RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000437051.5

SGO1-208, Transcript of shugoshin 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene SGO1, Length 1,187 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGO1-208ENST00000437051 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
SGO1-208ENST00000437051 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa21.53■■□□□ 1.04
SGO1-208ENST00000437051 GH1P01241 217 aa21.52■■□□□ 1.04
SGO1-208ENST00000437051 FGBP02675 491 aa21.52■■□□□ 1.04
SGO1-208ENST00000437051 TRDNQ13061 729 aa21.52■■□□□ 1.04
SGO1-208ENST00000437051 WTAPQ15007 396 aa21.52■■□□□ 1.04
SGO1-208ENST00000437051 ARHGEF16Q5VV41 709 aa21.52■■□□□ 1.04
SGO1-208ENST00000437051 HOMER1Q86YM7 354 aa21.52■■□□□ 1.04
SGO1-208ENST00000437051 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP21.52■■□□□ 1.04
SGO1-208ENST00000437051 USP38Q8NB14 1042 aa21.52■■□□□ 1.04
SGO1-208ENST00000437051 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP21.52■■□□□ 1.04
SGO1-208ENST00000437051 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
SGO1-208ENST00000437051 ZNF576Q9H609 170 aa21.52■■□□□ 1.04
SGO1-208ENST00000437051 CUL9Q8IWT3 2517 aa21.52■■□□□ 1.03
SGO1-208ENST00000437051 PTPRSQ13332 1948 aa21.51■■□□□ 1.03
SGO1-208ENST00000437051 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
SGO1-208ENST00000437051 GPNMBQ14956 572 aa21.51■■□□□ 1.03
SGO1-208ENST00000437051 PGM5Q15124 567 aa21.51■■□□□ 1.03
SGO1-208ENST00000437051 FAM47CQ5HY64 1035 aa21.51■■□□□ 1.03
SGO1-208ENST00000437051 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
SGO1-208ENST00000437051 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
SGO1-208ENST00000437051 MYL10Q9BUA6 226 aa21.51■■□□□ 1.03
SGO1-208ENST00000437051 TET1Q8NFU7 2136 aa21.5■■□□□ 1.03
SGO1-208ENST00000437051 B4DLN1 442 aa21.5■■□□□ 1.03
SGO1-208ENST00000437051 KPNA6O60684 536 aa21.5■■□□□ 1.03
SGO1-208ENST00000437051 FOSL2P15408 326 aa21.5■■□□□ 1.03
SGO1-208ENST00000437051 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
SGO1-208ENST00000437051 SP2Q02086 613 aa21.5■■□□□ 1.03
SGO1-208ENST00000437051 TMEM67Q5HYA8 995 aa21.5■■□□□ 1.03
SGO1-208ENST00000437051 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
SGO1-208ENST00000437051 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
SGO1-208ENST00000437051 BCAS3Q9H6U6 928 aa21.5■■□□□ 1.03
SGO1-208ENST00000437051 FRMPD4Q14CM0 1322 aa21.5■■□□□ 1.03
SGO1-208ENST00000437051 REV3LO60673 3130 aa21.49■■□□□ 1.03
SGO1-208ENST00000437051 MYH7BA7E2Y1 1941 aa21.49■■□□□ 1.03
SGO1-208ENST00000437051 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa21.49■■□□□ 1.03
SGO1-208ENST00000437051 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
SGO1-208ENST00000437051 RABGGTBP53611 331 aa21.49■■□□□ 1.03
SGO1-208ENST00000437051 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
SGO1-208ENST00000437051 HIC1Q14526 733 aa21.49■■□□□ 1.03
SGO1-208ENST00000437051 VSIG10LQ86VR7 867 aa21.49■■□□□ 1.03
SGO1-208ENST00000437051 SESTD1Q86VW0 696 aa21.49■■□□□ 1.03
SGO1-208ENST00000437051 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa21.49■■□□□ 1.03
SGO1-208ENST00000437051 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
SGO1-208ENST00000437051 HAS3O00219 553 aa21.48■■□□□ 1.03
SGO1-208ENST00000437051 MYOGP15173 224 aa21.48■■□□□ 1.03
SGO1-208ENST00000437051 ADGRE1Q14246 886 aa21.48■■□□□ 1.03
SGO1-208ENST00000437051 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
