RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428534.1

GLI3-202, Transcript of GLI family zinc finger 3, humanhuman

TSL 4

Gene GLI3, Length 583 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI3-202ENST00000428534 LCTP09848 1927 aa26.85■■□□□ 1.89
GLI3-202ENST00000428534 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP26.85■■□□□ 1.89
GLI3-202ENST00000428534 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP26.85■■□□□ 1.89
GLI3-202ENST00000428534 DUSP28Q4G0W2 176 aa26.85■■□□□ 1.89
GLI3-202ENST00000428534 PCNX4Q63HM2 1172 aa26.85■■□□□ 1.89
GLI3-202ENST00000428534 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP26.85■■□□□ 1.89
GLI3-202ENST00000428534 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP26.85■■□□□ 1.89
GLI3-202ENST00000428534 VPS54Q9P1Q0 977 aa26.85■■□□□ 1.89
GLI3-202ENST00000428534 DNM1LO00429 736 aa26.84■■□□□ 1.89
GLI3-202ENST00000428534 PPFIA3O75145 1194 aa26.84■■□□□ 1.89
GLI3-202ENST00000428534 CTDNEP1O95476 244 aa26.84■■□□□ 1.89
GLI3-202ENST00000428534 TGFB3P10600 412 aa26.84■■□□□ 1.89
GLI3-202ENST00000428534 ADCYAP1R1P41586 468 aa26.84■■□□□ 1.89
GLI3-202ENST00000428534 UBE2SQ16763 222 aa26.84■■□□□ 1.89
GLI3-202ENST00000428534 AP5M1Q9H0R1 490 aa26.84■■□□□ 1.89
GLI3-202ENST00000428534 KBTBD13C9JR72 458 aa26.83■■□□□ 1.89
GLI3-202ENST00000428534 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP26.83■■□□□ 1.89
GLI3-202ENST00000428534 CLK2P49760 499 aaKnown RBP26.83■■□□□ 1.89
GLI3-202ENST00000428534 NECAB2Q7Z6G3 386 aa26.83■■□□□ 1.89
GLI3-202ENST00000428534 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa26.83■■□□□ 1.89
GLI3-202ENST00000428534 CCDC83Q8IWF9 413 aa26.83■■□□□ 1.89
GLI3-202ENST00000428534 GJA9P57773 515 aa26.82■■□□□ 1.88
GLI3-202ENST00000428534 ANO1Q5XXA6 986 aa26.82■■□□□ 1.88
GLI3-202ENST00000428534 SEPT14Q6ZU15 432 aa26.82■■□□□ 1.88
GLI3-202ENST00000428534 NLRX1Q86UT6 975 aa26.82■■□□□ 1.88
GLI3-202ENST00000428534 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP26.82■■□□□ 1.88
GLI3-202ENST00000428534 PDGFCQ9NRA1 345 aa26.82■■□□□ 1.88
GLI3-202ENST00000428534 PCDHA4Q9UN74 947 aa26.82■■□□□ 1.88
GLI3-202ENST00000428534 KIF3AQ9Y496 699 aa26.82■■□□□ 1.88
GLI3-202ENST00000428534 ZEB2O60315 1214 aa26.81■■□□□ 1.88
GLI3-202ENST00000428534 TXNP10599 105 aaKnown RBP26.81■■□□□ 1.88
GLI3-202ENST00000428534 NKX3-2P78367 333 aa26.81■■□□□ 1.88
GLI3-202ENST00000428534 TRIM29Q14134 588 aa26.81■■□□□ 1.88
GLI3-202ENST00000428534 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP26.81■■□□□ 1.88
GLI3-202ENST00000428534 CDHR1Q96JP9 859 aa26.81■■□□□ 1.88
GLI3-202ENST00000428534 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP26.81■■□□□ 1.88
GLI3-202ENST00000428534 ALG1Q9BT22 464 aa26.81■■□□□ 1.88
GLI3-202ENST00000428534 ANO3Q9BYT9 981 aa26.81■■□□□ 1.88
GLI3-202ENST00000428534 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP26.81■■□□□ 1.88
GLI3-202ENST00000428534 BRMS1Q9HCU9 246 aa26.81■■□□□ 1.88
GLI3-202ENST00000428534 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP26.81■■□□□ 1.88
GLI3-202ENST00000428534 MRVI1Q9Y6F6 885 aa26.81■■□□□ 1.88
GLI3-202ENST00000428534 MAFGO15525 162 aa26.8■■□□□ 1.88
GLI3-202ENST00000428534 SMPD1P17405 629 aa26.8■■□□□ 1.88
GLI3-202ENST00000428534 DAGLBQ8NCG7 672 aa26.8■■□□□ 1.88
GLI3-202ENST00000428534 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP26.79■■□□□ 1.88
GLI3-202ENST00000428534 CST5P28325 142 aaPredicted RBP26.79■■□□□ 1.88
GLI3-202ENST00000428534 LRRC41Q15345 812 aa26.79■■□□□ 1.88
GLI3-202ENST00000428534 TLK2Q86UE8 772 aa26.79■■□□□ 1.88
