RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000363507.1

SNORD56.3-201, Transcript of small nucleolar RNA, C/D box 56, humanhuman

BASIC

Gene SNORD56, Length 71 nt, Biotype snoRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNORD56.3-201ENST00000363507 MTMR3Q13615 1198 aa3.6□□□□□ -1.83
SNORD56.3-201ENST00000363507 CUL1Q13616 776 aa3.6□□□□□ -1.83
SNORD56.3-201ENST00000363507 UBE4AQ14139 1066 aa3.6□□□□□ -1.83
SNORD56.3-201ENST00000363507 SEPT2Q15019 361 aa3.6□□□□□ -1.83
SNORD56.3-201ENST00000363507 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
SNORD56.3-201ENST00000363507 NAB2Q15742 525 aa3.6□□□□□ -1.83
SNORD56.3-201ENST00000363507 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP3.6□□□□□ -1.83
SNORD56.3-201ENST00000363507 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
SNORD56.3-201ENST00000363507 SKIDA1Q1XH10 827 aa3.6□□□□□ -1.83
SNORD56.3-201ENST00000363507 INF2Q27J81 1249 aa3.6□□□□□ -1.83
SNORD56.3-201ENST00000363507 ASTE1Q2TB18 679 aaPredicted RBP3.6□□□□□ -1.83
SNORD56.3-201ENST00000363507 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa3.6□□□□□ -1.83
SNORD56.3-201ENST00000363507 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP3.6□□□□□ -1.83
SNORD56.3-201ENST00000363507 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
SNORD56.3-201ENST00000363507 C10orf76Q5T2E6 689 aa3.6□□□□□ -1.83
SNORD56.3-201ENST00000363507 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP3.6□□□□□ -1.83
SNORD56.3-201ENST00000363507 AGBL2Q5U5Z8 902 aa3.6□□□□□ -1.83
SNORD56.3-201ENST00000363507 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa3.6□□□□□ -1.83
SNORD56.3-201ENST00000363507 TTC19Q6DKK2 380 aaPredicted RBP3.6□□□□□ -1.83
SNORD56.3-201ENST00000363507 CENPPQ6IPU0 288 aa3.6□□□□□ -1.83
SNORD56.3-201ENST00000363507 RUFY4Q6ZNE9 571 aa3.6□□□□□ -1.83
SNORD56.3-201ENST00000363507 LRRC55Q6ZSA7 311 aa3.6□□□□□ -1.83
SNORD56.3-201ENST00000363507 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP3.6□□□□□ -1.83
SNORD56.3-201ENST00000363507 CCDC121Q6ZUS5 278 aa3.6□□□□□ -1.83
SNORD56.3-201ENST00000363507 UNC13DQ70J99 1090 aa3.6□□□□□ -1.83
SNORD56.3-201ENST00000363507 SV2BQ7L1I2 683 aa3.6□□□□□ -1.83
SNORD56.3-201ENST00000363507 RRAGAQ7L523 313 aa3.6□□□□□ -1.83
SNORD56.3-201ENST00000363507 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa3.6□□□□□ -1.83
SNORD56.3-201ENST00000363507 TEX2Q8IWB9 1127 aa3.6□□□□□ -1.83
SNORD56.3-201ENST00000363507 PROM2Q8N271 834 aa3.6□□□□□ -1.83
SNORD56.3-201ENST00000363507 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
SNORD56.3-201ENST00000363507 SH2D3CQ8N5H7 860 aa3.6□□□□□ -1.83
SNORD56.3-201ENST00000363507 GPATCH11Q8N954 259 aa3.6□□□□□ -1.83
SNORD56.3-201ENST00000363507 KIAA0895Q8NCT3 520 aa3.6□□□□□ -1.83
SNORD56.3-201ENST00000363507 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa3.6□□□□□ -1.83
SNORD56.3-201ENST00000363507 MAGEC3Q8TD91 643 aa3.6□□□□□ -1.83
SNORD56.3-201ENST00000363507 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa3.6□□□□□ -1.83
SNORD56.3-201ENST00000363507 PIK3R5Q8WYR1 880 aa3.6□□□□□ -1.83
SNORD56.3-201ENST00000363507 PIGBQ92521 554 aa3.6□□□□□ -1.83
SNORD56.3-201ENST00000363507 TAF4BQ92750 862 aa3.6□□□□□ -1.83
SNORD56.3-201ENST00000363507 P3H4Q92791 437 aa3.6□□□□□ -1.83
SNORD56.3-201ENST00000363507 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP3.6□□□□□ -1.83
SNORD56.3-201ENST00000363507 LRRC45Q96CN5 670 aa3.6□□□□□ -1.83
SNORD56.3-201ENST00000363507 MTMR8Q96EF0 704 aa3.6□□□□□ -1.83
SNORD56.3-201ENST00000363507 CALML4Q96GE6 196 aa3.6□□□□□ -1.83
SNORD56.3-201ENST00000363507 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP3.6□□□□□ -1.83
SNORD56.3-201ENST00000363507 CCT8L2Q96SF2 557 aa3.6□□□□□ -1.83
