RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472427.5

RALGPS1-212, Transcript of Ral GEF with PH domain and SH3 binding motif 1, humanhuman

TSL 2

Gene RALGPS1, Length 764 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALGPS1-212ENST00000472427 SGPL1O95470 568 aa24.85■■□□□ 1.57
RALGPS1-212ENST00000472427 TFRCP02786 760 aaKnown RBP24.85■■□□□ 1.57
RALGPS1-212ENST00000472427 TNFAIP2Q03169 654 aa24.85■■□□□ 1.57
RALGPS1-212ENST00000472427 KCNV1Q6PIU1 500 aa24.85■■□□□ 1.57
RALGPS1-212ENST00000472427 NLRX1Q86UT6 975 aa24.85■■□□□ 1.57
RALGPS1-212ENST00000472427 KRT2P35908 639 aa24.84■■□□□ 1.57
RALGPS1-212ENST00000472427 ADCYAP1R1P41586 468 aa24.84■■□□□ 1.57
RALGPS1-212ENST00000472427 FOSBP53539 338 aa24.84■■□□□ 1.57
RALGPS1-212ENST00000472427 SEPT14Q6ZU15 432 aa24.84■■□□□ 1.57
RALGPS1-212ENST00000472427 IL31RAQ8NI17 732 aa24.84■■□□□ 1.57
RALGPS1-212ENST00000472427 WDR11Q9BZH6 1224 aa24.84■■□□□ 1.57
RALGPS1-212ENST00000472427 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa24.84■■□□□ 1.57
RALGPS1-212ENST00000472427 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP24.83■■□□□ 1.57
RALGPS1-212ENST00000472427 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP24.83■■□□□ 1.57
RALGPS1-212ENST00000472427 ZNF76P36508 570 aa24.83■■□□□ 1.57
RALGPS1-212ENST00000472427 SREBF1P36956 1147 aa24.83■■□□□ 1.57
RALGPS1-212ENST00000472427 CUL4AQ13619 759 aa24.83■■□□□ 1.57
RALGPS1-212ENST00000472427 TAPT1Q6NXT6 567 aa24.83■■□□□ 1.57
RALGPS1-212ENST00000472427 KRT25Q7Z3Z0 450 aa24.83■■□□□ 1.57
RALGPS1-212ENST00000472427 SHISA4Q96DD7 197 aa24.83■■□□□ 1.57
RALGPS1-212ENST00000472427 CDHR1Q96JP9 859 aa24.83■■□□□ 1.57
RALGPS1-212ENST00000472427 PGBD1Q96JS3 809 aa24.83■■□□□ 1.57
RALGPS1-212ENST00000472427 AP5M1Q9H0R1 490 aa24.83■■□□□ 1.57
RALGPS1-212ENST00000472427 MRVI1Q9Y6F6 885 aa24.83■■□□□ 1.57
RALGPS1-212ENST00000472427 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa24.82■■□□□ 1.56
RALGPS1-212ENST00000472427 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP24.82■■□□□ 1.56
RALGPS1-212ENST00000472427 MMP1P03956 469 aa24.82■■□□□ 1.56
RALGPS1-212ENST00000472427 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP24.82■■□□□ 1.56
RALGPS1-212ENST00000472427 GJB2P29033 226 aa24.82■■□□□ 1.56
RALGPS1-212ENST00000472427 SOX10P56693 466 aa24.82■■□□□ 1.56
RALGPS1-212ENST00000472427 KRT40Q6A162 431 aa24.82■■□□□ 1.56
RALGPS1-212ENST00000472427 ARRDC4Q8NCT1 418 aa24.82■■□□□ 1.56
RALGPS1-212ENST00000472427 RASGRP4Q8TDF6 673 aa24.82■■□□□ 1.56
RALGPS1-212ENST00000472427 PDGFCQ9NRA1 345 aa24.82■■□□□ 1.56
RALGPS1-212ENST00000472427 TXNP10599 105 aaKnown RBP24.81■■□□□ 1.56
RALGPS1-212ENST00000472427 ARHGAP4P98171 946 aa24.81■■□□□ 1.56
RALGPS1-212ENST00000472427 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP24.81■■□□□ 1.56
RALGPS1-212ENST00000472427 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP24.81■■□□□ 1.56
RALGPS1-212ENST00000472427 ANO1Q5XXA6 986 aa24.81■■□□□ 1.56
RALGPS1-212ENST00000472427 LHX8Q68G74 356 aa24.81■■□□□ 1.56
RALGPS1-212ENST00000472427 RNF180Q86T96 592 aa24.81■■□□□ 1.56
RALGPS1-212ENST00000472427 ANKLE1Q8NAG6 615 aa24.81■■□□□ 1.56
RALGPS1-212ENST00000472427 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa24.81■■□□□ 1.56
RALGPS1-212ENST00000472427 OGDHLQ9ULD0 1010 aa24.81■■□□□ 1.56
RALGPS1-212ENST00000472427 CENPFP49454 3210 aa24.81■■□□□ 1.56
RALGPS1-212ENST00000472427 FRMPD3Q5JV73 1810 aa24.8■■□□□ 1.56
RALGPS1-212ENST00000472427 FIBPO43427 364 aa24.8■■□□□ 1.56
RALGPS1-212ENST00000472427 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP24.8■■□□□ 1.56
RALGPS1-212ENST00000472427 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP24.8■■□□□ 1.56
RALGPS1-212ENST00000472427 DUSP28Q4G0W2 176 aa24.8■■□□□ 1.56
