RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000395713.6

TRPS1-202, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 3

Gene TRPS1, Length 581 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-202ENST00000395713 A0A1W2PQ27 194 aa6.6□□□□□ -1.35
TRPS1-202ENST00000395713 A0A1W2PQ64 194 aa6.6□□□□□ -1.35
TRPS1-202ENST00000395713 A0A1W2PQC6 194 aa6.6□□□□□ -1.35
TRPS1-202ENST00000395713 A0A1W2PQD8 194 aa6.6□□□□□ -1.35
TRPS1-202ENST00000395713 FITM1A5D6W6 292 aa6.6□□□□□ -1.35
TRPS1-202ENST00000395713 ARVCFO00192 962 aa6.6□□□□□ -1.35
TRPS1-202ENST00000395713 PSPNO60542 156 aa6.6□□□□□ -1.35
TRPS1-202ENST00000395713 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
TRPS1-202ENST00000395713 EFEMP2O95967 443 aa6.6□□□□□ -1.35
TRPS1-202ENST00000395713 HPXP02790 462 aa6.6□□□□□ -1.35
TRPS1-202ENST00000395713 NAT1P18440 290 aa6.6□□□□□ -1.35
TRPS1-202ENST00000395713 NCLP19338 710 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
TRPS1-202ENST00000395713 TRHRP34981 398 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
TRPS1-202ENST00000395713 IGFALSP35858 605 aa6.6□□□□□ -1.35
TRPS1-202ENST00000395713 ZNF460Q14592 562 aa6.6□□□□□ -1.35
TRPS1-202ENST00000395713 KIZQ2M2Z5 673 aa6.6□□□□□ -1.35
TRPS1-202ENST00000395713 TIGD5Q53EQ6 642 aa6.6□□□□□ -1.35
TRPS1-202ENST00000395713 GALNT18Q6P9A2 607 aa6.6□□□□□ -1.35
TRPS1-202ENST00000395713 CEP68Q76N32 757 aa6.6□□□□□ -1.35
TRPS1-202ENST00000395713 THNSL2Q86YJ6 484 aa6.6□□□□□ -1.35
TRPS1-202ENST00000395713 TEX2Q8IWB9 1127 aa6.6□□□□□ -1.35
TRPS1-202ENST00000395713 NLGN2Q8NFZ4 835 aa6.6□□□□□ -1.35
TRPS1-202ENST00000395713 ASIC4Q96FT7 647 aa6.6□□□□□ -1.35
TRPS1-202ENST00000395713 ALG1Q9BT22 464 aa6.6□□□□□ -1.35
TRPS1-202ENST00000395713 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
TRPS1-202ENST00000395713 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
TRPS1-202ENST00000395713 CLDND1Q9NY35 253 aa6.6□□□□□ -1.35
TRPS1-202ENST00000395713 MARCH2Q9P0N8 246 aa6.6□□□□□ -1.35
TRPS1-202ENST00000395713 CTNND2Q9UQB3 1225 aa6.6□□□□□ -1.35
TRPS1-202ENST00000395713 RWDD3Q9Y3V2 267 aa6.6□□□□□ -1.35
TRPS1-202ENST00000395713 TAF6LQ9Y6J9 622 aa6.6□□□□□ -1.35
TRPS1-202ENST00000395713 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP6.59□□□□□ -1.35
TRPS1-202ENST00000395713 PDE8AO60658 829 aa6.59□□□□□ -1.35
TRPS1-202ENST00000395713 FUCA1P04066 466 aa6.59□□□□□ -1.35
TRPS1-202ENST00000395713 SOD2P04179 222 aa6.59□□□□□ -1.35
TRPS1-202ENST00000395713 MSL3P1P0C860 447 aa6.59□□□□□ -1.35
TRPS1-202ENST00000395713 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa6.59□□□□□ -1.35
TRPS1-202ENST00000395713 PRKCAP17252 672 aa6.59□□□□□ -1.35
TRPS1-202ENST00000395713 KCNA6P17658 529 aa6.59□□□□□ -1.35
TRPS1-202ENST00000395713 GTF2A2P52657 109 aa6.59□□□□□ -1.35
TRPS1-202ENST00000395713 MVKQ03426 396 aa6.59□□□□□ -1.35
TRPS1-202ENST00000395713 PAK1Q13153 545 aa6.59□□□□□ -1.35
TRPS1-202ENST00000395713 NR0B2Q15466 257 aa6.59□□□□□ -1.35
TRPS1-202ENST00000395713 ARTNQ5T4W7 220 aa6.59□□□□□ -1.35
TRPS1-202ENST00000395713 NLRP10Q86W26 655 aa6.59□□□□□ -1.35
TRPS1-202ENST00000395713 ZC3H7AQ8IWR0 971 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
TRPS1-202ENST00000395713 ABI1Q8IZP0 508 aa6.59□□□□□ -1.35
TRPS1-202ENST00000395713 NUP43Q8NFH3 380 aa6.59□□□□□ -1.35
TRPS1-202ENST00000395713 PCDH19Q8TAB3 1148 aa6.59□□□□□ -1.35
