RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362449.1

RN7SKP25-201, Transcript of RNA, 7SK small nuclear pseudogene 25, humanhuman

BASIC

Gene RN7SKP25, Length 308 nt, Biotype misc RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RN7SKP25-201ENST00000362449 SELPP16109 830 aa9.98□□□□□ -0.81
RN7SKP25-201ENST00000362449 CALML3P27482 149 aa9.98□□□□□ -0.81
RN7SKP25-201ENST00000362449 CTDSPL2Q05D32 466 aa9.98□□□□□ -0.81
RN7SKP25-201ENST00000362449 PDE4BQ07343 736 aa9.98□□□□□ -0.81
RN7SKP25-201ENST00000362449 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
RN7SKP25-201ENST00000362449 PPP2R5BQ15173 497 aa9.98□□□□□ -0.81
RN7SKP25-201ENST00000362449 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
RN7SKP25-201ENST00000362449 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
RN7SKP25-201ENST00000362449 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
RN7SKP25-201ENST00000362449 FAM117BQ6P1L5 589 aa9.98□□□□□ -0.81
RN7SKP25-201ENST00000362449 CNKSR3Q6P9H4 555 aa9.98□□□□□ -0.81
RN7SKP25-201ENST00000362449 BTNL9Q6UXG8 535 aa9.98□□□□□ -0.81
RN7SKP25-201ENST00000362449 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP9.98□□□□□ -0.81
RN7SKP25-201ENST00000362449 LRRC8DQ7L1W4 858 aa9.98□□□□□ -0.81
RN7SKP25-201ENST00000362449 SESTD1Q86VW0 696 aa9.98□□□□□ -0.81
RN7SKP25-201ENST00000362449 CAGE1Q8TC20 777 aa9.98□□□□□ -0.81
RN7SKP25-201ENST00000362449 NEK9Q8TD19 979 aa9.98□□□□□ -0.81
RN7SKP25-201ENST00000362449 GPATCH3Q96I76 525 aa9.98□□□□□ -0.81
RN7SKP25-201ENST00000362449 UIMC1Q96RL1 719 aa9.98□□□□□ -0.81
RN7SKP25-201ENST00000362449 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
RN7SKP25-201ENST00000362449 PHOX2BQ99453 314 aa9.98□□□□□ -0.81
RN7SKP25-201ENST00000362449 RAD9AQ99638 391 aa9.98□□□□□ -0.81
RN7SKP25-201ENST00000362449 ZBED2Q9BTP6 218 aa9.98□□□□□ -0.81
RN7SKP25-201ENST00000362449 ZNF287Q9HBT7 754 aa9.98□□□□□ -0.81
RN7SKP25-201ENST00000362449 STX8Q9UNK0 236 aa9.98□□□□□ -0.81
RN7SKP25-201ENST00000362449 MYO10Q9HD67 2058 aa9.98□□□□□ -0.81
RN7SKP25-201ENST00000362449 H3BQ06 376 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
RN7SKP25-201ENST00000362449 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP9.97□□□□□ -0.81
RN7SKP25-201ENST00000362449 MMP3P08254 477 aa9.97□□□□□ -0.81
RN7SKP25-201ENST00000362449 TXNP10599 105 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
RN7SKP25-201ENST00000362449 CKBP12277 381 aa9.97□□□□□ -0.81
RN7SKP25-201ENST00000362449 GNAT2P19087 354 aa9.97□□□□□ -0.81
RN7SKP25-201ENST00000362449 RPS6P62753 249 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
RN7SKP25-201ENST00000362449 ARHGAP1Q07960 439 aa9.97□□□□□ -0.81
RN7SKP25-201ENST00000362449 PDE4DQ08499 809 aa9.97□□□□□ -0.81
RN7SKP25-201ENST00000362449 RBL2Q08999 1139 aa9.97□□□□□ -0.81
RN7SKP25-201ENST00000362449 HIC1Q14526 733 aa9.97□□□□□ -0.81
RN7SKP25-201ENST00000362449 CCDC96Q2M329 555 aa9.97□□□□□ -0.81
RN7SKP25-201ENST00000362449 TTC22Q5TAA0 569 aa9.97□□□□□ -0.81
RN7SKP25-201ENST00000362449 SYDE2Q5VT97 1194 aa9.97□□□□□ -0.81
RN7SKP25-201ENST00000362449 CCDC62Q6P9F0 684 aa9.97□□□□□ -0.81
RN7SKP25-201ENST00000362449 RNF207Q6ZRF8 634 aa9.97□□□□□ -0.81
RN7SKP25-201ENST00000362449 SCFD2Q8WU76 684 aa9.97□□□□□ -0.81
RN7SKP25-201ENST00000362449 AFG1LQ8WV93 481 aa9.97□□□□□ -0.81
RN7SKP25-201ENST00000362449 SNX27Q96L92 541 aa9.97□□□□□ -0.81
RN7SKP25-201ENST00000362449 OSBPL3Q9H4L5 887 aa9.97□□□□□ -0.81
RN7SKP25-201ENST00000362449 NOD1Q9Y239 953 aa9.97□□□□□ -0.81
RN7SKP25-201ENST00000362449 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
RN7SKP25-201ENST00000362449 TTC41PQ6P2S7 1318 aa9.97□□□□□ -0.81
