RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460120.5

HPS3-202, Transcript of HPS3, biogenesis of lysosomal organelles complex 2 subunit 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HPS3, Length 2,745 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS3-202ENST00000460120 ESYT2A0FGR8 921 aa20.18■□□□□ 0.82
HPS3-202ENST00000460120 HLA-DOAP06340 250 aa20.18■□□□□ 0.82
HPS3-202ENST00000460120 ZBED6P86452 979 aa20.18■□□□□ 0.82
HPS3-202ENST00000460120 APBA1Q02410 837 aa20.18■□□□□ 0.82
HPS3-202ENST00000460120 USH1GQ495M9 461 aa20.18■□□□□ 0.82
HPS3-202ENST00000460120 CAGE1Q8TC20 777 aa20.18■□□□□ 0.82
HPS3-202ENST00000460120 NDST4Q9H3R1 872 aa20.18■□□□□ 0.82
HPS3-202ENST00000460120 HAUS4Q9H6D7 363 aa20.18■□□□□ 0.82
HPS3-202ENST00000460120 RIC8AQ9NPQ8 531 aa20.18■□□□□ 0.82
HPS3-202ENST00000460120 GDF11O95390 407 aa20.18■□□□□ 0.82
HPS3-202ENST00000460120 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP20.18■□□□□ 0.82
HPS3-202ENST00000460120 MRPS25P82663 173 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
HPS3-202ENST00000460120 AMPD2Q01433 879 aa20.18■□□□□ 0.82
HPS3-202ENST00000460120 VWA3BQ502W6 1294 aa20.18■□□□□ 0.82
HPS3-202ENST00000460120 RRAGAQ7L523 313 aa20.18■□□□□ 0.82
HPS3-202ENST00000460120 TEKT1Q969V4 418 aa20.18■□□□□ 0.82
HPS3-202ENST00000460120 DEF6Q9H4E7 631 aa20.18■□□□□ 0.82
HPS3-202ENST00000460120 JADE2Q9NQC1 790 aa20.18■□□□□ 0.82
HPS3-202ENST00000460120 PCDHA12Q9UN75 941 aa20.18■□□□□ 0.82
HPS3-202ENST00000460120 KIAA1024Q9UPX6 916 aa20.18■□□□□ 0.82
HPS3-202ENST00000460120 H3BQF6 201 aa20.17■□□□□ 0.82
HPS3-202ENST00000460120 KRT83P78385 493 aa20.17■□□□□ 0.82
HPS3-202ENST00000460120 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
HPS3-202ENST00000460120 NLRC4Q9NPP4 1024 aa20.17■□□□□ 0.82
HPS3-202ENST00000460120 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa20.17■□□□□ 0.82
HPS3-202ENST00000460120 POTEB3A0JP26 581 aa20.17■□□□□ 0.82
HPS3-202ENST00000460120 CCDC151A5D8V7 595 aa20.17■□□□□ 0.82
HPS3-202ENST00000460120 POTECB2RU33 542 aa20.17■□□□□ 0.82
HPS3-202ENST00000460120 ZNF263O14978 683 aa20.17■□□□□ 0.82
HPS3-202ENST00000460120 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa20.17■□□□□ 0.82
HPS3-202ENST00000460120 CENPPQ6IPU0 288 aa20.17■□□□□ 0.82
HPS3-202ENST00000460120 POTEBQ6S5H4 581 aa20.17■□□□□ 0.82
HPS3-202ENST00000460120 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
HPS3-202ENST00000460120 CRACR2AQ9BSW2 395 aa20.17■□□□□ 0.82
HPS3-202ENST00000460120 MLXIPQ9HAP2 919 aa20.17■□□□□ 0.82
HPS3-202ENST00000460120 PDE11AQ9HCR9 933 aa20.17■□□□□ 0.82
HPS3-202ENST00000460120 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa20.16■□□□□ 0.82
HPS3-202ENST00000460120 ZBTB5O15062 677 aa20.16■□□□□ 0.82
HPS3-202ENST00000460120 KRT86O43790 486 aa20.16■□□□□ 0.82
HPS3-202ENST00000460120 KIF20AO95235 890 aa20.16■□□□□ 0.82
HPS3-202ENST00000460120 SNHG28P0DPA3 235 aa20.16■□□□□ 0.82
HPS3-202ENST00000460120 SMARCA1P28370 1054 aa20.16■□□□□ 0.82
HPS3-202ENST00000460120 SLC1A4P43007 532 aa20.16■□□□□ 0.82
HPS3-202ENST00000460120 NEK11Q8NG66 645 aa20.16■□□□□ 0.82
HPS3-202ENST00000460120 DNAJC18Q9H819 358 aa20.16■□□□□ 0.82
HPS3-202ENST00000460120 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa20.16■□□□□ 0.82
HPS3-202ENST00000460120 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
HPS3-202ENST00000460120 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
HPS3-202ENST00000460120 EEF2P13639 858 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
HPS3-202ENST00000460120 NOVP48745 357 aa20.16■□□□□ 0.82
