RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482015.5

UPP1-211, Transcript of uridine phosphorylase 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene UPP1, Length 861 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1-211ENST00000482015 RGS20O76081 388 aa21.74■■□□□ 1.07
UPP1-211ENST00000482015 PLEKHA8P1O95397 391 aa21.74■■□□□ 1.07
UPP1-211ENST00000482015 LIFRP42702 1097 aa21.74■■□□□ 1.07
UPP1-211ENST00000482015 CCL23P55773 120 aa21.74■■□□□ 1.07
UPP1-211ENST00000482015 CHMP4BP1P59074 171 aa21.74■■□□□ 1.07
UPP1-211ENST00000482015 PGM5Q15124 567 aa21.74■■□□□ 1.07
UPP1-211ENST00000482015 ZNF697Q5TEC3 545 aa21.74■■□□□ 1.07
UPP1-211ENST00000482015 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP21.74■■□□□ 1.07
UPP1-211ENST00000482015 SPZ1Q9BXG8 430 aa21.74■■□□□ 1.07
UPP1-211ENST00000482015 MRVI1Q9Y6F6 885 aa21.74■■□□□ 1.07
UPP1-211ENST00000482015 MMP3P08254 477 aa21.73■■□□□ 1.07
UPP1-211ENST00000482015 CYP2C9P11712 490 aa21.73■■□□□ 1.07
UPP1-211ENST00000482015 RNF20Q5VTR2 975 aa21.73■■□□□ 1.07
UPP1-211ENST00000482015 ZNF365Q70YC5 407 aa21.73■■□□□ 1.07
UPP1-211ENST00000482015 VSIG10LQ86VR7 867 aa21.73■■□□□ 1.07
UPP1-211ENST00000482015 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP21.73■■□□□ 1.07
UPP1-211ENST00000482015 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa21.72■■□□□ 1.07
UPP1-211ENST00000482015 RASEFQ8IZ41 740 aa21.72■■□□□ 1.07
UPP1-211ENST00000482015 GUCD1Q96NT3 240 aa21.72■■□□□ 1.07
UPP1-211ENST00000482015 NEK1Q96PY6 1258 aa21.72■■□□□ 1.07
UPP1-211ENST00000482015 LZTS2Q9BRK4 669 aa21.72■■□□□ 1.07
UPP1-211ENST00000482015 WNT8AQ9H1J5 351 aa21.72■■□□□ 1.07
UPP1-211ENST00000482015 IL23AQ9NPF7 189 aa21.72■■□□□ 1.07
UPP1-211ENST00000482015 SLC12A7Q9Y666 1083 aa21.72■■□□□ 1.07
UPP1-211ENST00000482015 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP21.72■■□□□ 1.07
UPP1-211ENST00000482015 SORBS3O60504 671 aa21.71■■□□□ 1.07
UPP1-211ENST00000482015 SMARCA1P28370 1054 aa21.71■■□□□ 1.07
UPP1-211ENST00000482015 GNAQP50148 359 aa21.71■■□□□ 1.07
UPP1-211ENST00000482015 NFRKBQ6P4R8 1299 aa21.71■■□□□ 1.07
UPP1-211ENST00000482015 SCLYQ96I15 445 aa21.71■■□□□ 1.07
UPP1-211ENST00000482015 TCEANC2Q96MN5 208 aa21.71■■□□□ 1.07
UPP1-211ENST00000482015 SEMA6BQ9H3T3 888 aa21.71■■□□□ 1.07
UPP1-211ENST00000482015 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP21.71■■□□□ 1.07
UPP1-211ENST00000482015 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa21.71■■□□□ 1.07
UPP1-211ENST00000482015 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP21.7■■□□□ 1.06
UPP1-211ENST00000482015 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP21.7■■□□□ 1.06
UPP1-211ENST00000482015 CALM1P0DP23 149 aa21.7■■□□□ 1.06
UPP1-211ENST00000482015 CALM2P0DP24 149 aa21.7■■□□□ 1.06
UPP1-211ENST00000482015 CALM3P0DP25 149 aa21.7■■□□□ 1.06
UPP1-211ENST00000482015 CCND2P30279 289 aa21.7■■□□□ 1.06
UPP1-211ENST00000482015 ADCK5Q3MIX3 580 aa21.7■■□□□ 1.06
UPP1-211ENST00000482015 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP21.7■■□□□ 1.06
UPP1-211ENST00000482015 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP21.7■■□□□ 1.06
UPP1-211ENST00000482015 CCDC82Q8N4S0 544 aa21.7■■□□□ 1.06
UPP1-211ENST00000482015 KAT2BQ92831 832 aa21.7■■□□□ 1.06
UPP1-211ENST00000482015 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP21.7■■□□□ 1.06
UPP1-211ENST00000482015 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa21.69■■□□□ 1.06
UPP1-211ENST00000482015 CASTP20810 708 aaKnown RBP21.69■■□□□ 1.06
UPP1-211ENST00000482015 SP2Q02086 613 aa21.69■■□□□ 1.06
