RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000348564.10

PTPRC-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 4,626 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-201ENST00000348564 KRT2P35908 639 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRC-201ENST00000348564 CNTN2Q02246 1040 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRC-201ENST00000348564 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP4.99□□□□□ -1.61
PTPRC-201ENST00000348564 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
PTPRC-201ENST00000348564 LAMC2Q13753 1193 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF174Q15697 407 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRC-201ENST00000348564 FAM102BQ5T8I3 360 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRC-201ENST00000348564 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRC-201ENST00000348564 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
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PTPRC-201ENST00000348564 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
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PTPRC-201ENST00000348564 ADD1P35611 737 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
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PTPRC-201ENST00000348564 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP4.98□□□□□ -1.61
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PTPRC-201ENST00000348564 WDR18Q9BV38 432 aa4.98□□□□□ -1.61
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PTPRC-201ENST00000348564 FBXL21Q9UKT6 434 aa4.98□□□□□ -1.61
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PTPRC-201ENST00000348564 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP4.98□□□□□ -1.61
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PTPRC-201ENST00000348564 C2CD2LO14523 706 aa4.97□□□□□ -1.61
PTPRC-201ENST00000348564 SEPT4O43236 478 aa4.97□□□□□ -1.61
PTPRC-201ENST00000348564 AMHP03971 560 aa4.97□□□□□ -1.61
PTPRC-201ENST00000348564 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP4.97□□□□□ -1.61
PTPRC-201ENST00000348564 BIRC3Q13489 604 aa4.97□□□□□ -1.61
PTPRC-201ENST00000348564 CALCRLQ16602 461 aa4.97□□□□□ -1.61
PTPRC-201ENST00000348564 PTGISQ16647 500 aa4.97□□□□□ -1.61
PTPRC-201ENST00000348564 PTPROQ16827 1216 aa4.97□□□□□ -1.61
PTPRC-201ENST00000348564 INF2Q27J81 1249 aa4.97□□□□□ -1.61
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PTPRC-201ENST00000348564 RASGRP4Q8TDF6 673 aa4.97□□□□□ -1.61
PTPRC-201ENST00000348564 NACC1Q96RE7 527 aa4.97□□□□□ -1.61
PTPRC-201ENST00000348564 TAAR1Q96RJ0 339 aa4.97□□□□□ -1.61
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