RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000387416.2

MT-TS1-201, Transcript of mitochondrially encoded tRNA serine 1 (UCN), humanhuman

BASIC

Gene MT-TS1, Length 69 nt, Biotype Mt tRNA, Subcellular localisation Exosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MT-TS1-201ENST00000387416 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP9.79□□□□□ -0.84
MT-TS1-201ENST00000387416 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP9.79□□□□□ -0.84
MT-TS1-201ENST00000387416 EHMT1Q9H9B1 1298 aa9.79□□□□□ -0.84
MT-TS1-201ENST00000387416 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa9.79□□□□□ -0.84
MT-TS1-201ENST00000387416 PDLIM7Q9NR12 457 aa9.79□□□□□ -0.84
MT-TS1-201ENST00000387416 TMEM39AQ9NV64 488 aa9.79□□□□□ -0.84
MT-TS1-201ENST00000387416 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP9.79□□□□□ -0.84
MT-TS1-201ENST00000387416 BRPF3Q9ULD4 1205 aa9.79□□□□□ -0.84
MT-TS1-201ENST00000387416 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa9.79□□□□□ -0.84
MT-TS1-201ENST00000387416 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP9.79□□□□□ -0.84
MT-TS1-201ENST00000387416 LRRC37A2A6NM11 1700 aa9.79□□□□□ -0.84
MT-TS1-201ENST00000387416 MAFGO15525 162 aa9.78□□□□□ -0.84
MT-TS1-201ENST00000387416 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP9.78□□□□□ -0.84
MT-TS1-201ENST00000387416 PPFIA4O75335 1185 aa9.78□□□□□ -0.84
MT-TS1-201ENST00000387416 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP9.78□□□□□ -0.84
MT-TS1-201ENST00000387416 RAG1P15918 1043 aa9.78□□□□□ -0.84
MT-TS1-201ENST00000387416 RXRAP19793 462 aa9.78□□□□□ -0.84
MT-TS1-201ENST00000387416 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP9.78□□□□□ -0.84
MT-TS1-201ENST00000387416 FAAP100Q0VG06 881 aa9.78□□□□□ -0.84
MT-TS1-201ENST00000387416 TDHQ8IZJ6 230 aa9.78□□□□□ -0.84
MT-TS1-201ENST00000387416 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP9.78□□□□□ -0.84
MT-TS1-201ENST00000387416 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP9.78□□□□□ -0.84
MT-TS1-201ENST00000387416 PIBF1Q8WXW3 757 aa9.78□□□□□ -0.84
MT-TS1-201ENST00000387416 BRF1Q92994 677 aa9.78□□□□□ -0.84
MT-TS1-201ENST00000387416 CDHR1Q96JP9 859 aa9.78□□□□□ -0.84
MT-TS1-201ENST00000387416 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP9.78□□□□□ -0.84
MT-TS1-201ENST00000387416 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP9.78□□□□□ -0.84
MT-TS1-201ENST00000387416 MRVI1Q9Y6F6 885 aa9.78□□□□□ -0.84
MT-TS1-201ENST00000387416 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP9.78□□□□□ -0.84
MT-TS1-201ENST00000387416 V9GY48 417 aaPredicted RBP9.78□□□□□ -0.84
MT-TS1-201ENST00000387416 FRMPD4Q14CM0 1322 aa9.78□□□□□ -0.84
MT-TS1-201ENST00000387416 SPDYE3A6NKU9 549 aa9.77□□□□□ -0.85
MT-TS1-201ENST00000387416 MEIS2O14770 477 aa9.77□□□□□ -0.85
MT-TS1-201ENST00000387416 TIMP1P01033 207 aa9.77□□□□□ -0.85
MT-TS1-201ENST00000387416 MYL3P08590 195 aa9.77□□□□□ -0.85
MT-TS1-201ENST00000387416 ICAM3P32942 547 aa9.77□□□□□ -0.85
MT-TS1-201ENST00000387416 PURAQ00577 322 aaKnown RBP9.77□□□□□ -0.85
MT-TS1-201ENST00000387416 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP9.77□□□□□ -0.85
MT-TS1-201ENST00000387416 ARHGAP1Q07960 439 aa9.77□□□□□ -0.85
MT-TS1-201ENST00000387416 APOBRQ0VD83 1088 aa9.77□□□□□ -0.85
MT-TS1-201ENST00000387416 FUT2Q10981 343 aa9.77□□□□□ -0.85
MT-TS1-201ENST00000387416 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP9.77□□□□□ -0.85
MT-TS1-201ENST00000387416 NEDD9Q14511 834 aa9.77□□□□□ -0.85
MT-TS1-201ENST00000387416 DGKDQ16760 1214 aa9.77□□□□□ -0.85
MT-TS1-201ENST00000387416 LRIT3Q3SXY7 679 aa9.77□□□□□ -0.85
MT-TS1-201ENST00000387416 PCNX4Q63HM2 1172 aa9.77□□□□□ -0.85
MT-TS1-201ENST00000387416 GPR153Q6NV75 609 aa9.77□□□□□ -0.85
MT-TS1-201ENST00000387416 NFRKBQ6P4R8 1299 aa9.77□□□□□ -0.85
MT-TS1-201ENST00000387416 USP17L6PQ6QN14 398 aa9.77□□□□□ -0.85
