RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493959.6

SENP6-211, Transcript of SUMO specific peptidase 6, humanhuman

TSL 3

Gene SENP6, Length 867 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Exosome, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP6-211ENST00000493959 MYH7BA7E2Y1 1941 aa26.23■■□□□ 1.79
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SENP6-211ENST00000493959 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP26.22■■□□□ 1.79
SENP6-211ENST00000493959 PGM5Q15124 567 aa26.22■■□□□ 1.79
SENP6-211ENST00000493959 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP26.22■■□□□ 1.79
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SENP6-211ENST00000493959 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP26.21■■□□□ 1.79
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SENP6-211ENST00000493959 TMEM199Q8N511 208 aa26.2■■□□□ 1.78
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SENP6-211ENST00000493959 CPA1P15085 419 aa26.18■■□□□ 1.78
SENP6-211ENST00000493959 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP26.18■■□□□ 1.78
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SENP6-211ENST00000493959 CALM2P0DP24 149 aa26.17■■□□□ 1.78
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SENP6-211ENST00000493959 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa26.14■■□□□ 1.78
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SENP6-211ENST00000493959 SEMA6BQ9H3T3 888 aa26.14■■□□□ 1.78
SENP6-211ENST00000493959 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP26.14■■□□□ 1.77
SENP6-211ENST00000493959 GGPS1O95749 300 aa26.13■■□□□ 1.77
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SENP6-211ENST00000493959 HSDL1Q3SXM5 330 aa26.13■■□□□ 1.77
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SENP6-211ENST00000493959 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP26.13■■□□□ 1.77
SENP6-211ENST00000493959 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP26.13■■□□□ 1.77
SENP6-211ENST00000493959 SNX14Q9Y5W7 946 aa26.13■■□□□ 1.77
SENP6-211ENST00000493959 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP26.12■■□□□ 1.77
SENP6-211ENST00000493959 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP26.12■■□□□ 1.77
SENP6-211ENST00000493959 ZNF286BP0CG31 522 aa26.12■■□□□ 1.77
SENP6-211ENST00000493959 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP26.12■■□□□ 1.77
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SENP6-211ENST00000493959 ZNF697Q5TEC3 545 aa26.12■■□□□ 1.77
SENP6-211ENST00000493959 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP26.12■■□□□ 1.77
SENP6-211ENST00000493959 PPTC7Q8NI37 304 aa26.12■■□□□ 1.77
SENP6-211ENST00000493959 CTAGE1Q96RT6 745 aa26.12■■□□□ 1.77
SENP6-211ENST00000493959 PSTPIP2Q9H939 334 aa26.12■■□□□ 1.77
SENP6-211ENST00000493959 FRMPD4Q14CM0 1322 aa26.12■■□□□ 1.77
SENP6-211ENST00000493959 PIK3CDO00329 1044 aa26.11■■□□□ 1.77
SENP6-211ENST00000493959 ZBTB43O43298 467 aa26.11■■□□□ 1.77
SENP6-211ENST00000493959 FGBP02675 491 aa26.11■■□□□ 1.77
SENP6-211ENST00000493959 HSPA4P34932 840 aa26.11■■□□□ 1.77
SENP6-211ENST00000493959 FUT2Q10981 343 aa26.11■■□□□ 1.77
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