RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473252.5

C9orf85-204, Transcript of chromosome 9 open reading frame 85, humanhuman

TSL 5

Gene C9orf85, Length 678 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf85-204ENST00000473252 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
C9orf85-204ENST00000473252 GH1P01241 217 aa14.61□□□□□ -0.07
C9orf85-204ENST00000473252 RXRAP19793 462 aa14.61□□□□□ -0.07
C9orf85-204ENST00000473252 CCND2P30279 289 aa14.61□□□□□ -0.07
C9orf85-204ENST00000473252 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
C9orf85-204ENST00000473252 FAAP100Q0VG06 881 aa14.61□□□□□ -0.07
C9orf85-204ENST00000473252 RTN1Q16799 776 aa14.61□□□□□ -0.07
C9orf85-204ENST00000473252 LRIT3Q3SXY7 679 aa14.61□□□□□ -0.07
C9orf85-204ENST00000473252 XRRA1Q6P2D8 792 aa14.61□□□□□ -0.07
C9orf85-204ENST00000473252 CXCL17Q6UXB2 119 aa14.61□□□□□ -0.07
C9orf85-204ENST00000473252 SEPT14Q6ZU15 432 aa14.61□□□□□ -0.07
C9orf85-204ENST00000473252 FAM126BQ8IXS8 530 aa14.61□□□□□ -0.07
C9orf85-204ENST00000473252 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
C9orf85-204ENST00000473252 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa14.61□□□□□ -0.07
C9orf85-204ENST00000473252 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
C9orf85-204ENST00000473252 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
C9orf85-204ENST00000473252 USP26Q9BXU7 913 aa14.61□□□□□ -0.07
C9orf85-204ENST00000473252 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
C9orf85-204ENST00000473252 TMEM39AQ9NV64 488 aa14.61□□□□□ -0.07
C9orf85-204ENST00000473252 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
C9orf85-204ENST00000473252 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa14.61□□□□□ -0.07
C9orf85-204ENST00000473252 TRIM43BA6NCK2 446 aa14.6□□□□□ -0.07
C9orf85-204ENST00000473252 RAG1P15918 1043 aa14.6□□□□□ -0.07
C9orf85-204ENST00000473252 RPS6KB1P23443 525 aa14.6□□□□□ -0.07
C9orf85-204ENST00000473252 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
C9orf85-204ENST00000473252 PURAQ00577 322 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
C9orf85-204ENST00000473252 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
C9orf85-204ENST00000473252 LAMC2Q13753 1193 aa14.6□□□□□ -0.07
C9orf85-204ENST00000473252 GNPTABQ3T906 1256 aa14.6□□□□□ -0.07
C9orf85-204ENST00000473252 TMEM63BQ5T3F8 832 aa14.6□□□□□ -0.07
C9orf85-204ENST00000473252 GPR153Q6NV75 609 aa14.6□□□□□ -0.07
C9orf85-204ENST00000473252 Q6ZUG5 572 aa14.6□□□□□ -0.07
C9orf85-204ENST00000473252 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
C9orf85-204ENST00000473252 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
C9orf85-204ENST00000473252 TM6SF1Q9BZW5 370 aa14.6□□□□□ -0.07
C9orf85-204ENST00000473252 BRPF3Q9ULD4 1205 aa14.6□□□□□ -0.07
C9orf85-204ENST00000473252 NID2Q14112 1375 aa14.6□□□□□ -0.07
C9orf85-204ENST00000473252 DNAH12Q6ZR08 3092 aa14.59□□□□□ -0.07
C9orf85-204ENST00000473252 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa14.59□□□□□ -0.07
C9orf85-204ENST00000473252 GOLGA8AA7E2F4 631 aa14.59□□□□□ -0.07
C9orf85-204ENST00000473252 GOLGA8BA8MQT2 603 aa14.59□□□□□ -0.07
C9orf85-204ENST00000473252 MEIS2O14770 477 aa14.59□□□□□ -0.07
C9orf85-204ENST00000473252 ARIH2O95376 493 aa14.59□□□□□ -0.07
C9orf85-204ENST00000473252 CD4P01730 458 aa14.59□□□□□ -0.07
C9orf85-204ENST00000473252 EVCP57679 992 aa14.59□□□□□ -0.07
C9orf85-204ENST00000473252 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
C9orf85-204ENST00000473252 PPP1R18Q6NYC8 613 aa14.59□□□□□ -0.07
C9orf85-204ENST00000473252 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa14.59□□□□□ -0.07
