RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490709.1

GLIS3-216, Transcript of GLIS family zinc finger 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene GLIS3, Length 768 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLIS3-216ENST00000490709 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa23.43■■□□□ 1.34
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GLIS3-216ENST00000490709 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa23.42■■□□□ 1.34
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GLIS3-216ENST00000490709 REC8O95072 547 aa23.42■■□□□ 1.34
GLIS3-216ENST00000490709 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
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GLIS3-216ENST00000490709 CYP2C18P33260 490 aa23.38■■□□□ 1.33
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GLIS3-216ENST00000490709 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa23.38■■□□□ 1.33
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GLIS3-216ENST00000490709 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP23.34■■□□□ 1.33
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GLIS3-216ENST00000490709 PPTC7Q8NI37 304 aa23.34■■□□□ 1.33
GLIS3-216ENST00000490709 BRF1Q92994 677 aa23.34■■□□□ 1.33
GLIS3-216ENST00000490709 SPATA33Q96N06 139 aa23.34■■□□□ 1.33
GLIS3-216ENST00000490709 MLXIPQ9HAP2 919 aa23.34■■□□□ 1.33
GLIS3-216ENST00000490709 RPS6KB1P23443 525 aa23.33■■□□□ 1.33
GLIS3-216ENST00000490709 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP23.33■■□□□ 1.33
GLIS3-216ENST00000490709 WWC2Q6AWC2 1192 aa23.33■■□□□ 1.33
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