RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472398.5

TTC3-214, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 3, human

TSL 1 (best)

Gene TTC3, Length 2,305 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTC3-214	ENST00000472398	TPCN2	Q8NHX9	752 aa		3.65	□□□□□ -1.83
TTC3-214	ENST00000472398	UTP15	Q8TED0	518 aa	Known RBP	3.65	□□□□□ -1.83
TTC3-214	ENST00000472398	ANKRD24	Q8TF21	1146 aa		3.65	□□□□□ -1.83
TTC3-214	ENST00000472398	DGCR8	Q8WYQ5	773 aa	Known RBP eCLIP	3.65	□□□□□ -1.83
TTC3-214	ENST00000472398	COG8	Q96MW5	612 aa		3.65	□□□□□ -1.83
TTC3-214	ENST00000472398	ASB2	Q96Q27	587 aa		3.65	□□□□□ -1.83
TTC3-214	ENST00000472398	FAM129B	Q96TA1	746 aa		3.65	□□□□□ -1.83
TTC3-214	ENST00000472398	RMDN3	Q96TC7	470 aa		3.65	□□□□□ -1.83
TTC3-214	ENST00000472398	TAOK3	Q9H2K8	898 aa		3.65	□□□□□ -1.83
TTC3-214	ENST00000472398	DEF6	Q9H4E7	631 aa		3.65	□□□□□ -1.83
TTC3-214	ENST00000472398	SMOC1	Q9H4F8	434 aa		3.65	□□□□□ -1.83
TTC3-214	ENST00000472398	RABEP2	Q9H5N1	569 aa		3.65	□□□□□ -1.83
TTC3-214	ENST00000472398	KBTBD4	Q9NVX7	518 aa		3.65	□□□□□ -1.83
TTC3-214	ENST00000472398	FAM184B	Q9ULE4	1060 aa		3.65	□□□□□ -1.83
TTC3-214	ENST00000472398	PHLDB1	Q86UU1	1377 aa		3.65	□□□□□ -1.83
TTC3-214	ENST00000472398		A6NNZ2	444 aa		3.64	□□□□□ -1.83
TTC3-214	ENST00000472398		H3BRJ5	948 aa		3.64	□□□□□ -1.83
TTC3-214	ENST00000472398	CASQ2	O14958	399 aa	Predicted RBP	3.64	□□□□□ -1.83
TTC3-214	ENST00000472398	SMAD7	O15105	426 aa	Known RBP	3.64	□□□□□ -1.83
TTC3-214	ENST00000472398	SART1	O43290	800 aa	Known RBP	3.64	□□□□□ -1.83
TTC3-214	ENST00000472398	FRS3	O43559	492 aa		3.64	□□□□□ -1.83
TTC3-214	ENST00000472398	NDUFB5	O43674	189 aa		3.64	□□□□□ -1.83
TTC3-214	ENST00000472398	PPP1R12B	O60237	982 aa	Predicted RBP	3.64	□□□□□ -1.83
TTC3-214	ENST00000472398	NEMF	O60524	1076 aa		3.64	□□□□□ -1.83
TTC3-214	ENST00000472398	DGKI	O75912	1065 aa		3.64	□□□□□ -1.83
TTC3-214	ENST00000472398	CDKL5	O76039	1030 aa		3.64	□□□□□ -1.83
TTC3-214	ENST00000472398	FAM13A	O94988	1023 aa		3.64	□□□□□ -1.83
TTC3-214	ENST00000472398	SNX4	O95219	450 aa		3.64	□□□□□ -1.83
TTC3-214	ENST00000472398	LARGE1	O95461	756 aa		3.64	□□□□□ -1.83
TTC3-214	ENST00000472398	HSPA4L	O95757	839 aa		3.64	□□□□□ -1.83
TTC3-214	ENST00000472398	MYC	P01106	439 aa	Predicted RBP	3.64	□□□□□ -1.83
