RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000400183.6

USP25-204, Transcript of ubiquitin specific peptidase 25, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene USP25, Length 5,341 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP25-204ENST00000400183 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
USP25-204ENST00000400183 KCTD1Q719H9 257 aa20.14■□□□□ 0.81
USP25-204ENST00000400183 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa20.14■□□□□ 0.81
USP25-204ENST00000400183 SYNJ2BP-COX16A0A087WUM0 186 aa20.13■□□□□ 0.81
USP25-204ENST00000400183 DIXDC1Q155Q3 683 aa20.13■□□□□ 0.81
USP25-204ENST00000400183 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa20.13■□□□□ 0.81
USP25-204ENST00000400183 TACO1Q9BSH4 297 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
USP25-204ENST00000400183 COX16Q9P0S2 106 aa20.13■□□□□ 0.81
USP25-204ENST00000400183 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
USP25-204ENST00000400183 PRPSAP1Q14558 356 aa20.13■□□□□ 0.81
USP25-204ENST00000400183 TTBK2Q6IQ55 1244 aa20.13■□□□□ 0.81
USP25-204ENST00000400183 PPP1R2P3Q6NXS1 205 aa20.13■□□□□ 0.81
USP25-204ENST00000400183 EXOC8Q8IYI6 725 aa20.13■□□□□ 0.81
USP25-204ENST00000400183 KMT5AQ9NQR1 393 aa20.13■□□□□ 0.81
USP25-204ENST00000400183 MMP1P03956 469 aa20.13■□□□□ 0.81
USP25-204ENST00000400183 INHBAP08476 426 aa20.13■□□□□ 0.81
USP25-204ENST00000400183 IFNAR1P17181 557 aa20.13■□□□□ 0.81
USP25-204ENST00000400183 UBXN2AP68543 259 aa20.13■□□□□ 0.81
USP25-204ENST00000400183 DBN1Q16643 649 aa20.13■□□□□ 0.81
USP25-204ENST00000400183 ZNF653Q96CK0 615 aa20.13■□□□□ 0.81
USP25-204ENST00000400183 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa20.13■□□□□ 0.81
USP25-204ENST00000400183 SAT1P21673 171 aa20.13■□□□□ 0.81
USP25-204ENST00000400183 DPP9Q86TI2 863 aa20.13■□□□□ 0.81
USP25-204ENST00000400183 CDHR1Q96JP9 859 aa20.13■□□□□ 0.81
USP25-204ENST00000400183 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
USP25-204ENST00000400183 TMEM206Q9H813 350 aa20.13■□□□□ 0.81
USP25-204ENST00000400183 KRT3P12035 628 aa20.12■□□□□ 0.81
USP25-204ENST00000400183 RFX6Q8HWS3 928 aa20.12■□□□□ 0.81
USP25-204ENST00000400183 LINC00301Q8NCQ3 95 aa20.12■□□□□ 0.81
USP25-204ENST00000400183 BMP3P12645 472 aa20.12■□□□□ 0.81
USP25-204ENST00000400183 PTPREP23469 700 aa20.12■□□□□ 0.81
USP25-204ENST00000400183 PDE1BQ01064 536 aa20.12■□□□□ 0.81
USP25-204ENST00000400183 SEC31BQ9NQW1 1179 aa20.12■□□□□ 0.81
USP25-204ENST00000400183 SERPINB2P05120 415 aa20.12■□□□□ 0.81
USP25-204ENST00000400183 MAPK4P31152 587 aa20.12■□□□□ 0.81
USP25-204ENST00000400183 BBS5Q8N3I7 341 aa20.12■□□□□ 0.81
USP25-204ENST00000400183 PIGSQ96S52 555 aa20.12■□□□□ 0.81
USP25-204ENST00000400183 APOL6Q9BWW8 343 aa20.12■□□□□ 0.81
USP25-204ENST00000400183 RCOR1Q9UKL0 485 aa20.12■□□□□ 0.81
USP25-204ENST00000400183 LRRC41Q15345 812 aa20.12■□□□□ 0.81
USP25-204ENST00000400183 CCDC93Q567U6 631 aa20.12■□□□□ 0.81
USP25-204ENST00000400183 MYCBPQ99417 103 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
USP25-204ENST00000400183 ESYT2A0FGR8 921 aa20.12■□□□□ 0.81
USP25-204ENST00000400183 COBLO75128 1261 aa20.12■□□□□ 0.81
USP25-204ENST00000400183 CFAP61Q8NHU2 1237 aa20.12■□□□□ 0.81
USP25-204ENST00000400183 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
USP25-204ENST00000400183 ABCD1P33897 745 aa20.11■□□□□ 0.81
USP25-204ENST00000400183 NBPF3Q9H094 633 aa20.11■□□□□ 0.81
