RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000330233.11

CRIP1-201, Transcript of cysteine rich protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CRIP1, Length 1,311 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP1-201ENST00000330233 KCNJ14Q9UNX9 436 aa30.61■■■□□ 2.49
CRIP1-201ENST00000330233 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP30.6■■■□□ 2.49
CRIP1-201ENST00000330233 TNFAIP2Q03169 654 aa30.6■■■□□ 2.49
CRIP1-201ENST00000330233 CUL4AQ13619 759 aa30.6■■■□□ 2.49
CRIP1-201ENST00000330233 IL31RAQ8NI17 732 aa30.6■■■□□ 2.49
CRIP1-201ENST00000330233 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa30.6■■■□□ 2.49
CRIP1-201ENST00000330233 MYH7BA7E2Y1 1941 aa30.6■■■□□ 2.49
CRIP1-201ENST00000330233 FRMPD3Q5JV73 1810 aa30.59■■■□□ 2.49
CRIP1-201ENST00000330233 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP30.59■■■□□ 2.49
CRIP1-201ENST00000330233 KCNV1Q6PIU1 500 aa30.59■■■□□ 2.49
CRIP1-201ENST00000330233 WDR11Q9BZH6 1224 aa30.59■■■□□ 2.49
CRIP1-201ENST00000330233 ADCYAP1R1P41586 468 aa30.58■■■□□ 2.49
CRIP1-201ENST00000330233 TTLL4Q14679 1199 aa30.58■■■□□ 2.49
CRIP1-201ENST00000330233 SEPT14Q6ZU15 432 aa30.58■■■□□ 2.49
CRIP1-201ENST00000330233 BRMS1Q9HCU9 246 aa30.58■■■□□ 2.49
CRIP1-201ENST00000330233 OGDHLQ9ULD0 1010 aa30.58■■■□□ 2.49
CRIP1-201ENST00000330233 POTEFA5A3E0 1075 aa30.57■■■□□ 2.48
CRIP1-201ENST00000330233 SREBF1P36956 1147 aa30.57■■■□□ 2.48
CRIP1-201ENST00000330233 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP30.57■■■□□ 2.48
CRIP1-201ENST00000330233 NPY5RQ15761 445 aa30.57■■■□□ 2.48
CRIP1-201ENST00000330233 GNPTABQ3T906 1256 aa30.57■■■□□ 2.48
CRIP1-201ENST00000330233 HSCBQ8IWL3 235 aa30.57■■■□□ 2.48
CRIP1-201ENST00000330233 C8orf76Q96K31 380 aa30.57■■■□□ 2.48
CRIP1-201ENST00000330233 GJB4Q9NTQ9 266 aa30.57■■■□□ 2.48
CRIP1-201ENST00000330233 SMC3Q9UQE7 1217 aa30.57■■■□□ 2.48
CRIP1-201ENST00000330233 Q9Y3F1 56 aa30.57■■■□□ 2.48
CRIP1-201ENST00000330233 M0R2N6 131 aa30.56■■■□□ 2.48
CRIP1-201ENST00000330233 ADAMTS3O15072 1205 aa30.56■■■□□ 2.48
CRIP1-201ENST00000330233 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP30.56■■■□□ 2.48
CRIP1-201ENST00000330233 TGFB3P10600 412 aa30.56■■■□□ 2.48
CRIP1-201ENST00000330233 DUSP28Q4G0W2 176 aa30.56■■■□□ 2.48
CRIP1-201ENST00000330233 KRT40Q6A162 431 aa30.56■■■□□ 2.48
CRIP1-201ENST00000330233 ARRDC4Q8NCT1 418 aa30.56■■■□□ 2.48
CRIP1-201ENST00000330233 PGBD1Q96JS3 809 aa30.56■■■□□ 2.48
CRIP1-201ENST00000330233 MMP1P03956 469 aa30.55■■■□□ 2.48
CRIP1-201ENST00000330233 TXNP10599 105 aaKnown RBP30.55■■■□□ 2.48
CRIP1-201ENST00000330233 SMPD1P17405 629 aa30.55■■■□□ 2.48
CRIP1-201ENST00000330233 ANO1Q5XXA6 986 aa30.55■■■□□ 2.48
CRIP1-201ENST00000330233 NLRX1Q86UT6 975 aa30.55■■■□□ 2.48
CRIP1-201ENST00000330233 RASGRP4Q8TDF6 673 aa30.55■■■□□ 2.48
CRIP1-201ENST00000330233 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP30.55■■■□□ 2.48
CRIP1-201ENST00000330233 SPC25Q9HBM1 224 aa30.55■■■□□ 2.48
CRIP1-201ENST00000330233 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa30.55■■■□□ 2.48
CRIP1-201ENST00000330233 RTEL1Q9NZ71 1219 aa30.55■■■□□ 2.48
CRIP1-201ENST00000330233 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP30.55■■■□□ 2.48
CRIP1-201ENST00000330233 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP30.54■■■□□ 2.48
CRIP1-201ENST00000330233 RGS20O76081 388 aa30.54■■■□□ 2.48
CRIP1-201ENST00000330233 CYP3A4P08684 503 aa30.54■■■□□ 2.48
CRIP1-201ENST00000330233 EN2P19622 333 aaPredicted RBP30.54■■■□□ 2.48
CRIP1-201ENST00000330233 SOX10P56693 466 aa30.54■■■□□ 2.48
