RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000494420.1

HOXB-AS3-215, HOXB cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 2

Gene HOXB-AS3, Length 431 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB-AS3-215ENST00000494420 PGM5Q15124 567 aa22.31■■□□□ 1.16
HOXB-AS3-215ENST00000494420 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
HOXB-AS3-215ENST00000494420 NEK1Q96PY6 1258 aa22.31■■□□□ 1.16
HOXB-AS3-215ENST00000494420 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP22.31■■□□□ 1.16
HOXB-AS3-215ENST00000494420 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
HOXB-AS3-215ENST00000494420 PLEKHA8P1O95397 391 aa22.3■■□□□ 1.16
HOXB-AS3-215ENST00000494420 ACRP10323 421 aa22.3■■□□□ 1.16
HOXB-AS3-215ENST00000494420 CCL23P55773 120 aa22.3■■□□□ 1.16
HOXB-AS3-215ENST00000494420 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
HOXB-AS3-215ENST00000494420 ZNF697Q5TEC3 545 aa22.3■■□□□ 1.16
HOXB-AS3-215ENST00000494420 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa22.3■■□□□ 1.16
HOXB-AS3-215ENST00000494420 C16orf59Q7L2K0 433 aa22.3■■□□□ 1.16
HOXB-AS3-215ENST00000494420 VSIG10LQ86VR7 867 aa22.3■■□□□ 1.16
HOXB-AS3-215ENST00000494420 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa22.3■■□□□ 1.16
HOXB-AS3-215ENST00000494420 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
HOXB-AS3-215ENST00000494420 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa22.3■■□□□ 1.16
HOXB-AS3-215ENST00000494420 FAM161BQ96MY7 647 aa22.3■■□□□ 1.16
HOXB-AS3-215ENST00000494420 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
HOXB-AS3-215ENST00000494420 MMP3P08254 477 aa22.29■■□□□ 1.16
HOXB-AS3-215ENST00000494420 CASTP20810 708 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
HOXB-AS3-215ENST00000494420 CCND2P30279 289 aa22.29■■□□□ 1.16
HOXB-AS3-215ENST00000494420 LAMC2Q13753 1193 aa22.29■■□□□ 1.16
HOXB-AS3-215ENST00000494420 TMEM240Q5SV17 173 aa22.29■■□□□ 1.16
HOXB-AS3-215ENST00000494420 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
HOXB-AS3-215ENST00000494420 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
HOXB-AS3-215ENST00000494420 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
HOXB-AS3-215ENST00000494420 UMODL1Q5DID0 1318 aa22.29■■□□□ 1.16
HOXB-AS3-215ENST00000494420 CYP2C9P11712 490 aa22.28■■□□□ 1.16
HOXB-AS3-215ENST00000494420 NFRKBQ6P4R8 1299 aa22.28■■□□□ 1.16
HOXB-AS3-215ENST00000494420 KCNV1Q6PIU1 500 aa22.28■■□□□ 1.16
HOXB-AS3-215ENST00000494420 ZNF365Q70YC5 407 aa22.28■■□□□ 1.16
HOXB-AS3-215ENST00000494420 CCDC82Q8N4S0 544 aa22.28■■□□□ 1.16
HOXB-AS3-215ENST00000494420 FANCBQ8NB91 859 aa22.28■■□□□ 1.16
HOXB-AS3-215ENST00000494420 IL31RAQ8NI17 732 aa22.28■■□□□ 1.16
HOXB-AS3-215ENST00000494420 CUL5Q93034 780 aa22.28■■□□□ 1.16
HOXB-AS3-215ENST00000494420 IL23AQ9NPF7 189 aa22.28■■□□□ 1.16
HOXB-AS3-215ENST00000494420 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
HOXB-AS3-215ENST00000494420 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
HOXB-AS3-215ENST00000494420 RGS20O76081 388 aa22.27■■□□□ 1.16
HOXB-AS3-215ENST00000494420 DGKDQ16760 1214 aa22.27■■□□□ 1.16
HOXB-AS3-215ENST00000494420 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
HOXB-AS3-215ENST00000494420 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
HOXB-AS3-215ENST00000494420 RASEFQ8IZ41 740 aa22.27■■□□□ 1.16
HOXB-AS3-215ENST00000494420 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa22.27■■□□□ 1.16
HOXB-AS3-215ENST00000494420 SORBS3O60504 671 aa22.26■■□□□ 1.15
HOXB-AS3-215ENST00000494420 FGBP02675 491 aa22.26■■□□□ 1.15
HOXB-AS3-215ENST00000494420 NEFLP07196 543 aa22.26■■□□□ 1.15
HOXB-AS3-215ENST00000494420 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
