RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462721.5

DMKN-222, Transcript of dermokine, human

TSL 1 (best)

Gene DMKN, Length 970 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DMKN-222	ENST00000462721	JAKMIP1	Q96N16	626 aa	Known RBP	12.97	□□□□□ -0.33
DMKN-222	ENST00000462721	TRPV6	Q9H1D0	765 aa		12.97	□□□□□ -0.33
DMKN-222	ENST00000462721	PSTPIP2	Q9H939	334 aa		12.97	□□□□□ -0.33
DMKN-222	ENST00000462721	SNX14	Q9Y5W7	946 aa		12.97	□□□□□ -0.33
DMKN-222	ENST00000462721	hCG_1642624	A0A1W2PR95	340 aa		12.96	□□□□□ -0.33
DMKN-222	ENST00000462721	PIK3CD	O00329	1044 aa		12.96	□□□□□ -0.33
DMKN-222	ENST00000462721	MEIS2	O14770	477 aa		12.96	□□□□□ -0.33
DMKN-222	ENST00000462721	ZBTB43	O43298	467 aa		12.96	□□□□□ -0.33
DMKN-222	ENST00000462721	TGFB3	P10600	412 aa		12.96	□□□□□ -0.33
DMKN-222	ENST00000462721	CPA1	P15085	419 aa		12.96	□□□□□ -0.33
DMKN-222	ENST00000462721	CCND2	P30279	289 aa		12.96	□□□□□ -0.33
DMKN-222	ENST00000462721	EPHB4	P54760	987 aa		12.96	□□□□□ -0.33
DMKN-222	ENST00000462721	FGD1	P98174	961 aa		12.96	□□□□□ -0.33
DMKN-222	ENST00000462721	FPGS	Q05932	587 aa		12.96	□□□□□ -0.33
DMKN-222	ENST00000462721	ARHGAP1	Q07960	439 aa		12.96	□□□□□ -0.33
DMKN-222	ENST00000462721	LAMC2	Q13753	1193 aa		12.96	□□□□□ -0.33
DMKN-222	ENST00000462721	NBPF20	Q3BBV1	942 aa		12.96	□□□□□ -0.33
DMKN-222	ENST00000462721	C9orf50	Q5SZB4	431 aa		12.96	□□□□□ -0.33
DMKN-222	ENST00000462721	MFSD5	Q6N075	450 aa		12.96	□□□□□ -0.33
DMKN-222	ENST00000462721	USP17L6P	Q6QN14	398 aa		12.96	□□□□□ -0.33
DMKN-222	ENST00000462721	SMARCC2	Q8TAQ2	1214 aa		12.96	□□□□□ -0.33
DMKN-222	ENST00000462721	CUL5	Q93034	780 aa		12.96	□□□□□ -0.33
DMKN-222	ENST00000462721	RBM28	Q9NW13	759 aa	Known RBP	12.96	□□□□□ -0.33
DMKN-222	ENST00000462721	MRVI1	Q9Y6F6	885 aa		12.96	□□□□□ -0.33
DMKN-222	ENST00000462721		V9GY48	417 aa	Predicted RBP	12.96	□□□□□ -0.33
DMKN-222	ENST00000462721	FRMPD3	Q5JV73	1810 aa		12.96	□□□□□ -0.33
DMKN-222	ENST00000462721	MCM3AP	O60318	1980 aa		12.95	□□□□□ -0.34
DMKN-222	ENST00000462721	KLF18	A0A0U1RQI7	1052 aa		12.95	□□□□□ -0.34
DMKN-222	ENST00000462721	EPB41L2	O43491	1005 aa	Known RBP	12.95	□□□□□ -0.34
DMKN-222	ENST00000462721	B4GALT4	O60513	344 aa		12.95	□□□□□ -0.34
DMKN-222	ENST00000462721	CAST	P20810	708 aa	Known RBP	12.95	□□□□□ -0.34
DMKN-222	ENST00000462721	PSMA5	P28066	241 aa		12.95	□□□□□ -0.34