CRIP1-201ENST00000330233 ARHGAP4P98171 946 aa30.54■■■□□ 2.48
CRIP1-201ENST00000330233 KRT25Q7Z3Z0 450 aa30.54■■■□□ 2.48
CRIP1-201ENST00000330233 ANKLE1Q8NAG6 615 aa30.54■■■□□ 2.48
CRIP1-201ENST00000330233 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP30.54■■■□□ 2.48
CRIP1-201ENST00000330233 GJB2P29033 226 aa30.53■■■□□ 2.48
CRIP1-201ENST00000330233 KRT2P35908 639 aa30.53■■■□□ 2.48
CRIP1-201ENST00000330233 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP30.53■■■□□ 2.48
CRIP1-201ENST00000330233 CCDC62Q6P9F0 684 aa30.53■■■□□ 2.48
CRIP1-201ENST00000330233 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa30.53■■■□□ 2.48
CRIP1-201ENST00000330233 AP5M1Q9H0R1 490 aa30.53■■■□□ 2.48
CRIP1-201ENST00000330233 MRVI1Q9Y6F6 885 aa30.53■■■□□ 2.48
CRIP1-201ENST00000330233 MAFGO15525 162 aa30.52■■■□□ 2.48
CRIP1-201ENST00000330233 ICAM3P32942 547 aa30.52■■■□□ 2.48
CRIP1-201ENST00000330233 CRYGNQ8WXF5 182 aa30.52■■■□□ 2.48
CRIP1-201ENST00000330233 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP30.52■■■□□ 2.48
CRIP1-201ENST00000330233 CDHR1Q96JP9 859 aa30.52■■■□□ 2.48
CRIP1-201ENST00000330233 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa30.52■■■□□ 2.48
CRIP1-201ENST00000330233 ADCY6O43306 1168 aa30.51■■■□□ 2.48
CRIP1-201ENST00000330233 ZNF76P36508 570 aa30.51■■■□□ 2.48
CRIP1-201ENST00000330233 USP11P51784 963 aa30.51■■■□□ 2.48
CRIP1-201ENST00000330233 FOSBP53539 338 aa30.51■■■□□ 2.48
CRIP1-201ENST00000330233 GJA9P57773 515 aa30.51■■■□□ 2.48
CRIP1-201ENST00000330233 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP30.51■■■□□ 2.48
CRIP1-201ENST00000330233 RNF180Q86T96 592 aa30.51■■■□□ 2.48
CRIP1-201ENST00000330233 GPRASP2Q96D09 838 aa30.51■■■□□ 2.48
CRIP1-201ENST00000330233 MXRA8Q9BRK3 442 aa30.51■■■□□ 2.48
CRIP1-201ENST00000330233 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP30.51■■■□□ 2.48
CRIP1-201ENST00000330233 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP30.51■■■□□ 2.48
CRIP1-201ENST00000330233 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa30.5■■■□□ 2.47
CRIP1-201ENST00000330233 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa30.5■■■□□ 2.47
CRIP1-201ENST00000330233 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP30.5■■■□□ 2.47
CRIP1-201ENST00000330233 FIBPO43427 364 aa30.5■■■□□ 2.47
CRIP1-201ENST00000330233 TLK2Q86UE8 772 aa30.5■■■□□ 2.47
CRIP1-201ENST00000330233 JADE2Q9NQC1 790 aa30.5■■■□□ 2.47
CRIP1-201ENST00000330233 PGK1P00558 417 aa30.49■■■□□ 2.47
CRIP1-201ENST00000330233 ITGB5P18084 799 aa30.49■■■□□ 2.47
CRIP1-201ENST00000330233 NKX3-2P78367 333 aa30.49■■■□□ 2.47
CRIP1-201ENST00000330233 LY6KQ17RY6 165 aa30.49■■■□□ 2.47
CRIP1-201ENST00000330233 CEP55Q53EZ4 464 aa30.49■■■□□ 2.47
CRIP1-201ENST00000330233 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP30.49■■■□□ 2.47
CRIP1-201ENST00000330233 OXER1Q8TDS5 423 aa30.49■■■□□ 2.47
CRIP1-201ENST00000330233 TBCKQ8TEA7 893 aa30.49■■■□□ 2.47
CRIP1-201ENST00000330233 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP30.49■■■□□ 2.47
CRIP1-201ENST00000330233 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa30.49■■■□□ 2.47
CRIP1-201ENST00000330233 ARIH2O95376 493 aa30.48■■■□□ 2.47
CRIP1-201ENST00000330233 LRRC41Q15345 812 aa30.48■■■□□ 2.47
CRIP1-201ENST00000330233 NIPA1Q7RTP0 329 aa30.48■■■□□ 2.47
CRIP1-201ENST00000330233 BTBD18B2RXH4 712 aa30.47■■■□□ 2.47
CRIP1-201ENST00000330233 ADAMTS4O75173 837 aa30.47■■■□□ 2.47
CRIP1-201ENST00000330233 GH1P01241 217 aa30.47■■■□□ 2.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.6 ms