RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486480.1

PTPRN-216, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type N, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRN, Length 563 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRN-216ENST00000486480 SPC25Q9HBM1 224 aa21.96■■□□□ 1.11
PTPRN-216ENST00000486480 VPS54Q9P1Q0 977 aa21.96■■□□□ 1.11
PTPRN-216ENST00000486480 MYADML2A6NDP7 307 aa21.95■■□□□ 1.1
PTPRN-216ENST00000486480 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP21.95■■□□□ 1.1
PTPRN-216ENST00000486480 CST5P28325 142 aaPredicted RBP21.95■■□□□ 1.1
PTPRN-216ENST00000486480 ST3GAL1Q11201 340 aa21.95■■□□□ 1.1
PTPRN-216ENST00000486480 TTLL4Q14679 1199 aa21.95■■□□□ 1.1
PTPRN-216ENST00000486480 PCDHA6Q9UN73 950 aa21.95■■□□□ 1.1
PTPRN-216ENST00000486480 Q9Y3F1 56 aa21.95■■□□□ 1.1
PTPRN-216ENST00000486480 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa21.95■■□□□ 1.1
PTPRN-216ENST00000486480 MYH7BA7E2Y1 1941 aa21.95■■□□□ 1.1
PTPRN-216ENST00000486480 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.1
PTPRN-216ENST00000486480 ARIH2O95376 493 aa21.94■■□□□ 1.1
PTPRN-216ENST00000486480 CLK2P49760 499 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
PTPRN-216ENST00000486480 NKX3-2P78367 333 aa21.94■■□□□ 1.1
PTPRN-216ENST00000486480 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
PTPRN-216ENST00000486480 PCNX4Q63HM2 1172 aa21.94■■□□□ 1.1
PTPRN-216ENST00000486480 KLHDC9Q8NEP7 349 aa21.94■■□□□ 1.1
PTPRN-216ENST00000486480 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
PTPRN-216ENST00000486480 AIFM3Q96NN9 605 aa21.94■■□□□ 1.1
PTPRN-216ENST00000486480 AP5M1Q9H0R1 490 aa21.94■■□□□ 1.1
PTPRN-216ENST00000486480 EHMT1Q9H9B1 1298 aa21.94■■□□□ 1.1
PTPRN-216ENST00000486480 C6orf50Q9HD87 102 aa21.94■■□□□ 1.1
PTPRN-216ENST00000486480 SH3GLB2Q9NR46 395 aa21.94■■□□□ 1.1
PTPRN-216ENST00000486480 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP21.93■■□□□ 1.1
PTPRN-216ENST00000486480 CTAGE5O15320 804 aa21.93■■□□□ 1.1
PTPRN-216ENST00000486480 ST18O60284 1047 aa21.93■■□□□ 1.1
PTPRN-216ENST00000486480 DTNBO60941 627 aa21.93■■□□□ 1.1
PTPRN-216ENST00000486480 STAM2O75886 525 aa21.93■■□□□ 1.1
PTPRN-216ENST00000486480 RGS20O76081 388 aa21.93■■□□□ 1.1
PTPRN-216ENST00000486480 FOSP01100 380 aaPredicted RBP21.93■■□□□ 1.1
PTPRN-216ENST00000486480 TXNP10599 105 aaKnown RBP21.93■■□□□ 1.1
PTPRN-216ENST00000486480 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP21.93■■□□□ 1.1
PTPRN-216ENST00000486480 AP3B2Q13367 1082 aa21.93■■□□□ 1.1
PTPRN-216ENST00000486480 XRRA1Q6P2D8 792 aa21.93■■□□□ 1.1
PTPRN-216ENST00000486480 CCDC62Q6P9F0 684 aa21.93■■□□□ 1.1
PTPRN-216ENST00000486480 HTATIP2Q9BUP3 242 aa21.93■■□□□ 1.1
PTPRN-216ENST00000486480 TMEM260Q9NX78 707 aa21.93■■□□□ 1.1
PTPRN-216ENST00000486480 PHF24Q9UPV7 400 aa21.93■■□□□ 1.1
PTPRN-216ENST00000486480 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP21.93■■□□□ 1.1
PTPRN-216ENST00000486480 DOCK5Q9H7D0 1870 aa21.92■■□□□ 1.1
PTPRN-216ENST00000486480 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP21.92■■□□□ 1.1
PTPRN-216ENST00000486480 GNA11P29992 359 aa21.92■■□□□ 1.1
PTPRN-216ENST00000486480 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP21.92■■□□□ 1.1
PTPRN-216ENST00000486480 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP21.92■■□□□ 1.1
PTPRN-216ENST00000486480 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP21.92■■□□□ 1.1
PTPRN-216ENST00000486480 IL27Q8NEV9 243 aa21.92■■□□□ 1.1
PTPRN-216ENST00000486480 OR6J1Q8NGC5 347 aa21.92■■□□□ 1.1
