RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420964.1

FAAP20-208, Transcript of FA core complex associated protein 20, human

TSL 3

Gene FAAP20, Length 314 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FAAP20-208	ENST00000420964	CPA4	Q9UI42	421 aa		13.98	□□□□□ -0.17
FAAP20-208	ENST00000420964	SRPRB	Q9Y5M8	271 aa	Known RBP	13.98	□□□□□ -0.17
FAAP20-208	ENST00000420964	LRRC37A2	A6NM11	1700 aa		13.98	□□□□□ -0.17
FAAP20-208	ENST00000420964	ZNF236	Q9UL36	1845 aa		13.97	□□□□□ -0.17
FAAP20-208	ENST00000420964	CCDC85C	A6NKD9	419 aa		13.97	□□□□□ -0.17
FAAP20-208	ENST00000420964	FAM86B1	E9PN63	330 aa		13.97	□□□□□ -0.17
FAAP20-208	ENST00000420964	TRAK2	O60296	914 aa		13.97	□□□□□ -0.17
FAAP20-208	ENST00000420964	FAM86B2	P0C5J1	330 aa		13.97	□□□□□ -0.17
FAAP20-208	ENST00000420964	BCR	P11274	1271 aa		13.97	□□□□□ -0.17
FAAP20-208	ENST00000420964	GRIN1	Q05586	938 aa		13.97	□□□□□ -0.17
FAAP20-208	ENST00000420964	CRHR2	Q13324	411 aa		13.97	□□□□□ -0.17
FAAP20-208	ENST00000420964	KCTD2	Q14681	263 aa		13.97	□□□□□ -0.17
FAAP20-208	ENST00000420964	PGM5	Q15124	567 aa		13.97	□□□□□ -0.17
FAAP20-208	ENST00000420964	SKOR2	Q2VWA4	1001 aa	Predicted RBP	13.97	□□□□□ -0.17
FAAP20-208	ENST00000420964		Q4G0T1	1027 aa		13.97	□□□□□ -0.17
FAAP20-208	ENST00000420964	PRR16	Q569H4	304 aa		13.97	□□□□□ -0.17
FAAP20-208	ENST00000420964	PCNX4	Q63HM2	1172 aa		13.97	□□□□□ -0.17
FAAP20-208	ENST00000420964	CCAR1	Q8IX12	1150 aa	Known RBP	13.97	□□□□□ -0.17
FAAP20-208	ENST00000420964	REM2	Q8IYK8	340 aa	Predicted RBP	13.97	□□□□□ -0.17
FAAP20-208	ENST00000420964	NSUN6	Q8TEA1	469 aa	Known RBP	13.97	□□□□□ -0.17
FAAP20-208	ENST00000420964	MRPS27	Q92552	414 aa	Known RBP	13.97	□□□□□ -0.17
FAAP20-208	ENST00000420964	LENG9	Q96B70	501 aa		13.97	□□□□□ -0.17
FAAP20-208	ENST00000420964	PDCD2L	Q9BRP1	358 aa		13.97	□□□□□ -0.17
FAAP20-208	ENST00000420964	MCOLN1	Q9GZU1	580 aa		13.97	□□□□□ -0.17
FAAP20-208	ENST00000420964	DDX49	Q9Y6V7	483 aa	Known RBP	13.97	□□□□□ -0.17
FAAP20-208	ENST00000420964	ZNFX1	Q9P2E3	1918 aa	Known RBP	13.97	□□□□□ -0.17
FAAP20-208	ENST00000420964	PLXNA1	Q9UIW2	1896 aa		13.96	□□□□□ -0.17
FAAP20-208	ENST00000420964	IGLV3-22	A0A075B6J6	115 aa		13.96	□□□□□ -0.17
FAAP20-208	ENST00000420964	VWA3A	A6NCI4	1184 aa		13.96	□□□□□ -0.17
FAAP20-208	ENST00000420964	POTEB2	H3BUK9	544 aa		13.96	□□□□□ -0.17
FAAP20-208	ENST00000420964	TLR2	O60603	784 aa		13.96	□□□□□ -0.17
