RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000456317.1

TTPAL-204, Transcript of alpha tocopherol transfer protein like, humanhuman

TSL 2

Gene TTPAL, Length 926 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAL-204ENST00000456317 AFAP1L1Q8TED9 768 aa9.46□□□□□ -0.9
TTPAL-204ENST00000456317 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP9.46□□□□□ -0.9
TTPAL-204ENST00000456317 VCPKMTQ9H867 229 aa9.46□□□□□ -0.9
TTPAL-204ENST00000456317 FBXO28Q9NVF7 368 aa9.46□□□□□ -0.9
TTPAL-204ENST00000456317 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa9.46□□□□□ -0.9
TTPAL-204ENST00000456317 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa9.46□□□□□ -0.9
TTPAL-204ENST00000456317 Q9Y3F1 56 aa9.46□□□□□ -0.9
TTPAL-204ENST00000456317 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa9.46□□□□□ -0.9
TTPAL-204ENST00000456317 SPTBN2O15020 2390 aa9.46□□□□□ -0.9
TTPAL-204ENST00000456317 PARP14Q460N5 1801 aa9.45□□□□□ -0.9
TTPAL-204ENST00000456317 ASB14A6NK59 587 aa9.45□□□□□ -0.9
TTPAL-204ENST00000456317 LINC01565O15544 149 aa9.45□□□□□ -0.9
TTPAL-204ENST00000456317 EYA4O95677 639 aa9.45□□□□□ -0.9
TTPAL-204ENST00000456317 SELPP16109 830 aa9.45□□□□□ -0.9
TTPAL-204ENST00000456317 PTGS1P23219 599 aa9.45□□□□□ -0.9
TTPAL-204ENST00000456317 CTNNB1P35222 781 aa9.45□□□□□ -0.9
TTPAL-204ENST00000456317 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP9.45□□□□□ -0.9
TTPAL-204ENST00000456317 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP9.45□□□□□ -0.9
TTPAL-204ENST00000456317 ICA1Q05084 483 aa9.45□□□□□ -0.9
TTPAL-204ENST00000456317 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP9.45□□□□□ -0.9
TTPAL-204ENST00000456317 IQSEC1Q6DN90 963 aa9.45□□□□□ -0.9
TTPAL-204ENST00000456317 TMEM179Q6ZVK1 233 aa9.45□□□□□ -0.9
TTPAL-204ENST00000456317 LRRC8DQ7L1W4 858 aa9.45□□□□□ -0.9
TTPAL-204ENST00000456317 CPXCR1Q8N123 301 aa9.45□□□□□ -0.9
TTPAL-204ENST00000456317 CYP2W1Q8TAV3 490 aa9.45□□□□□ -0.9
TTPAL-204ENST00000456317 FASNP49327 2511 aaKnown RBP9.45□□□□□ -0.9
TTPAL-204ENST00000456317 NLRC5Q86WI3 1866 aa9.45□□□□□ -0.9
TTPAL-204ENST00000456317 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP9.44□□□□□ -0.9
TTPAL-204ENST00000456317 CPT1AP50416 773 aa9.44□□□□□ -0.9
TTPAL-204ENST00000456317 ADAM15Q13444 863 aa9.44□□□□□ -0.9
TTPAL-204ENST00000456317 ANGPT1Q15389 498 aa9.44□□□□□ -0.9
TTPAL-204ENST00000456317 NFRKBQ6P4R8 1299 aa9.44□□□□□ -0.9
TTPAL-204ENST00000456317 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa9.44□□□□□ -0.9
TTPAL-204ENST00000456317 EEPD1Q7L9B9 569 aa9.44□□□□□ -0.9
TTPAL-204ENST00000456317 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa9.44□□□□□ -0.9
TTPAL-204ENST00000456317 KATNBL1Q9H079 304 aa9.44□□□□□ -0.9
TTPAL-204ENST00000456317 LMAN2LQ9H0V9 348 aa9.44□□□□□ -0.9
TTPAL-204ENST00000456317 FBXO40Q9UH90 709 aa9.44□□□□□ -0.9
TTPAL-204ENST00000456317 TMX2Q9Y320 296 aa9.44□□□□□ -0.9
TTPAL-204ENST00000456317 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP9.44□□□□□ -0.9
TTPAL-204ENST00000456317 RIPK3Q9Y572 518 aa9.44□□□□□ -0.9
TTPAL-204ENST00000456317 CEP250Q9BV73 2442 aa9.43□□□□□ -0.9
TTPAL-204ENST00000456317 MICAL3Q7RTP6 2002 aa9.43□□□□□ -0.9
TTPAL-204ENST00000456317 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP9.43□□□□□ -0.9
TTPAL-204ENST00000456317 PURAQ00577 322 aaKnown RBP9.43□□□□□ -0.9
TTPAL-204ENST00000456317 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP9.43□□□□□ -0.9
TTPAL-204ENST00000456317 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP9.43□□□□□ -0.9