PTPRN-216ENST00000486480 PGBD1Q96JS3 809 aa21.92■■□□□ 1.1
PTPRN-216ENST00000486480 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP21.92■■□□□ 1.1
PTPRN-216ENST00000486480 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP21.92■■□□□ 1.1
PTPRN-216ENST00000486480 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP21.92■■□□□ 1.1
PTPRN-216ENST00000486480 ANO3Q9BYT9 981 aa21.92■■□□□ 1.1
PTPRN-216ENST00000486480 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP21.92■■□□□ 1.1
PTPRN-216ENST00000486480 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP21.92■■□□□ 1.1
PTPRN-216ENST00000486480 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP21.92■■□□□ 1.1
PTPRN-216ENST00000486480 MRVI1Q9Y6F6 885 aa21.92■■□□□ 1.1
PTPRN-216ENST00000486480 ADAMTS3O15072 1205 aa21.91■■□□□ 1.1
PTPRN-216ENST00000486480 BEX3Q00994 111 aa21.91■■□□□ 1.1
PTPRN-216ENST00000486480 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP21.91■■□□□ 1.1
PTPRN-216ENST00000486480 GNASQ5JWF2 1037 aa21.91■■□□□ 1.1
PTPRN-216ENST00000486480 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP21.91■■□□□ 1.1
PTPRN-216ENST00000486480 COPS5Q92905 334 aa21.91■■□□□ 1.1
PTPRN-216ENST00000486480 MOXD2PA6NHM9 499 aa21.9■■□□□ 1.1
PTPRN-216ENST00000486480 ACLYP53396 1101 aa21.9■■□□□ 1.1
PTPRN-216ENST00000486480 NLRP5P59047 1200 aa21.9■■□□□ 1.1
PTPRN-216ENST00000486480 KCNA10Q16322 511 aa21.9■■□□□ 1.1
PTPRN-216ENST00000486480 LY6KQ17RY6 165 aa21.9■■□□□ 1.1
PTPRN-216ENST00000486480 GNPTABQ3T906 1256 aa21.9■■□□□ 1.1
PTPRN-216ENST00000486480 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa21.9■■□□□ 1.1
PTPRN-216ENST00000486480 MCTP2Q6DN12 878 aa21.9■■□□□ 1.1
PTPRN-216ENST00000486480 CCDC83Q8IWF9 413 aa21.9■■□□□ 1.1
PTPRN-216ENST00000486480 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
PTPRN-216ENST00000486480 BICD2Q8TD16 824 aa21.9■■□□□ 1.1
PTPRN-216ENST00000486480 RTEL1Q9NZ71 1219 aa21.9■■□□□ 1.1
PTPRN-216ENST00000486480 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
PTPRN-216ENST00000486480 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP21.89■■□□□ 1.09
PTPRN-216ENST00000486480 A0A1W2PQY0 241 aa21.89■■□□□ 1.09
PTPRN-216ENST00000486480 JAK2O60674 1132 aa21.89■■□□□ 1.09
PTPRN-216ENST00000486480 GH1P01241 217 aa21.89■■□□□ 1.09
PTPRN-216ENST00000486480 FDPSP14324 419 aaKnown RBP21.89■■□□□ 1.09
PTPRN-216ENST00000486480 SREBF1P36956 1147 aa21.89■■□□□ 1.09
PTPRN-216ENST00000486480 KCNV1Q6PIU1 500 aa21.89■■□□□ 1.09
PTPRN-216ENST00000486480 WASF1Q92558 559 aa21.89■■□□□ 1.09
PTPRN-216ENST00000486480 FERMT2Q96AC1 680 aa21.89■■□□□ 1.09
PTPRN-216ENST00000486480 FIBPO43427 364 aa21.88■■□□□ 1.09
PTPRN-216ENST00000486480 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
PTPRN-216ENST00000486480 ASGR1P07306 291 aa21.88■■□□□ 1.09
PTPRN-216ENST00000486480 ICAM3P32942 547 aa21.88■■□□□ 1.09
PTPRN-216ENST00000486480 ARHGAP1Q07960 439 aa21.88■■□□□ 1.09
PTPRN-216ENST00000486480 RASGRP4Q8TDF6 673 aa21.88■■□□□ 1.09
PTPRN-216ENST00000486480 PCDHA4Q9UN74 947 aa21.88■■□□□ 1.09
PTPRN-216ENST00000486480 TGFB3P10600 412 aa21.87■■□□□ 1.09
PTPRN-216ENST00000486480 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
PTPRN-216ENST00000486480 CPT1AP50416 773 aa21.87■■□□□ 1.09
PTPRN-216ENST00000486480 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
PTPRN-216ENST00000486480 SEMA3FQ13275 785 aa21.87■■□□□ 1.09
PTPRN-216ENST00000486480 NPY5RQ15761 445 aa21.87■■□□□ 1.09
PTPRN-216ENST00000486480 LRRC26Q2I0M4 334 aa21.87■■□□□ 1.09
PTPRN-216ENST00000486480 NLRX1Q86UT6 975 aa21.87■■□□□ 1.09
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