RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361198.9

LDB1-201, Transcript of LIM domain binding 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LDB1, Length 2,285 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDB1-201ENST00000361198 AMNQ9BXJ7 453 aa25.25■■□□□ 1.63
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LDB1-201ENST00000361198 TTC26A0AVF1 554 aa25.16■■□□□ 1.62
LDB1-201ENST00000361198 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP25.16■■□□□ 1.622e-6■□□□□ 10.4
LDB1-201ENST00000361198 KIF5CO60282 957 aa25.16■■□□□ 1.62
LDB1-201ENST00000361198 DNM2P50570 870 aa25.16■■□□□ 1.62
LDB1-201ENST00000361198 PRR16Q569H4 304 aa25.16■■□□□ 1.62
LDB1-201ENST00000361198 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP25.16■■□□□ 1.62
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