RALGPS1-212ENST00000472427 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP24.8■■□□□ 1.56
RALGPS1-212ENST00000472427 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP24.8■■□□□ 1.56
RALGPS1-212ENST00000472427 GJB4Q9NTQ9 266 aa24.8■■□□□ 1.56
RALGPS1-212ENST00000472427 Q9Y3F1 56 aa24.8■■□□□ 1.56
RALGPS1-212ENST00000472427 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa24.8■■□□□ 1.56
RALGPS1-212ENST00000472427 POTEFA5A3E0 1075 aa24.79■■□□□ 1.56
RALGPS1-212ENST00000472427 KBTBD13C9JR72 458 aa24.79■■□□□ 1.56
RALGPS1-212ENST00000472427 TGFB3P10600 412 aa24.79■■□□□ 1.56
RALGPS1-212ENST00000472427 SMPD1P17405 629 aa24.79■■□□□ 1.56
RALGPS1-212ENST00000472427 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP24.79■■□□□ 1.56
RALGPS1-212ENST00000472427 TLK2Q86UE8 772 aa24.79■■□□□ 1.56
RALGPS1-212ENST00000472427 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP24.79■■□□□ 1.56
RALGPS1-212ENST00000472427 GPRASP2Q96D09 838 aa24.79■■□□□ 1.56
RALGPS1-212ENST00000472427 RTEL1Q9NZ71 1219 aa24.79■■□□□ 1.56
RALGPS1-212ENST00000472427 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP24.78■■□□□ 1.56
RALGPS1-212ENST00000472427 H3BQV1 296 aa24.78■■□□□ 1.56
RALGPS1-212ENST00000472427 PDCP20941 246 aa24.78■■□□□ 1.56
RALGPS1-212ENST00000472427 GUCY1B3Q02153 619 aa24.78■■□□□ 1.56
RALGPS1-212ENST00000472427 MTMR1Q13613 665 aa24.78■■□□□ 1.56
RALGPS1-212ENST00000472427 NPY5RQ15761 445 aa24.78■■□□□ 1.56
RALGPS1-212ENST00000472427 IFFO2Q5TF58 517 aa24.78■■□□□ 1.56
RALGPS1-212ENST00000472427 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa24.78■■□□□ 1.56
RALGPS1-212ENST00000472427 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa24.78■■□□□ 1.56
RALGPS1-212ENST00000472427 MAFGO15525 162 aa24.77■■□□□ 1.56
RALGPS1-212ENST00000472427 GH1P01241 217 aa24.77■■□□□ 1.56
RALGPS1-212ENST00000472427 CYP3A4P08684 503 aa24.77■■□□□ 1.56
RALGPS1-212ENST00000472427 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP24.77■■□□□ 1.56
RALGPS1-212ENST00000472427 SETQ01105 290 aaPredicted RBP24.77■■□□□ 1.56
RALGPS1-212ENST00000472427 BECN1Q14457 450 aa24.77■■□□□ 1.56
RALGPS1-212ENST00000472427 CEP55Q53EZ4 464 aa24.77■■□□□ 1.56
RALGPS1-212ENST00000472427 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP24.77■■□□□ 1.56
RALGPS1-212ENST00000472427 OR6J1Q8NGC5 347 aa24.77■■□□□ 1.56
RALGPS1-212ENST00000472427 TBCKQ8TEA7 893 aa24.77■■□□□ 1.56
RALGPS1-212ENST00000472427 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP24.77■■□□□ 1.56
RALGPS1-212ENST00000472427 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP24.77■■□□□ 1.56
RALGPS1-212ENST00000472427 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP24.77■■□□□ 1.56
RALGPS1-212ENST00000472427 MXRA8Q9BRK3 442 aa24.77■■□□□ 1.56
RALGPS1-212ENST00000472427 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP24.77■■□□□ 1.56
RALGPS1-212ENST00000472427 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa24.77■■□□□ 1.56
RALGPS1-212ENST00000472427 M0R2N6 131 aa24.76■■□□□ 1.55
RALGPS1-212ENST00000472427 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP24.76■■□□□ 1.55
RALGPS1-212ENST00000472427 ZEB2O60315 1214 aa24.76■■□□□ 1.55
RALGPS1-212ENST00000472427 EN2P19622 333 aaPredicted RBP24.76■■□□□ 1.55
RALGPS1-212ENST00000472427 ICAM3P32942 547 aa24.76■■□□□ 1.55
RALGPS1-212ENST00000472427 USP11P51784 963 aa24.76■■□□□ 1.55
RALGPS1-212ENST00000472427 GJA9P57773 515 aa24.76■■□□□ 1.55
RALGPS1-212ENST00000472427 JADE2Q9NQC1 790 aa24.76■■□□□ 1.55
RALGPS1-212ENST00000472427 DNM1LO00429 736 aa24.75■■□□□ 1.55
RALGPS1-212ENST00000472427 ADAMTS3O15072 1205 aa24.75■■□□□ 1.55
RALGPS1-212ENST00000472427 RGS20O76081 388 aa24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.3 ms