SGO1-208ENST00000437051 ZNF654Q8IZM8 581 aa21.48■■□□□ 1.03
SGO1-208ENST00000437051 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa21.48■■□□□ 1.03
SGO1-208ENST00000437051 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
SGO1-208ENST00000437051 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa21.47■■□□□ 1.03
SGO1-208ENST00000437051 PITPNM1O00562 1244 aa21.47■■□□□ 1.03
SGO1-208ENST00000437051 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
SGO1-208ENST00000437051 SLC27A2O14975 620 aa21.47■■□□□ 1.03
SGO1-208ENST00000437051 F2P00734 622 aa21.47■■□□□ 1.03
SGO1-208ENST00000437051 IQCF3P0C7M6 154 aa21.47■■□□□ 1.03
SGO1-208ENST00000437051 ZNF286BP0CG31 522 aa21.47■■□□□ 1.03
SGO1-208ENST00000437051 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
SGO1-208ENST00000437051 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
SGO1-208ENST00000437051 NECTIN1Q15223 517 aa21.47■■□□□ 1.03
SGO1-208ENST00000437051 TCTN1Q2MV58 587 aa21.47■■□□□ 1.03
SGO1-208ENST00000437051 HSDL1Q3SXM5 330 aa21.47■■□□□ 1.03
SGO1-208ENST00000437051 MYSM1Q5VVJ2 828 aa21.47■■□□□ 1.03
SGO1-208ENST00000437051 DEFB128Q7Z7B8 93 aa21.47■■□□□ 1.03
SGO1-208ENST00000437051 PIBF1Q8WXW3 757 aa21.47■■□□□ 1.03
SGO1-208ENST00000437051 WNT8BQ93098 351 aa21.47■■□□□ 1.03
SGO1-208ENST00000437051 MRVI1Q9Y6F6 885 aa21.47■■□□□ 1.03
SGO1-208ENST00000437051 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
SGO1-208ENST00000437051 DOCK5Q9H7D0 1870 aa21.46■■□□□ 1.03
SGO1-208ENST00000437051 PRC1O43663 620 aa21.46■■□□□ 1.03
SGO1-208ENST00000437051 SORBS3O60504 671 aa21.46■■□□□ 1.03
SGO1-208ENST00000437051 PLEKHA8P1O95397 391 aa21.46■■□□□ 1.03
SGO1-208ENST00000437051 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
SGO1-208ENST00000437051 SEMA3FQ13275 785 aa21.46■■□□□ 1.03
SGO1-208ENST00000437051 TRAF7Q6Q0C0 670 aa21.46■■□□□ 1.03
SGO1-208ENST00000437051 PPTC7Q8NI37 304 aa21.46■■□□□ 1.03
SGO1-208ENST00000437051 PRDM12Q9H4Q4 367 aa21.46■■□□□ 1.03
SGO1-208ENST00000437051 HDAC6Q9UBN7 1215 aa21.46■■□□□ 1.03
SGO1-208ENST00000437051 TELO2Q9Y4R8 837 aa21.46■■□□□ 1.03
SGO1-208ENST00000437051 ERICH2A1L162 156 aa21.45■■□□□ 1.02
SGO1-208ENST00000437051 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
SGO1-208ENST00000437051 ARHGEF15O94989 841 aa21.45■■□□□ 1.02
SGO1-208ENST00000437051 POLR2MP0CAP2 368 aa21.45■■□□□ 1.02
SGO1-208ENST00000437051 PSEN2P49810 448 aa21.45■■□□□ 1.02
SGO1-208ENST00000437051 CHMP4BP1P59074 171 aa21.45■■□□□ 1.02
SGO1-208ENST00000437051 PTGISQ16647 500 aa21.45■■□□□ 1.02
SGO1-208ENST00000437051 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
SGO1-208ENST00000437051 CREB3L3Q68CJ9 461 aa21.45■■□□□ 1.02
SGO1-208ENST00000437051 CATIPQ7Z7H3 387 aa21.45■■□□□ 1.02
SGO1-208ENST00000437051 FCHSD1Q86WN1 690 aa21.45■■□□□ 1.02
SGO1-208ENST00000437051 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
SGO1-208ENST00000437051 SAMD3Q8N6K7 520 aa21.45■■□□□ 1.02
SGO1-208ENST00000437051 MAP3K14Q99558 947 aa21.45■■□□□ 1.02
SGO1-208ENST00000437051 SPZ1Q9BXG8 430 aa21.45■■□□□ 1.02
SGO1-208ENST00000437051 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa21.45■■□□□ 1.02
SGO1-208ENST00000437051 DDAH1O94760 285 aa21.44■■□□□ 1.02
SGO1-208ENST00000437051 PFKMP08237 780 aa21.44■■□□□ 1.02
SGO1-208ENST00000437051 RXRAP19793 462 aa21.44■■□□□ 1.02
SGO1-208ENST00000437051 CASTP20810 708 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.3 ms