RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000348333.7

TNFRSF25-201, Transcript of TNF receptor superfamily member 25, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TNFRSF25, Length 1,119 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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TNFRSF25-201ENST00000348333 ZNF697Q5TEC3 545 aa26.33■■□□□ 1.81
TNFRSF25-201ENST00000348333 NFXL1Q6ZNB6 911 aa26.33■■□□□ 1.81
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TNFRSF25-201ENST00000348333 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP26.32■■□□□ 1.8
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TNFRSF25-201ENST00000348333 MAP3K14Q99558 947 aa26.32■■□□□ 1.8
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TNFRSF25-201ENST00000348333 IL23AQ9NPF7 189 aa26.32■■□□□ 1.8
TNFRSF25-201ENST00000348333 MRVI1Q9Y6F6 885 aa26.32■■□□□ 1.8
TNFRSF25-201ENST00000348333 CDH23Q9H251 3354 aa26.32■■□□□ 1.8
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TNFRSF25-201ENST00000348333 GRXCR1A8MXD5 290 aa26.31■■□□□ 1.8
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TNFRSF25-201ENST00000348333 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa26.3■■□□□ 1.8
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TNFRSF25-201ENST00000348333 KIF5BP33176 963 aa26.29■■□□□ 1.8
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TNFRSF25-201ENST00000348333 SP2Q02086 613 aa26.29■■□□□ 1.8
TNFRSF25-201ENST00000348333 ADCK5Q3MIX3 580 aa26.29■■□□□ 1.8
TNFRSF25-201ENST00000348333 NFRKBQ6P4R8 1299 aa26.29■■□□□ 1.8
TNFRSF25-201ENST00000348333 TET1Q8NFU7 2136 aa26.29■■□□□ 1.8
TNFRSF25-201ENST00000348333 ZNF286BP0CG31 522 aa26.28■■□□□ 1.8
TNFRSF25-201ENST00000348333 PBX2P40425 430 aa26.28■■□□□ 1.8
TNFRSF25-201ENST00000348333 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP26.28■■□□□ 1.8
TNFRSF25-201ENST00000348333 SAMD3Q8N6K7 520 aa26.28■■□□□ 1.8
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TNFRSF25-201ENST00000348333 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP26.28■■□□□ 1.8
TNFRSF25-201ENST00000348333 BCAS3Q9H6U6 928 aa26.28■■□□□ 1.8
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TNFRSF25-201ENST00000348333 EYSQ5T1H1 3165 aa26.26■■□□□ 1.79
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TNFRSF25-201ENST00000348333 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP26.24■■□□□ 1.79
TNFRSF25-201ENST00000348333 CALM1P0DP23 149 aa26.23■■□□□ 1.79
TNFRSF25-201ENST00000348333 CALM2P0DP24 149 aa26.23■■□□□ 1.79
TNFRSF25-201ENST00000348333 CALM3P0DP25 149 aa26.23■■□□□ 1.79
TNFRSF25-201ENST00000348333 PSEN2P49810 448 aa26.23■■□□□ 1.79
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