FAAP20-208	ENST00000420964	ALDH1A1	P00352	501 aa		13.96	□□□□□ -0.17
FAAP20-208	ENST00000420964	FCER1A	P12319	257 aa		13.96	□□□□□ -0.17
FAAP20-208	ENST00000420964	CCND2	P30279	289 aa		13.96	□□□□□ -0.17
FAAP20-208	ENST00000420964	SET	Q01105	290 aa	Predicted RBP	13.96	□□□□□ -0.17
FAAP20-208	ENST00000420964	CNTN2	Q02246	1040 aa		13.96	□□□□□ -0.17
FAAP20-208	ENST00000420964	KLHL40	Q2TBA0	621 aa		13.96	□□□□□ -0.17
FAAP20-208	ENST00000420964	CEP55	Q53EZ4	464 aa		13.96	□□□□□ -0.17
FAAP20-208	ENST00000420964	FSIP1	Q8NA03	581 aa		13.96	□□□□□ -0.17
FAAP20-208	ENST00000420964	ZNF579	Q8NAF0	562 aa	Known RBP	13.96	□□□□□ -0.17
FAAP20-208	ENST00000420964	DNER	Q8NFT8	737 aa		13.96	□□□□□ -0.17
FAAP20-208	ENST00000420964	MTMR9	Q96QG7	549 aa		13.96	□□□□□ -0.17
FAAP20-208	ENST00000420964	CSRNP2	Q9H175	543 aa		13.96	□□□□□ -0.17
FAAP20-208	ENST00000420964	GOLPH3L	Q9H4A5	285 aa		13.96	□□□□□ -0.17
FAAP20-208	ENST00000420964	KCNMB3	Q9NPA1	279 aa		13.96	□□□□□ -0.17
FAAP20-208	ENST00000420964	ASTN1	O14525	1302 aa		13.95	□□□□□ -0.18
FAAP20-208	ENST00000420964	CA12	O43570	354 aa		13.95	□□□□□ -0.18
FAAP20-208	ENST00000420964	PGK2	P07205	417 aa		13.95	□□□□□ -0.18
FAAP20-208	ENST00000420964	MYCL	P12524	364 aa	Predicted RBP	13.95	□□□□□ -0.18
FAAP20-208	ENST00000420964	CMA1	P23946	247 aa		13.95	□□□□□ -0.18
FAAP20-208	ENST00000420964	MAPK4	P31152	587 aa		13.95	□□□□□ -0.18
FAAP20-208	ENST00000420964	IL17A	Q16552	155 aa		13.95	□□□□□ -0.18
FAAP20-208	ENST00000420964	RESP18	Q5W5W9	173 aa		13.95	□□□□□ -0.18
FAAP20-208	ENST00000420964	XRRA1	Q6P2D8	792 aa		13.95	□□□□□ -0.18
FAAP20-208	ENST00000420964	SHC4	Q6S5L8	630 aa		13.95	□□□□□ -0.18
FAAP20-208	ENST00000420964	C17orf99	Q6UX52	265 aa		13.95	□□□□□ -0.18
FAAP20-208	ENST00000420964	DTHD1	Q6ZMT9	781 aa		13.95	□□□□□ -0.18
FAAP20-208	ENST00000420964	CCDC73	Q6ZRK6	1079 aa		13.95	□□□□□ -0.18
FAAP20-208	ENST00000420964	FAM133A	Q8N9E0	248 aa		13.95	□□□□□ -0.18
FAAP20-208	ENST00000420964	CYP2W1	Q8TAV3	490 aa		13.95	□□□□□ -0.18
FAAP20-208	ENST00000420964	ETNPPL	Q8TBG4	499 aa		13.95	□□□□□ -0.18
FAAP20-208	ENST00000420964	RNF186	Q9NXI6	227 aa		13.95	□□□□□ -0.18
FAAP20-208	ENST00000420964	ADD3	Q9UEY8	706 aa	Known RBP	13.95	□□□□□ -0.18
FAAP20-208	ENST00000420964	IVNS1ABP	Q9Y6Y0	642 aa		13.95	□□□□□ -0.18
FAAP20-208	ENST00000420964	DNAJC25-GNG10	A0A024R161	153 aa		13.94	□□□□□ -0.18
FAAP20-208	ENST00000420964	SOWAHB	A6NEL2	793 aa		13.94	□□□□□ -0.18
