RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442563.5

RABGEF1-204, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 4

Gene RABGEF1, Length 553 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-204ENST00000442563 TXNP10599 105 aaKnown RBP19.35■□□□□ 0.69
RABGEF1-204ENST00000442563 TGFB3P10600 412 aa19.35■□□□□ 0.69
RABGEF1-204ENST00000442563 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP19.35■□□□□ 0.69
RABGEF1-204ENST00000442563 ADCY7P51828 1080 aa19.35■□□□□ 0.69
RABGEF1-204ENST00000442563 KCNA10Q16322 511 aa19.35■□□□□ 0.69
RABGEF1-204ENST00000442563 TMEM63BQ5T3F8 832 aa19.35■□□□□ 0.69
RABGEF1-204ENST00000442563 SEPT14Q6ZU15 432 aa19.35■□□□□ 0.69
RABGEF1-204ENST00000442563 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP19.35■□□□□ 0.69
RABGEF1-204ENST00000442563 IL31RAQ8NI17 732 aa19.35■□□□□ 0.69
RABGEF1-204ENST00000442563 ZMYND12Q9H0C1 365 aa19.35■□□□□ 0.69
RABGEF1-204ENST00000442563 SH3GLB2Q9NR46 395 aa19.35■□□□□ 0.69
RABGEF1-204ENST00000442563 PCDHA6Q9UN73 950 aa19.35■□□□□ 0.69
RABGEF1-204ENST00000442563 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa19.35■□□□□ 0.69
RABGEF1-204ENST00000442563 MYADML2A6NDP7 307 aa19.34■□□□□ 0.69
RABGEF1-204ENST00000442563 SPDYE3A6NKU9 549 aa19.34■□□□□ 0.69
RABGEF1-204ENST00000442563 ZEB2O60315 1214 aa19.34■□□□□ 0.69
RABGEF1-204ENST00000442563 RGS20O76081 388 aa19.34■□□□□ 0.69
RABGEF1-204ENST00000442563 DEXIO95424 95 aa19.34■□□□□ 0.69
RABGEF1-204ENST00000442563 GNA11P29992 359 aa19.34■□□□□ 0.69
RABGEF1-204ENST00000442563 ACLYP53396 1101 aa19.34■□□□□ 0.69
RABGEF1-204ENST00000442563 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP19.34■□□□□ 0.69
RABGEF1-204ENST00000442563 ME3Q16798 604 aa19.34■□□□□ 0.69
RABGEF1-204ENST00000442563 C1orf53Q5VUE5 145 aa19.34■□□□□ 0.69
RABGEF1-204ENST00000442563 PCNX4Q63HM2 1172 aa19.34■□□□□ 0.69
RABGEF1-204ENST00000442563 MCTP2Q6DN12 878 aa19.34■□□□□ 0.69
RABGEF1-204ENST00000442563 C6orf50Q9HD87 102 aa19.34■□□□□ 0.69
RABGEF1-204ENST00000442563 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP19.34■□□□□ 0.69
RABGEF1-204ENST00000442563 LRRC37A2A6NM11 1700 aa19.34■□□□□ 0.69
RABGEF1-204ENST00000442563 CLK2P49760 499 aaKnown RBP19.33■□□□□ 0.68
RABGEF1-204ENST00000442563 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP19.33■□□□□ 0.68
RABGEF1-204ENST00000442563 AP3B2Q13367 1082 aa19.33■□□□□ 0.68
RABGEF1-204ENST00000442563 UBE2SQ16763 222 aa19.33■□□□□ 0.68
RABGEF1-204ENST00000442563 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa19.33■□□□□ 0.68
RABGEF1-204ENST00000442563 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP19.33■□□□□ 0.68
RABGEF1-204ENST00000442563 EHMT1Q9H9B1 1298 aa19.33■□□□□ 0.68
RABGEF1-204ENST00000442563 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa19.33■□□□□ 0.68
RABGEF1-204ENST00000442563 NR2E3Q9Y5X4 410 aa19.33■□□□□ 0.68
RABGEF1-204ENST00000442563 ELP1O95163 1332 aa19.32■□□□□ 0.68
RABGEF1-204ENST00000442563 EVI5O60447 810 aa19.32■□□□□ 0.68
RABGEF1-204ENST00000442563 CABYRO75952 493 aa19.32■□□□□ 0.68
RABGEF1-204ENST00000442563 ARIH2O95376 493 aa19.32■□□□□ 0.68
RABGEF1-204ENST00000442563 ASGR1P07306 291 aa19.32■□□□□ 0.68
RABGEF1-204ENST00000442563 ICAM3P32942 547 aa19.32■□□□□ 0.68
RABGEF1-204ENST00000442563 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP19.32■□□□□ 0.68
RABGEF1-204ENST00000442563 SNX17Q15036 470 aa19.32■□□□□ 0.68
RABGEF1-204ENST00000442563 RABEP1Q15276 862 aa19.32■□□□□ 0.68
RABGEF1-204ENST00000442563 GNPTABQ3T906 1256 aa19.32■□□□□ 0.68
RABGEF1-204ENST00000442563 CCDC148Q8NFR7 591 aa19.32■□□□□ 0.68
RABGEF1-204ENST00000442563 OR6J1Q8NGC5 347 aa19.32■□□□□ 0.68
