RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000404125.5

PSME4-202, Transcript of proteasome activator subunit 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PSME4, Length 7,099 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME4-202ENST00000404125 CCDC26Q8TAB7 109 aa14.98□□□□□ -0.01
PSME4-202ENST00000404125 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa14.98□□□□□ -0.01
PSME4-202ENST00000404125 CCDC77Q9BR77 488 aa14.98□□□□□ -0.01
PSME4-202ENST00000404125 ZBED2Q9BTP6 218 aa14.98□□□□□ -0.01
PSME4-202ENST00000404125 SWAP70Q9UH65 585 aa14.98□□□□□ -0.01
PSME4-202ENST00000404125 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
PSME4-202ENST00000404125 MAP7D1Q3KQU3 841 aa14.98□□□□□ -0.01
PSME4-202ENST00000404125 C2orf69Q8N8R5 385 aa14.98□□□□□ -0.01
PSME4-202ENST00000404125 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
PSME4-202ENST00000404125 TRIM7Q9C029 511 aa14.98□□□□□ -0.01
PSME4-202ENST00000404125 KANSL2Q9H9L4 492 aa14.98□□□□□ -0.01
PSME4-202ENST00000404125 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa14.98□□□□□ -0.01
PSME4-202ENST00000404125 TLR3O15455 904 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
PSME4-202ENST00000404125 PDE6CP51160 858 aa14.98□□□□□ -0.01
PSME4-202ENST00000404125 SREK1Q8WXA9 508 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
PSME4-202ENST00000404125 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
PSME4-202ENST00000404125 TRIM50Q86XT4 487 aa14.98□□□□□ -0.01
PSME4-202ENST00000404125 POTEDQ86YR6 584 aa14.98□□□□□ -0.01
PSME4-202ENST00000404125 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa14.98□□□□□ -0.01
PSME4-202ENST00000404125 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
PSME4-202ENST00000404125 MTMR2Q13614 643 aa14.97□□□□□ -0.01
PSME4-202ENST00000404125 RPS6KA1Q15418 735 aa14.97□□□□□ -0.01
PSME4-202ENST00000404125 ASPRV1Q53RT3 343 aa14.97□□□□□ -0.01
PSME4-202ENST00000404125 MAN1B1Q9UKM7 699 aa14.97□□□□□ -0.01
PSME4-202ENST00000404125 TRIM49BA6NDI0 452 aa14.97□□□□□ -0.01
PSME4-202ENST00000404125 ERVV-1B6SEH8 477 aa14.97□□□□□ -0.01
PSME4-202ENST00000404125 CASP14P31944 242 aa14.97□□□□□ -0.01
PSME4-202ENST00000404125 RBL2Q08999 1139 aa14.97□□□□□ -0.01
PSME4-202ENST00000404125 ITPK1Q13572 414 aa14.97□□□□□ -0.01
PSME4-202ENST00000404125 SLC27A3Q5K4L6 730 aa14.97□□□□□ -0.01
PSME4-202ENST00000404125 NRBP2Q9NSY0 501 aa14.97□□□□□ -0.01
PSME4-202ENST00000404125 ZNF18P17022 549 aa14.97□□□□□ -0.01
PSME4-202ENST00000404125 HMGCS2P54868 508 aa14.97□□□□□ -0.01
PSME4-202ENST00000404125 FIS1Q9Y3D6 152 aa14.97□□□□□ -0.01
PSME4-202ENST00000404125 FAM26FQ5R3K3 315 aa14.97□□□□□ -0.01
PSME4-202ENST00000404125 COA1Q9GZY4 146 aa14.97□□□□□ -0.01
PSME4-202ENST00000404125 GLYCTKQ8IVS8 523 aa14.97□□□□□ -0.01
PSME4-202ENST00000404125 ABCA6Q8N139 1617 aa14.97□□□□□ -0.01
PSME4-202ENST00000404125 H7C1W4 665 aa14.96□□□□□ -0.01
PSME4-202ENST00000404125 UPP2O95045 317 aa14.96□□□□□ -0.01
PSME4-202ENST00000404125 GUCY1A2P33402 732 aa14.96□□□□□ -0.01
PSME4-202ENST00000404125 CERS3Q8IU89 383 aa14.96□□□□□ -0.01
PSME4-202ENST00000404125 MICALL2Q8IY33 904 aa14.96□□□□□ -0.01
PSME4-202ENST00000404125 RMDN3Q96TC7 470 aa14.96□□□□□ -0.01
PSME4-202ENST00000404125 PCDHA6Q9UN73 950 aa14.96□□□□□ -0.01
PSME4-202ENST00000404125 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa14.96□□□□□ -0.01
PSME4-202ENST00000404125 MMP1P03956 469 aa14.96□□□□□ -0.01
PSME4-202ENST00000404125 CDC27P30260 824 aa14.96□□□□□ -0.01
PSME4-202ENST00000404125 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa14.96□□□□□ -0.01