TTC3-214	ENST00000472398	PHKG2	P15735	406 aa		3.64	□□□□□ -1.83
TTC3-214	ENST00000472398	PRLR	P16471	622 aa		3.64	□□□□□ -1.83
TTC3-214	ENST00000472398	NPR3	P17342	541 aa		3.64	□□□□□ -1.83
TTC3-214	ENST00000472398	WEE1	P30291	646 aa		3.64	□□□□□ -1.83
TTC3-214	ENST00000472398	HSPA1L	P34931	641 aa		3.64	□□□□□ -1.83
TTC3-214	ENST00000472398	PHKA1	P46020	1223 aa		3.64	□□□□□ -1.83
TTC3-214	ENST00000472398	SCTR	P47872	440 aa		3.64	□□□□□ -1.83
TTC3-214	ENST00000472398	CCT5	P48643	541 aa		3.64	□□□□□ -1.83
TTC3-214	ENST00000472398	GJA9	P57773	515 aa		3.64	□□□□□ -1.83
TTC3-214	ENST00000472398	IRX1	P78414	480 aa	Predicted RBP	3.64	□□□□□ -1.83
TTC3-214	ENST00000472398	GBX1	Q14549	363 aa		3.64	□□□□□ -1.83
TTC3-214	ENST00000472398	TNIP1	Q15025	636 aa		3.64	□□□□□ -1.83
TTC3-214	ENST00000472398	SMUG1	Q53HV7	270 aa		3.64	□□□□□ -1.83
TTC3-214	ENST00000472398	OXLD1	Q5BKU9	147 aa		3.64	□□□□□ -1.83
TTC3-214	ENST00000472398	CAVIN4	Q5BKX8	364 aa		3.64	□□□□□ -1.83
TTC3-214	ENST00000472398	PERM1	Q5SV97	790 aa		3.64	□□□□□ -1.83
TTC3-214	ENST00000472398	C1orf53	Q5VUE5	145 aa		3.64	□□□□□ -1.83
TTC3-214	ENST00000472398	FAM205BP	Q63HN1	556 aa		3.64	□□□□□ -1.83
TTC3-214	ENST00000472398	MCTP2	Q6DN12	878 aa		3.64	□□□□□ -1.83
TTC3-214	ENST00000472398	NUP54	Q7Z3B4	507 aa		3.64	□□□□□ -1.83
TTC3-214	ENST00000472398	PASD1	Q8IV76	773 aa		3.64	□□□□□ -1.83
TTC3-214	ENST00000472398	PEX5L	Q8IYB4	626 aa		3.64	□□□□□ -1.83
TTC3-214	ENST00000472398	FAM186B	Q8IYM0	893 aa		3.64	□□□□□ -1.83
TTC3-214	ENST00000472398	C2orf69	Q8N8R5	385 aa		3.64	□□□□□ -1.83
TTC3-214	ENST00000472398	GOT1L1	Q8NHS2	421 aa	Predicted RBP	3.64	□□□□□ -1.83
TTC3-214	ENST00000472398	TBC1D22A	Q8WUA7	517 aa		3.64	□□□□□ -1.83
TTC3-214	ENST00000472398	CCT6B	Q92526	530 aa		3.64	□□□□□ -1.83
TTC3-214	ENST00000472398	ARL8A	Q96BM9	186 aa		3.64	□□□□□ -1.83
TTC3-214	ENST00000472398	GCC1	Q96CN9	775 aa		3.64	□□□□□ -1.83
TTC3-214	ENST00000472398	NIFK	Q9BYG3	293 aa	Known RBP	3.64	□□□□□ -1.83
TTC3-214	ENST00000472398	CCDC113	Q9H0I3	377 aa		3.64	□□□□□ -1.83
TTC3-214	ENST00000472398	ACAD9	Q9H845	621 aa		3.64	□□□□□ -1.83
TTC3-214	ENST00000472398	FBRS	Q9HAH7	460 aa		3.64	□□□□□ -1.83
TTC3-214	ENST00000472398	TRPV4	Q9HBA0	871 aa		3.64	□□□□□ -1.83
TTC3-214	ENST00000472398	HPS4	Q9NQG7	708 aa		3.64	□□□□□ -1.83
TTC3-214	ENST00000472398	STRN4	Q9NRL3	753 aa		3.64	□□□□□ -1.83
