RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489487.1

TMEM30CP-202, Transcript of transmembrane protein 30C, pseudogene, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TMEM30CP, Length 380 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM30CP-202ENST00000489487 CLDND1Q9NY35 253 aa7.14□□□□□ -1.27
TMEM30CP-202ENST00000489487 NPFFR2Q9Y5X5 522 aa7.14□□□□□ -1.27
TMEM30CP-202ENST00000489487 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa7.14□□□□□ -1.27
TMEM30CP-202ENST00000489487 H7BY64 318 aa7.13□□□□□ -1.27
TMEM30CP-202ENST00000489487 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
TMEM30CP-202ENST00000489487 LINC00310P59036 64 aa7.13□□□□□ -1.27
TMEM30CP-202ENST00000489487 NFE2L2Q16236 605 aa7.13□□□□□ -1.27
TMEM30CP-202ENST00000489487 ZNF385BQ569K4 471 aa7.13□□□□□ -1.27
TMEM30CP-202ENST00000489487 YOD1Q5VVQ6 348 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
TMEM30CP-202ENST00000489487 TSPAN17Q96FV3 270 aa7.13□□□□□ -1.27
TMEM30CP-202ENST00000489487 DNAJC7Q99615 494 aa7.13□□□□□ -1.27
TMEM30CP-202ENST00000489487 X6R8D5 127 aa7.13□□□□□ -1.27
TMEM30CP-202ENST00000489487 ADCY3O60266 1144 aa7.12□□□□□ -1.27
TMEM30CP-202ENST00000489487 FAM153BP0C7A2 387 aa7.12□□□□□ -1.27
TMEM30CP-202ENST00000489487 NCKAP1LP55160 1127 aa7.12□□□□□ -1.27
TMEM30CP-202ENST00000489487 LONRF2Q1L5Z9 754 aa7.12□□□□□ -1.27
TMEM30CP-202ENST00000489487 ZC3H12BQ5HYM0 836 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
TMEM30CP-202ENST00000489487 RIOX2Q8IUF8 465 aa7.12□□□□□ -1.27
TMEM30CP-202ENST00000489487 LRRC56Q8IYG6 542 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
TMEM30CP-202ENST00000489487 SEC14L1Q92503 715 aa7.12□□□□□ -1.27
TMEM30CP-202ENST00000489487 FAN1Q9Y2M0 1017 aa7.12□□□□□ -1.27
TMEM30CP-202ENST00000489487 SIT1Q9Y3P8 196 aa7.12□□□□□ -1.27
TMEM30CP-202ENST00000489487 KCTD3Q9Y597 815 aa7.12□□□□□ -1.27
TMEM30CP-202ENST00000489487 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa7.12□□□□□ -1.27
TMEM30CP-202ENST00000489487 IRS2Q9Y4H2 1338 aa7.11□□□□□ -1.27
TMEM30CP-202ENST00000489487 TRBV23-1A0A0A0MS06 115 aa7.11□□□□□ -1.27
TMEM30CP-202ENST00000489487 NUAK1O60285 661 aa7.11□□□□□ -1.27
TMEM30CP-202ENST00000489487 BUB1BO60566 1050 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
TMEM30CP-202ENST00000489487 NCAM1P13591 858 aa7.11□□□□□ -1.27
TMEM30CP-202ENST00000489487 SUMO1P63165 101 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
TMEM30CP-202ENST00000489487 CHRNA2Q15822 529 aa7.11□□□□□ -1.27
TMEM30CP-202ENST00000489487 IFNL3Q8IZI9 196 aa7.11□□□□□ -1.27
TMEM30CP-202ENST00000489487 Q8N1Y9 231 aa7.11□□□□□ -1.27
TMEM30CP-202ENST00000489487 ZFYVE21Q9BQ24 234 aa7.11□□□□□ -1.27
TMEM30CP-202ENST00000489487 RNF38Q9H0F5 515 aa7.11□□□□□ -1.27
TMEM30CP-202ENST00000489487 BLACEA4D250 179 aa7.1□□□□□ -1.27
TMEM30CP-202ENST00000489487 DGKIO75912 1065 aa7.1□□□□□ -1.27
TMEM30CP-202ENST00000489487 CFPP27918 469 aa7.1□□□□□ -1.27
TMEM30CP-202ENST00000489487 SLC6A11P48066 632 aa7.1□□□□□ -1.27
TMEM30CP-202ENST00000489487 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
TMEM30CP-202ENST00000489487 NTRK3Q16288 839 aa7.1□□□□□ -1.27
TMEM30CP-202ENST00000489487 FAM209AQ5JX71 171 aa7.1□□□□□ -1.27
TMEM30CP-202ENST00000489487 STYK1Q6J9G0 422 aa7.1□□□□□ -1.27
TMEM30CP-202ENST00000489487 KCNT2Q6UVM3 1135 aa7.1□□□□□ -1.27
TMEM30CP-202ENST00000489487 NLRP10Q86W26 655 aa7.1□□□□□ -1.27
TMEM30CP-202ENST00000489487 IGDCC3Q8IVU1 814 aa7.1□□□□□ -1.27
TMEM30CP-202ENST00000489487 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa7.1□□□□□ -1.27
TMEM30CP-202ENST00000489487 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa7.1□□□□□ -1.27
