RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000455134.1

GAPDHP28-201, Transcript of glyceraldehyde 3 phosphate dehydrogenase pseudogene 28, humanhuman

BASIC

Gene GAPDHP28, Length 1,003 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPDHP28-201ENST00000455134 CHMLP26374 656 aa9.87□□□□□ -0.83
GAPDHP28-201ENST00000455134 HSD17B4P51659 736 aa9.87□□□□□ -0.83
GAPDHP28-201ENST00000455134 ANTXR2P58335 489 aa9.87□□□□□ -0.83
GAPDHP28-201ENST00000455134 TTLL4Q14679 1199 aa9.87□□□□□ -0.83
GAPDHP28-201ENST00000455134 GPNMBQ14956 572 aa9.87□□□□□ -0.83
GAPDHP28-201ENST00000455134 LY6KQ17RY6 165 aa9.87□□□□□ -0.83
GAPDHP28-201ENST00000455134 CCDC178Q5BJE1 867 aa9.87□□□□□ -0.83
GAPDHP28-201ENST00000455134 FBXO11Q86XK2 927 aa9.87□□□□□ -0.83
GAPDHP28-201ENST00000455134 IL31RAQ8NI17 732 aa9.87□□□□□ -0.83
GAPDHP28-201ENST00000455134 KRT23Q9C075 422 aa9.87□□□□□ -0.83
GAPDHP28-201ENST00000455134 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa9.87□□□□□ -0.83
GAPDHP28-201ENST00000455134 PRDM12Q9H4Q4 367 aa9.87□□□□□ -0.83
GAPDHP28-201ENST00000455134 PXMP2Q9NR77 195 aa9.87□□□□□ -0.83
GAPDHP28-201ENST00000455134 BDP1A6H8Y1 2624 aa9.87□□□□□ -0.83
GAPDHP28-201ENST00000455134 PLXNA4Q9HCM2 1894 aa9.87□□□□□ -0.83
GAPDHP28-201ENST00000455134 ARHGEF15O94989 841 aa9.86□□□□□ -0.83
GAPDHP28-201ENST00000455134 RABGGTBP53611 331 aa9.86□□□□□ -0.83
GAPDHP28-201ENST00000455134 GRM4Q14833 912 aa9.86□□□□□ -0.83
GAPDHP28-201ENST00000455134 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
GAPDHP28-201ENST00000455134 NFRKBQ6P4R8 1299 aa9.86□□□□□ -0.83
GAPDHP28-201ENST00000455134 SEPT14Q6ZU15 432 aa9.86□□□□□ -0.83
GAPDHP28-201ENST00000455134 SESTD1Q86VW0 696 aa9.86□□□□□ -0.83
GAPDHP28-201ENST00000455134 AFG1LQ8WV93 481 aa9.86□□□□□ -0.83
GAPDHP28-201ENST00000455134 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
GAPDHP28-201ENST00000455134 RMDN3Q96TC7 470 aa9.86□□□□□ -0.83
GAPDHP28-201ENST00000455134 RIOX1Q9H6W3 641 aa9.86□□□□□ -0.83
GAPDHP28-201ENST00000455134 CNNM2Q9H8M5 875 aa9.86□□□□□ -0.83
GAPDHP28-201ENST00000455134 VAT1LQ9HCJ6 419 aa9.86□□□□□ -0.83
GAPDHP28-201ENST00000455134 CTNNA3Q9UI47 895 aa9.86□□□□□ -0.83
GAPDHP28-201ENST00000455134 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
GAPDHP28-201ENST00000455134 KLRF2D3W0D1 207 aa9.85□□□□□ -0.83
GAPDHP28-201ENST00000455134 HAS3O00219 553 aa9.85□□□□□ -0.83
GAPDHP28-201ENST00000455134 PITPNM1O00562 1244 aa9.85□□□□□ -0.83
GAPDHP28-201ENST00000455134 SGSM2O43147 1006 aa9.85□□□□□ -0.83
GAPDHP28-201ENST00000455134 CFBP00751 764 aa9.85□□□□□ -0.83
GAPDHP28-201ENST00000455134 GH1P01241 217 aa9.85□□□□□ -0.83
GAPDHP28-201ENST00000455134 NR3C2P08235 984 aa9.85□□□□□ -0.83
GAPDHP28-201ENST00000455134 IQCF3P0C7M6 154 aa9.85□□□□□ -0.83
GAPDHP28-201ENST00000455134 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP9.85□□□□□ -0.83
GAPDHP28-201ENST00000455134 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
GAPDHP28-201ENST00000455134 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP9.85□□□□□ -0.83
GAPDHP28-201ENST00000455134 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP9.85□□□□□ -0.83
GAPDHP28-201ENST00000455134 TROAPQ12815 778 aa9.85□□□□□ -0.83
GAPDHP28-201ENST00000455134 HIC1Q14526 733 aa9.85□□□□□ -0.83
GAPDHP28-201ENST00000455134 RAB30Q15771 203 aa9.85□□□□□ -0.83
GAPDHP28-201ENST00000455134 TCTN1Q2MV58 587 aa9.85□□□□□ -0.83
GAPDHP28-201ENST00000455134 FAM47CQ5HY64 1035 aa9.85□□□□□ -0.83
GAPDHP28-201ENST00000455134 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP9.85□□□□□ -0.83
GAPDHP28-201ENST00000455134 SPRED2Q7Z698 418 aa9.85□□□□□ -0.83
GAPDHP28-201ENST00000455134 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP9.85□□□□□ -0.83