UPP1-211ENST00000482015 LAMC2Q13753 1193 aa21.69■■□□□ 1.06
UPP1-211ENST00000482015 DGKDQ16760 1214 aa21.69■■□□□ 1.06
UPP1-211ENST00000482015 RASIP1Q5U651 963 aa21.69■■□□□ 1.06
UPP1-211ENST00000482015 USP17L6PQ6QN14 398 aa21.69■■□□□ 1.06
UPP1-211ENST00000482015 SGMS1Q86VZ5 419 aa21.69■■□□□ 1.06
UPP1-211ENST00000482015 MICU3Q86XE3 530 aa21.69■■□□□ 1.06
UPP1-211ENST00000482015 FANCBQ8NB91 859 aa21.69■■□□□ 1.06
UPP1-211ENST00000482015 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP21.69■■□□□ 1.06
UPP1-211ENST00000482015 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP21.69■■□□□ 1.06
UPP1-211ENST00000482015 GRXCR1A8MXD5 290 aa21.68■■□□□ 1.06
UPP1-211ENST00000482015 FGBP02675 491 aa21.68■■□□□ 1.06
UPP1-211ENST00000482015 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP21.68■■□□□ 1.06
UPP1-211ENST00000482015 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP21.68■■□□□ 1.06
UPP1-211ENST00000482015 MYSM1Q5VVJ2 828 aa21.68■■□□□ 1.06
UPP1-211ENST00000482015 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa21.68■■□□□ 1.06
UPP1-211ENST00000482015 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP21.68■■□□□ 1.06
UPP1-211ENST00000482015 COL6A3P12111 3177 aa21.67■■□□□ 1.06
UPP1-211ENST00000482015 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa21.67■■□□□ 1.06
UPP1-211ENST00000482015 GGPS1O95749 300 aa21.67■■□□□ 1.06
UPP1-211ENST00000482015 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP21.67■■□□□ 1.06
UPP1-211ENST00000482015 TSGA10IPQ3SY00 556 aa21.67■■□□□ 1.06
UPP1-211ENST00000482015 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP21.67■■□□□ 1.06
UPP1-211ENST00000482015 KCNV1Q6PIU1 500 aa21.67■■□□□ 1.06
UPP1-211ENST00000482015 TMTC3Q6ZXV5 915 aa21.67■■□□□ 1.06
UPP1-211ENST00000482015 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP21.67■■□□□ 1.06
UPP1-211ENST00000482015 OTOP2Q7RTS6 562 aa21.67■■□□□ 1.06
UPP1-211ENST00000482015 PPTC7Q8NI37 304 aa21.67■■□□□ 1.06
UPP1-211ENST00000482015 HERVK_113Q902F9 699 aa21.67■■□□□ 1.06
UPP1-211ENST00000482015 VWCEQ96DN2 955 aa21.67■■□□□ 1.06
UPP1-211ENST00000482015 RTEL1Q9NZ71 1219 aa21.67■■□□□ 1.06
UPP1-211ENST00000482015 FRMPD4Q14CM0 1322 aa21.66■■□□□ 1.06
UPP1-211ENST00000482015 MEIS2O14770 477 aa21.66■■□□□ 1.06
UPP1-211ENST00000482015 ZNF286BP0CG31 522 aa21.66■■□□□ 1.06
UPP1-211ENST00000482015 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP21.66■■□□□ 1.06
UPP1-211ENST00000482015 HSDL1Q3SXM5 330 aa21.66■■□□□ 1.06
UPP1-211ENST00000482015 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa21.66■■□□□ 1.06
UPP1-211ENST00000482015 CUL5Q93034 780 aa21.66■■□□□ 1.06
UPP1-211ENST00000482015 SPATA33Q96N06 139 aa21.66■■□□□ 1.06
UPP1-211ENST00000482015 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP21.66■■□□□ 1.06
UPP1-211ENST00000482015 ALG1Q9BT22 464 aa21.66■■□□□ 1.06
UPP1-211ENST00000482015 BCAS3Q9H6U6 928 aa21.66■■□□□ 1.06
UPP1-211ENST00000482015 BRPF3Q9ULD4 1205 aa21.66■■□□□ 1.06
UPP1-211ENST00000482015 NOD1Q9Y239 953 aa21.66■■□□□ 1.06
UPP1-211ENST00000482015 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa21.66■■□□□ 1.06
UPP1-211ENST00000482015 PIK3CDO00329 1044 aa21.65■■□□□ 1.06
UPP1-211ENST00000482015 TGFB3P10600 412 aa21.65■■□□□ 1.06
UPP1-211ENST00000482015 DNAJB2P25686 324 aa21.65■■□□□ 1.06
UPP1-211ENST00000482015 PBX2P40425 430 aa21.65■■□□□ 1.06
UPP1-211ENST00000482015 PSEN2P49810 448 aa21.65■■□□□ 1.06
UPP1-211ENST00000482015 PTGISQ16647 500 aa21.65■■□□□ 1.06
UPP1-211ENST00000482015 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.9 ms