TMEM30CP-202ENST00000489487 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa7.1□□□□□ -1.27
TMEM30CP-202ENST00000489487 EPB41L1Q9H4G0 881 aa7.1□□□□□ -1.27
TMEM30CP-202ENST00000489487 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa7.1□□□□□ -1.27
TMEM30CP-202ENST00000489487 FBXL7Q9UJT9 491 aa7.1□□□□□ -1.27
TMEM30CP-202ENST00000489487 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
TMEM30CP-202ENST00000489487 MSCO60682 206 aa7.09□□□□□ -1.27
TMEM30CP-202ENST00000489487 ASGR2P07307 311 aa7.09□□□□□ -1.27
TMEM30CP-202ENST00000489487 PI3P19957 117 aa7.09□□□□□ -1.27
TMEM30CP-202ENST00000489487 GPR85P60893 370 aa7.09□□□□□ -1.27
TMEM30CP-202ENST00000489487 SSPNQ14714 243 aa7.09□□□□□ -1.27
TMEM30CP-202ENST00000489487 KIZQ2M2Z5 673 aa7.09□□□□□ -1.27
TMEM30CP-202ENST00000489487 LCE4AQ5TA78 99 aa7.09□□□□□ -1.27
TMEM30CP-202ENST00000489487 CNKSR3Q6P9H4 555 aa7.09□□□□□ -1.27
TMEM30CP-202ENST00000489487 MILR1Q7Z6M3 343 aa7.09□□□□□ -1.27
TMEM30CP-202ENST00000489487 TMEM151BQ8IW70 566 aa7.09□□□□□ -1.27
TMEM30CP-202ENST00000489487 DHRS4Q9BTZ2 278 aa7.09□□□□□ -1.27
TMEM30CP-202ENST00000489487 BCAS3Q9H6U6 928 aa7.09□□□□□ -1.27
TMEM30CP-202ENST00000489487 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP7.08□□□□□ -1.28
TMEM30CP-202ENST00000489487 APPP05067 770 aa7.08□□□□□ -1.28
TMEM30CP-202ENST00000489487 PMLP29590 882 aa7.08□□□□□ -1.28
TMEM30CP-202ENST00000489487 FOXB2Q5VYV0 432 aa7.08□□□□□ -1.28
TMEM30CP-202ENST00000489487 LBX2Q6XYB7 198 aa7.08□□□□□ -1.28
TMEM30CP-202ENST00000489487 NLGN1Q8N2Q7 840 aa7.08□□□□□ -1.28
TMEM30CP-202ENST00000489487 PUM2Q8TB72 1066 aaKnown RBP eCLIP7.08□□□□□ -1.28
TMEM30CP-202ENST00000489487 THAP3Q8WTV1 239 aaPredicted RBP7.08□□□□□ -1.28
TMEM30CP-202ENST00000489487 PTPRN2Q92932 1015 aa7.08□□□□□ -1.28
TMEM30CP-202ENST00000489487 ALG1Q9BT22 464 aa7.08□□□□□ -1.28
TMEM30CP-202ENST00000489487 PALD1Q9ULE6 856 aa7.08□□□□□ -1.28
TMEM30CP-202ENST00000489487 KRIT1O00522 736 aa7.07□□□□□ -1.28
TMEM30CP-202ENST00000489487 AQP7O14520 342 aa7.07□□□□□ -1.28
TMEM30CP-202ENST00000489487 HGSO14964 777 aaPredicted RBP7.07□□□□□ -1.28
TMEM30CP-202ENST00000489487 SGSM2O43147 1006 aa7.07□□□□□ -1.28
TMEM30CP-202ENST00000489487 MAFKO60675 156 aa7.07□□□□□ -1.28
TMEM30CP-202ENST00000489487 FBLN1P23142 703 aa7.07□□□□□ -1.28
TMEM30CP-202ENST00000489487 STEAP3Q658P3 488 aa7.07□□□□□ -1.28
TMEM30CP-202ENST00000489487 MAMDC2Q7Z304 686 aaPredicted RBP7.07□□□□□ -1.28
TMEM30CP-202ENST00000489487 CILP2Q8IUL8 1156 aa7.07□□□□□ -1.28
TMEM30CP-202ENST00000489487 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa7.07□□□□□ -1.28
TMEM30CP-202ENST00000489487 DDX11Q96FC9 970 aa7.07□□□□□ -1.28
TMEM30CP-202ENST00000489487 YIPF4Q9BSR8 244 aa7.07□□□□□ -1.28
TMEM30CP-202ENST00000489487 LNPKQ9C0E8 428 aa7.07□□□□□ -1.28
TMEM30CP-202ENST00000489487 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP7.07□□□□□ -1.28
TMEM30CP-202ENST00000489487 CCDC163A0A0D9SF12 145 aa7.06□□□□□ -1.28
TMEM30CP-202ENST00000489487 ATF2P15336 505 aa7.06□□□□□ -1.28
TMEM30CP-202ENST00000489487 NAT1P18440 290 aa7.06□□□□□ -1.28
TMEM30CP-202ENST00000489487 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP7.06□□□□□ -1.28
TMEM30CP-202ENST00000489487 GRK2P25098 689 aa7.06□□□□□ -1.28
TMEM30CP-202ENST00000489487 GRK3P35626 688 aa7.06□□□□□ -1.28
TMEM30CP-202ENST00000489487 GABREP78334 506 aa7.06□□□□□ -1.28
TMEM30CP-202ENST00000489487 FOXO4P98177 505 aa7.06□□□□□ -1.28
TMEM30CP-202ENST00000489487 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa7.06□□□□□ -1.28
TMEM30CP-202ENST00000489487 CCDC144BQ3MJ40 725 aa7.06□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.2 ms