAM86C1Q9NVL1 165 aa7.26□□□□□ -1.25
CBX1-205ENST00000495350 HDAC6Q9UBN7 1215 aa7.26□□□□□ -1.25
CBX1-205ENST00000495350 CD207Q9UJ71 328 aa7.26□□□□□ -1.25
CBX1-205ENST00000495350 RWDD3Q9Y3V2 267 aa7.26□□□□□ -1.25
CBX1-205ENST00000495350 MYH7P12883 1935 aa7.26□□□□□ -1.25
CBX1-205ENST00000495350 SPTBN4Q9H254 2564 aa7.26□□□□□ -1.25
CBX1-205ENST00000495350 RIF1Q5UIP0 2472 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
CBX1-205ENST00000495350 RSPH10B2B2RC85 870 aa7.25□□□□□ -1.25
CBX1-205ENST00000495350 KDM4AO75164 1064 aa7.25□□□□□ -1.25
CBX1-205ENST00000495350 CSPG5O95196 566 aa7.25□□□□□ -1.25
CBX1-205ENST00000495350 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
CBX1-205ENST00000495350 RSPH10BP0C881 870 aa7.25□□□□□ -1.25
CBX1-205ENST00000495350 EDNRBP24530 442 aa7.25□□□□□ -1.25
CBX1-205ENST00000495350 SLC16A2P36021 539 aa7.25□□□□□ -1.25
CBX1-205ENST00000495350 THPOP40225 353 aa7.25□□□□□ -1.25
CBX1-205ENST00000495350 PSEN2P49810 448 aa7.25□□□□□ -1.25
CBX1-205ENST00000495350 RPS6P62753 249 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
CBX1-205ENST00000495350 TCF15Q12870 199 aa7.25□□□□□ -1.25
CBX1-205ENST00000495350 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
CBX1-205ENST00000495350 MFSD10Q14728 455 aa7.25□□□□□ -1.25
CBX1-205ENST00000495350 COL19A1Q14993 1142 aa7.25□□□□□ -1.25
CBX1-205ENST00000495350 KIAA0753Q2KHM9 967 aa7.25□□□□□ -1.25
CBX1-205ENST00000495350 TCTN1Q2MV58 587 aa7.25□□□□□ -1.25
CBX1-205ENST00000495350 SEPT14Q6ZU15 432 aa7.25□□□□□ -1.25
CBX1-205ENST00000495350 FIBCD1Q8N539 461 aa7.25□□□□□ -1.25
CBX1-205ENST00000495350 DBF4BQ8NFT6 615 aa7.25□□□□□ -1.25
CBX1-205ENST00000495350 GPATCH3Q96I76 525 aa7.25□□□□□ -1.25
CBX1-205ENST00000495350 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
CBX1-205ENST00000495350 LMAN2LQ9H0V9 348 aa7.25□□□□□ -1.25
CBX1-205ENST00000495350 IGFLR1Q9H665 355 aa7.25□□□□□ -1.25
CBX1-205ENST00000495350 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
CBX1-205ENST00000495350 FAM186AA6NE01 2351 aa7.25□□□□□ -1.25
CBX1-205ENST00000495350 MICAL3Q7RTP6 2002 aa7.25□□□□□ -1.25
CBX1-205ENST00000495350 C5orf42Q9H799 3197 aa7.24□□□□□ -1.25
CBX1-205ENST00000495350 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
CBX1-205ENST00000495350 ARIH2O95376 493 aa7.24□□□□□ -1.25
CBX1-205ENST00000495350 RB1P06400 928 aa7.24□□□□□ -1.25
CBX1-205ENST00000495350 ZNF286BP0CG31 522 aa7.24□□□□□ -1.25
CBX1-205ENST00000495350 RLBP1P12271 317 aa7.24□□□□□ -1.25
CBX1-205ENST00000495350 ZXDAP98168 799 aa7.24□□□□□ -1.25
CBX1-205ENST00000495350 PPARAQ07869 468 aa7.24□□□□□ -1.25
CBX1-205ENST00000495350 SIGLEC14Q08ET2 396 aa7.24□□□□□ -1.25
CBX1-205ENST00000495350 LY6KQ17RY6 165 aa7.24□□□□□ -1.25
CBX1-205ENST00000495350 ERMP1Q7Z2K6 904 aa7.24□□□□□ -1.25
CBX1-205ENST00000495350 IFNL3Q8IZI9 196 aa7.24□□□□□ -1.25
CBX1-205ENST00000495350 KBTBD3Q8NAB2 608 aa7.24□□□□□ -1.25
CBX1-205ENST00000495350 KAT2BQ92831 832 aa7.24□□□□□ -1.25
CBX1-205ENST00000495350 TOP1MTQ969P6 601 aa7.24□□□□□ -1.25
CBX1-205ENST00000495350 OSBP2Q969R2 916 aa7.24□□□□□ -1.25
CBX1-205ENST00000495350 CTAGE1Q96RT6 745 aa7.24□□□□□ -1.25
CBX1-205ENST00000495350 TOMM22Q9NS69 142 aa7.24□□□□□ -1.25
CBX1-205ENST00000495350 LCTP09848 1927 aa7.24□□□□□ -1.25
CBX1-205ENST00000495350 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26 ms