RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492539.5

NELFE-212, Transcript of negative elongation factor complex member E, humanhuman

TSL 3

Gene NELFE, Length 583 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFE-212ENST00000492539 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
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NELFE-212ENST00000492539 PTGISQ16647 500 aa23.22■■□□□ 1.31
NELFE-212ENST00000492539 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
NELFE-212ENST00000492539 FBXO11Q86XK2 927 aa23.22■■□□□ 1.31
NELFE-212ENST00000492539 CAGE1Q8TC20 777 aa23.22■■□□□ 1.31
NELFE-212ENST00000492539 RMDN3Q96TC7 470 aa23.22■■□□□ 1.31
NELFE-212ENST00000492539 NOD1Q9Y239 953 aa23.22■■□□□ 1.31
NELFE-212ENST00000492539 BAIAP3O94812 1187 aa23.21■■□□□ 1.31
NELFE-212ENST00000492539 GHRHRQ02643 423 aa23.21■■□□□ 1.31
NELFE-212ENST00000492539 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP23.21■■□□□ 1.31
NELFE-212ENST00000492539 AFAP1L1Q8TED9 768 aa23.21■■□□□ 1.31
NELFE-212ENST00000492539 KRT23Q9C075 422 aa23.21■■□□□ 1.31
NELFE-212ENST00000492539 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP23.21■■□□□ 1.31
NELFE-212ENST00000492539 RBL2Q08999 1139 aa23.2■■□□□ 1.3
NELFE-212ENST00000492539 GPNMBQ14956 572 aa23.2■■□□□ 1.3
NELFE-212ENST00000492539 HERC6Q8IVU3 1022 aa23.2■■□□□ 1.3
NELFE-212ENST00000492539 CCDC155Q8N6L0 562 aa23.2■■□□□ 1.3
NELFE-212ENST00000492539 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa23.2■■□□□ 1.3
NELFE-212ENST00000492539 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP23.2■■□□□ 1.3
NELFE-212ENST00000492539 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP23.2■■□□□ 1.3
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NELFE-212ENST00000492539 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP23.19■■□□□ 1.3
NELFE-212ENST00000492539 CASTP20810 708 aaKnown RBP23.19■■□□□ 1.3
NELFE-212ENST00000492539 HSD17B4P51659 736 aa23.19■■□□□ 1.3
NELFE-212ENST00000492539 ARHGEF16Q5VV41 709 aa23.19■■□□□ 1.3
NELFE-212ENST00000492539 CHST3Q7LGC8 479 aa23.19■■□□□ 1.3
NELFE-212ENST00000492539 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP23.19■■□□□ 1.3
NELFE-212ENST00000492539 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP23.19■■□□□ 1.3
NELFE-212ENST00000492539 CNNM2Q9H8M5 875 aa23.19■■□□□ 1.3
NELFE-212ENST00000492539 VAT1LQ9HCJ6 419 aa23.19■■□□□ 1.3
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NELFE-212ENST00000492539 MTCH2Q9Y6C9 303 aa23.19■■□□□ 1.3
NELFE-212ENST00000492539 TCF20Q9UGU0 1960 aaKnown RBP23.19■■□□□ 1.3
NELFE-212ENST00000492539 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP23.19■■□□□ 1.3
NELFE-212ENST00000492539 EPOPA6NHQ4 379 aa23.18■■□□□ 1.3
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NELFE-212ENST00000492539 NR3C2P08235 984 aa23.18■■□□□ 1.3
NELFE-212ENST00000492539 CHMP4BP1P59074 171 aa23.18■■□□□ 1.3
NELFE-212ENST00000492539 TAP1Q03518 808 aa23.18■■□□□ 1.3
