RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409189.7

CCL20-202, Transcript of C-C motif chemokine ligand 20, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCL20, Length 839 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL20-202ENST00000409189 ZBTB37Q5TC79 503 aa8.21□□□□□ -1.1
CCL20-202ENST00000409189 SOGA3Q5TF21 947 aa8.21□□□□□ -1.1
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CCL20-202ENST00000409189 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.1
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CCL20-202ENST00000409189 TPTE2Q6XPS3 522 aa8.21□□□□□ -1.1
CCL20-202ENST00000409189 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP8.21□□□□□ -1.1
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CCL20-202ENST00000409189 SSH1Q8WYL5 1049 aa8.21□□□□□ -1.1
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CCL20-202ENST00000409189 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP8.19□□□□□ -1.1
CCL20-202ENST00000409189 LLGL2Q6P1M3 1020 aa8.19□□□□□ -1.1
CCL20-202ENST00000409189 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP8.19□□□□□ -1.1
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CCL20-202ENST00000409189 ALG1LQ6GMV1 187 aa8.18□□□□□ -1.1
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CCL20-202ENST00000409189 PANK1Q8TE04 598 aa8.18□□□□□ -1.1
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CCL20-202ENST00000409189 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP8.17□□□□□ -1.1
CCL20-202ENST00000409189 RLBP1P12271 317 aa8.17□□□□□ -1.1
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CCL20-202ENST00000409189 LRRC14Q15048 493 aa8.17□□□□□ -1.1
CCL20-202ENST00000409189 C1orf141Q5JVX7 400 aa8.17□□□□□ -1.1
CCL20-202ENST00000409189 RGMBQ6NW40 437 aa8.17□□□□□ -1.1
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CCL20-202ENST00000409189 KCT2Q8NC54 265 aa8.17□□□□□ -1.1
CCL20-202ENST00000409189 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP8.17□□□□□ -1.1
CCL20-202ENST00000409189 CHMP4AQ9BY43 222 aa8.17□□□□□ -1.1
CCL20-202ENST00000409189 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP8.17□□□□□ -1.1
CCL20-202ENST00000409189 GPRC5DQ9NZD1 345 aa8.17□□□□□ -1.1
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CCL20-202ENST00000409189 CLCN7P51798 805 aa8.16□□□□□ -1.1
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CCL20-202ENST00000409189 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa8.16□□□□□ -1.1
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CCL20-202ENST00000409189 NPR1P16066 1061 aa8.15□□□□□ -1.1
CCL20-202ENST00000409189 C22orf34Q6ZV56 151 aa8.15□□□□□ -1.1
CCL20-202ENST00000409189 ARMCX6Q7L4S7 300 aa8.15□□□□□ -1.1
CCL20-202ENST00000409189 USP48Q86UV5 1035 aa8.15□□□□□ -1.1
CCL20-202ENST00000409189 ITPRIPQ8IWB1 547 aa8.15□□□□□ -1.1
CCL20-202ENST00000409189 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP8.15□□□□□ -1.1
CCL20-202ENST00000409189 TSPYL6Q8N831 410 aa8.15□□□□□ -1.1
CCL20-202ENST00000409189 C8orf58Q8NAV2 365 aa8.15□□□□□ -1.1
CCL20-202ENST00000409189 PSMD1Q99460 953 aa8.15□□□□□ -1.1
CCL20-202ENST00000409189 C12orf49Q9H741 205 aa8.15□□□□□ -1.1
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