PSME4-202ENST00000404125 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa14.96□□□□□ -0.01
PSME4-202ENST00000404125 SPTLC3Q9NUV7 552 aa14.96□□□□□ -0.01
PSME4-202ENST00000404125 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
PSME4-202ENST00000404125 EHHADHQ08426 723 aa14.96□□□□□ -0.01
PSME4-202ENST00000404125 CUL4BQ13620 913 aa14.96□□□□□ -0.01
PSME4-202ENST00000404125 GAS2L3Q86XJ1 694 aa14.96□□□□□ -0.01
PSME4-202ENST00000404125 RHPN2Q8IUC4 686 aa14.96□□□□□ -0.01
PSME4-202ENST00000404125 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa14.96□□□□□ -0.01
PSME4-202ENST00000404125 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
PSME4-202ENST00000404125 GLT8D2Q9H1C3 349 aa14.96□□□□□ -0.01
PSME4-202ENST00000404125 ADGRF4Q8IZF3 695 aa14.96□□□□□ -0.01
PSME4-202ENST00000404125 MAD1L1Q9Y6D9 718 aa14.96□□□□□ -0.01
PSME4-202ENST00000404125 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.02
PSME4-202ENST00000404125 KRT222Q8N1A0 295 aa14.96□□□□□ -0.02
PSME4-202ENST00000404125 SLC7A3Q8WY07 619 aa14.96□□□□□ -0.02
PSME4-202ENST00000404125 HSPH1Q92598 858 aa14.96□□□□□ -0.02
PSME4-202ENST00000404125 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.02
PSME4-202ENST00000404125 AATKQ6ZMQ8 1374 aa14.95□□□□□ -0.02
PSME4-202ENST00000404125 ZBBXA8MT70 800 aa14.95□□□□□ -0.02
PSME4-202ENST00000404125 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
PSME4-202ENST00000404125 EXOC3L4Q17RC7 722 aa14.95□□□□□ -0.02
PSME4-202ENST00000404125 CD2APQ9Y5K6 639 aa14.95□□□□□ -0.02
PSME4-202ENST00000404125 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
PSME4-202ENST00000404125 GBP6Q6ZN66 633 aa14.95□□□□□ -0.02
PSME4-202ENST00000404125 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa14.95□□□□□ -0.02
PSME4-202ENST00000404125 KRT15P19012 456 aa14.95□□□□□ -0.02
PSME4-202ENST00000404125 ATP1A2P50993 1020 aa14.95□□□□□ -0.02
PSME4-202ENST00000404125 TNS3Q68CZ2 1445 aa14.95□□□□□ -0.02
PSME4-202ENST00000404125 TMEM47Q9BQJ4 181 aa14.95□□□□□ -0.02
PSME4-202ENST00000404125 BHMT2Q9H2M3 363 aa14.95□□□□□ -0.02
PSME4-202ENST00000404125 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP14.95□□□□□ -0.023e-8■■■□□ 17.1
PSME4-202ENST00000404125 ATP10DQ9P241 1426 aa14.95□□□□□ -0.02
PSME4-202ENST00000404125 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
PSME4-202ENST00000404125 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
PSME4-202ENST00000404125 CCDC125Q86Z20 511 aa14.95□□□□□ -0.02
PSME4-202ENST00000404125 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
PSME4-202ENST00000404125 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa14.95□□□□□ -0.02
PSME4-202ENST00000404125 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
PSME4-202ENST00000404125 SOWAHDA6NJG2 315 aa14.95□□□□□ -0.02
PSME4-202ENST00000404125 PLA2G4BP0C869 781 aa14.95□□□□□ -0.02
PSME4-202ENST00000404125 ATL3Q6DD88 541 aa14.95□□□□□ -0.02
PSME4-202ENST00000404125 MICALCLQ6ZW33 695 aa14.95□□□□□ -0.02
PSME4-202ENST00000404125 TBC1D31Q96DN5 1066 aa14.95□□□□□ -0.02
PSME4-202ENST00000404125 ZNF131P52739 623 aa14.95□□□□□ -0.02
PSME4-202ENST00000404125 TEX2Q8IWB9 1127 aa14.95□□□□□ -0.02
PSME4-202ENST00000404125 HACE1Q8IYU2 909 aa14.95□□□□□ -0.02
PSME4-202ENST00000404125 DDX12PQ92771 950 aa14.95□□□□□ -0.02
PSME4-202ENST00000404125 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
PSME4-202ENST00000404125 KRIT1O00522 736 aa14.94□□□□□ -0.02
PSME4-202ENST00000404125 ADCY8P40145 1251 aa14.94□□□□□ -0.02
PSME4-202ENST00000404125 CCDC14Q49A88 953 aa14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21 ms