RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000367364.5

PTPRC-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 1,017 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-202ENST00000367364 MARCH2Q9P0N8 246 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRC-202ENST00000367364 TRBV23OR9-2A0A075B6M9 112 aa7.49□□□□□ -1.21
PTPRC-202ENST00000367364 MUSKO15146 869 aa7.49□□□□□ -1.21
PTPRC-202ENST00000367364 CYP1A1P04798 512 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
PTPRC-202ENST00000367364 AMPD2Q01433 879 aa7.49□□□□□ -1.21
PTPRC-202ENST00000367364 PPT2Q9UMR5 302 aa7.49□□□□□ -1.21
PTPRC-202ENST00000367364 GRB10Q13322 594 aa7.48□□□□□ -1.21
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PTPRC-202ENST00000367364 ARHGEF39Q8N4T4 335 aa7.48□□□□□ -1.21
PTPRC-202ENST00000367364 SEC14L1Q92503 715 aa7.48□□□□□ -1.21
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PTPRC-202ENST00000367364 TESMINQ9Y4I5 508 aa7.48□□□□□ -1.21
PTPRC-202ENST00000367364 EPHX1P07099 455 aa7.47□□□□□ -1.21
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PTPRC-202ENST00000367364 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP7.47□□□□□ -1.21
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PTPRC-202ENST00000367364 FBXW10Q5XX13 1052 aa7.46□□□□□ -1.22
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PTPRC-202ENST00000367364 MMP19Q99542 508 aa7.46□□□□□ -1.22
PTPRC-202ENST00000367364 TMEM168Q9H0V1 697 aa7.46□□□□□ -1.22
PTPRC-202ENST00000367364 PLS3P13797 630 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRC-202ENST00000367364 FHL2Q14192 279 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRC-202ENST00000367364 GNPTABQ3T906 1256 aa7.45□□□□□ -1.22
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PTPRC-202ENST00000367364 COPS5Q92905 334 aa7.45□□□□□ -1.22
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PTPRC-202ENST00000367364 SEMA4AQ9H3S1 761 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRC-202ENST00000367364 L2HGDHQ9H9P8 463 aa7.45□□□□□ -1.22
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PTPRC-202ENST00000367364 PCDHB10Q9UN67 800 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRC-202ENST00000367364 C22orf46C9J442 243 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRC-202ENST00000367364 NPIPB8E9PQR5 432 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRC-202ENST00000367364 PPM1BO75688 479 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRC-202ENST00000367364 INF2Q27J81 1249 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRC-202ENST00000367364 ZNF513Q8N8E2 541 aaPredicted RBP7.44□□□□□ -1.22
PTPRC-202ENST00000367364 GPRC5CQ9NQ84 441 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRC-202ENST00000367364 C11orf21Q9P2W6 132 aa7.44□□□□□ -1.22
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PTPRC-202ENST00000367364 KLHL6Q8WZ60 621 aa7.43□□□□□ -1.22
PTPRC-202ENST00000367364 ZNF341Q9BYN7 854 aa7.43□□□□□ -1.22
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PTPRC-202ENST00000367364 KLHL36Q8N4N3 616 aa7.41□□□□□ -1.22
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PTPRC-202ENST00000367364 WASF3Q9UPY6 502 aa7.41□□□□□ -1.22
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PTPRC-202ENST00000367364 FOXE3Q13461 319 aa7.4□□□□□ -1.22
PTPRC-202ENST00000367364 SMN1Q16637 294 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
PTPRC-202ENST00000367364 MIIPQ5JXC2 388 aa7.4□□□□□ -1.22
PTPRC-202ENST00000367364 Q8N1Y9 231 aa7.4□□□□□ -1.22
PTPRC-202ENST00000367364 CLIC6Q96NY7 704 aa7.4□□□□□ -1.22
PTPRC-202ENST00000367364 NFATC3Q12968 1075 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRC-202ENST00000367364 MROH9Q5TGP6 573 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRC-202ENST00000367364 CCDC81Q6ZN84 652 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRC-202ENST00000367364 NLRP10Q86W26 655 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRC-202ENST00000367364 CHFRQ96EP1 664 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRC-202ENST00000367364 APEX2Q9UBZ4 518 aa7.39□□□□□ -1.23
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PTPRC-202ENST00000367364 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa7.39□□□□□ -1.23
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PTPRC-202ENST00000367364 DTLQ9NZJ0 730 aa7.38□□□□□ -1.23
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PTPRC-202ENST00000367364 CNOT4O95628 575 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
PTPRC-202ENST00000367364 COL6A1P12109 1028 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRC-202ENST00000367364 TEPPQ6URK8 271 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRC-202ENST00000367364 RNF207Q6ZRF8 634 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRC-202ENST00000367364 ARRDC4Q8NCT1 418 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRC-202ENST00000367364 TOE1Q96GM8 510 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
PTPRC-202ENST00000367364 FTSJ1Q9UET6 329 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRC-202ENST00000367364 AKT3Q9Y243 479 aa7.37□□□□□ -1.23
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