RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428678.1

UPK3BP1-201, Transcript of uroplakin 3B pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene UPK3BP1, Length 509 nt, Biotype transcribed unprocessed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPK3BP1-201ENST00000428678 TAAR1Q96RJ0 339 aa21.43■■□□□ 1.02
UPK3BP1-201ENST00000428678 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
UPK3BP1-201ENST00000428678 EPHX3Q9H6B9 360 aa21.43■■□□□ 1.02
UPK3BP1-201ENST00000428678 ABCB11O95342 1321 aa21.43■■□□□ 1.02
UPK3BP1-201ENST00000428678 CCDC171Q6TFL3 1326 aa21.43■■□□□ 1.02
UPK3BP1-201ENST00000428678 MYH6P13533 1939 aa21.43■■□□□ 1.02
UPK3BP1-201ENST00000428678 NEDD4P46934 1319 aa21.42■■□□□ 1.02
UPK3BP1-201ENST00000428678 GPNMBQ14956 572 aa21.42■■□□□ 1.02
UPK3BP1-201ENST00000428678 STXBP2Q15833 593 aa21.42■■□□□ 1.02
UPK3BP1-201ENST00000428678 CNKSR3Q6P9H4 555 aa21.42■■□□□ 1.02
UPK3BP1-201ENST00000428678 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
UPK3BP1-201ENST00000428678 RMDN3Q96TC7 470 aa21.42■■□□□ 1.02
UPK3BP1-201ENST00000428678 COL20A1Q9P218 1284 aa21.42■■□□□ 1.02
UPK3BP1-201ENST00000428678 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa21.41■■□□□ 1.02
UPK3BP1-201ENST00000428678 PARNO95453 639 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
UPK3BP1-201ENST00000428678 DGKDQ16760 1214 aa21.41■■□□□ 1.02
UPK3BP1-201ENST00000428678 C7orf31Q8N865 590 aa21.41■■□□□ 1.02
UPK3BP1-201ENST00000428678 PNMA1Q8ND90 353 aa21.41■■□□□ 1.02
UPK3BP1-201ENST00000428678 ALG1Q9BT22 464 aa21.41■■□□□ 1.02
UPK3BP1-201ENST00000428678 HDAC6Q9UBN7 1215 aa21.41■■□□□ 1.02
UPK3BP1-201ENST00000428678 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa21.41■■□□□ 1.02
UPK3BP1-201ENST00000428678 MTUS1Q9ULD2 1270 aa21.41■■□□□ 1.02
UPK3BP1-201ENST00000428678 NBNO60934 754 aa21.4■■□□□ 1.02
UPK3BP1-201ENST00000428678 CKBP12277 381 aa21.4■■□□□ 1.02
UPK3BP1-201ENST00000428678 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
UPK3BP1-201ENST00000428678 PSEN2P49810 448 aa21.4■■□□□ 1.02
UPK3BP1-201ENST00000428678 RBL2Q08999 1139 aa21.4■■□□□ 1.02
UPK3BP1-201ENST00000428678 ARHGEF16Q5VV41 709 aa21.4■■□□□ 1.02
UPK3BP1-201ENST00000428678 DGKHQ86XP1 1220 aa21.4■■□□□ 1.02
UPK3BP1-201ENST00000428678 TICAM2Q86XR7 235 aa21.4■■□□□ 1.02
UPK3BP1-201ENST00000428678 MCF2L2Q86YR7 1114 aa21.4■■□□□ 1.02
UPK3BP1-201ENST00000428678 ADGRF4Q8IZF3 695 aa21.4■■□□□ 1.02
UPK3BP1-201ENST00000428678 RILPL2Q969X0 211 aa21.4■■□□□ 1.02
UPK3BP1-201ENST00000428678 IWS1Q96ST2 819 aa21.4■■□□□ 1.02
UPK3BP1-201ENST00000428678 MAF1Q9H063 256 aa21.4■■□□□ 1.02
UPK3BP1-201ENST00000428678 KAT14Q9H8E8 782 aa21.4■■□□□ 1.02
UPK3BP1-201ENST00000428678 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.01
UPK3BP1-201ENST00000428678 CXCL10P02778 98 aa21.39■■□□□ 1.01
UPK3BP1-201ENST00000428678 QRICH1Q2TAL8 776 aa21.39■■□□□ 1.01
UPK3BP1-201ENST00000428678 IQCA1Q86XH1 822 aa21.39■■□□□ 1.01
UPK3BP1-201ENST00000428678 CRBNQ96SW2 442 aa21.39■■□□□ 1.01
UPK3BP1-201ENST00000428678 RAD9AQ99638 391 aa21.39■■□□□ 1.01
UPK3BP1-201ENST00000428678 LRFN3Q9BTN0 628 aa21.39■■□□□ 1.01
UPK3BP1-201ENST00000428678 KATNAL1Q9BW62 490 aa21.39■■□□□ 1.01
UPK3BP1-201ENST00000428678 LMCD1Q9NZU5 365 aa21.39■■□□□ 1.01
UPK3BP1-201ENST00000428678 MYH7BA7E2Y1 1941 aa21.39■■□□□ 1.01
UPK3BP1-201ENST00000428678 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa21.38■■□□□ 1.01
UPK3BP1-201ENST00000428678 ZNF213O14771 459 aa21.38■■□□□ 1.01
UPK3BP1-201ENST00000428678 GJB5O95377 273 aa21.38■■□□□ 1.01
UPK3BP1-201ENST00000428678 ZNF286BP0CG31 522 aa21.38■■□□□ 1.01