RABGEF1-204ENST00000442563 GLT1D1Q96MS3 346 aa19.32■□□□□ 0.68
RABGEF1-204ENST00000442563 BACH2Q9BYV9 841 aa19.32■□□□□ 0.68
RABGEF1-204ENST00000442563 MRVI1Q9Y6F6 885 aa19.32■□□□□ 0.68
RABGEF1-204ENST00000442563 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP19.31■□□□□ 0.68
RABGEF1-204ENST00000442563 STK36Q9NRP7 1315 aa19.31■□□□□ 0.68
RABGEF1-204ENST00000442563 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP19.31■□□□□ 0.68
RABGEF1-204ENST00000442563 A0A1W2PQY0 241 aa19.31■□□□□ 0.68
RABGEF1-204ENST00000442563 A6NJR5 290 aa19.31■□□□□ 0.68
RABGEF1-204ENST00000442563 KPNA6O60684 536 aa19.31■□□□□ 0.68
RABGEF1-204ENST00000442563 PPFIA3O75145 1194 aa19.31■□□□□ 0.68
RABGEF1-204ENST00000442563 GH1P01241 217 aa19.31■□□□□ 0.68
RABGEF1-204ENST00000442563 CPT1AP50416 773 aa19.31■□□□□ 0.68
RABGEF1-204ENST00000442563 BEX3Q00994 111 aa19.31■□□□□ 0.68
RABGEF1-204ENST00000442563 LY6KQ17RY6 165 aa19.31■□□□□ 0.68
RABGEF1-204ENST00000442563 LRRC26Q2I0M4 334 aa19.31■□□□□ 0.68
RABGEF1-204ENST00000442563 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP19.31■□□□□ 0.68
RABGEF1-204ENST00000442563 BICD2Q8TD16 824 aa19.31■□□□□ 0.68
RABGEF1-204ENST00000442563 GTF3C6Q969F1 213 aa19.31■□□□□ 0.68
RABGEF1-204ENST00000442563 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP19.31■□□□□ 0.68
RABGEF1-204ENST00000442563 FERMT2Q96AC1 680 aa19.31■□□□□ 0.68
RABGEF1-204ENST00000442563 TBC1D32Q96NH3 1257 aa19.31■□□□□ 0.68
RABGEF1-204ENST00000442563 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa19.3■□□□□ 0.68
RABGEF1-204ENST00000442563 CTDNEP1O95476 244 aa19.3■□□□□ 0.68
RABGEF1-204ENST00000442563 PTGS1P23219 599 aa19.3■□□□□ 0.68
RABGEF1-204ENST00000442563 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP19.3■□□□□ 0.68
RABGEF1-204ENST00000442563 LAMC2Q13753 1193 aa19.3■□□□□ 0.68
RABGEF1-204ENST00000442563 NLRX1Q86UT6 975 aa19.3■□□□□ 0.68
RABGEF1-204ENST00000442563 NECAB1Q8N987 351 aa19.3■□□□□ 0.68
RABGEF1-204ENST00000442563 COPS5Q92905 334 aa19.3■□□□□ 0.68
RABGEF1-204ENST00000442563 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP19.3■□□□□ 0.68
RABGEF1-204ENST00000442563 STARD7Q9NQZ5 370 aa19.3■□□□□ 0.68
RABGEF1-204ENST00000442563 RTEL1Q9NZ71 1219 aa19.3■□□□□ 0.68
RABGEF1-204ENST00000442563 MAFGO15525 162 aa19.29■□□□□ 0.68
RABGEF1-204ENST00000442563 FIBPO43427 364 aa19.29■□□□□ 0.68
RABGEF1-204ENST00000442563 LARGE1O95461 756 aa19.29■□□□□ 0.68
RABGEF1-204ENST00000442563 ARHGAP1Q07960 439 aa19.29■□□□□ 0.68
RABGEF1-204ENST00000442563 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP19.29■□□□□ 0.68
RABGEF1-204ENST00000442563 GALNT17Q6IS24 598 aa19.29■□□□□ 0.68
RABGEF1-204ENST00000442563 GPRASP2Q96D09 838 aa19.29■□□□□ 0.68
RABGEF1-204ENST00000442563 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa19.29■□□□□ 0.68
RABGEF1-204ENST00000442563 ANO3Q9BYT9 981 aa19.29■□□□□ 0.68
RABGEF1-204ENST00000442563 POLR3EQ9NVU0 708 aa19.29■□□□□ 0.68
RABGEF1-204ENST00000442563 VPS54Q9P1Q0 977 aa19.29■□□□□ 0.68
RABGEF1-204ENST00000442563 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa19.29■□□□□ 0.68
RABGEF1-204ENST00000442563 SREBF1P36956 1147 aa19.28■□□□□ 0.68
RABGEF1-204ENST00000442563 RTP1P59025 263 aa19.28■□□□□ 0.68
RABGEF1-204ENST00000442563 NLRP5P59047 1200 aa19.28■□□□□ 0.68
RABGEF1-204ENST00000442563 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP19.28■□□□□ 0.68
RABGEF1-204ENST00000442563 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP19.28■□□□□ 0.68
RABGEF1-204ENST00000442563 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP19.28■□□□□ 0.68
RABGEF1-204ENST00000442563 WASF1Q92558 559 aa19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.1 ms