TTPAL-204ENST00000456317 MTMR3Q13615 1198 aa9.43□□□□□ -0.9
TTPAL-204ENST00000456317 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP9.43□□□□□ -0.9
TTPAL-204ENST00000456317 PTGISQ16647 500 aa9.43□□□□□ -0.9
TTPAL-204ENST00000456317 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP9.43□□□□□ -0.9
TTPAL-204ENST00000456317 ADGRA1Q86SQ6 560 aa9.43□□□□□ -0.9
TTPAL-204ENST00000456317 CERS3Q8IU89 383 aa9.43□□□□□ -0.9
TTPAL-204ENST00000456317 UBALD2Q8IYN6 164 aa9.43□□□□□ -0.9
TTPAL-204ENST00000456317 SMRP1Q8NCR6 262 aa9.43□□□□□ -0.9
TTPAL-204ENST00000456317 REPS2Q8NFH8 660 aa9.43□□□□□ -0.9
TTPAL-204ENST00000456317 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP9.43□□□□□ -0.9
TTPAL-204ENST00000456317 RUBCNQ92622 972 aa9.43□□□□□ -0.9
TTPAL-204ENST00000456317 MSLNLQ96KJ4 702 aa9.43□□□□□ -0.9
TTPAL-204ENST00000456317 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP9.43□□□□□ -0.9
TTPAL-204ENST00000456317 GOPCQ9HD26 462 aa9.43□□□□□ -0.9
TTPAL-204ENST00000456317 PDGFCQ9NRA1 345 aa9.43□□□□□ -0.9
TTPAL-204ENST00000456317 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP9.43□□□□□ -0.9
TTPAL-204ENST00000456317 RAD50Q92878 1312 aa9.42□□□□□ -0.9
TTPAL-204ENST00000456317 FANCIQ9NVI1 1328 aa9.42□□□□□ -0.9
TTPAL-204ENST00000456317 USP17L12C9JPN9 530 aa9.42□□□□□ -0.9
TTPAL-204ENST00000456317 USP17L21D6R901 530 aa9.42□□□□□ -0.9
TTPAL-204ENST00000456317 NBNO60934 754 aa9.42□□□□□ -0.9
TTPAL-204ENST00000456317 ZBED4O75132 1171 aa9.42□□□□□ -0.9
TTPAL-204ENST00000456317 UPP2O95045 317 aa9.42□□□□□ -0.9
TTPAL-204ENST00000456317 CXCL10P02778 98 aa9.42□□□□□ -0.9
TTPAL-204ENST00000456317 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa9.42□□□□□ -0.9
TTPAL-204ENST00000456317 CYP7A1P22680 504 aa9.42□□□□□ -0.9
TTPAL-204ENST00000456317 PLCD1P51178 756 aa9.42□□□□□ -0.9
TTPAL-204ENST00000456317 CLCN5P51795 746 aa9.42□□□□□ -0.9
TTPAL-204ENST00000456317 ATXN1P54253 815 aaKnown RBP9.42□□□□□ -0.9
TTPAL-204ENST00000456317 CNTN2Q02246 1040 aa9.42□□□□□ -0.9
TTPAL-204ENST00000456317 COASYQ13057 564 aa9.42□□□□□ -0.9
TTPAL-204ENST00000456317 FAM83BQ5T0W9 1011 aa9.42□□□□□ -0.9
TTPAL-204ENST00000456317 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP9.42□□□□□ -0.9
TTPAL-204ENST00000456317 KREMEN2Q8NCW0 462 aa9.42□□□□□ -0.9
TTPAL-204ENST00000456317 FLCNQ8NFG4 579 aa9.42□□□□□ -0.9
TTPAL-204ENST00000456317 FGD4Q96M96 766 aa9.42□□□□□ -0.9
TTPAL-204ENST00000456317 SLF1Q9BQI6 1058 aa9.42□□□□□ -0.9
TTPAL-204ENST00000456317 SNRKQ9NRH2 765 aa9.42□□□□□ -0.9
TTPAL-204ENST00000456317 COG6Q9Y2V7 657 aa9.42□□□□□ -0.9
TTPAL-204ENST00000456317 USP24Q9UPU5 2620 aa9.42□□□□□ -0.9
TTPAL-204ENST00000456317 FRYLO94915 3013 aa9.42□□□□□ -0.9
TTPAL-204ENST00000456317 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa9.41□□□□□ -0.9
TTPAL-204ENST00000456317 GRM6O15303 877 aa9.41□□□□□ -0.9
TTPAL-204ENST00000456317 RB1P06400 928 aa9.41□□□□□ -0.9
TTPAL-204ENST00000456317 ADRB1P08588 477 aa9.41□□□□□ -0.9
TTPAL-204ENST00000456317 SP100P23497 879 aaPredicted RBP9.41□□□□□ -0.9
TTPAL-204ENST00000456317 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP9.41□□□□□ -0.9
TTPAL-204ENST00000456317 TFCP2Q12800 502 aa9.41□□□□□ -0.9
TTPAL-204ENST00000456317 TCTN1Q2MV58 587 aa9.41□□□□□ -0.9
TTPAL-204ENST00000456317 CLEC10AQ8IUN9 316 aa9.41□□□□□ -0.9
TTPAL-204ENST00000456317 FIBCD1Q8N539 461 aa9.41□□□□□ -0.9
TTPAL-204ENST00000456317 DCLK2Q8N568 766 aa9.41□□□□□ -0.9
TTPAL-204ENST00000456317 MIGA1Q8NAN2 632 aa9.41□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.8 ms