UPK3BP1-201ENST00000428678 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
UPK3BP1-201ENST00000428678 MFSD10Q14728 455 aa21.38■■□□□ 1.01
UPK3BP1-201ENST00000428678 TCTN1Q2MV58 587 aa21.38■■□□□ 1.01
UPK3BP1-201ENST00000428678 CCDC178Q5BJE1 867 aa21.38■■□□□ 1.01
UPK3BP1-201ENST00000428678 TMEM31Q5JXX7 168 aa21.38■■□□□ 1.01
UPK3BP1-201ENST00000428678 FAM117BQ6P1L5 589 aa21.38■■□□□ 1.01
UPK3BP1-201ENST00000428678 FBXO11Q86XK2 927 aa21.38■■□□□ 1.01
UPK3BP1-201ENST00000428678 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
UPK3BP1-201ENST00000428678 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
UPK3BP1-201ENST00000428678 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
UPK3BP1-201ENST00000428678 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa21.38■■□□□ 1.01
UPK3BP1-201ENST00000428678 MRVI1Q9Y6F6 885 aa21.38■■□□□ 1.01
UPK3BP1-201ENST00000428678 LAMA4Q16363 1823 aa21.37■■□□□ 1.01
UPK3BP1-201ENST00000428678 EFCAB14O75071 495 aa21.37■■□□□ 1.01
UPK3BP1-201ENST00000428678 KDM4AO75164 1064 aa21.37■■□□□ 1.01
UPK3BP1-201ENST00000428678 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
UPK3BP1-201ENST00000428678 PTK7Q13308 1070 aa21.37■■□□□ 1.01
UPK3BP1-201ENST00000428678 IKBKEQ14164 716 aa21.37■■□□□ 1.01
UPK3BP1-201ENST00000428678 KIAA0753Q2KHM9 967 aa21.37■■□□□ 1.01
UPK3BP1-201ENST00000428678 ASPRV1Q53RT3 343 aa21.37■■□□□ 1.01
UPK3BP1-201ENST00000428678 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP21.37■■□□□ 1.01
UPK3BP1-201ENST00000428678 SUGCTQ9HAC7 445 aa21.37■■□□□ 1.01
UPK3BP1-201ENST00000428678 VAT1LQ9HCJ6 419 aa21.37■■□□□ 1.01
UPK3BP1-201ENST00000428678 PIEZO1Q92508 2521 aa21.37■■□□□ 1.01
UPK3BP1-201ENST00000428678 MUC6Q6W4X9 2439 aa21.36■■□□□ 1.01
UPK3BP1-201ENST00000428678 LINC01553A4QN01 128 aa21.36■■□□□ 1.01
UPK3BP1-201ENST00000428678 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa21.36■■□□□ 1.01
UPK3BP1-201ENST00000428678 F2P00734 622 aa21.36■■□□□ 1.01
UPK3BP1-201ENST00000428678 CFBP00751 764 aa21.36■■□□□ 1.01
UPK3BP1-201ENST00000428678 ERVK-21P61565 698 aa21.36■■□□□ 1.01
UPK3BP1-201ENST00000428678 LAMC2Q13753 1193 aa21.36■■□□□ 1.01
UPK3BP1-201ENST00000428678 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
UPK3BP1-201ENST00000428678 PPTC7Q8NI37 304 aa21.36■■□□□ 1.01
UPK3BP1-201ENST00000428678 PXMP2Q9NR77 195 aa21.36■■□□□ 1.01
UPK3BP1-201ENST00000428678 SIP14410 1827 aa21.36■■□□□ 1.01
UPK3BP1-201ENST00000428678 NR3C2P08235 984 aa21.35■■□□□ 1.01
UPK3BP1-201ENST00000428678 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP21.35■■□□□ 1.01
UPK3BP1-201ENST00000428678 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP21.35■■□□□ 1.01
UPK3BP1-201ENST00000428678 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP21.35■■□□□ 1.01
UPK3BP1-201ENST00000428678 ZNF618Q5T7W0 954 aa21.35■■□□□ 1.01
UPK3BP1-201ENST00000428678 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP21.35■■□□□ 1.01
UPK3BP1-201ENST00000428678 WNT8BQ93098 351 aa21.35■■□□□ 1.01
UPK3BP1-201ENST00000428678 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP21.35■■□□□ 1.01
UPK3BP1-201ENST00000428678 LNPKQ9C0E8 428 aa21.35■■□□□ 1.01
UPK3BP1-201ENST00000428678 B4E1Z4 1266 aa21.34■■□□□ 1.01
UPK3BP1-201ENST00000428678 HAS3O00219 553 aa21.34■■□□□ 1.01
UPK3BP1-201ENST00000428678 SORBS3O60504 671 aa21.34■■□□□ 1.01
UPK3BP1-201ENST00000428678 SDSP20132 328 aa21.34■■□□□ 1.01
UPK3BP1-201ENST00000428678 NT5C2P49902 561 aa21.34■■□□□ 1.01
UPK3BP1-201ENST00000428678 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 383.9 ms