RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490914.1

SSB-211, Transcript of Sjogren syndrome antigen B, humanhuman

TSL 5

Gene SSB, Length 754 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSB-211ENST00000490914 LINC00482Q8N8I6 264 aa7.22□□□□□ -1.25
SSB-211ENST00000490914 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
SSB-211ENST00000490914 AP5M1Q9H0R1 490 aa7.22□□□□□ -1.25
SSB-211ENST00000490914 PRKAG3Q9UGI9 489 aa7.22□□□□□ -1.25
SSB-211ENST00000490914 BCL6P41182 706 aa7.21□□□□□ -1.26
SSB-211ENST00000490914 SARSP49591 514 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
SSB-211ENST00000490914 RPL11P62913 178 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
SSB-211ENST00000490914 TNNI3KQ59H18 835 aa7.21□□□□□ -1.26
SSB-211ENST00000490914 UBXN11Q5T124 520 aa7.21□□□□□ -1.26
SSB-211ENST00000490914 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
SSB-211ENST00000490914 STK32CQ86UX6 486 aa7.21□□□□□ -1.26
SSB-211ENST00000490914 ZNF761Q86XN6 746 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
SSB-211ENST00000490914 MIB1Q86YT6 1006 aa7.21□□□□□ -1.26
SSB-211ENST00000490914 SEC14L1Q92503 715 aa7.21□□□□□ -1.26
SSB-211ENST00000490914 DIO2Q92813 273 aa7.21□□□□□ -1.26
SSB-211ENST00000490914 NTMQ9P121 344 aa7.21□□□□□ -1.26
SSB-211ENST00000490914 LRP2BPQ9P2M1 347 aa7.21□□□□□ -1.26
SSB-211ENST00000490914 PALD1Q9ULE6 856 aa7.21□□□□□ -1.26
SSB-211ENST00000490914 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
SSB-211ENST00000490914 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
SSB-211ENST00000490914 DDAH1O94760 285 aa7.2□□□□□ -1.26
SSB-211ENST00000490914 SCG5P05408 212 aa7.2□□□□□ -1.26
SSB-211ENST00000490914 ADRB1P08588 477 aa7.2□□□□□ -1.26
SSB-211ENST00000490914 HOXC12P31275 282 aa7.2□□□□□ -1.26
SSB-211ENST00000490914 IQCEQ6IPM2 695 aa7.2□□□□□ -1.26
SSB-211ENST00000490914 DENND5AQ6IQ26 1287 aa7.2□□□□□ -1.26
SSB-211ENST00000490914 CD300LDQ6UXZ3 194 aa7.2□□□□□ -1.26
SSB-211ENST00000490914 CEP68Q76N32 757 aa7.2□□□□□ -1.26
SSB-211ENST00000490914 Q8N1Y9 231 aa7.2□□□□□ -1.26
SSB-211ENST00000490914 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
SSB-211ENST00000490914 LNPKQ9C0E8 428 aa7.2□□□□□ -1.26
SSB-211ENST00000490914 X6R8D5 127 aa7.2□□□□□ -1.26
SSB-211ENST00000490914 LCP1P13796 627 aa7.19□□□□□ -1.26
SSB-211ENST00000490914 CNR2P34972 360 aa7.19□□□□□ -1.26
SSB-211ENST00000490914 THBS2P35442 1172 aa7.19□□□□□ -1.26
SSB-211ENST00000490914 SLC6A11P48066 632 aa7.19□□□□□ -1.26
SSB-211ENST00000490914 GJA9P57773 515 aa7.19□□□□□ -1.26
SSB-211ENST00000490914 EFEMP1Q12805 493 aa7.19□□□□□ -1.26
SSB-211ENST00000490914 SPATS1Q496A3 300 aa7.19□□□□□ -1.26
SSB-211ENST00000490914 TTLL7Q6ZT98 887 aa7.19□□□□□ -1.26
SSB-211ENST00000490914 MILR1Q7Z6M3 343 aa7.19□□□□□ -1.26
SSB-211ENST00000490914 VPS37DQ86XT2 251 aa7.19□□□□□ -1.26
SSB-211ENST00000490914 RIOX2Q8IUF8 465 aa7.19□□□□□ -1.26
SSB-211ENST00000490914 RCBTB1Q8NDN9 531 aa7.19□□□□□ -1.26
SSB-211ENST00000490914 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
SSB-211ENST00000490914 BORCS6Q96GS4 357 aa7.19□□□□□ -1.26
SSB-211ENST00000490914 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP7.19□□□□□ -1.26
SSB-211ENST00000490914 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