TRPS1-202ENST00000395713 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
TRPS1-202ENST00000395713 CDIP1Q9H305 208 aa6.59□□□□□ -1.35
TRPS1-202ENST00000395713 IPPKQ9H8X2 491 aa6.59□□□□□ -1.35
TRPS1-202ENST00000395713 ACSL6Q9UKU0 697 aa6.59□□□□□ -1.35
TRPS1-202ENST00000395713 PBRM1Q86U86 1689 aa6.58□□□□□ -1.36
TRPS1-202ENST00000395713 FAM83GA6ND36 823 aa6.58□□□□□ -1.36
TRPS1-202ENST00000395713 GSG1L2A8MUP6 293 aa6.58□□□□□ -1.36
TRPS1-202ENST00000395713 FPR2P25090 351 aa6.58□□□□□ -1.36
TRPS1-202ENST00000395713 TACR1P25103 407 aa6.58□□□□□ -1.36
TRPS1-202ENST00000395713 GALK1P51570 392 aa6.58□□□□□ -1.36
TRPS1-202ENST00000395713 GP2P55259 537 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
TRPS1-202ENST00000395713 PTPROQ16827 1216 aa6.58□□□□□ -1.36
TRPS1-202ENST00000395713 ABHD17CQ6PCB6 329 aa6.58□□□□□ -1.36
TRPS1-202ENST00000395713 SIRT2Q8IXJ6 389 aa6.58□□□□□ -1.36
TRPS1-202ENST00000395713 PLEKHO2Q8TD55 490 aa6.58□□□□□ -1.36
TRPS1-202ENST00000395713 MYLIPQ8WY64 445 aa6.58□□□□□ -1.36
TRPS1-202ENST00000395713 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
TRPS1-202ENST00000395713 TMEM169Q96HH4 297 aa6.58□□□□□ -1.36
TRPS1-202ENST00000395713 GPATCH3Q96I76 525 aa6.58□□□□□ -1.36
TRPS1-202ENST00000395713 MTA3Q9BTC8 594 aa6.58□□□□□ -1.36
TRPS1-202ENST00000395713 JAM3Q9BX67 310 aa6.58□□□□□ -1.36
TRPS1-202ENST00000395713 TMX1Q9H3N1 280 aa6.58□□□□□ -1.36
TRPS1-202ENST00000395713 FBLN5Q9UBX5 448 aa6.58□□□□□ -1.36
TRPS1-202ENST00000395713 GPR160Q9UJ42 338 aa6.58□□□□□ -1.36
TRPS1-202ENST00000395713 C22orf46C9J442 243 aa6.57□□□□□ -1.36
TRPS1-202ENST00000395713 FAM47E-STBD1D6RA91 191 aa6.57□□□□□ -1.36
TRPS1-202ENST00000395713 H7BY64 318 aa6.57□□□□□ -1.36
TRPS1-202ENST00000395713 APPP05067 770 aa6.57□□□□□ -1.36
TRPS1-202ENST00000395713 VIL1P09327 827 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
TRPS1-202ENST00000395713 JMJD7P0C870 316 aa6.57□□□□□ -1.36
TRPS1-202ENST00000395713 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
TRPS1-202ENST00000395713 GRK2P25098 689 aa6.57□□□□□ -1.36
TRPS1-202ENST00000395713 GRK3P35626 688 aa6.57□□□□□ -1.36
TRPS1-202ENST00000395713 NEK4P51957 841 aa6.57□□□□□ -1.36
TRPS1-202ENST00000395713 CORO7P57737 925 aa6.57□□□□□ -1.36
TRPS1-202ENST00000395713 KRT26Q7Z3Y9 468 aa6.57□□□□□ -1.36
TRPS1-202ENST00000395713 LILRA2Q8N149 483 aa6.57□□□□□ -1.36
TRPS1-202ENST00000395713 LZTR1Q8N653 840 aa6.57□□□□□ -1.36
TRPS1-202ENST00000395713 UBR7Q8N806 425 aa6.57□□□□□ -1.36
TRPS1-202ENST00000395713 USP33Q8TEY7 942 aa6.57□□□□□ -1.36
TRPS1-202ENST00000395713 KCNJ15Q99712 375 aa6.57□□□□□ -1.36
TRPS1-202ENST00000395713 PDLIM7Q9NR12 457 aa6.57□□□□□ -1.36
TRPS1-202ENST00000395713 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP6.57□□□□□ -1.36
TRPS1-202ENST00000395713 KDM6BO15054 1643 aa6.57□□□□□ -1.36
TRPS1-202ENST00000395713 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa6.57□□□□□ -1.36
TRPS1-202ENST00000395713 KIF13AQ9H1H9 1805 aa6.57□□□□□ -1.36
TRPS1-202ENST00000395713 B4E1Z4 1266 aa6.56□□□□□ -1.36
TRPS1-202ENST00000395713 CKMP06732 381 aa6.56□□□□□ -1.36
TRPS1-202ENST00000395713 PYGMP11217 842 aa6.56□□□□□ -1.36
TRPS1-202ENST00000395713 RAC2P15153 192 aa6.56□□□□□ -1.36
TRPS1-202ENST00000395713 POU3F2P20265 443 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
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