HOXB-AS3-215ENST00000494420 KRT32Q14532 448 aa22.26■■□□□ 1.15
HOXB-AS3-215ENST00000494420 TSGA10IPQ3SY00 556 aa22.26■■□□□ 1.15
HOXB-AS3-215ENST00000494420 SGMS1Q86VZ5 419 aa22.26■■□□□ 1.15
HOXB-AS3-215ENST00000494420 MICU3Q86XE3 530 aa22.26■■□□□ 1.15
HOXB-AS3-215ENST00000494420 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
HOXB-AS3-215ENST00000494420 TCEANC2Q96MN5 208 aa22.26■■□□□ 1.15
HOXB-AS3-215ENST00000494420 NOD1Q9Y239 953 aa22.26■■□□□ 1.15
HOXB-AS3-215ENST00000494420 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa22.26■■□□□ 1.15
HOXB-AS3-215ENST00000494420 TGFB3P10600 412 aa22.25■■□□□ 1.15
HOXB-AS3-215ENST00000494420 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
HOXB-AS3-215ENST00000494420 ADCK5Q3MIX3 580 aa22.25■■□□□ 1.15
HOXB-AS3-215ENST00000494420 USP17L6PQ6QN14 398 aa22.25■■□□□ 1.15
HOXB-AS3-215ENST00000494420 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
HOXB-AS3-215ENST00000494420 WNT8AQ9H1J5 351 aa22.25■■□□□ 1.15
HOXB-AS3-215ENST00000494420 SEMA6BQ9H3T3 888 aa22.25■■□□□ 1.15
HOXB-AS3-215ENST00000494420 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa22.24■■□□□ 1.15
HOXB-AS3-215ENST00000494420 GGPS1O95749 300 aa22.24■■□□□ 1.15
HOXB-AS3-215ENST00000494420 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
HOXB-AS3-215ENST00000494420 MYSM1Q5VVJ2 828 aa22.24■■□□□ 1.15
HOXB-AS3-215ENST00000494420 TMTC3Q6ZXV5 915 aa22.24■■□□□ 1.15
HOXB-AS3-215ENST00000494420 PPTC7Q8NI37 304 aa22.24■■□□□ 1.15
HOXB-AS3-215ENST00000494420 KAT2BQ92831 832 aa22.24■■□□□ 1.15
HOXB-AS3-215ENST00000494420 SCLYQ96I15 445 aa22.24■■□□□ 1.15
HOXB-AS3-215ENST00000494420 SPATA33Q96N06 139 aa22.24■■□□□ 1.15
HOXB-AS3-215ENST00000494420 MLXIPQ9HAP2 919 aa22.24■■□□□ 1.15
HOXB-AS3-215ENST00000494420 SP2Q02086 613 aa22.23■■□□□ 1.15
HOXB-AS3-215ENST00000494420 GNPTABQ3T906 1256 aa22.23■■□□□ 1.15
HOXB-AS3-215ENST00000494420 RETREG2Q8NC44 543 aa22.23■■□□□ 1.15
HOXB-AS3-215ENST00000494420 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP22.23■■□□□ 1.15
HOXB-AS3-215ENST00000494420 GUCD1Q96NT3 240 aa22.23■■□□□ 1.15
HOXB-AS3-215ENST00000494420 ALG1Q9BT22 464 aa22.23■■□□□ 1.15
HOXB-AS3-215ENST00000494420 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
HOXB-AS3-215ENST00000494420 PSTPIP2Q9H939 334 aa22.23■■□□□ 1.15
HOXB-AS3-215ENST00000494420 RTEL1Q9NZ71 1219 aa22.23■■□□□ 1.15
HOXB-AS3-215ENST00000494420 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa22.23■■□□□ 1.15
HOXB-AS3-215ENST00000494420 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
HOXB-AS3-215ENST00000494420 PIK3CDO00329 1044 aa22.22■■□□□ 1.15
HOXB-AS3-215ENST00000494420 MEIS2O14770 477 aa22.22■■□□□ 1.15
HOXB-AS3-215ENST00000494420 PPFIA4O75335 1185 aa22.22■■□□□ 1.15
HOXB-AS3-215ENST00000494420 STAM2O75886 525 aa22.22■■□□□ 1.15
HOXB-AS3-215ENST00000494420 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
HOXB-AS3-215ENST00000494420 PSEN2P49810 448 aa22.22■■□□□ 1.15
HOXB-AS3-215ENST00000494420 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
HOXB-AS3-215ENST00000494420 PTGISQ16647 500 aa22.22■■□□□ 1.15
HOXB-AS3-215ENST00000494420 RASIP1Q5U651 963 aa22.22■■□□□ 1.15
HOXB-AS3-215ENST00000494420 APOA5Q6Q788 366 aa22.22■■□□□ 1.15
HOXB-AS3-215ENST00000494420 OTOP2Q7RTS6 562 aa22.22■■□□□ 1.15
HOXB-AS3-215ENST00000494420 HERVK_113Q902F9 699 aa22.22■■□□□ 1.15
HOXB-AS3-215ENST00000494420 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
HOXB-AS3-215ENST00000494420 BRPF3Q9ULD4 1205 aa22.22■■□□□ 1.15
HOXB-AS3-215ENST00000494420 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa22.21■■□□□ 1.15
HOXB-AS3-215ENST00000494420 ZBTB43O43298 467 aa22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.8 ms