DMKN-222	ENST00000462721	FUT2	Q10981	343 aa		12.95	□□□□□ -0.34
DMKN-222	ENST00000462721	RTN1	Q16799	776 aa		12.95	□□□□□ -0.34
DMKN-222	ENST00000462721	GPR153	Q6NV75	609 aa		12.95	□□□□□ -0.34
DMKN-222	ENST00000462721	BLOC1S2	Q6QNY1	142 aa		12.95	□□□□□ -0.34
DMKN-222	ENST00000462721		Q6ZUG5	572 aa		12.95	□□□□□ -0.34
DMKN-222	ENST00000462721	DHX37	Q8IY37	1157 aa	Known RBP	12.95	□□□□□ -0.34
DMKN-222	ENST00000462721	IL31RA	Q8NI17	732 aa		12.95	□□□□□ -0.34
DMKN-222	ENST00000462721	EMID1	Q96A84	441 aa	Predicted RBP	12.95	□□□□□ -0.34
DMKN-222	ENST00000462721	USP26	Q9BXU7	913 aa		12.95	□□□□□ -0.34
DMKN-222	ENST00000462721	ALDH8A1	Q9H2A2	487 aa	Predicted RBP	12.95	□□□□□ -0.34
DMKN-222	ENST00000462721	FAM217B	Q9NTX9	383 aa	Predicted RBP	12.95	□□□□□ -0.34
DMKN-222	ENST00000462721	RTEL1	Q9NZ71	1219 aa		12.95	□□□□□ -0.34
DMKN-222	ENST00000462721	PPFIA4	O75335	1185 aa		12.94	□□□□□ -0.34
DMKN-222	ENST00000462721	STAM2	O75886	525 aa		12.94	□□□□□ -0.34
DMKN-222	ENST00000462721	MMP3	P08254	477 aa		12.94	□□□□□ -0.34
DMKN-222	ENST00000462721	SUPT20HL2	P0C7V6	817 aa		12.94	□□□□□ -0.34
DMKN-222	ENST00000462721	MRPS9	P82933	396 aa	Known RBP	12.94	□□□□□ -0.34
DMKN-222	ENST00000462721	SP2	Q02086	613 aa		12.94	□□□□□ -0.34
DMKN-222	ENST00000462721	DGKD	Q16760	1214 aa		12.94	□□□□□ -0.34
DMKN-222	ENST00000462721	MYSM1	Q5VVJ2	828 aa		12.94	□□□□□ -0.34
DMKN-222	ENST00000462721	XRRA1	Q6P2D8	792 aa		12.94	□□□□□ -0.34
DMKN-222	ENST00000462721	NFRKB	Q6P4R8	1299 aa		12.94	□□□□□ -0.34
DMKN-222	ENST00000462721	FBXL16	Q8N461	479 aa		12.94	□□□□□ -0.34
DMKN-222	ENST00000462721	TMEM199	Q8N511	208 aa		12.94	□□□□□ -0.34
DMKN-222	ENST00000462721	PPP1R12C	Q9BZL4	782 aa		12.94	□□□□□ -0.34
DMKN-222	ENST00000462721	TRMT13	Q9NUP7	481 aa	Known RBP	12.94	□□□□□ -0.34
DMKN-222	ENST00000462721	NAP1L2	Q9ULW6	460 aa	Predicted RBP	12.94	□□□□□ -0.34
DMKN-222	ENST00000462721	GOLGA8A	A7E2F4	631 aa		12.93	□□□□□ -0.34
DMKN-222	ENST00000462721	GOLGA8B	A8MQT2	603 aa		12.93	□□□□□ -0.34
DMKN-222	ENST00000462721	SPATA31C2	B4DYI2	1134 aa		12.93	□□□□□ -0.34
DMKN-222	ENST00000462721	RPS6KB1	P23443	525 aa		12.93	□□□□□ -0.34
DMKN-222	ENST00000462721	CDC27	P30260	824 aa		12.93	□□□□□ -0.34
DMKN-222	ENST00000462721	CYP2C18	P33260	490 aa		12.93	□□□□□ -0.34
DMKN-222	ENST00000462721	ADD1	P35611	737 aa	Known RBP	12.93	□□□□□ -0.34
DMKN-222	ENST00000462721	RCAN1	P53805	252 aa		12.93	□□□□□ -0.34