USP25-204ENST00000400183 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa20.11■□□□□ 0.81
USP25-204ENST00000400183 DISP1Q96F81 1524 aa20.11■□□□□ 0.81
USP25-204ENST00000400183 SGK1O00141 431 aa20.11■□□□□ 0.81
USP25-204ENST00000400183 RBL2Q08999 1139 aa20.11■□□□□ 0.81
USP25-204ENST00000400183 FAM149B1Q96BN6 582 aa20.11■□□□□ 0.81
USP25-204ENST00000400183 NRBP1Q9UHY1 535 aa20.11■□□□□ 0.81
USP25-204ENST00000400183 PTPN22Q9Y2R2 807 aa20.11■□□□□ 0.81
USP25-204ENST00000400183 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
USP25-204ENST00000400183 ENC1O14682 589 aa20.11■□□□□ 0.81
USP25-204ENST00000400183 GPC4O75487 556 aa20.11■□□□□ 0.81
USP25-204ENST00000400183 ECE1P42892 770 aa20.11■□□□□ 0.81
USP25-204ENST00000400183 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa20.11■□□□□ 0.81
USP25-204ENST00000400183 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
USP25-204ENST00000400183 AKT3Q9Y243 479 aa20.11■□□□□ 0.81
USP25-204ENST00000400183 KDM5DQ9BY66 1539 aa20.11■□□□□ 0.81
USP25-204ENST00000400183 POC1B-GALNT4F8VUJ3 575 aa20.11■□□□□ 0.81
USP25-204ENST00000400183 IL9RQ01113 521 aa20.11■□□□□ 0.81
USP25-204ENST00000400183 C4orf50Q6ZRC1 276 aa20.11■□□□□ 0.81
USP25-204ENST00000400183 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
USP25-204ENST00000400183 RSPH3Q86UC2 560 aa20.11■□□□□ 0.81
USP25-204ENST00000400183 LCORLQ8N3X6 602 aa20.11■□□□□ 0.81
USP25-204ENST00000400183 BAG5Q9UL15 447 aa20.11■□□□□ 0.81
USP25-204ENST00000400183 SLC16A2P36021 539 aa20.1■□□□□ 0.81
USP25-204ENST00000400183 LIG3P49916 1009 aa20.1■□□□□ 0.81
USP25-204ENST00000400183 CUL4AQ13619 759 aa20.1■□□□□ 0.81
USP25-204ENST00000400183 JADE1Q6IE81 842 aa20.1■□□□□ 0.81
USP25-204ENST00000400183 CEP170P1Q96L14 293 aa20.1■□□□□ 0.81
USP25-204ENST00000400183 ASPHQ12797 758 aa20.1■□□□□ 0.81
USP25-204ENST00000400183 SPZ1Q9BXG8 430 aa20.1■□□□□ 0.81
USP25-204ENST00000400183 INTS9Q9NV88 658 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
USP25-204ENST00000400183 JRKLQ9Y4A0 524 aa20.1■□□□□ 0.81
USP25-204ENST00000400183 BAG2O95816 211 aa20.1■□□□□ 0.81
USP25-204ENST00000400183 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
USP25-204ENST00000400183 FAM196AQ6ZSG2 479 aa20.1■□□□□ 0.81
USP25-204ENST00000400183 PDE11AQ9HCR9 933 aa20.1■□□□□ 0.81
USP25-204ENST00000400183 FAN1Q9Y2M0 1017 aa20.1■□□□□ 0.81
USP25-204ENST00000400183 WDR17Q8IZU2 1322 aa20.1■□□□□ 0.81
USP25-204ENST00000400183 HVCN1Q96D96 273 aa20.1■□□□□ 0.81
USP25-204ENST00000400183 HDAC11Q96DB2 347 aa20.1■□□□□ 0.81
USP25-204ENST00000400183 GBP5Q96PP8 586 aa20.1■□□□□ 0.81
USP25-204ENST00000400183 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
USP25-204ENST00000400183 PRKAB2O43741 272 aa20.09■□□□□ 0.81
USP25-204ENST00000400183 SUN1O94901 812 aa20.09■□□□□ 0.81
USP25-204ENST00000400183 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
USP25-204ENST00000400183 NR5A1Q13285 461 aa20.09■□□□□ 0.81
USP25-204ENST00000400183 ERFEQ4G0M1 354 aa20.09■□□□□ 0.81
USP25-204ENST00000400183 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
USP25-204ENST00000400183 TRIM56Q9BRZ2 755 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
USP25-204ENST00000400183 MAN1B1Q9UKM7 699 aa20.09■□□□□ 0.81
USP25-204ENST00000400183 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
USP25-204ENST00000400183 PGRMC1O00264 195 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
USP25-204ENST00000400183 GDF11O95390 407 aa20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.2 ms