RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429738.1

MRPL28-203, Transcript of mitochondrial ribosomal protein L28, human

TSL 2 BASIC

Gene MRPL28, Length 310 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MRPL28-203	ENST00000429738	OR6J1	Q8NGC5	347 aa		20.62	■□□□□ 0.89
MRPL28-203	ENST00000429738	IGDCC4	Q8TDY8	1250 aa		20.62	■□□□□ 0.89
MRPL28-203	ENST00000429738	NSUN6	Q8TEA1	469 aa	Known RBP	20.62	■□□□□ 0.89
MRPL28-203	ENST00000429738	SCLY	Q96I15	445 aa		20.62	■□□□□ 0.89
MRPL28-203	ENST00000429738	TCF20	Q9UGU0	1960 aa	Known RBP	20.62	■□□□□ 0.89
MRPL28-203	ENST00000429738	PRRC2B	Q5JSZ5	2229 aa	Known RBP	20.62	■□□□□ 0.89
MRPL28-203	ENST00000429738	ZBBX	A8MT70	800 aa		20.61	■□□□□ 0.89
MRPL28-203	ENST00000429738	CYTH3	O43739	400 aa		20.61	■□□□□ 0.89
MRPL28-203	ENST00000429738	ARIH2	O95376	493 aa		20.61	■□□□□ 0.89
MRPL28-203	ENST00000429738	PFKM	P08237	780 aa		20.61	■□□□□ 0.89
MRPL28-203	ENST00000429738	ATP2A2	P16615	1042 aa	Known RBP	20.61	■□□□□ 0.89
MRPL28-203	ENST00000429738	HSD17B4	P51659	736 aa		20.61	■□□□□ 0.89
MRPL28-203	ENST00000429738	SART3	Q15020	963 aa	Known RBP	20.61	■□□□□ 0.89
MRPL28-203	ENST00000429738	CCDC62	Q6P9F0	684 aa		20.61	■□□□□ 0.89
MRPL28-203	ENST00000429738	CHST3	Q7LGC8	479 aa		20.61	■□□□□ 0.89
MRPL28-203	ENST00000429738	IWS1	Q96ST2	819 aa		20.61	■□□□□ 0.89
MRPL28-203	ENST00000429738	POLR3E	Q9NVU0	708 aa		20.61	■□□□□ 0.89
MRPL28-203	ENST00000429738	RAPGEFL1	Q9UHV5	662 aa		20.61	■□□□□ 0.89
MRPL28-203	ENST00000429738		A6NJR5	290 aa		20.6	■□□□□ 0.89
MRPL28-203	ENST00000429738	BMP1	P13497	986 aa		20.6	■□□□□ 0.89
MRPL28-203	ENST00000429738	TTLL4	Q14679	1199 aa		20.6	■□□□□ 0.89
MRPL28-203	ENST00000429738	CENPQ	Q7L2Z9	268 aa	Predicted RBP	20.6	■□□□□ 0.89
MRPL28-203	ENST00000429738	COPS5	Q92905	334 aa		20.6	■□□□□ 0.89
MRPL28-203	ENST00000429738	RMDN3	Q96TC7	470 aa		20.6	■□□□□ 0.89
MRPL28-203	ENST00000429738	ESYT1	Q9BSJ8	1104 aa		20.6	■□□□□ 0.89
MRPL28-203	ENST00000429738	MTA3	Q9BTC8	594 aa		20.6	■□□□□ 0.89
MRPL28-203	ENST00000429738	TRMT13	Q9NUP7	481 aa	Known RBP	20.6	■□□□□ 0.89
MRPL28-203	ENST00000429738	MAP3K20	Q9NYL2	800 aa	Known RBP	20.6	■□□□□ 0.89
MRPL28-203	ENST00000429738	CFB	P00751	764 aa		20.59	■□□□□ 0.89
MRPL28-203	ENST00000429738	TXN	P10599	105 aa	Known RBP	20.59	■□□□□ 0.89
MRPL28-203	ENST00000429738	CYP2C9	P11712	490 aa		20.59	■□□□□ 0.89
MRPL28-203	ENST00000429738	AAK1	Q2M2I8	961 aa		20.59	■□□□□ 0.89