GAPDHP28-201ENST00000455134 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
GAPDHP28-201ENST00000455134 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP9.85□□□□□ -0.83
GAPDHP28-201ENST00000455134 WNT8BQ93098 351 aa9.85□□□□□ -0.83
GAPDHP28-201ENST00000455134 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP9.85□□□□□ -0.83
GAPDHP28-201ENST00000455134 PIGSQ96S52 555 aa9.85□□□□□ -0.83
GAPDHP28-201ENST00000455134 IWS1Q96ST2 819 aa9.85□□□□□ -0.83
GAPDHP28-201ENST00000455134 PDCD2LQ9BRP1 358 aa9.85□□□□□ -0.83
GAPDHP28-201ENST00000455134 UBAC1Q9BSL1 405 aa9.85□□□□□ -0.83
GAPDHP28-201ENST00000455134 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
GAPDHP28-201ENST00000455134 COL4A6Q14031 1691 aa9.85□□□□□ -0.83
GAPDHP28-201ENST00000455134 FRMPD4Q14CM0 1322 aa9.84□□□□□ -0.83
GAPDHP28-201ENST00000455134 E7EWF7 191 aa9.84□□□□□ -0.83
GAPDHP28-201ENST00000455134 ZBTB5O15062 677 aa9.84□□□□□ -0.83
GAPDHP28-201ENST00000455134 KPNA6O60684 536 aa9.84□□□□□ -0.83
GAPDHP28-201ENST00000455134 F2P00734 622 aa9.84□□□□□ -0.83
GAPDHP28-201ENST00000455134 PFKMP08237 780 aa9.84□□□□□ -0.83
GAPDHP28-201ENST00000455134 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa9.84□□□□□ -0.83
GAPDHP28-201ENST00000455134 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP9.84□□□□□ -0.83
GAPDHP28-201ENST00000455134 SP2Q02086 613 aa9.84□□□□□ -0.83
GAPDHP28-201ENST00000455134 RBL2Q08999 1139 aa9.84□□□□□ -0.83
GAPDHP28-201ENST00000455134 PGM5Q15124 567 aa9.84□□□□□ -0.83
GAPDHP28-201ENST00000455134 STXBP2Q15833 593 aa9.84□□□□□ -0.83
GAPDHP28-201ENST00000455134 TRAF7Q6Q0C0 670 aa9.84□□□□□ -0.83
GAPDHP28-201ENST00000455134 CHST3Q7LGC8 479 aa9.84□□□□□ -0.83
GAPDHP28-201ENST00000455134 DEFB128Q7Z7B8 93 aa9.84□□□□□ -0.83
GAPDHP28-201ENST00000455134 MCF2L2Q86YR7 1114 aa9.84□□□□□ -0.83
GAPDHP28-201ENST00000455134 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
GAPDHP28-201ENST00000455134 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP9.84□□□□□ -0.83
GAPDHP28-201ENST00000455134 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
GAPDHP28-201ENST00000455134 AMNQ9BXJ7 453 aa9.84□□□□□ -0.83
GAPDHP28-201ENST00000455134 BCAS3Q9H6U6 928 aa9.84□□□□□ -0.83
GAPDHP28-201ENST00000455134 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP9.84□□□□□ -0.83
GAPDHP28-201ENST00000455134 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa9.84□□□□□ -0.83
GAPDHP28-201ENST00000455134 EPOPA6NHQ4 379 aa9.83□□□□□ -0.84
GAPDHP28-201ENST00000455134 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP9.83□□□□□ -0.84
GAPDHP28-201ENST00000455134 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP9.83□□□□□ -0.84
GAPDHP28-201ENST00000455134 ZNF286BP0CG31 522 aa9.83□□□□□ -0.84
GAPDHP28-201ENST00000455134 PTGISQ16647 500 aa9.83□□□□□ -0.84
GAPDHP28-201ENST00000455134 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP9.83□□□□□ -0.84
GAPDHP28-201ENST00000455134 HSDL1Q3SXM5 330 aa9.83□□□□□ -0.84
GAPDHP28-201ENST00000455134 ARHGEF16Q5VV41 709 aa9.83□□□□□ -0.84
GAPDHP28-201ENST00000455134 MYSM1Q5VVJ2 828 aa9.83□□□□□ -0.84
GAPDHP28-201ENST00000455134 VSIG10LQ86VR7 867 aa9.83□□□□□ -0.84
GAPDHP28-201ENST00000455134 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa9.83□□□□□ -0.84
GAPDHP28-201ENST00000455134 MAP4K1Q92918 833 aa9.83□□□□□ -0.84
GAPDHP28-201ENST00000455134 HDAC6Q9UBN7 1215 aa9.83□□□□□ -0.84
GAPDHP28-201ENST00000455134 MSRAQ9UJ68 235 aa9.83□□□□□ -0.84
GAPDHP28-201ENST00000455134 TELO2Q9Y4R8 837 aa9.83□□□□□ -0.84
GAPDHP28-201ENST00000455134 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa9.83□□□□□ -0.84
GAPDHP28-201ENST00000455134 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa9.83□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.6 ms