RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465846.6

HOXB-AS3-203, HOXB cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene HOXB-AS3, Length 434 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB-AS3-203ENST00000465846 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa21.13■□□□□ 0.97
HOXB-AS3-203ENST00000465846 PRC1O43663 620 aa21.13■□□□□ 0.97
HOXB-AS3-203ENST00000465846 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP21.13■□□□□ 0.97
HOXB-AS3-203ENST00000465846 MMP3P08254 477 aa21.13■□□□□ 0.97
HOXB-AS3-203ENST00000465846 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa21.13■□□□□ 0.97
HOXB-AS3-203ENST00000465846 CYP2C9P11712 490 aa21.13■□□□□ 0.97
HOXB-AS3-203ENST00000465846 DNAJB2P25686 324 aa21.13■□□□□ 0.97
HOXB-AS3-203ENST00000465846 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP21.13■□□□□ 0.97
HOXB-AS3-203ENST00000465846 NFRKBQ6P4R8 1299 aa21.13■□□□□ 0.97
HOXB-AS3-203ENST00000465846 CASC1Q6TDU7 716 aa21.13■□□□□ 0.97
HOXB-AS3-203ENST00000465846 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP21.13■□□□□ 0.97
HOXB-AS3-203ENST00000465846 ZNF654Q8IZM8 581 aa21.13■□□□□ 0.97
HOXB-AS3-203ENST00000465846 SAMD3Q8N6K7 520 aa21.13■□□□□ 0.97
HOXB-AS3-203ENST00000465846 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa21.13■□□□□ 0.97
HOXB-AS3-203ENST00000465846 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP21.13■□□□□ 0.97
HOXB-AS3-203ENST00000465846 PDCD2LQ9BRP1 358 aa21.13■□□□□ 0.97
HOXB-AS3-203ENST00000465846 SLC27A2O14975 620 aa21.12■□□□□ 0.97
HOXB-AS3-203ENST00000465846 DDAH1O94760 285 aa21.12■□□□□ 0.97
HOXB-AS3-203ENST00000465846 BMP2KLQ5H9B9 411 aa21.12■□□□□ 0.97
HOXB-AS3-203ENST00000465846 HERVK_113Q902F9 699 aa21.12■□□□□ 0.97
HOXB-AS3-203ENST00000465846 MTA3Q9BTC8 594 aa21.12■□□□□ 0.97
HOXB-AS3-203ENST00000465846 MYL10Q9BUA6 226 aa21.12■□□□□ 0.97
HOXB-AS3-203ENST00000465846 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP21.12■□□□□ 0.97
HOXB-AS3-203ENST00000465846 MRVI1Q9Y6F6 885 aa21.12■□□□□ 0.97
HOXB-AS3-203ENST00000465846 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP21.11■□□□□ 0.97
HOXB-AS3-203ENST00000465846 POLR2MP0CAP2 368 aa21.11■□□□□ 0.97
HOXB-AS3-203ENST00000465846 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP21.11■□□□□ 0.97
HOXB-AS3-203ENST00000465846 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP21.11■□□□□ 0.97
HOXB-AS3-203ENST00000465846 CREB3L3Q68CJ9 461 aa21.11■□□□□ 0.97
HOXB-AS3-203ENST00000465846 IL31RAQ8NI17 732 aa21.11■□□□□ 0.97
HOXB-AS3-203ENST00000465846 PIBF1Q8WXW3 757 aa21.11■□□□□ 0.97
HOXB-AS3-203ENST00000465846 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP21.11■□□□□ 0.97
HOXB-AS3-203ENST00000465846 SCLYQ96I15 445 aa21.11■□□□□ 0.97
HOXB-AS3-203ENST00000465846 MAP3K14Q99558 947 aa21.11■□□□□ 0.97
HOXB-AS3-203ENST00000465846 ANO2Q9NQ90 1003 aa21.11■□□□□ 0.97
HOXB-AS3-203ENST00000465846 TANC1Q9C0D5 1861 aa21.11■□□□□ 0.97
HOXB-AS3-203ENST00000465846 CHD7Q9P2D1 2997 aa21.11■□□□□ 0.97
HOXB-AS3-203ENST00000465846 VCANP13611 3396 aa21.11■□□□□ 0.97
HOXB-AS3-203ENST00000465846 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP21.1■□□□□ 0.97
HOXB-AS3-203ENST00000465846 FGBP02675 491 aa21.1■□□□□ 0.97
HOXB-AS3-203ENST00000465846 MCM5P33992 734 aa21.1■□□□□ 0.97
HOXB-AS3-203ENST00000465846 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP21.1■□□□□ 0.97
HOXB-AS3-203ENST00000465846 PGM5Q15124 567 aa21.1■□□□□ 0.97
HOXB-AS3-203ENST00000465846 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP21.1■□□□□ 0.97
HOXB-AS3-203ENST00000465846 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP21.1■□□□□ 0.97
HOXB-AS3-203ENST00000465846 MYLIPQ8WY64 445 aa21.1■□□□□ 0.97
