RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490478.5

CACNA2D3-210, Transcript of calcium voltage-gated channel auxiliary subunit alpha2delta 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CACNA2D3, Length 3,557 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D3-210ENST00000490478 TMEM247A6NEH6 219 aa7.55□□□□□ -1.2
CACNA2D3-210ENST00000490478 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
CACNA2D3-210ENST00000490478 CHGBP05060 677 aa7.55□□□□□ -1.2
CACNA2D3-210ENST00000490478 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
CACNA2D3-210ENST00000490478 COPS2P61201 443 aa7.55□□□□□ -1.2
CACNA2D3-210ENST00000490478 GSTM4Q03013 218 aa7.55□□□□□ -1.2
CACNA2D3-210ENST00000490478 DHX9Q08211 1270 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
CACNA2D3-210ENST00000490478 TMED1Q13445 227 aa7.55□□□□□ -1.2
CACNA2D3-210ENST00000490478 PTPAQ15257 358 aa7.55□□□□□ -1.2
CACNA2D3-210ENST00000490478 KCTD19Q17RG1 926 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
CACNA2D3-210ENST00000490478 NT5DC1Q5TFE4 455 aa7.55□□□□□ -1.2
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CACNA2D3-210ENST00000490478 DNAJC9Q8WXX5 260 aa7.55□□□□□ -1.2
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CACNA2D3-210ENST00000490478 VCX3BQ9H321 246 aa7.55□□□□□ -1.2
CACNA2D3-210ENST00000490478 VCX3AQ9NNX9 186 aa7.55□□□□□ -1.2
CACNA2D3-210ENST00000490478 SCOCQ9UIL1 159 aa7.55□□□□□ -1.2
CACNA2D3-210ENST00000490478 SH3GLB1Q9Y371 365 aa7.55□□□□□ -1.2
CACNA2D3-210ENST00000490478 USH1CQ9Y6N9 552 aa7.55□□□□□ -1.2
CACNA2D3-210ENST00000490478 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
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CACNA2D3-210ENST00000490478 PTDSS1P48651 473 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
CACNA2D3-210ENST00000490478 CLCN2P51788 898 aa7.55□□□□□ -1.2
CACNA2D3-210ENST00000490478 BNIP1Q12981 228 aa7.55□□□□□ -1.2
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CACNA2D3-210ENST00000490478 ASAP3Q8TDY4 903 aa7.55□□□□□ -1.2
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CACNA2D3-210ENST00000490478 CLMNQ96JQ2 1002 aa7.55□□□□□ -1.2
CACNA2D3-210ENST00000490478 HAPLN3Q96S86 360 aa7.55□□□□□ -1.2
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CACNA2D3-210ENST00000490478 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa7.55□□□□□ -1.2
CACNA2D3-210ENST00000490478 MROH2AA6NES4 1674 aa7.55□□□□□ -1.2
CACNA2D3-210ENST00000490478 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa7.55□□□□□ -1.2
CACNA2D3-210ENST00000490478 SIGLEC16A6NMB1 481 aa7.55□□□□□ -1.2
CACNA2D3-210ENST00000490478 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
CACNA2D3-210ENST00000490478 MLH1P40692 756 aa7.55□□□□□ -1.2
CACNA2D3-210ENST00000490478 FLIIQ13045 1269 aa7.55□□□□□ -1.2
CACNA2D3-210ENST00000490478 KRT32Q14532 448 aa7.55□□□□□ -1.2
CACNA2D3-210ENST00000490478 SPATA1Q5VX52 437 aa7.55□□□□□ -1.2
CACNA2D3-210ENST00000490478 LRIG3Q6UXM1 1119 aa7.55□□□□□ -1.2
CACNA2D3-210ENST00000490478 BARGINQ6ZT62 677 aa7.55□□□□□ -1.2
CACNA2D3-210ENST00000490478 IQCF2Q8IXL9 164 aa7.55□□□□□ -1.2
CACNA2D3-210ENST00000490478 STAG2Q8N3U4 1231 aa7.55□□□□□ -1.2
CACNA2D3-210ENST00000490478 FBF1Q8TES7 1133 aa7.55□□□□□ -1.2
CACNA2D3-210ENST00000490478 ABTB1Q969K4 478 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
CACNA2D3-210ENST00000490478 RMND1Q9NWS8 449 aa7.55□□□□□ -1.2
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CACNA2D3-210ENST00000490478 ATP9BO43861 1147 aa7.54□□□□□ -1.2
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CACNA2D3-210ENST00000490478 TMEM53Q6P2H8 277 aa7.54□□□□□ -1.2
CACNA2D3-210ENST00000490478 ARHGAP18Q8N392 663 aa7.54□□□□□ -1.2
CACNA2D3-210ENST00000490478 OGFOD1Q8N543 542 aa7.54□□□□□ -1.2
CACNA2D3-210ENST00000490478 STK32AQ8WU08 396 aa7.54□□□□□ -1.2
CACNA2D3-210ENST00000490478 CTNNBL1Q8WYA6 563 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
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CACNA2D3-210ENST00000490478 RAB17Q9H0T7 212 aa7.54□□□□□ -1.2
CACNA2D3-210ENST00000490478 VPS16Q9H269 839 aa7.54□□□□□ -1.2
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CACNA2D3-210ENST00000490478 ZNHIT6Q9NWK9 470 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
CACNA2D3-210ENST00000490478 CIDEBQ9UHD4 219 aa7.54□□□□□ -1.2
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CACNA2D3-210ENST00000490478 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa7.54□□□□□ -1.2
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CACNA2D3-210ENST00000490478 ASLP04424 464 aa7.54□□□□□ -1.2
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CACNA2D3-210ENST00000490478 XBP1P17861 261 aa7.54□□□□□ -1.2
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CACNA2D3-210ENST00000490478 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
CACNA2D3-210ENST00000490478 CYP27A1Q02318 531 aa7.54□□□□□ -1.2
CACNA2D3-210ENST00000490478 KRT31Q15323 416 aa7.54□□□□□ -1.2
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CACNA2D3-210ENST00000490478 CYP4X1Q8N118 509 aa7.54□□□□□ -1.2
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CACNA2D3-210ENST00000490478 WDR60Q8WVS4 1066 aa7.54□□□□□ -1.2
CACNA2D3-210ENST00000490478 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
CACNA2D3-210ENST00000490478 ZNF333Q96JL9 665 aa7.54□□□□□ -1.2
CACNA2D3-210ENST00000490478 GBP5Q96PP8 586 aa7.54□□□□□ -1.2
CACNA2D3-210ENST00000490478 FAM192AQ9GZU8 254 aa7.54□□□□□ -1.2
CACNA2D3-210ENST00000490478 ARHGEF38Q9NXL2 777 aa7.54□□□□□ -1.2
CACNA2D3-210ENST00000490478 ABCA8O94911 1581 aa7.54□□□□□ -1.2
CACNA2D3-210ENST00000490478 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa7.54□□□□□ -1.2
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