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NELFE-212ENST00000492539 MICALL1Q8N3F8 863 aa23.18■■□□□ 1.3
NELFE-212ENST00000492539 STAG2Q8N3U4 1231 aa23.18■■□□□ 1.3
NELFE-212ENST00000492539 MTMR8Q96EF0 704 aa23.18■■□□□ 1.3
NELFE-212ENST00000492539 UBAC1Q9BSL1 405 aa23.18■■□□□ 1.3
NELFE-212ENST00000492539 AMNQ9BXJ7 453 aa23.18■■□□□ 1.3
NELFE-212ENST00000492539 IL25Q9H293 177 aa23.18■■□□□ 1.3
NELFE-212ENST00000492539 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa23.18■■□□□ 1.3
NELFE-212ENST00000492539 BDP1A6H8Y1 2624 aa23.18■■□□□ 1.3
NELFE-212ENST00000492539 CFBP00751 764 aa23.17■■□□□ 1.3
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NELFE-212ENST00000492539 LRRC8DQ7L1W4 858 aa23.16■■□□□ 1.3
NELFE-212ENST00000492539 PPTC7Q8NI37 304 aa23.16■■□□□ 1.3
NELFE-212ENST00000492539 KATNAL1Q9BW62 490 aa23.16■■□□□ 1.3
NELFE-212ENST00000492539 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP23.16■■□□□ 1.3
NELFE-212ENST00000492539 HDAC6Q9UBN7 1215 aa23.16■■□□□ 1.3
NELFE-212ENST00000492539 MAD2L2Q9UI95 211 aa23.16■■□□□ 1.3
NELFE-212ENST00000492539 MRVI1Q9Y6F6 885 aa23.16■■□□□ 1.3
NELFE-212ENST00000492539 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP23.15■■□□□ 1.3
NELFE-212ENST00000492539 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP23.15■■□□□ 1.3
NELFE-212ENST00000492539 RGS20O76081 388 aa23.15■■□□□ 1.3
NELFE-212ENST00000492539 CXCL10P02778 98 aa23.15■■□□□ 1.3
NELFE-212ENST00000492539 NEFLP07196 543 aa23.15■■□□□ 1.3
NELFE-212ENST00000492539 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP23.15■■□□□ 1.3
NELFE-212ENST00000492539 WDR5P61964 334 aaKnown RBP23.15■■□□□ 1.3
NELFE-212ENST00000492539 PDCD2LQ9BRP1 358 aa23.15■■□□□ 1.3
NELFE-212ENST00000492539 KLRF2D3W0D1 207 aa23.14■■□□□ 1.29
NELFE-212ENST00000492539 ZBTB5O15062 677 aa23.14■■□□□ 1.29
NELFE-212ENST00000492539 CKBP12277 381 aa23.14■■□□□ 1.29
NELFE-212ENST00000492539 BMP1P13497 986 aa23.14■■□□□ 1.29
NELFE-212ENST00000492539 KCNJ6P48051 423 aa23.14■■□□□ 1.29
NELFE-212ENST00000492539 MFSD10Q14728 455 aa23.14■■□□□ 1.29
NELFE-212ENST00000492539 CNKSR3Q6P9H4 555 aa23.14■■□□□ 1.29
NELFE-212ENST00000492539 STOX1Q6ZVD7 989 aa23.14■■□□□ 1.29
NELFE-212ENST00000492539 CYB5R4Q7L1T6 521 aa23.14■■□□□ 1.29
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NELFE-212ENST00000492539 C7orf31Q8N865 590 aa23.14■■□□□ 1.29
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NELFE-212ENST00000492539 ARNTL2Q8WYA1 636 aa23.14■■□□□ 1.29
NELFE-212ENST00000492539 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP23.13■■□□□ 1.29
NELFE-212ENST00000492539 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP23.13■■□□□ 1.29
NELFE-212ENST00000492539 TLL1O43897 1013 aa23.13■■□□□ 1.29
NELFE-212ENST00000492539 NBNO60934 754 aa23.13■■□□□ 1.29
NELFE-212ENST00000492539 TFF2Q03403 129 aa23.13■■□□□ 1.29
NELFE-212ENST00000492539 PTK7Q13308 1070 aa23.13■■□□□ 1.29
NELFE-212ENST00000492539 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP23.13■■□□□ 1.29
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