DMKN-222	ENST00000462721	CHMP4BP1	P59074	171 aa		12.93	□□□□□ -0.34
DMKN-222	ENST00000462721	PTPN11	Q06124	597 aa	Predicted RBP	12.93	□□□□□ -0.34
DMKN-222	ENST00000462721	APOBR	Q0VD83	1088 aa		12.93	□□□□□ -0.34
DMKN-222	ENST00000462721	CELF3	Q5SZQ8	465 aa	Known RBP	12.93	□□□□□ -0.34
DMKN-222	ENST00000462721	C16orf59	Q7L2K0	433 aa		12.93	□□□□□ -0.34
DMKN-222	ENST00000462721	HEATR3	Q7Z4Q2	680 aa		12.93	□□□□□ -0.34
DMKN-222	ENST00000462721	PPTC7	Q8NI37	304 aa		12.93	□□□□□ -0.34
DMKN-222	ENST00000462721	GPKOW	Q92917	476 aa	Predicted RBP eCLIP	12.93	□□□□□ -0.34
DMKN-222	ENST00000462721	BRF1	Q92994	677 aa		12.93	□□□□□ -0.34
DMKN-222	ENST00000462721	HIPK3	Q9H422	1215 aa		12.93	□□□□□ -0.34
DMKN-222	ENST00000462721	BAZ2B	Q9UIF8	2168 aa	Known RBP	12.93	□□□□□ -0.34
DMKN-222	ENST00000462721	FRMPD4	Q14CM0	1322 aa		12.92	□□□□□ -0.34
DMKN-222	ENST00000462721	LAMA3	Q16787	3333 aa		12.92	□□□□□ -0.34
DMKN-222	ENST00000462721	SZT2	Q5T011	3432 aa		12.92	□□□□□ -0.34
DMKN-222	ENST00000462721	CCDC196	A0A1B0GTZ2	297 aa		12.92	□□□□□ -0.34
DMKN-222	ENST00000462721	GGPS1	O95749	300 aa		12.92	□□□□□ -0.34
DMKN-222	ENST00000462721	CSF2RA	P15509	400 aa		12.92	□□□□□ -0.34
DMKN-222	ENST00000462721	ICAM3	P32942	547 aa		12.92	□□□□□ -0.34
DMKN-222	ENST00000462721	PPIG	Q13427	754 aa	Known RBP eCLIP	12.92	□□□□□ -0.34	9e-6	■■□□□ 12.8
DMKN-222	ENST00000462721	GNPTAB	Q3T906	1256 aa		12.92	□□□□□ -0.34
DMKN-222	ENST00000462721	FAM47C	Q5HY64	1035 aa		12.92	□□□□□ -0.34
DMKN-222	ENST00000462721	PCNX4	Q63HM2	1172 aa		12.92	□□□□□ -0.34
DMKN-222	ENST00000462721	PPP1R13L	Q8WUF5	828 aa		12.92	□□□□□ -0.34
DMKN-222	ENST00000462721	KAT2B	Q92831	832 aa		12.92	□□□□□ -0.34
DMKN-222	ENST00000462721	SPATA33	Q96N06	139 aa		12.92	□□□□□ -0.34
DMKN-222	ENST00000462721	INPP4A	Q96PE3	977 aa	Predicted RBP	12.92	□□□□□ -0.34
DMKN-222	ENST00000462721	NOC4L	Q9BVI4	516 aa	Known RBP	12.92	□□□□□ -0.34
DMKN-222	ENST00000462721	BCAS3	Q9H6U6	928 aa		12.92	□□□□□ -0.34
DMKN-222	ENST00000462721	MLXIP	Q9HAP2	919 aa		12.92	□□□□□ -0.34
DMKN-222	ENST00000462721	ZSWIM6	Q9HCJ5	1215 aa		12.92	□□□□□ -0.34
DMKN-222	ENST00000462721	LCT	P09848	1927 aa		12.92	□□□□□ -0.34
DMKN-222	ENST00000462721	SORBS3	O60504	671 aa		12.91	□□□□□ -0.34
DMKN-222	ENST00000462721	CYP2C9	P11712	490 aa		12.91	□□□□□ -0.34

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