MRPL28-203	ENST00000429738	BMP2KL	Q5H9B9	411 aa		20.59	■□□□□ 0.89
MRPL28-203	ENST00000429738	TMEM67	Q5HYA8	995 aa		20.59	■□□□□ 0.89
MRPL28-203	ENST00000429738	MICALL1	Q8N3F8	863 aa		20.59	■□□□□ 0.89
MRPL28-203	ENST00000429738	SAMD3	Q8N6K7	520 aa		20.59	■□□□□ 0.89
MRPL28-203	ENST00000429738	PCDHA1	Q9Y5I3	950 aa		20.59	■□□□□ 0.89
MRPL28-203	ENST00000429738	POU3F3	P20264	500 aa	Predicted RBP	20.58	■□□□□ 0.89
MRPL28-203	ENST00000429738	STXBP2	Q15833	593 aa		20.58	■□□□□ 0.89
MRPL28-203	ENST00000429738	PIGS	Q96S52	555 aa		20.58	■□□□□ 0.89
MRPL28-203	ENST00000429738	MAP3K14	Q99558	947 aa		20.58	■□□□□ 0.89
MRPL28-203	ENST00000429738	MTG1	Q9BT17	334 aa	Predicted RBP	20.58	■□□□□ 0.89
MRPL28-203	ENST00000429738	LY9	Q9HBG7	655 aa		20.58	■□□□□ 0.89
MRPL28-203	ENST00000429738	PXMP2	Q9NR77	195 aa		20.58	■□□□□ 0.89
MRPL28-203	ENST00000429738	TRANK1	O15050	2925 aa		20.57	■□□□□ 0.88
MRPL28-203	ENST00000429738	MYL3	P08590	195 aa		20.57	■□□□□ 0.88
MRPL28-203	ENST00000429738	NECTIN1	Q15223	517 aa		20.57	■□□□□ 0.88
MRPL28-203	ENST00000429738	BRDT	Q58F21	947 aa	Predicted RBP	20.57	■□□□□ 0.88
MRPL28-203	ENST00000429738	ARHGEF16	Q5VV41	709 aa		20.57	■□□□□ 0.88
MRPL28-203	ENST00000429738	DEFB128	Q7Z7B8	93 aa		20.57	■□□□□ 0.88
MRPL28-203	ENST00000429738	CATIP	Q7Z7H3	387 aa		20.57	■□□□□ 0.88
MRPL28-203	ENST00000429738	NECAB3	Q96P71	396 aa	Predicted RBP	20.57	■□□□□ 0.88
MRPL28-203	ENST00000429738	SLC27A2	O14975	620 aa		20.56	■□□□□ 0.88
MRPL28-203	ENST00000429738	KPNA6	O60684	536 aa		20.56	■□□□□ 0.88
MRPL28-203	ENST00000429738	NR3C2	P08235	984 aa		20.56	■□□□□ 0.88
MRPL28-203	ENST00000429738	ACTN1	P12814	892 aa		20.56	■□□□□ 0.88
MRPL28-203	ENST00000429738	EIF2AK2	P19525	551 aa	Known RBP	20.56	■□□□□ 0.88
MRPL28-203	ENST00000429738	TFF2	Q03403	129 aa		20.56	■□□□□ 0.88
MRPL28-203	ENST00000429738	TRAF1	Q13077	416 aa		20.56	■□□□□ 0.88
MRPL28-203	ENST00000429738	COL9A3	Q14050	684 aa	Predicted RBP	20.56	■□□□□ 0.88
MRPL28-203	ENST00000429738	SEPT14	Q6ZU15	432 aa		20.56	■□□□□ 0.88
MRPL28-203	ENST00000429738	SKAP1	Q86WV1	359 aa		20.56	■□□□□ 0.88
MRPL28-203	ENST00000429738	HOMER1	Q86YM7	354 aa		20.56	■□□□□ 0.88
MRPL28-203	ENST00000429738	GPHN	Q9NQX3	736 aa	Predicted RBP	20.56	■□□□□ 0.88
MRPL28-203	ENST00000429738	MTCH2	Q9Y6C9	303 aa		20.56	■□□□□ 0.88
MRPL28-203	ENST00000429738	REV3L	O60673	3130 aa		20.56	■□□□□ 0.88