GLI3-202ENST00000428534 BLIDQ8IZY5 108 aa26.79■■□□□ 1.88
GLI3-202ENST00000428534 FAM184AQ8NB25 1140 aa26.79■■□□□ 1.88
GLI3-202ENST00000428534 DPF3Q92784 378 aa26.79■■□□□ 1.88
GLI3-202ENST00000428534 TMX3Q96JJ7 454 aa26.79■■□□□ 1.88
GLI3-202ENST00000428534 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP26.79■■□□□ 1.88
GLI3-202ENST00000428534 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP26.79■■□□□ 1.88
GLI3-202ENST00000428534 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa26.79■■□□□ 1.88
GLI3-202ENST00000428534 MCM3APO60318 1980 aa26.78■■□□□ 1.88
GLI3-202ENST00000428534 MOXD2PA6NHM9 499 aa26.78■■□□□ 1.88
GLI3-202ENST00000428534 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP26.78■■□□□ 1.88
GLI3-202ENST00000428534 ADAMTS4O75173 837 aa26.78■■□□□ 1.88
GLI3-202ENST00000428534 PGK1P00558 417 aa26.78■■□□□ 1.88
GLI3-202ENST00000428534 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP26.78■■□□□ 1.88
GLI3-202ENST00000428534 SREBF1P36956 1147 aa26.78■■□□□ 1.88
GLI3-202ENST00000428534 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa26.78■■□□□ 1.88
GLI3-202ENST00000428534 CCDC62Q6P9F0 684 aa26.78■■□□□ 1.88
GLI3-202ENST00000428534 IL31RAQ8NI17 732 aa26.78■■□□□ 1.88
GLI3-202ENST00000428534 HTATIP2Q9BUP3 242 aa26.78■■□□□ 1.88
GLI3-202ENST00000428534 PHF20Q9BVI0 1012 aa26.78■■□□□ 1.88
GLI3-202ENST00000428534 C11orf49Q9H6J7 331 aa26.78■■□□□ 1.88
GLI3-202ENST00000428534 LRRC37A2A6NM11 1700 aa26.77■■□□□ 1.88
GLI3-202ENST00000428534 FIBPO43427 364 aa26.77■■□□□ 1.88
GLI3-202ENST00000428534 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP26.77■■□□□ 1.88
GLI3-202ENST00000428534 FDPSP14324 419 aaKnown RBP26.77■■□□□ 1.88
GLI3-202ENST00000428534 ICAM3P32942 547 aa26.77■■□□□ 1.88
GLI3-202ENST00000428534 CPT1AP50416 773 aa26.77■■□□□ 1.88
GLI3-202ENST00000428534 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP26.77■■□□□ 1.88
GLI3-202ENST00000428534 CHRDL2Q6WN34 429 aa26.77■■□□□ 1.88
GLI3-202ENST00000428534 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP26.77■■□□□ 1.88
GLI3-202ENST00000428534 KLHDC9Q8NEP7 349 aa26.77■■□□□ 1.88
GLI3-202ENST00000428534 GPRASP2Q96D09 838 aa26.77■■□□□ 1.88
GLI3-202ENST00000428534 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP26.77■■□□□ 1.88
GLI3-202ENST00000428534 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP26.77■■□□□ 1.88
GLI3-202ENST00000428534 GH1P01241 217 aa26.76■■□□□ 1.87
GLI3-202ENST00000428534 GNASQ5JWF2 1037 aa26.76■■□□□ 1.87
GLI3-202ENST00000428534 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP26.76■■□□□ 1.87
GLI3-202ENST00000428534 OR6J1Q8NGC5 347 aa26.76■■□□□ 1.87
GLI3-202ENST00000428534 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP26.76■■□□□ 1.87
GLI3-202ENST00000428534 TMEM260Q9NX78 707 aa26.76■■□□□ 1.87
GLI3-202ENST00000428534 ALPK3Q96L96 1907 aa26.76■■□□□ 1.87
GLI3-202ENST00000428534 JAK2O60674 1132 aa26.75■■□□□ 1.87
GLI3-202ENST00000428534 CYP3A4P08684 503 aa26.75■■□□□ 1.87
GLI3-202ENST00000428534 ZNF76P36508 570 aa26.75■■□□□ 1.87
GLI3-202ENST00000428534 ST3GAL1Q11201 340 aa26.75■■□□□ 1.87
GLI3-202ENST00000428534 LAMC2Q13753 1193 aa26.75■■□□□ 1.87
GLI3-202ENST00000428534 NEDD9Q14511 834 aa26.75■■□□□ 1.87
GLI3-202ENST00000428534 AIFM3Q96NN9 605 aa26.75■■□□□ 1.87
GLI3-202ENST00000428534 RTEL1Q9NZ71 1219 aa26.75■■□□□ 1.87
GLI3-202ENST00000428534 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa26.74■■□□□ 1.87
GLI3-202ENST00000428534 ADCY6O43306 1168 aa26.74■■□□□ 1.87
GLI3-202ENST00000428534 KPNA6O60684 536 aa26.74■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.3 ms