HOXB-AS3-203ENST00000465846 TMEM87BQ96K49 555 aa21.1■□□□□ 0.97
HOXB-AS3-203ENST00000465846 SPZ1Q9BXG8 430 aa21.1■□□□□ 0.97
HOXB-AS3-203ENST00000465846 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP21.1■□□□□ 0.97
HOXB-AS3-203ENST00000465846 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP21.1■□□□□ 0.97
HOXB-AS3-203ENST00000465846 GRXCR1A8MXD5 290 aa21.09■□□□□ 0.97
HOXB-AS3-203ENST00000465846 RGS20O76081 388 aa21.09■□□□□ 0.97
HOXB-AS3-203ENST00000465846 KIF5BP33176 963 aa21.09■□□□□ 0.97
HOXB-AS3-203ENST00000465846 CHMP4BP1P59074 171 aa21.09■□□□□ 0.97
HOXB-AS3-203ENST00000465846 NECTIN1Q15223 517 aa21.09■□□□□ 0.97
HOXB-AS3-203ENST00000465846 NFXL1Q6ZNB6 911 aa21.09■□□□□ 0.97
HOXB-AS3-203ENST00000465846 FCHSD1Q86WN1 690 aa21.09■□□□□ 0.97
HOXB-AS3-203ENST00000465846 TIFAQ96CG3 184 aa21.09■□□□□ 0.97
HOXB-AS3-203ENST00000465846 VWCEQ96DN2 955 aa21.09■□□□□ 0.97
HOXB-AS3-203ENST00000465846 PBX4Q9BYU1 374 aa21.09■□□□□ 0.97
HOXB-AS3-203ENST00000465846 CCDC69A6NI79 296 aa21.08■□□□□ 0.97
HOXB-AS3-203ENST00000465846 CASTP20810 708 aaKnown RBP21.08■□□□□ 0.97
HOXB-AS3-203ENST00000465846 CCND2P30279 289 aa21.08■□□□□ 0.97
HOXB-AS3-203ENST00000465846 PBX2P40425 430 aa21.08■□□□□ 0.97
HOXB-AS3-203ENST00000465846 SCN5AQ14524 2016 aa21.08■□□□□ 0.97
HOXB-AS3-203ENST00000465846 DGKDQ16760 1214 aa21.08■□□□□ 0.97
HOXB-AS3-203ENST00000465846 OTOP2Q7RTS6 562 aa21.08■□□□□ 0.97
HOXB-AS3-203ENST00000465846 VSIG10LQ86VR7 867 aa21.08■□□□□ 0.97
HOXB-AS3-203ENST00000465846 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP21.08■□□□□ 0.97
HOXB-AS3-203ENST00000465846 PPTC7Q8NI37 304 aa21.08■□□□□ 0.97
HOXB-AS3-203ENST00000465846 KAT2BQ92831 832 aa21.08■□□□□ 0.97
HOXB-AS3-203ENST00000465846 MYH7BA7E2Y1 1941 aa21.08■□□□□ 0.96
HOXB-AS3-203ENST00000465846 FRMPD4Q14CM0 1322 aa21.07■□□□□ 0.96
HOXB-AS3-203ENST00000465846 PLEKHA8P1O95397 391 aa21.07■□□□□ 0.96
HOXB-AS3-203ENST00000465846 LAMC2Q13753 1193 aa21.07■□□□□ 0.96
HOXB-AS3-203ENST00000465846 KCNV1Q6PIU1 500 aa21.07■□□□□ 0.96
HOXB-AS3-203ENST00000465846 SESTD1Q86VW0 696 aa21.07■□□□□ 0.96
HOXB-AS3-203ENST00000465846 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP21.07■□□□□ 0.96
HOXB-AS3-203ENST00000465846 TMTC2Q8N394 836 aa21.07■□□□□ 0.96
HOXB-AS3-203ENST00000465846 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP21.07■□□□□ 0.96
HOXB-AS3-203ENST00000465846 NOD1Q9Y239 953 aa21.07■□□□□ 0.96
HOXB-AS3-203ENST00000465846 GBF1Q92538 1859 aa21.07■□□□□ 0.96
HOXB-AS3-203ENST00000465846 PFKMP08237 780 aa21.06■□□□□ 0.96
HOXB-AS3-203ENST00000465846 FOSL2P15408 326 aa21.06■□□□□ 0.96
HOXB-AS3-203ENST00000465846 RXRAP19793 462 aa21.06■□□□□ 0.96
HOXB-AS3-203ENST00000465846 SMARCA1P28370 1054 aa21.06■□□□□ 0.96
HOXB-AS3-203ENST00000465846 LIFRP42702 1097 aa21.06■□□□□ 0.96
HOXB-AS3-203ENST00000465846 LZTS2Q9BRK4 669 aa21.06■□□□□ 0.96
HOXB-AS3-203ENST00000465846 LRRC2Q9BYS8 371 aa21.06■□□□□ 0.96
HOXB-AS3-203ENST00000465846 ZNF576Q9H609 170 aa21.06■□□□□ 0.96
HOXB-AS3-203ENST00000465846 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP21.06■□□□□ 0.96
HOXB-AS3-203ENST00000465846 SORBS3O60504 671 aa21.05■□□□□ 0.96
HOXB-AS3-203ENST00000465846 F2P00734 622 aa21.05■□□□□ 0.96
HOXB-AS3-203ENST00000465846 ZNF286BP0CG31 522 aa21.05■□□□□ 0.96
HOXB-AS3-203ENST00000465846 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP21.05■□□□□ 0.96
HOXB-AS3-203ENST00000465846 GNAQP50148 359 aa21.05■□□□□ 0.96
HOXB-AS3-203ENST00000465846 BFSP2Q13515 415 aa21.05■□□□□ 0.96
HOXB-AS3-203ENST00000465846 GRIN2CQ14957 1233 aa21.05■□□□□ 0.96
HOXB-AS3-203ENST00000465846 PTGISQ16647 500 aa21.05■□□□□ 0.96
HOXB-AS3-203ENST00000465846 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.2 ms