RN7SKP25-201ENST00000362449 TTC3P53804 2025 aa9.97□□□□□ -0.81
RN7SKP25-201ENST00000362449 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa9.96□□□□□ -0.82
RN7SKP25-201ENST00000362449 C19orf67A6NJJ6 358 aa9.96□□□□□ -0.82
RN7SKP25-201ENST00000362449 DCXO43602 365 aa9.96□□□□□ -0.82
RN7SKP25-201ENST00000362449 ALADP13716 330 aa9.96□□□□□ -0.82
RN7SKP25-201ENST00000362449 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.82
RN7SKP25-201ENST00000362449 ZP2Q05996 745 aa9.96□□□□□ -0.82
RN7SKP25-201ENST00000362449 COL19A1Q14993 1142 aa9.96□□□□□ -0.82
RN7SKP25-201ENST00000362449 FBXO22Q8NEZ5 403 aa9.96□□□□□ -0.82
RN7SKP25-201ENST00000362449 PI4K2BQ8TCG2 481 aa9.96□□□□□ -0.82
RN7SKP25-201ENST00000362449 DCAF4Q8WV16 495 aa9.96□□□□□ -0.82
RN7SKP25-201ENST00000362449 TBC1D5Q92609 795 aa9.96□□□□□ -0.82
RN7SKP25-201ENST00000362449 OSBPL7Q9BZF2 842 aa9.96□□□□□ -0.82
RN7SKP25-201ENST00000362449 NAPBQ9H115 298 aa9.96□□□□□ -0.82
RN7SKP25-201ENST00000362449 GPCPD1Q9NPB8 672 aa9.96□□□□□ -0.82
RN7SKP25-201ENST00000362449 HDAC6Q9UBN7 1215 aa9.96□□□□□ -0.82
RN7SKP25-201ENST00000362449 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa9.96□□□□□ -0.82
RN7SKP25-201ENST00000362449 RAD50Q92878 1312 aa9.96□□□□□ -0.82
RN7SKP25-201ENST00000362449 TSPY2A6NKD2 308 aa9.95□□□□□ -0.82
RN7SKP25-201ENST00000362449 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa9.95□□□□□ -0.82
RN7SKP25-201ENST00000362449 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
RN7SKP25-201ENST00000362449 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
RN7SKP25-201ENST00000362449 LTBRP36941 435 aa9.95□□□□□ -0.82
RN7SKP25-201ENST00000362449 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
RN7SKP25-201ENST00000362449 LY6KQ17RY6 165 aa9.95□□□□□ -0.82
RN7SKP25-201ENST00000362449 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa9.95□□□□□ -0.82
RN7SKP25-201ENST00000362449 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
RN7SKP25-201ENST00000362449 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa9.95□□□□□ -0.82
RN7SKP25-201ENST00000362449 ZNF618Q5T7W0 954 aa9.95□□□□□ -0.82
RN7SKP25-201ENST00000362449 HFE2Q6ZVN8 426 aa9.95□□□□□ -0.82
RN7SKP25-201ENST00000362449 CCDC155Q8N6L0 562 aa9.95□□□□□ -0.82
RN7SKP25-201ENST00000362449 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
RN7SKP25-201ENST00000362449 MRPL38Q96DV4 380 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
RN7SKP25-201ENST00000362449 TMEM47Q9BQJ4 181 aa9.95□□□□□ -0.82
RN7SKP25-201ENST00000362449 COL20A1Q9P218 1284 aa9.95□□□□□ -0.82
RN7SKP25-201ENST00000362449 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
RN7SKP25-201ENST00000362449 HAS3O00219 553 aa9.94□□□□□ -0.82
RN7SKP25-201ENST00000362449 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
RN7SKP25-201ENST00000362449 LGR5O75473 907 aa9.94□□□□□ -0.82
RN7SKP25-201ENST00000362449 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
RN7SKP25-201ENST00000362449 FGRP09769 529 aa9.94□□□□□ -0.82
RN7SKP25-201ENST00000362449 IRS1P35568 1242 aa9.94□□□□□ -0.82
RN7SKP25-201ENST00000362449 IKBKEQ14164 716 aa9.94□□□□□ -0.82
RN7SKP25-201ENST00000362449 EPC2Q52LR7 807 aa9.94□□□□□ -0.82
RN7SKP25-201ENST00000362449 TCEAL5Q5H9L2 206 aa9.94□□□□□ -0.82
RN7SKP25-201ENST00000362449 VPS53Q5VIR6 699 aa9.94□□□□□ -0.82
RN7SKP25-201ENST00000362449 SEPT14Q6ZU15 432 aa9.94□□□□□ -0.82
RN7SKP25-201ENST00000362449 CHST3Q7LGC8 479 aa9.94□□□□□ -0.82
RN7SKP25-201ENST00000362449 DNERQ8NFT8 737 aa9.94□□□□□ -0.82
RN7SKP25-201ENST00000362449 RILPL2Q969X0 211 aa9.94□□□□□ -0.82
RN7SKP25-201ENST00000362449 ALG1Q9BT22 464 aa9.94□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 72.8 ms