FAAP20-208	ENST00000420964	TBX3	O15119	743 aa		13.94	□□□□□ -0.18
FAAP20-208	ENST00000420964	MARCH6	O60337	910 aa		13.94	□□□□□ -0.18
FAAP20-208	ENST00000420964	TRPA1	O75762	1119 aa		13.94	□□□□□ -0.18
FAAP20-208	ENST00000420964	NR3C2	P08235	984 aa		13.94	□□□□□ -0.18
FAAP20-208	ENST00000420964	PFKFB1	P16118	471 aa		13.94	□□□□□ -0.18
FAAP20-208	ENST00000420964	ITGB5	P18084	799 aa		13.94	□□□□□ -0.18
FAAP20-208	ENST00000420964	LIG1	P18858	919 aa		13.94	□□□□□ -0.18
FAAP20-208	ENST00000420964	LONP1	P36776	959 aa	Known RBP	13.94	□□□□□ -0.18
FAAP20-208	ENST00000420964	ALDH5A1	P51649	535 aa	Predicted RBP	13.94	□□□□□ -0.18
FAAP20-208	ENST00000420964	MRPS9	P82933	396 aa	Known RBP	13.94	□□□□□ -0.18
FAAP20-208	ENST00000420964	TMEM266	Q2M3C6	531 aa		13.94	□□□□□ -0.18
FAAP20-208	ENST00000420964	SPECC1	Q5M775	1068 aa		13.94	□□□□□ -0.18
FAAP20-208	ENST00000420964	NIPA1	Q7RTP0	329 aa		13.94	□□□□□ -0.18
FAAP20-208	ENST00000420964	GPR142	Q7Z601	462 aa		13.94	□□□□□ -0.18
FAAP20-208	ENST00000420964	PLEKHH3	Q7Z736	793 aa		13.94	□□□□□ -0.18
FAAP20-208	ENST00000420964	PLA2G4D	Q86XP0	818 aa		13.94	□□□□□ -0.18
FAAP20-208	ENST00000420964	SLFN12	Q8IYM2	578 aa		13.94	□□□□□ -0.18
FAAP20-208	ENST00000420964	ABRA	Q8N0Z2	381 aa		13.94	□□□□□ -0.18
FAAP20-208	ENST00000420964	HAS1	Q92839	578 aa		13.94	□□□□□ -0.18
FAAP20-208	ENST00000420964	IWS1	Q96ST2	819 aa		13.94	□□□□□ -0.18
FAAP20-208	ENST00000420964	MXRA8	Q9BRK3	442 aa		13.94	□□□□□ -0.18
FAAP20-208	ENST00000420964	UBIAD1	Q9Y5Z9	338 aa		13.94	□□□□□ -0.18
FAAP20-208	ENST00000420964		A0A1B0GVL5	298 aa		13.93	□□□□□ -0.18
FAAP20-208	ENST00000420964	MEIS1	O00470	390 aa		13.93	□□□□□ -0.18
FAAP20-208	ENST00000420964	MSH4	O15457	936 aa		13.93	□□□□□ -0.18
FAAP20-208	ENST00000420964	STRN	O43815	780 aa		13.93	□□□□□ -0.18
FAAP20-208	ENST00000420964	ADORA2A	P29274	412 aa		13.93	□□□□□ -0.18
FAAP20-208	ENST00000420964	TXK	P42681	527 aa		13.93	□□□□□ -0.18
FAAP20-208	ENST00000420964	RGS19	P49795	217 aa		13.93	□□□□□ -0.18
FAAP20-208	ENST00000420964	FXR2	P51116	673 aa	Known RBP eCLIP	13.93	□□□□□ -0.18
FAAP20-208	ENST00000420964	FAM160A1	Q05DH4	1040 aa		13.93	□□□□□ -0.18
FAAP20-208	ENST00000420964	GRB14	Q14449	540 aa		13.93	□□□□□ -0.18
FAAP20-208	ENST00000420964	VSIG10L	Q86VR7	867 aa		13.93	□□□□□ -0.18
FAAP20-208	ENST00000420964	SYMPK	Q92797	1274 aa	Known RBP	13.93	□□□□□ -0.18

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