MRPL28-203	ENST00000429738	MYH7B	A7E2Y1	1941 aa		20.55	■□□□□ 0.88
MRPL28-203	ENST00000429738	PNMA6F	A0A0J9YX94	578 aa		20.55	■□□□□ 0.88
MRPL28-203	ENST00000429738	RFXAP	O00287	272 aa		20.55	■□□□□ 0.88
MRPL28-203	ENST00000429738	GTPBP6	O43824	516 aa	Predicted RBP	20.55	■□□□□ 0.88
MRPL28-203	ENST00000429738	EIF3J	O75822	258 aa	Known RBP	20.55	■□□□□ 0.88
MRPL28-203	ENST00000429738	CA3	P07451	260 aa		20.55	■□□□□ 0.88
MRPL28-203	ENST00000429738	RFC2	P35250	354 aa		20.55	■□□□□ 0.88
MRPL28-203	ENST00000429738	ARHGAP1	Q07960	439 aa		20.55	■□□□□ 0.88
MRPL28-203	ENST00000429738	SKIV2L	Q15477	1246 aa	Known RBP	20.55	■□□□□ 0.88
MRPL28-203	ENST00000429738	LY6K	Q17RY6	165 aa		20.55	■□□□□ 0.88
MRPL28-203	ENST00000429738	CREB3L3	Q68CJ9	461 aa		20.55	■□□□□ 0.88
MRPL28-203	ENST00000429738	PHOSPHO2	Q8TCD6	241 aa		20.55	■□□□□ 0.88
MRPL28-203	ENST00000429738	PDCD2L	Q9BRP1	358 aa		20.55	■□□□□ 0.88
MRPL28-203	ENST00000429738	C1QTNF1	Q9BXJ1	281 aa		20.55	■□□□□ 0.88
MRPL28-203	ENST00000429738	DDX41	Q9UJV9	622 aa	Known RBP	20.55	■□□□□ 0.88
MRPL28-203	ENST00000429738	SCN5A	Q14524	2016 aa		20.54	■□□□□ 0.88
MRPL28-203	ENST00000429738	SH2B2	O14492	632 aa	Predicted RBP	20.54	■□□□□ 0.88
MRPL28-203	ENST00000429738	PRC1	O43663	620 aa		20.54	■□□□□ 0.88
MRPL28-203	ENST00000429738	RGS20	O76081	388 aa		20.54	■□□□□ 0.88
MRPL28-203	ENST00000429738	DDAH1	O94760	285 aa		20.54	■□□□□ 0.88
MRPL28-203	ENST00000429738	GH1	P01241	217 aa		20.54	■□□□□ 0.88
MRPL28-203	ENST00000429738	MMP3	P08254	477 aa		20.54	■□□□□ 0.88
MRPL28-203	ENST00000429738	MCM5	P33992	734 aa		20.54	■□□□□ 0.88
MRPL28-203	ENST00000429738	NBPF20	Q3BBV1	942 aa		20.54	■□□□□ 0.88
MRPL28-203	ENST00000429738	NFRKB	Q6P4R8	1299 aa		20.54	■□□□□ 0.88
MRPL28-203	ENST00000429738	CASC1	Q6TDU7	716 aa		20.54	■□□□□ 0.88
MRPL28-203	ENST00000429738	ZNF654	Q8IZM8	581 aa		20.54	■□□□□ 0.88
MRPL28-203	ENST00000429738	EMID1	Q96A84	441 aa	Predicted RBP	20.54	■□□□□ 0.88
MRPL28-203	ENST00000429738	TMEM87B	Q96K49	555 aa		20.54	■□□□□ 0.88
MRPL28-203	ENST00000429738	SLC9A7	Q96T83	725 aa		20.54	■□□□□ 0.88
MRPL28-203	ENST00000429738	SPZ1	Q9BXG8	430 aa		20.54	■□□□□ 0.88
MRPL28-203	ENST00000429738	XIRP2	A4UGR9	3374 aa		20.54	■□□□□ 0.88
MRPL28-203	ENST00000429738	SMARCA1	P28370	1054 aa		20.53	■□□□□ 0.88
MRPL28-203	ENST00000429738	HOXA13	P31271	388 aa	Predicted RBP	20.53	■□□□□ 0.88

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