C9orf85-204ENST00000473252 FCHSD1Q86WN1 690 aa14.59□□□□□ -0.07
C9orf85-204ENST00000473252 PLCD3Q8N3E9 789 aa14.59□□□□□ -0.07
C9orf85-204ENST00000473252 PIBF1Q8WXW3 757 aa14.59□□□□□ -0.07
C9orf85-204ENST00000473252 TCEANC2Q96MN5 208 aa14.59□□□□□ -0.07
C9orf85-204ENST00000473252 GLT8D2Q9H1C3 349 aa14.59□□□□□ -0.07
C9orf85-204ENST00000473252 PSTPIP2Q9H939 334 aa14.59□□□□□ -0.07
C9orf85-204ENST00000473252 TBX21Q9UL17 535 aa14.59□□□□□ -0.07
C9orf85-204ENST00000473252 MRVI1Q9Y6F6 885 aa14.59□□□□□ -0.07
C9orf85-204ENST00000473252 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa14.59□□□□□ -0.07
C9orf85-204ENST00000473252 TIMP1P01033 207 aa14.58□□□□□ -0.08
C9orf85-204ENST00000473252 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa14.58□□□□□ -0.08
C9orf85-204ENST00000473252 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
C9orf85-204ENST00000473252 CASTP20810 708 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
C9orf85-204ENST00000473252 ICAM3P32942 547 aa14.58□□□□□ -0.08
C9orf85-204ENST00000473252 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP14.58□□□□□ -0.08
C9orf85-204ENST00000473252 ARHGAP1Q07960 439 aa14.58□□□□□ -0.08
C9orf85-204ENST00000473252 FUT2Q10981 343 aa14.58□□□□□ -0.08
C9orf85-204ENST00000473252 LY6KQ17RY6 165 aa14.58□□□□□ -0.08
C9orf85-204ENST00000473252 NFRKBQ6P4R8 1299 aa14.58□□□□□ -0.08
C9orf85-204ENST00000473252 RUFY3Q7L099 469 aa14.58□□□□□ -0.08
C9orf85-204ENST00000473252 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
C9orf85-204ENST00000473252 COPS5Q92905 334 aa14.58□□□□□ -0.08
C9orf85-204ENST00000473252 BADQ92934 168 aa14.58□□□□□ -0.08
C9orf85-204ENST00000473252 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa14.58□□□□□ -0.08
C9orf85-204ENST00000473252 GRIN2DO15399 1336 aa14.58□□□□□ -0.08
C9orf85-204ENST00000473252 RGS20O76081 388 aa14.57□□□□□ -0.08
C9orf85-204ENST00000473252 MMP3P08254 477 aa14.57□□□□□ -0.08
C9orf85-204ENST00000473252 MYL3P08590 195 aa14.57□□□□□ -0.08
C9orf85-204ENST00000473252 DGKDQ16760 1214 aa14.57□□□□□ -0.08
C9orf85-204ENST00000473252 PCNX4Q63HM2 1172 aa14.57□□□□□ -0.08
C9orf85-204ENST00000473252 MFSD5Q6N075 450 aa14.57□□□□□ -0.08
C9orf85-204ENST00000473252 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa14.57□□□□□ -0.08
C9orf85-204ENST00000473252 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
C9orf85-204ENST00000473252 CCDC82Q8N4S0 544 aa14.57□□□□□ -0.08
C9orf85-204ENST00000473252 PPTC7Q8NI37 304 aa14.57□□□□□ -0.08
C9orf85-204ENST00000473252 BRF1Q92994 677 aa14.57□□□□□ -0.08
C9orf85-204ENST00000473252 KATNAL1Q9BW62 490 aa14.57□□□□□ -0.08
C9orf85-204ENST00000473252 EHMT1Q9H9B1 1298 aa14.57□□□□□ -0.08
C9orf85-204ENST00000473252 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
C9orf85-204ENST00000473252 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa14.57□□□□□ -0.08
C9orf85-204ENST00000473252 SPDYE3A6NKU9 549 aa14.56□□□□□ -0.08
C9orf85-204ENST00000473252 MAFGO15525 162 aa14.56□□□□□ -0.08
C9orf85-204ENST00000473252 PPFIA4O75335 1185 aa14.56□□□□□ -0.08
C9orf85-204ENST00000473252 PTGS1P23219 599 aa14.56□□□□□ -0.08
C9orf85-204ENST00000473252 CDC27P30260 824 aa14.56□□□□□ -0.08
C9orf85-204ENST00000473252 ANAPC15P60006 121 aa14.56□□□□□ -0.08
C9orf85-204ENST00000473252 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
C9orf85-204ENST00000473252 APOBRQ0VD83 1088 aa14.56□□□□□ -0.08
C9orf85-204ENST00000473252 NEDD9Q14511 834 aa14.56□□□□□ -0.08
C9orf85-204ENST00000473252 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
C9orf85-204ENST00000473252 USP17L6PQ6QN14 398 aa14.56□□□□□ -0.08
C9orf85-204ENST00000473252 TMEM199Q8N511 208 aa14.56□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.7 ms