RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000401498.6

PKDCC-202, Transcript of protein kinase domain containing, cytoplasmic, humanhuman

TSL 5

Gene PKDCC, Length 1,550 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDCC-202ENST00000401498 M0R2N6 131 aa34.44■■■■□ 3.1
PKDCC-202ENST00000401498 MSCO60682 206 aa34.44■■■■□ 3.1
PKDCC-202ENST00000401498 RGS20O76081 388 aa34.44■■■■□ 3.1
PKDCC-202ENST00000401498 PCNX4Q63HM2 1172 aa34.44■■■■□ 3.1
PKDCC-202ENST00000401498 BLIDQ8IZY5 108 aa34.44■■■■□ 3.1
PKDCC-202ENST00000401498 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa34.44■■■■□ 3.1
PKDCC-202ENST00000401498 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP34.43■■■■□ 3.1
PKDCC-202ENST00000401498 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP34.43■■■■□ 3.1
PKDCC-202ENST00000401498 TMEM63BQ5T3F8 832 aa34.43■■■■□ 3.1
PKDCC-202ENST00000401498 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP34.43■■■■□ 3.1
PKDCC-202ENST00000401498 FOSBP53539 338 aa34.42■■■■□ 3.1
PKDCC-202ENST00000401498 SOX10P56693 466 aa34.42■■■■□ 3.1
PKDCC-202ENST00000401498 MCTP2Q6DN12 878 aa34.42■■■■□ 3.1
PKDCC-202ENST00000401498 IQSEC1Q6DN90 963 aa34.41■■■■□ 3.1
PKDCC-202ENST00000401498 SEPT14Q6ZU15 432 aa34.41■■■■□ 3.1
PKDCC-202ENST00000401498 FAM184AQ8NB25 1140 aa34.41■■■■□ 3.1
PKDCC-202ENST00000401498 EHMT1Q9H9B1 1298 aa34.41■■■■□ 3.1
PKDCC-202ENST00000401498 MYH7BA7E2Y1 1941 aa34.41■■■■□ 3.1
PKDCC-202ENST00000401498 SREBF1P36956 1147 aa34.4■■■■□ 3.1
PKDCC-202ENST00000401498 TNFAIP2Q03169 654 aa34.4■■■■□ 3.1
PKDCC-202ENST00000401498 KRT40Q6A162 431 aa34.4■■■■□ 3.1
PKDCC-202ENST00000401498 XRRA1Q6P2D8 792 aa34.4■■■■□ 3.1
PKDCC-202ENST00000401498 WDR11Q9BZH6 1224 aa34.4■■■■□ 3.1
PKDCC-202ENST00000401498 RTEL1Q9NZ71 1219 aa34.4■■■■□ 3.1
PKDCC-202ENST00000401498 SMPD1P17405 629 aa34.4■■■■□ 3.1
PKDCC-202ENST00000401498 EN2P19622 333 aaPredicted RBP34.4■■■■□ 3.1
PKDCC-202ENST00000401498 SCFD2Q8WU76 684 aa34.4■■■■□ 3.1
PKDCC-202ENST00000401498 OGDHLQ9ULD0 1010 aa34.4■■■■□ 3.1
PKDCC-202ENST00000401498 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP34.4■■■■□ 3.1
PKDCC-202ENST00000401498 RARBP10826 455 aa34.39■■■■□ 3.1
PKDCC-202ENST00000401498 OXER1Q8TDS5 423 aa34.39■■■■□ 3.1
PKDCC-202ENST00000401498 CRYGNQ8WXF5 182 aa34.39■■■■□ 3.1
PKDCC-202ENST00000401498 C8orf76Q96K31 380 aa34.39■■■■□ 3.1
PKDCC-202ENST00000401498 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP34.39■■■■□ 3.1
PKDCC-202ENST00000401498 STAM2O75886 525 aa34.38■■■■□ 3.09
PKDCC-202ENST00000401498 TFRCP02786 760 aaKnown RBP34.38■■■■□ 3.09
PKDCC-202ENST00000401498 MMP1P03956 469 aa34.38■■■■□ 3.09
PKDCC-202ENST00000401498 PTGS1P23219 599 aa34.38■■■■□ 3.09
PKDCC-202ENST00000401498 GJB2P29033 226 aa34.38■■■■□ 3.09
PKDCC-202ENST00000401498 TRIM29Q14134 588 aa34.38■■■■□ 3.09
PKDCC-202ENST00000401498 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP34.38■■■■□ 3.09
PKDCC-202ENST00000401498 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP34.37■■■■□ 3.09
PKDCC-202ENST00000401498 ARIH2O95376 493 aa34.37■■■■□ 3.09
PKDCC-202ENST00000401498 DUSP28Q4G0W2 176 aa34.37■■■■□ 3.09
PKDCC-202ENST00000401498 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP34.37■■■■□ 3.09
PKDCC-202ENST00000401498 CCDC62Q6P9F0 684 aa34.37■■■■□ 3.09
PKDCC-202ENST00000401498 SMC3Q9UQE7 1217 aa34.37■■■■□ 3.09
PKDCC-202ENST00000401498 ARHGAP4P98171 946 aa34.36■■■■□ 3.09
PKDCC-202ENST00000401498 GUCY1B3Q02153 619 aa34.36■■■■□ 3.09
PKDCC-202ENST00000401498 HSCBQ8IWL3 235 aa34.36■■■■□ 3.09
PKDCC-202ENST00000401498 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa34.36■■■■□ 3.09