MT-TS1-201ENST00000387416 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa9.77□□□□□ -0.85
MT-TS1-201ENST00000387416 NLRX1Q86UT6 975 aa9.77□□□□□ -0.85
MT-TS1-201ENST00000387416 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP9.77□□□□□ -0.85
MT-TS1-201ENST00000387416 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP9.77□□□□□ -0.85
MT-TS1-201ENST00000387416 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP9.77□□□□□ -0.85
MT-TS1-201ENST00000387416 CCDC82Q8N4S0 544 aa9.77□□□□□ -0.85
MT-TS1-201ENST00000387416 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP9.77□□□□□ -0.85
MT-TS1-201ENST00000387416 TCEANC2Q96MN5 208 aa9.77□□□□□ -0.85
MT-TS1-201ENST00000387416 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP9.77□□□□□ -0.85
MT-TS1-201ENST00000387416 SENP7Q9BQF6 1050 aa9.77□□□□□ -0.85
MT-TS1-201ENST00000387416 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP9.77□□□□□ -0.85
MT-TS1-201ENST00000387416 RIC8AQ9NPQ8 531 aa9.77□□□□□ -0.85
MT-TS1-201ENST00000387416 TBX21Q9UL17 535 aa9.77□□□□□ -0.85
MT-TS1-201ENST00000387416 NID2Q14112 1375 aa9.76□□□□□ -0.85
MT-TS1-201ENST00000387416 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa9.76□□□□□ -0.85
MT-TS1-201ENST00000387416 TRIM43BA6NCK2 446 aa9.76□□□□□ -0.85
MT-TS1-201ENST00000387416 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
MT-TS1-201ENST00000387416 FIBPO43427 364 aa9.76□□□□□ -0.85
MT-TS1-201ENST00000387416 ARIH2O95376 493 aa9.76□□□□□ -0.85
MT-TS1-201ENST00000387416 CD4P01730 458 aa9.76□□□□□ -0.85
MT-TS1-201ENST00000387416 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP9.76□□□□□ -0.85
MT-TS1-201ENST00000387416 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP9.76□□□□□ -0.85
MT-TS1-201ENST00000387416 NAPAP54920 295 aa9.76□□□□□ -0.85
MT-TS1-201ENST00000387416 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP9.76□□□□□ -0.85
MT-TS1-201ENST00000387416 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP9.76□□□□□ -0.85
MT-TS1-201ENST00000387416 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP9.76□□□□□ -0.85
MT-TS1-201ENST00000387416 LY6KQ17RY6 165 aa9.76□□□□□ -0.85
MT-TS1-201ENST00000387416 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
MT-TS1-201ENST00000387416 MYSM1Q5VVJ2 828 aa9.76□□□□□ -0.85
MT-TS1-201ENST00000387416 MFSD5Q6N075 450 aa9.76□□□□□ -0.85
MT-TS1-201ENST00000387416 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
MT-TS1-201ENST00000387416 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa9.76□□□□□ -0.85
MT-TS1-201ENST00000387416 FAM126BQ8IXS8 530 aa9.76□□□□□ -0.85
MT-TS1-201ENST00000387416 PPTC7Q8NI37 304 aa9.76□□□□□ -0.85
MT-TS1-201ENST00000387416 AFG1LQ8WV93 481 aa9.76□□□□□ -0.85
MT-TS1-201ENST00000387416 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP9.76□□□□□ -0.85
MT-TS1-201ENST00000387416 GPRASP2Q96D09 838 aa9.76□□□□□ -0.85
MT-TS1-201ENST00000387416 KATNAL1Q9BW62 490 aa9.76□□□□□ -0.85
MT-TS1-201ENST00000387416 MLXIPQ9HAP2 919 aa9.76□□□□□ -0.85
MT-TS1-201ENST00000387416 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP9.76□□□□□ -0.85
MT-TS1-201ENST00000387416 BARHL2Q9NY43 387 aa9.76□□□□□ -0.85
MT-TS1-201ENST00000387416 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa9.76□□□□□ -0.85
MT-TS1-201ENST00000387416 MYH7BA7E2Y1 1941 aa9.76□□□□□ -0.85
MT-TS1-201ENST00000387416 ESYT2A0FGR8 921 aa9.75□□□□□ -0.85
MT-TS1-201ENST00000387416 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa9.75□□□□□ -0.85
MT-TS1-201ENST00000387416 RGS20O76081 388 aa9.75□□□□□ -0.85
MT-TS1-201ENST00000387416 SLC34A2O95436 690 aa9.75□□□□□ -0.85
MT-TS1-201ENST00000387416 MMP3P08254 477 aa9.75□□□□□ -0.85
MT-TS1-201ENST00000387416 SCG2P13521 617 aa9.75□□□□□ -0.85
MT-TS1-201ENST00000387416 IFNAR1P17181 557 aa9.75□□□□□ -0.85
MT-TS1-201ENST00000387416 GNA11P29992 359 aa9.75□□□□□ -0.85
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