RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000430766.1

PTPRD-AS1-201, PTPRD antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PTPRD-AS1, Length 1,959 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 POMKQ9H5K3 350 aa10.58□□□□□ -0.72
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 WNT16Q9UBV4 365 aa10.58□□□□□ -0.72
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 KRBA1A5PL33 1030 aa10.57□□□□□ -0.72
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SRGAP2BP0DMP2 458 aa10.57□□□□□ -0.72
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CKBP12277 381 aa10.57□□□□□ -0.72
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 FOXC1Q12948 553 aa10.57□□□□□ -0.72
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PTGISQ16647 500 aa10.57□□□□□ -0.72
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP10.57□□□□□ -0.72
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ZNF605Q86T29 641 aa10.57□□□□□ -0.72
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SPPL3Q8TCT6 385 aa10.57□□□□□ -0.72
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 LPIN2Q92539 896 aa10.57□□□□□ -0.72
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TBC1D17Q9HA65 648 aa10.57□□□□□ -0.72
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 J3QKU1 62 aa10.57□□□□□ -0.72
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP10.57□□□□□ -0.72
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 UPP2O95045 317 aa10.57□□□□□ -0.72
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 RETP07949 1114 aa10.57□□□□□ -0.72
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 MECOMQ03112 1051 aa10.57□□□□□ -0.72
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 NAALADL2Q58DX5 795 aa10.57□□□□□ -0.72
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 IQSEC1Q6DN90 963 aa10.57□□□□□ -0.72
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 LAIR1Q6GTX8 287 aa10.57□□□□□ -0.72
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa10.57□□□□□ -0.72
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TRAF7Q6Q0C0 670 aa10.57□□□□□ -0.72
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP10.57□□□□□ -0.72
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 FAM133AQ8N9E0 248 aa10.57□□□□□ -0.72
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SIT1Q9Y3P8 196 aa10.57□□□□□ -0.72
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CFAP46Q8IYW2 2715 aa10.56□□□□□ -0.72
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PRB1P04280 392 aa10.56□□□□□ -0.72
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 HOXB8P17481 243 aaPredicted RBP10.56□□□□□ -0.72
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 NCLP19338 710 aaKnown RBP10.56□□□□□ -0.72
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 KCNC3Q14003 757 aa10.56□□□□□ -0.72
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 MBTPS1Q14703 1052 aa10.56□□□□□ -0.72
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 DUSP6Q16828 381 aa10.56□□□□□ -0.72
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa10.56□□□□□ -0.72
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PROSER1Q86XN7 944 aa10.56□□□□□ -0.72
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 REPS2Q8NFH8 660 aa10.56□□□□□ -0.72
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 DBF4BQ8NFT6 615 aa10.56□□□□□ -0.72
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ABCF2Q9UG63 623 aa10.56□□□□□ -0.72
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 KIAA1671Q9BY89 1806 aa10.56□□□□□ -0.72
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ASXL3Q9C0F0 2248 aa10.56□□□□□ -0.72
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 MIA3Q5JRA6 1907 aa10.56□□□□□ -0.72
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 A0A1W2PRG0 241 aa10.56□□□□□ -0.72
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 LDHCP07864 332 aa10.56□□□□□ -0.72
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 MYL3P08590 195 aa10.56□□□□□ -0.72
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 NEUROD2Q15784 382 aa10.56□□□□□ -0.72
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa10.56□□□□□ -0.72
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa10.56□□□□□ -0.72
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 DNAAF4Q8WXU2 420 aa10.56□□□□□ -0.72
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP10.56□□□□□ -0.72
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 USTQ9Y2C2 406 aa10.56□□□□□ -0.72
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 FREM2Q5SZK8 3169 aa10.55□□□□□ -0.72
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TK2O00142 265 aa10.55□□□□□ -0.72
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ITGB1P05556 798 aa10.55□□□□□ -0.72
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TECP42680 631 aa10.55□□□□□ -0.72
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ABCB5Q2M3G0 1257 aa10.55□□□□□ -0.72
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TMEM63BQ5T3F8 832 aa10.55□□□□□ -0.72
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SCNM1Q9BWG6 230 aa10.55□□□□□ -0.72
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP10.55□□□□□ -0.72
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP10.55□□□□□ -0.72
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa10.55□□□□□ -0.72
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PER2O15055 1255 aa10.54□□□□□ -0.72
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 LAMTOR5O43504 91 aa10.54□□□□□ -0.72
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 HLA-DOAP06340 250 aa10.54□□□□□ -0.72
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 GLULP15104 373 aa10.54□□□□□ -0.72
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 GUCY1A2P33402 732 aa10.54□□□□□ -0.72
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CPT1AP50416 773 aa10.54□□□□□ -0.72
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP10.54□□□□□ -0.72
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 POF1BQ8WVV4 589 aa10.54□□□□□ -0.72
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 APOL5Q9BWW9 433 aa10.54□□□□□ -0.72
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CLMPQ9H6B4 373 aa10.54□□□□□ -0.72
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP10.54□□□□□ -0.72
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CABP5Q9NP86 173 aa10.54□□□□□ -0.72
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 RAB23Q9ULC3 237 aa10.54□□□□□ -0.72
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PALD1Q9ULE6 856 aa10.54□□□□□ -0.72
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 EMSYQ7Z589 1322 aa10.54□□□□□ -0.72
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 VWA5AO00534 786 aa10.54□□□□□ -0.72
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 WDR46O15213 610 aaKnown RBP10.54□□□□□ -0.72
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CACNA1FO60840 1977 aa10.54□□□□□ -0.72
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 FLT1P17948 1338 aa10.54□□□□□ -0.72
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 GSTO1P78417 241 aa10.54□□□□□ -0.72
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PSAPL1Q6NUJ1 521 aa10.54□□□□□ -0.72
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 RUNDC1Q96C34 613 aa10.54□□□□□ -0.72
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PLXNA4Q9HCM2 1894 aa10.54□□□□□ -0.72
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CYP26B1Q9NR63 512 aa10.54□□□□□ -0.72
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CDH22Q9UJ99 828 aa10.54□□□□□ -0.72
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 DENND4AQ7Z401 1863 aa10.53□□□□□ -0.72
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP10.53□□□□□ -0.72
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TOP3BO95985 862 aaKnown RBP10.53□□□□□ -0.72
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CSTF1Q05048 431 aaKnown RBP10.53□□□□□ -0.72
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP10.53□□□□□ -0.72
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa10.53□□□□□ -0.72
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TAPT1Q6NXT6 567 aa10.53□□□□□ -0.72
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ERICH6Q7L0X2 663 aa10.53□□□□□ -0.72
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 G2E3Q7L622 706 aa10.53□□□□□ -0.72
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SESTD1Q86VW0 696 aa10.53□□□□□ -0.72
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa10.53□□□□□ -0.72
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PDGFCQ9NRA1 345 aa10.53□□□□□ -0.72
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TRIM35Q9UPQ4 493 aa10.53□□□□□ -0.72
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa10.52□□□□□ -0.72
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CAPNS1P04632 268 aa10.52□□□□□ -0.72
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 MMP3P08254 477 aa10.52□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21 ms