RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000454996.5

TTC28-AS1-220, TTC28 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2

Gene TTC28-AS1, Length 837 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-AS1-220ENST00000454996 STXBP2Q15833 593 aa8.9□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-220ENST00000454996 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP8.9□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-220ENST00000454996 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP8.9□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-220ENST00000454996 FCHSD1Q86WN1 690 aa8.9□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-220ENST00000454996 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP8.9□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-220ENST00000454996 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP8.9□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-220ENST00000454996 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP8.9□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-220ENST00000454996 WNT8BQ93098 351 aa8.9□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-220ENST00000454996 TIFAQ96CG3 184 aa8.9□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-220ENST00000454996 AMNQ9BXJ7 453 aa8.9□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-220ENST00000454996 LRRC2Q9BYS8 371 aa8.9□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-220ENST00000454996 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa8.9□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-220ENST00000454996 PRDM12Q9H4Q4 367 aa8.9□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-220ENST00000454996 LY9Q9HBG7 655 aa8.9□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-220ENST00000454996 POLR3EQ9NVU0 708 aa8.9□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-220ENST00000454996 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP8.9□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-220ENST00000454996 RAD50Q92878 1312 aa8.89□□□□□ -0.99
TTC28-AS1-220ENST00000454996 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa8.89□□□□□ -0.99
TTC28-AS1-220ENST00000454996 RFXAPO00287 272 aa8.89□□□□□ -0.99
TTC28-AS1-220ENST00000454996 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP8.89□□□□□ -0.99
TTC28-AS1-220ENST00000454996 ARHGEF15O94989 841 aa8.89□□□□□ -0.99
TTC28-AS1-220ENST00000454996 IQCF3P0C7M6 154 aa8.89□□□□□ -0.99
TTC28-AS1-220ENST00000454996 ZNF286BP0CG31 522 aa8.89□□□□□ -0.99
TTC28-AS1-220ENST00000454996 FOSL2P15408 326 aa8.89□□□□□ -0.99
TTC28-AS1-220ENST00000454996 WTAPQ15007 396 aa8.89□□□□□ -0.99
TTC28-AS1-220ENST00000454996 PGM5Q15124 567 aa8.89□□□□□ -0.99
TTC28-AS1-220ENST00000454996 TMEM67Q5HYA8 995 aa8.89□□□□□ -0.99
TTC28-AS1-220ENST00000454996 SPRED2Q7Z698 418 aa8.89□□□□□ -0.99
TTC28-AS1-220ENST00000454996 VSIG10LQ86VR7 867 aa8.89□□□□□ -0.99
TTC28-AS1-220ENST00000454996 MCF2L2Q86YR7 1114 aa8.89□□□□□ -0.99
TTC28-AS1-220ENST00000454996 NCOA7Q8NI08 942 aa8.89□□□□□ -0.99
TTC28-AS1-220ENST00000454996 RUFY2Q8WXA3 655 aa8.89□□□□□ -0.99
TTC28-AS1-220ENST00000454996 PPM1EQ8WY54 764 aa8.89□□□□□ -0.99
TTC28-AS1-220ENST00000454996 IWS1Q96ST2 819 aa8.89□□□□□ -0.99
TTC28-AS1-220ENST00000454996 PDCD2LQ9BRP1 358 aa8.89□□□□□ -0.99
TTC28-AS1-220ENST00000454996 ALG1Q9BT22 464 aa8.89□□□□□ -0.99
TTC28-AS1-220ENST00000454996 OSBPL7Q9BZF2 842 aa8.89□□□□□ -0.99
TTC28-AS1-220ENST00000454996 RTEL1Q9NZ71 1219 aa8.89□□□□□ -0.99
TTC28-AS1-220ENST00000454996 HDAC6Q9UBN7 1215 aa8.89□□□□□ -0.99
TTC28-AS1-220ENST00000454996 PNMA2Q9UL42 364 aa8.89□□□□□ -0.99
TTC28-AS1-220ENST00000454996 MYH6P13533 1939 aa8.88□□□□□ -0.99
TTC28-AS1-220ENST00000454996 VCANP13611 3396 aa8.88□□□□□ -0.99
TTC28-AS1-220ENST00000454996 GBF1Q92538 1859 aa8.88□□□□□ -0.99
TTC28-AS1-220ENST00000454996 SLC27A2O14975 620 aa8.88□□□□□ -0.99
TTC28-AS1-220ENST00000454996 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP8.88□□□□□ -0.99
TTC28-AS1-220ENST00000454996 PLEKHA8P1O95397 391 aa8.88□□□□□ -0.99
TTC28-AS1-220ENST00000454996 GH1P01241 217 aa8.88□□□□□ -0.99
