RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000421540.1

NFS1-207, Transcript of NFS1, cysteine desulfurase, humanhuman

TSL 5

Gene NFS1, Length 563 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFS1-207ENST00000421540 KCNB2Q92953 911 aa22.7■■□□□ 1.22
NFS1-207ENST00000421540 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
NFS1-207ENST00000421540 LCTP09848 1927 aa22.7■■□□□ 1.22
NFS1-207ENST00000421540 GRIN2DO15399 1336 aa22.69■■□□□ 1.22
NFS1-207ENST00000421540 CD4P01730 458 aa22.69■■□□□ 1.22
NFS1-207ENST00000421540 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa22.69■■□□□ 1.22
NFS1-207ENST00000421540 PSMA5P28066 241 aa22.69■■□□□ 1.22
NFS1-207ENST00000421540 LAMC2Q13753 1193 aa22.69■■□□□ 1.22
NFS1-207ENST00000421540 SHHQ15465 462 aa22.69■■□□□ 1.22
NFS1-207ENST00000421540 MFSD5Q6N075 450 aa22.69■■□□□ 1.22
NFS1-207ENST00000421540 GPR153Q6NV75 609 aa22.69■■□□□ 1.22
NFS1-207ENST00000421540 TMEM199Q8N511 208 aa22.69■■□□□ 1.22
NFS1-207ENST00000421540 AFG1LQ8WV93 481 aa22.69■■□□□ 1.22
NFS1-207ENST00000421540 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
NFS1-207ENST00000421540 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
NFS1-207ENST00000421540 TGFB3P10600 412 aa22.68■■□□□ 1.22
NFS1-207ENST00000421540 CASTP20810 708 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
NFS1-207ENST00000421540 RTN1Q16799 776 aa22.68■■□□□ 1.22
NFS1-207ENST00000421540 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa22.68■■□□□ 1.22
NFS1-207ENST00000421540 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
NFS1-207ENST00000421540 PSTPIP2Q9H939 334 aa22.68■■□□□ 1.22
NFS1-207ENST00000421540 LRRC37A2A6NM11 1700 aa22.68■■□□□ 1.22
NFS1-207ENST00000421540 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa22.67■■□□□ 1.22
NFS1-207ENST00000421540 PIK3CDO00329 1044 aa22.67■■□□□ 1.22
NFS1-207ENST00000421540 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
NFS1-207ENST00000421540 STAM2O75886 525 aa22.67■■□□□ 1.22
NFS1-207ENST00000421540 ARHGAP1Q07960 439 aa22.67■■□□□ 1.22
NFS1-207ENST00000421540 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP22.67■■□□□ 1.228e-9■■□□□ 13.7
NFS1-207ENST00000421540 DGKDQ16760 1214 aa22.67■■□□□ 1.22
NFS1-207ENST00000421540 GNPTABQ3T906 1256 aa22.67■■□□□ 1.22
NFS1-207ENST00000421540 FAM47CQ5HY64 1035 aa22.67■■□□□ 1.22
NFS1-207ENST00000421540 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa22.67■■□□□ 1.22
NFS1-207ENST00000421540 TRPV6Q9H1D0 765 aa22.67■■□□□ 1.22
NFS1-207ENST00000421540 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP22.67■■□□□ 1.22
NFS1-207ENST00000421540 BRPF3Q9ULD4 1205 aa22.67■■□□□ 1.22
NFS1-207ENST00000421540 SNX14Q9Y5W7 946 aa22.67■■□□□ 1.22
NFS1-207ENST00000421540 DNAH12Q6ZR08 3092 aa22.67■■□□□ 1.22
NFS1-207ENST00000421540 B4GALT4O60513 344 aa22.66■■□□□ 1.22
NFS1-207ENST00000421540 MMP3P08254 477 aa22.66■■□□□ 1.22
NFS1-207ENST00000421540 RCAN1P53805 252 aa22.66■■□□□ 1.22
NFS1-207ENST00000421540 NBPF20Q3BBV1 942 aa22.66■■□□□ 1.22
NFS1-207ENST00000421540 C9orf50Q5SZB4 431 aa22.66■■□□□ 1.22
NFS1-207ENST00000421540 USP17L6PQ6QN14 398 aa22.66■■□□□ 1.22
NFS1-207ENST00000421540 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa22.66■■□□□ 1.22
NFS1-207ENST00000421540 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
NFS1-207ENST00000421540 HIPK3Q9H422 1215 aa22.66■■□□□ 1.22
NFS1-207ENST00000421540 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa22.65■■□□□ 1.22
NFS1-207ENST00000421540 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa22.65■■□□□ 1.22