SSB-211ENST00000490914 GJB6O95452 261 aa7.18□□□□□ -1.26
SSB-211ENST00000490914 FGRP09769 529 aa7.18□□□□□ -1.26
SSB-211ENST00000490914 STAT5AP42229 794 aa7.18□□□□□ -1.26
SSB-211ENST00000490914 KCNJ6P48051 423 aa7.18□□□□□ -1.26
SSB-211ENST00000490914 GFRA1P56159 465 aa7.18□□□□□ -1.26
SSB-211ENST00000490914 KCNAB2Q13303 367 aa7.18□□□□□ -1.26
SSB-211ENST00000490914 MROH9Q5TGP6 573 aa7.18□□□□□ -1.26
SSB-211ENST00000490914 GGNQ86UU5 652 aa7.18□□□□□ -1.26
SSB-211ENST00000490914 PPIL6Q8IXY8 311 aa7.18□□□□□ -1.26
SSB-211ENST00000490914 TMEM145Q8NBT3 493 aa7.18□□□□□ -1.26
SSB-211ENST00000490914 ADAMTS17Q8TE56 1095 aa7.18□□□□□ -1.26
SSB-211ENST00000490914 C1orf159Q96HA4 380 aa7.18□□□□□ -1.26
SSB-211ENST00000490914 ZNF408Q9H9D4 720 aa7.18□□□□□ -1.26
SSB-211ENST00000490914 ITGA1P56199 1179 aa7.17□□□□□ -1.26
SSB-211ENST00000490914 RBM10P98175 930 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
SSB-211ENST00000490914 TESK1Q15569 626 aa7.17□□□□□ -1.26
SSB-211ENST00000490914 FXNQ16595 210 aa7.17□□□□□ -1.26
SSB-211ENST00000490914 ACBD5Q5T8D3 534 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
SSB-211ENST00000490914 FAM126BQ8IXS8 530 aa7.17□□□□□ -1.26
SSB-211ENST00000490914 KYQ8NBH2 561 aa7.17□□□□□ -1.26
SSB-211ENST00000490914 TMEM169Q96HH4 297 aa7.17□□□□□ -1.26
SSB-211ENST00000490914 TINF2Q9BSI4 451 aa7.17□□□□□ -1.26
SSB-211ENST00000490914 CAPNS1P04632 268 aa7.16□□□□□ -1.26
SSB-211ENST00000490914 TCF3P15923 654 aa7.16□□□□□ -1.26
SSB-211ENST00000490914 RPL13P26373 211 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
SSB-211ENST00000490914 GRIA2P42262 883 aa7.16□□□□□ -1.26
SSB-211ENST00000490914 CR1LQ2VPA4 569 aa7.16□□□□□ -1.26
SSB-211ENST00000490914 MCF2L2Q86YR7 1114 aa7.16□□□□□ -1.26
SSB-211ENST00000490914 ZNF428Q96B54 188 aa7.16□□□□□ -1.26
SSB-211ENST00000490914 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa7.16□□□□□ -1.26
SSB-211ENST00000490914 K7ESM1 405 aa7.15□□□□□ -1.26
SSB-211ENST00000490914 MYO1BO43795 1136 aa7.15□□□□□ -1.26
SSB-211ENST00000490914 CPP00450 1065 aa7.15□□□□□ -1.26
SSB-211ENST00000490914 LTBRP36941 435 aa7.15□□□□□ -1.26
SSB-211ENST00000490914 GTF2A2P52657 109 aa7.15□□□□□ -1.26
SSB-211ENST00000490914 SLC10A6Q3KNW5 377 aa7.15□□□□□ -1.26
SSB-211ENST00000490914 SLC35F1Q5T1Q4 408 aa7.15□□□□□ -1.26
SSB-211ENST00000490914 ZC3H18Q86VM9 953 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
SSB-211ENST00000490914 ADAM9Q13443 819 aa7.14□□□□□ -1.27
SSB-211ENST00000490914 RGL3Q3MIN7 710 aa7.14□□□□□ -1.27
SSB-211ENST00000490914 PRR31Q5SQ13 230 aa7.14□□□□□ -1.27
SSB-211ENST00000490914 HHIPL2Q6UWX4 724 aa7.14□□□□□ -1.27
SSB-211ENST00000490914 CELF2-AS1Q8N7Q2 184 aa7.14□□□□□ -1.27
SSB-211ENST00000490914 ARRDC4Q8NCT1 418 aa7.14□□□□□ -1.27
SSB-211ENST00000490914 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
SSB-211ENST00000490914 CHAMP1Q96JM3 812 aa7.14□□□□□ -1.27
SSB-211ENST00000490914 CCDC140Q96MF4 163 aa7.14□□□□□ -1.27
SSB-211ENST00000490914 PCDH18Q9HCL0 1135 aa7.14□□□□□ -1.27
SSB-211ENST00000490914 ZNF652Q9Y2D9 606 aa7.14□□□□□ -1.27
SSB-211ENST00000490914 COA3Q9Y2R0 106 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
SSB-211ENST00000490914 PPP2R2AP63151 447 aa7.13□□□□□ -1.27
SSB-211ENST00000490914 LSAMPQ13449 338 aa7.13□□□□□ -1.27
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