TTC28-AS1-220ENST00000454996 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP8.88□□□□□ -0.99
TTC28-AS1-220ENST00000454996 GHRHRQ02643 423 aa8.88□□□□□ -0.99
TTC28-AS1-220ENST00000454996 TRDNQ13061 729 aa8.88□□□□□ -0.99
TTC28-AS1-220ENST00000454996 SEMA3FQ13275 785 aa8.88□□□□□ -0.99
TTC28-AS1-220ENST00000454996 NECTIN1Q15223 517 aa8.88□□□□□ -0.99
TTC28-AS1-220ENST00000454996 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP8.88□□□□□ -0.99
TTC28-AS1-220ENST00000454996 PTGISQ16647 500 aa8.88□□□□□ -0.99
TTC28-AS1-220ENST00000454996 HSDL1Q3SXM5 330 aa8.88□□□□□ -0.99
TTC28-AS1-220ENST00000454996 MYSM1Q5VVJ2 828 aa8.88□□□□□ -0.99
TTC28-AS1-220ENST00000454996 NFRKBQ6P4R8 1299 aa8.88□□□□□ -0.99
TTC28-AS1-220ENST00000454996 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP8.88□□□□□ -0.99
TTC28-AS1-220ENST00000454996 USP17L6PQ6QN14 398 aa8.88□□□□□ -0.99
TTC28-AS1-220ENST00000454996 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP8.88□□□□□ -0.99
TTC28-AS1-220ENST00000454996 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa8.88□□□□□ -0.99
TTC28-AS1-220ENST00000454996 CERS4Q9HA82 394 aa8.88□□□□□ -0.99
TTC28-AS1-220ENST00000454996 MRVI1Q9Y6F6 885 aa8.88□□□□□ -0.99
TTC28-AS1-220ENST00000454996 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa8.88□□□□□ -0.99
TTC28-AS1-220ENST00000454996 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa8.88□□□□□ -0.99
TTC28-AS1-220ENST00000454996 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP8.87□□□□□ -0.99
TTC28-AS1-220ENST00000454996 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa8.87□□□□□ -0.99
TTC28-AS1-220ENST00000454996 EPOPA6NHQ4 379 aa8.87□□□□□ -0.99
TTC28-AS1-220ENST00000454996 ZBBXA8MT70 800 aa8.87□□□□□ -0.99
TTC28-AS1-220ENST00000454996 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP8.87□□□□□ -0.99
TTC28-AS1-220ENST00000454996 PRC1O43663 620 aa8.87□□□□□ -0.99
TTC28-AS1-220ENST00000454996 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa8.87□□□□□ -0.99
TTC28-AS1-220ENST00000454996 POLR2MP0CAP2 368 aa8.87□□□□□ -0.99
TTC28-AS1-220ENST00000454996 PSEN2P49810 448 aa8.87□□□□□ -0.99
TTC28-AS1-220ENST00000454996 NT5C2P49902 561 aa8.87□□□□□ -0.99
TTC28-AS1-220ENST00000454996 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP8.87□□□□□ -0.99
TTC28-AS1-220ENST00000454996 CREB3L3Q68CJ9 461 aa8.87□□□□□ -0.99
TTC28-AS1-220ENST00000454996 KRT40Q6A162 431 aa8.87□□□□□ -0.99
TTC28-AS1-220ENST00000454996 TRAF7Q6Q0C0 670 aa8.87□□□□□ -0.99
TTC28-AS1-220ENST00000454996 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP8.87□□□□□ -0.99
TTC28-AS1-220ENST00000454996 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP8.87□□□□□ -0.99
TTC28-AS1-220ENST00000454996 ZNF654Q8IZM8 581 aa8.87□□□□□ -0.99
TTC28-AS1-220ENST00000454996 CCDC82Q8N4S0 544 aa8.87□□□□□ -0.99
TTC28-AS1-220ENST00000454996 TCEANC2Q96MN5 208 aa8.87□□□□□ -0.99
TTC28-AS1-220ENST00000454996 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP8.87□□□□□ -0.99
TTC28-AS1-220ENST00000454996 MYH7BA7E2Y1 1941 aa8.87□□□□□ -0.99
TTC28-AS1-220ENST00000454996 REV3LO60673 3130 aa8.87□□□□□ -0.99
TTC28-AS1-220ENST00000454996 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP8.86□□□□□ -0.99
TTC28-AS1-220ENST00000454996 CHD7Q9P2D1 2997 aa8.86□□□□□ -0.99
TTC28-AS1-220ENST00000454996 TET1Q8NFU7 2136 aa8.86□□□□□ -0.99
TTC28-AS1-220ENST00000454996 B4DLN1 442 aa8.86□□□□□ -0.99
TTC28-AS1-220ENST00000454996 HAS3O00219 553 aa8.86□□□□□ -0.99
TTC28-AS1-220ENST00000454996 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP8.86□□□□□ -0.99
TTC28-AS1-220ENST00000454996 MEIS2O14770 477 aa8.86□□□□□ -0.99
TTC28-AS1-220ENST00000454996 KPNA6O60684 536 aa8.86□□□□□ -0.99
TTC28-AS1-220ENST00000454996 NBNO60934 754 aa8.86□□□□□ -0.99
TTC28-AS1-220ENST00000454996 GGPS1O95749 300 aa8.86□□□□□ -0.99
TTC28-AS1-220ENST00000454996 CASTP20810 708 aaKnown RBP8.86□□□□□ -0.99
TTC28-AS1-220ENST00000454996 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP8.86□□□□□ -0.99
TTC28-AS1-220ENST00000454996 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP8.86□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.4 ms