NFS1-207ENST00000421540 GOLGA8AA7E2F4 631 aa22.65■■□□□ 1.22
NFS1-207ENST00000421540 GOLGA8BA8MQT2 603 aa22.65■■□□□ 1.22
NFS1-207ENST00000421540 CHMP4BP1P59074 171 aa22.65■■□□□ 1.22
NFS1-207ENST00000421540 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP22.65■■□□□ 1.22
NFS1-207ENST00000421540 XRRA1Q6P2D8 792 aa22.65■■□□□ 1.22
NFS1-207ENST00000421540 NFRKBQ6P4R8 1299 aa22.65■■□□□ 1.22
NFS1-207ENST00000421540 IL31RAQ8NI17 732 aa22.65■■□□□ 1.22
NFS1-207ENST00000421540 MEIS2O14770 477 aa22.64■■□□□ 1.21
NFS1-207ENST00000421540 RGS20O76081 388 aa22.64■■□□□ 1.21
NFS1-207ENST00000421540 Q6ZUG5 572 aa22.64■■□□□ 1.21
NFS1-207ENST00000421540 PPTC7Q8NI37 304 aa22.64■■□□□ 1.21
NFS1-207ENST00000421540 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.21
NFS1-207ENST00000421540 CPA1P15085 419 aa22.63■■□□□ 1.21
NFS1-207ENST00000421540 CYP2C18P33260 490 aa22.63■■□□□ 1.21
NFS1-207ENST00000421540 EPHB4P54760 987 aa22.63■■□□□ 1.21
NFS1-207ENST00000421540 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
NFS1-207ENST00000421540 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
NFS1-207ENST00000421540 SPATA33Q96N06 139 aa22.63■■□□□ 1.21
NFS1-207ENST00000421540 MLXIPQ9HAP2 919 aa22.63■■□□□ 1.21
NFS1-207ENST00000421540 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
NFS1-207ENST00000421540 NOD1Q9Y239 953 aa22.63■■□□□ 1.21
NFS1-207ENST00000421540 V9GY48 417 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
NFS1-207ENST00000421540 MYH6P13533 1939 aa22.63■■□□□ 1.21
NFS1-207ENST00000421540 FRMPD4Q14CM0 1322 aa22.62■■□□□ 1.21
NFS1-207ENST00000421540 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
NFS1-207ENST00000421540 SPDYE3A6NKU9 549 aa22.62■■□□□ 1.21
NFS1-207ENST00000421540 PPFIA4O75335 1185 aa22.62■■□□□ 1.21
NFS1-207ENST00000421540 GGPS1O95749 300 aa22.62■■□□□ 1.21
NFS1-207ENST00000421540 CSF2RAP15509 400 aa22.62■■□□□ 1.21
NFS1-207ENST00000421540 RPS6KB1P23443 525 aa22.62■■□□□ 1.21
NFS1-207ENST00000421540 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP22.62■■□□□ 1.21
NFS1-207ENST00000421540 MYSM1Q5VVJ2 828 aa22.62■■□□□ 1.21
NFS1-207ENST00000421540 PCNX4Q63HM2 1172 aa22.62■■□□□ 1.21
NFS1-207ENST00000421540 BRF1Q92994 677 aa22.62■■□□□ 1.21
NFS1-207ENST00000421540 KATNAL1Q9BW62 490 aa22.62■■□□□ 1.21
NFS1-207ENST00000421540 RTEL1Q9NZ71 1219 aa22.62■■□□□ 1.21
NFS1-207ENST00000421540 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
NFS1-207ENST00000421540 APOBRQ0VD83 1088 aa22.61■■□□□ 1.21
NFS1-207ENST00000421540 NEDD9Q14511 834 aa22.61■■□□□ 1.21
NFS1-207ENST00000421540 NLRX1Q86UT6 975 aa22.61■■□□□ 1.21
NFS1-207ENST00000421540 TEX2Q8IWB9 1127 aa22.61■■□□□ 1.21
NFS1-207ENST00000421540 DEFB123Q8N688 67 aa22.61■■□□□ 1.21
NFS1-207ENST00000421540 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP22.61■■□□□ 1.21
NFS1-207ENST00000421540 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
NFS1-207ENST00000421540 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
NFS1-207ENST00000421540 EHMT1Q9H9B1 1298 aa22.61■■□□□ 1.21
NFS1-207ENST00000421540 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa22.6■■□□□ 1.21
NFS1-207ENST00000421540 hCG_1984214I3L0E3 225 aa22.6■■□□□ 1.21
NFS1-207ENST00000421540 FIBPO43427 364 aa22.6■■□□□ 1.21
NFS1-207ENST00000421540 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
NFS1-207ENST00000421540 ICAM3P32942 547 aa22.6■■□□□ 1.21
NFS1-207ENST00000421540 NAPAP54920 295 aa22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23 ms