TTC3-214	ENST00000472398	DDX18	Q9NVP1	670 aa	Known RBP	3.64	□□□□□ -1.83
TTC3-214	ENST00000472398	IFT80	Q9P2H3	777 aa	Predicted RBP	3.64	□□□□□ -1.83
TTC3-214	ENST00000472398	PRKAG3	Q9UGI9	489 aa		3.64	□□□□□ -1.83
TTC3-214	ENST00000472398	GJD2	Q9UKL4	321 aa		3.64	□□□□□ -1.83
TTC3-214	ENST00000472398	LUC7L2	Q9Y383	392 aa	Known RBP	3.64	□□□□□ -1.83
TTC3-214	ENST00000472398	TTLL3	Q9Y4R7	772 aa		3.64	□□□□□ -1.83
TTC3-214	ENST00000472398	PCDHGC5	Q9Y5F6	944 aa		3.64	□□□□□ -1.83
TTC3-214	ENST00000472398	AK5	Q9Y6K8	562 aa		3.64	□□□□□ -1.83
TTC3-214	ENST00000472398	DROSHA	Q9NRR4	1374 aa	Known RBP eCLIP	3.64	□□□□□ -1.83
TTC3-214	ENST00000472398	FSD2	A1L4K1	749 aa		3.64	□□□□□ -1.83
TTC3-214	ENST00000472398	RRN3P2	A6NIE6	340 aa		3.64	□□□□□ -1.83
TTC3-214	ENST00000472398	SFI1	A8K8P3	1242 aa		3.64	□□□□□ -1.83
TTC3-214	ENST00000472398	NMT2	O60551	498 aa		3.64	□□□□□ -1.83
TTC3-214	ENST00000472398	SOCS5	O75159	536 aa		3.64	□□□□□ -1.83
TTC3-214	ENST00000472398	EPN2	O95208	641 aa		3.64	□□□□□ -1.83
TTC3-214	ENST00000472398	TBX18	O95935	607 aa		3.64	□□□□□ -1.83
TTC3-214	ENST00000472398	ASGR2	P07307	311 aa		3.64	□□□□□ -1.83
TTC3-214	ENST00000472398	MYB	P10242	640 aa		3.64	□□□□□ -1.83
TTC3-214	ENST00000472398	GUCY2C	P25092	1073 aa		3.64	□□□□□ -1.83
TTC3-214	ENST00000472398	IL6ST	P40189	918 aa	Predicted RBP	3.64	□□□□□ -1.83
TTC3-214	ENST00000472398	CCNH	P51946	323 aa	Predicted RBP	3.64	□□□□□ -1.83
TTC3-214	ENST00000472398	USP14	P54578	494 aa		3.64	□□□□□ -1.83
TTC3-214	ENST00000472398	NLRP5	P59047	1200 aa		3.64	□□□□□ -1.83
TTC3-214	ENST00000472398	ITIH3	Q06033	890 aa		3.64	□□□□□ -1.83
TTC3-214	ENST00000472398	SOS1	Q07889	1333 aa	Predicted RBP	3.64	□□□□□ -1.83
TTC3-214	ENST00000472398	FAP	Q12884	760 aa		3.64	□□□□□ -1.83
TTC3-214	ENST00000472398	IFRD2	Q12894	506 aa	Predicted RBP	3.64	□□□□□ -1.83
TTC3-214	ENST00000472398	STRN3	Q13033	797 aa		3.64	□□□□□ -1.83
TTC3-214	ENST00000472398	TRDN	Q13061	729 aa		3.64	□□□□□ -1.83
TTC3-214	ENST00000472398	RASGRF1	Q13972	1273 aa		3.64	□□□□□ -1.83
TTC3-214	ENST00000472398	RABEP1	Q15276	862 aa		3.64	□□□□□ -1.83
TTC3-214	ENST00000472398	ANKDD1A	Q495B1	522 aa		3.64	□□□□□ -1.83
TTC3-214	ENST00000472398	ZNF362	Q5T0B9	420 aa	Predicted RBP	3.64	□□□□□ -1.83

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