PKDCC-202ENST00000401498 TXNP10599 105 aaKnown RBP34.36■■■■□ 3.09
PKDCC-202ENST00000401498 TTLL4Q14679 1199 aa34.36■■■■□ 3.09
PKDCC-202ENST00000401498 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa34.36■■■■□ 3.09
PKDCC-202ENST00000401498 ITGB5P18084 799 aa34.35■■■■□ 3.09
PKDCC-202ENST00000401498 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa34.35■■■■□ 3.09
PKDCC-202ENST00000401498 PGK1P00558 417 aa34.34■■■■□ 3.09
PKDCC-202ENST00000401498 KRT2P35908 639 aa34.34■■■■□ 3.09
PKDCC-202ENST00000401498 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP34.34■■■■□ 3.09
PKDCC-202ENST00000401498 MRVI1Q9Y6F6 885 aa34.34■■■■□ 3.09
PKDCC-202ENST00000401498 EDIL3O43854 480 aa34.33■■■■□ 3.09
PKDCC-202ENST00000401498 CYP3A4P08684 503 aa34.33■■■■□ 3.09
PKDCC-202ENST00000401498 NR5A1Q13285 461 aa34.33■■■■□ 3.09
PKDCC-202ENST00000401498 LY6KQ17RY6 165 aa34.33■■■■□ 3.09
PKDCC-202ENST00000401498 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP34.33■■■■□ 3.09
PKDCC-202ENST00000401498 CYP2W1Q8TAV3 490 aa34.33■■■■□ 3.09
PKDCC-202ENST00000401498 COPS5Q92905 334 aa34.33■■■■□ 3.09
PKDCC-202ENST00000401498 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP34.33■■■■□ 3.09
PKDCC-202ENST00000401498 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa34.33■■■■□ 3.09
PKDCC-202ENST00000401498 BTBD18B2RXH4 712 aa34.32■■■■□ 3.09
PKDCC-202ENST00000401498 ADAMTS4O75173 837 aa34.32■■■■□ 3.09
PKDCC-202ENST00000401498 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP34.32■■■■□ 3.09
PKDCC-202ENST00000401498 SEMA3FQ13275 785 aa34.32■■■■□ 3.09
PKDCC-202ENST00000401498 GNPTABQ3T906 1256 aa34.32■■■■□ 3.09
PKDCC-202ENST00000401498 TBCKQ8TEA7 893 aa34.32■■■■□ 3.09
PKDCC-202ENST00000401498 TNFRSF25Q93038 417 aa34.32■■■■□ 3.09
PKDCC-202ENST00000401498 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP34.32■■■■□ 3.09
PKDCC-202ENST00000401498 BRMS1Q9HCU9 246 aa34.32■■■■□ 3.09
PKDCC-202ENST00000401498 KIF3AQ9Y496 699 aa34.32■■■■□ 3.09
PKDCC-202ENST00000401498 CAPN2P17655 700 aa34.32■■■■□ 3.08
PKDCC-202ENST00000401498 ICAM3P32942 547 aa34.32■■■■□ 3.08
PKDCC-202ENST00000401498 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP34.32■■■■□ 3.08
PKDCC-202ENST00000401498 KRT25Q7Z3Z0 450 aa34.32■■■■□ 3.08
PKDCC-202ENST00000401498 TLK2Q86UE8 772 aa34.32■■■■□ 3.08
PKDCC-202ENST00000401498 Q9Y3F1 56 aa34.32■■■■□ 3.08
PKDCC-202ENST00000401498 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa34.31■■■■□ 3.08
PKDCC-202ENST00000401498 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP34.31■■■■□ 3.08
PKDCC-202ENST00000401498 GJA9P57773 515 aa34.31■■■■□ 3.08
PKDCC-202ENST00000401498 SP2Q02086 613 aa34.31■■■■□ 3.08
PKDCC-202ENST00000401498 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP34.31■■■■□ 3.08
PKDCC-202ENST00000401498 KCNV1Q6PIU1 500 aa34.31■■■■□ 3.08
PKDCC-202ENST00000401498 NLRX1Q86UT6 975 aa34.31■■■■□ 3.08
PKDCC-202ENST00000401498 MXRA8Q9BRK3 442 aa34.31■■■■□ 3.08
PKDCC-202ENST00000401498 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP34.31■■■■□ 3.08
PKDCC-202ENST00000401498 JADE2Q9NQC1 790 aa34.31■■■■□ 3.08
PKDCC-202ENST00000401498 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP34.3■■■■□ 3.085e-7■■■□□ 17.1
PKDCC-202ENST00000401498 TGFB3P10600 412 aa34.3■■■■□ 3.08
PKDCC-202ENST00000401498 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP34.3■■■■□ 3.08
PKDCC-202ENST00000401498 LRRC41Q15345 812 aa34.3■■■■□ 3.08
PKDCC-202ENST00000401498 CEP55Q53EZ4 464 aa34.3■■■■□ 3.08
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