HPS3-202ENST00000460120 QRICH1Q2TAL8 776 aa20.16■□□□□ 0.82
HPS3-202ENST00000460120 PROM2Q8N271 834 aa20.16■□□□□ 0.82
HPS3-202ENST00000460120 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
HPS3-202ENST00000460120 STK17AQ9UEE5 414 aa20.16■□□□□ 0.82
HPS3-202ENST00000460120 SAR1BQ9Y6B6 198 aa20.16■□□□□ 0.82
HPS3-202ENST00000460120 LY75O60449 1722 aa20.16■□□□□ 0.82
HPS3-202ENST00000460120 LRRC53A6NM62 1247 aa20.15■□□□□ 0.82
HPS3-202ENST00000460120 TRAF5O00463 557 aa20.15■□□□□ 0.82
HPS3-202ENST00000460120 MEIS1O00470 390 aa20.15■□□□□ 0.82
HPS3-202ENST00000460120 PHACTR2O75167 634 aa20.15■□□□□ 0.82
HPS3-202ENST00000460120 CRKP46108 304 aa20.15■□□□□ 0.82
HPS3-202ENST00000460120 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
HPS3-202ENST00000460120 COASYQ13057 564 aa20.15■□□□□ 0.82
HPS3-202ENST00000460120 BRD3Q15059 726 aa20.15■□□□□ 0.82
HPS3-202ENST00000460120 MEA1Q16626 185 aa20.15■□□□□ 0.82
HPS3-202ENST00000460120 NUP58Q9BVL2 599 aa20.15■□□□□ 0.82
HPS3-202ENST00000460120 MYO1AQ9UBC5 1043 aa20.15■□□□□ 0.82
HPS3-202ENST00000460120 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
HPS3-202ENST00000460120 DNA2P51530 1060 aa20.15■□□□□ 0.82
HPS3-202ENST00000460120 SPA17Q15506 151 aa20.15■□□□□ 0.82
HPS3-202ENST00000460120 CCDC40Q4G0X9 1142 aa20.15■□□□□ 0.82
HPS3-202ENST00000460120 BEND6Q5SZJ8 279 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
HPS3-202ENST00000460120 GSPT2Q8IYD1 628 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
HPS3-202ENST00000460120 TRIM34Q9BYJ4 488 aa20.15■□□□□ 0.82
HPS3-202ENST00000460120 PANK4Q9NVE7 773 aa20.15■□□□□ 0.82
HPS3-202ENST00000460120 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa20.15■□□□□ 0.82
HPS3-202ENST00000460120 KRT18P05783 430 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.82
HPS3-202ENST00000460120 ARID5AQ03989 594 aa20.14■□□□□ 0.82
HPS3-202ENST00000460120 SEPT2Q15019 361 aa20.14■□□□□ 0.82
HPS3-202ENST00000460120 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa20.14■□□□□ 0.82
HPS3-202ENST00000460120 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa20.14■□□□□ 0.82
HPS3-202ENST00000460120 SLC30A10Q6XR72 485 aa20.14■□□□□ 0.81
HPS3-202ENST00000460120 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa20.14■□□□□ 0.81
HPS3-202ENST00000460120 ZBTB22O15209 634 aa20.13■□□□□ 0.81
HPS3-202ENST00000460120 AKR1B10O60218 316 aa20.13■□□□□ 0.81
HPS3-202ENST00000460120 MOCS3O95396 460 aa20.13■□□□□ 0.81
HPS3-202ENST00000460120 CXCR5P32302 372 aa20.13■□□□□ 0.81
HPS3-202ENST00000460120 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP20.13■□□□□ 0.81
HPS3-202ENST00000460120 KIF5AQ12840 1032 aa20.13■□□□□ 0.81
HPS3-202ENST00000460120 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa20.13■□□□□ 0.81
HPS3-202ENST00000460120 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
HPS3-202ENST00000460120 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
HPS3-202ENST00000460120 SWAP70Q9UH65 585 aa20.13■□□□□ 0.81
HPS3-202ENST00000460120 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
HPS3-202ENST00000460120 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa20.13■□□□□ 0.81
HPS3-202ENST00000460120 POTEFA5A3E0 1075 aa20.13■□□□□ 0.81
HPS3-202ENST00000460120 PSMD14O00487 310 aa20.13■□□□□ 0.81
HPS3-202ENST00000460120 POTEIP0CG38 1075 aa20.13■□□□□ 0.81
HPS3-202ENST00000460120 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
HPS3-202ENST00000460120 C2orf54Q08AI8 447 aa20.13■□□□□ 0.81
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