SNORD56.3-201ENST00000363507 LRRC27Q9C0I9 530 aa3.6□□□□□ -1.83
SNORD56.3-201ENST00000363507 TMEM60Q9H2L4 133 aa3.6□□□□□ -1.83
SNORD56.3-201ENST00000363507 NDST4Q9H3R1 872 aa3.6□□□□□ -1.83
SNORD56.3-201ENST00000363507 SEMA6BQ9H3T3 888 aa3.6□□□□□ -1.83
SNORD56.3-201ENST00000363507 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP3.6□□□□□ -1.83
SNORD56.3-201ENST00000363507 RABEP2Q9H5N1 569 aa3.6□□□□□ -1.83
SNORD56.3-201ENST00000363507 CXorf56Q9H5V9 222 aa3.6□□□□□ -1.83
SNORD56.3-201ENST00000363507 MMRN2Q9H8L6 949 aa3.6□□□□□ -1.83
SNORD56.3-201ENST00000363507 TMBIM4Q9HC24 238 aa3.6□□□□□ -1.83
SNORD56.3-201ENST00000363507 EPB41L5Q9HCM4 733 aa3.6□□□□□ -1.83
SNORD56.3-201ENST00000363507 PLCB1Q9NQ66 1216 aa3.6□□□□□ -1.83
SNORD56.3-201ENST00000363507 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP3.6□□□□□ -1.83
SNORD56.3-201ENST00000363507 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa3.6□□□□□ -1.83
SNORD56.3-201ENST00000363507 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa3.6□□□□□ -1.83
SNORD56.3-201ENST00000363507 CEP72Q9P209 647 aa3.6□□□□□ -1.83
SNORD56.3-201ENST00000363507 ABCF2Q9UG63 623 aa3.6□□□□□ -1.83
SNORD56.3-201ENST00000363507 NFU1Q9UMS0 254 aa3.6□□□□□ -1.83
SNORD56.3-201ENST00000363507 PCDHA6Q9UN73 950 aa3.6□□□□□ -1.83
SNORD56.3-201ENST00000363507 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa3.6□□□□□ -1.83
SNORD56.3-201ENST00000363507 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa3.6□□□□□ -1.83
SNORD56.3-201ENST00000363507 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
SNORD56.3-201ENST00000363507 ATP8B3O60423 1300 aa3.6□□□□□ -1.83
SNORD56.3-201ENST00000363507 ROBO3Q96MS0 1386 aa3.6□□□□□ -1.83
SNORD56.3-201ENST00000363507 BCL9O00512 1426 aa3.6□□□□□ -1.83
SNORD56.3-201ENST00000363507 DOT1LQ8TEK3 1739 aa3.59□□□□□ -1.83
SNORD56.3-201ENST00000363507 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
SNORD56.3-201ENST00000363507 GMNCA6NCL1 334 aa3.59□□□□□ -1.83
SNORD56.3-201ENST00000363507 C5orf60A6NFR6 353 aa3.59□□□□□ -1.83
SNORD56.3-201ENST00000363507 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.83
SNORD56.3-201ENST00000363507 E7EVH7 732 aa3.59□□□□□ -1.83
SNORD56.3-201ENST00000363507 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.83
SNORD56.3-201ENST00000363507 SMIM22K7EJ46 135 aa3.59□□□□□ -1.83
SNORD56.3-201ENST00000363507 MYO1FO00160 1098 aa3.59□□□□□ -1.83
SNORD56.3-201ENST00000363507 SNAP23O00161 211 aa3.59□□□□□ -1.83
SNORD56.3-201ENST00000363507 ADAMTS3O15072 1205 aa3.59□□□□□ -1.83
SNORD56.3-201ENST00000363507 EPHB6O15197 1021 aa3.59□□□□□ -1.83
SNORD56.3-201ENST00000363507 RAD51CO43502 376 aa3.59□□□□□ -1.83
SNORD56.3-201ENST00000363507 SLC26A4O43511 780 aa3.59□□□□□ -1.83
SNORD56.3-201ENST00000363507 TRAPPC3O43617 180 aa3.59□□□□□ -1.83
SNORD56.3-201ENST00000363507 C21orf2O43822 256 aa3.59□□□□□ -1.83
SNORD56.3-201ENST00000363507 NMT2O60551 498 aa3.59□□□□□ -1.83
SNORD56.3-201ENST00000363507 PALMO75781 387 aa3.59□□□□□ -1.83
SNORD56.3-201ENST00000363507 ADAMTS2O95450 1211 aa3.59□□□□□ -1.83
SNORD56.3-201ENST00000363507 NTSR2O95665 410 aa3.59□□□□□ -1.83
SNORD56.3-201ENST00000363507 GNA14O95837 355 aa3.59□□□□□ -1.83
SNORD56.3-201ENST00000363507 KRT14P02533 472 aa3.59□□□□□ -1.83
SNORD56.3-201ENST00000363507 PAEPP09466 180 aa3.59□□□□□ -1.83
SNORD56.3-201ENST00000363507 FAM153BP0C7A2 387 aa3.59□□□□□ -1.83
SNORD56.3-201ENST00000363507 MYZAPP0CAP1 466 aa3.59□□□□□ -1.83
SNORD56.3-201ENST00000363507 GHRP10912 638 aa3.59□□□□□ -1.83
SNORD56.3-201ENST00000363507 FCER1AP12319 257 aa3.59□□□□□ -1.83
SNORD56.3-201ENST00000363507 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.83
SNORD56.3-201ENST00000363507 ANXA13P27216 316 aa3.59□□□□□ -1.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.6 ms