RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000328839.3

PPP4R4-202, Transcript of protein phosphatase 4 regulatory subunit 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PPP4R4, Length 876 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP4R4-202ENST00000328839 TET1Q8NFU7 2136 aa29.17■■■□□ 2.26
PPP4R4-202ENST00000328839 CHD7Q9P2D1 2997 aa29.16■■■□□ 2.26
PPP4R4-202ENST00000328839 CASTP20810 708 aaKnown RBP29.16■■■□□ 2.26
PPP4R4-202ENST00000328839 CCDC155Q8N6L0 562 aa29.16■■■□□ 2.26
PPP4R4-202ENST00000328839 PXMP2Q9NR77 195 aa29.16■■■□□ 2.26
PPP4R4-202ENST00000328839 MRVI1Q9Y6F6 885 aa29.16■■■□□ 2.26
PPP4R4-202ENST00000328839 KLRF2D3W0D1 207 aa29.15■■■□□ 2.26
PPP4R4-202ENST00000328839 CA3P07451 260 aa29.15■■■□□ 2.26
PPP4R4-202ENST00000328839 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP29.15■■■□□ 2.26
PPP4R4-202ENST00000328839 SLC9A7Q96T83 725 aa29.15■■■□□ 2.26
PPP4R4-202ENST00000328839 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP29.14■■■□□ 2.26
PPP4R4-202ENST00000328839 NR3C2P08235 984 aa29.14■■■□□ 2.26
PPP4R4-202ENST00000328839 DGKDQ16760 1214 aa29.14■■■□□ 2.26
PPP4R4-202ENST00000328839 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP29.14■■■□□ 2.26
PPP4R4-202ENST00000328839 CYB5R4Q7L1T6 521 aa29.14■■■□□ 2.26
PPP4R4-202ENST00000328839 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP29.14■■■□□ 2.26
PPP4R4-202ENST00000328839 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP29.13■■■□□ 2.25
PPP4R4-202ENST00000328839 TRDNQ13061 729 aa29.13■■■□□ 2.25
PPP4R4-202ENST00000328839 SEC23AQ15436 765 aa29.13■■■□□ 2.25
PPP4R4-202ENST00000328839 CAGE1Q8TC20 777 aa29.13■■■□□ 2.25
PPP4R4-202ENST00000328839 KAT2BQ92831 832 aa29.13■■■□□ 2.25
PPP4R4-202ENST00000328839 ALG1Q9BT22 464 aa29.13■■■□□ 2.25
PPP4R4-202ENST00000328839 CERS4Q9HA82 394 aa29.13■■■□□ 2.25
PPP4R4-202ENST00000328839 PTPRSQ13332 1948 aa29.12■■■□□ 2.25
PPP4R4-202ENST00000328839 HSD17B4P51659 736 aa29.12■■■□□ 2.25
PPP4R4-202ENST00000328839 HOMER1Q86YM7 354 aa29.12■■■□□ 2.25
PPP4R4-202ENST00000328839 C7orf31Q8N865 590 aa29.12■■■□□ 2.25
PPP4R4-202ENST00000328839 MAD2L2Q9UI95 211 aa29.12■■■□□ 2.25
PPP4R4-202ENST00000328839 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa29.12■■■□□ 2.25
PPP4R4-202ENST00000328839 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP29.11■■■□□ 2.25
PPP4R4-202ENST00000328839 OPLAHO14841 1288 aa29.11■■■□□ 2.25
PPP4R4-202ENST00000328839 ZBTB5O15062 677 aa29.11■■■□□ 2.25
PPP4R4-202ENST00000328839 TTC22Q5TAA0 569 aa29.11■■■□□ 2.25
PPP4R4-202ENST00000328839 SESTD1Q86VW0 696 aa29.11■■■□□ 2.25
PPP4R4-202ENST00000328839 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP29.11■■■□□ 2.25
PPP4R4-202ENST00000328839 IL27Q8NEV9 243 aa29.11■■■□□ 2.25
PPP4R4-202ENST00000328839 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa29.11■■■□□ 2.25
PPP4R4-202ENST00000328839 AFAP1L1Q8TED9 768 aa29.11■■■□□ 2.25
PPP4R4-202ENST00000328839 ASB2Q96Q27 587 aa29.11■■■□□ 2.25
PPP4R4-202ENST00000328839 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP29.11■■■□□ 2.25
PPP4R4-202ENST00000328839 SORBS3O60504 671 aa29.1■■■□□ 2.25
PPP4R4-202ENST00000328839 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP29.1■■■□□ 2.25
PPP4R4-202ENST00000328839 ZNF286BP0CG31 522 aa29.1■■■□□ 2.25
PPP4R4-202ENST00000328839 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP29.1■■■□□ 2.25
PPP4R4-202ENST00000328839 PDE4AP27815 886 aa29.1■■■□□ 2.25
PPP4R4-202ENST00000328839 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP29.1■■■□□ 2.25
PPP4R4-202ENST00000328839 KCNJ6P48051 423 aa29.1■■■□□ 2.25
PPP4R4-202ENST00000328839 PSEN2P49810 448 aa29.1■■■□□ 2.25
PPP4R4-202ENST00000328839 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP29.1■■■□□ 2.25
PPP4R4-202ENST00000328839 LAMC2Q13753 1193 aa29.1■■■□□ 2.25
PPP4R4-202ENST00000328839 HERC6Q8IVU3 1022 aa29.1■■■□□ 2.25
PPP4R4-202ENST00000328839 CTAGE1Q96RT6 745 aa29.1■■■□□ 2.25
PPP4R4-202ENST00000328839 KATNAL1Q9BW62 490 aa29.1■■■□□ 2.25
PPP4R4-202ENST00000328839 HDAC6Q9UBN7 1215 aa29.1■■■□□ 2.25
PPP4R4-202ENST00000328839 TTC28Q96AY4 2481 aa29.09■■■□□ 2.25
PPP4R4-202ENST00000328839 KIF28PB7ZC32 967 aa29.09■■■□□ 2.25
PPP4R4-202ENST00000328839 TNFRSF10AO00220 468 aa29.09■■■□□ 2.25
PPP4R4-202ENST00000328839 RFXAPO00287 272 aa29.09■■■□□ 2.25
PPP4R4-202ENST00000328839 LRRC8DQ7L1W4 858 aa29.09■■■□□ 2.25
PPP4R4-202ENST00000328839 PPTC7Q8NI37 304 aa29.09■■■□□ 2.25
PPP4R4-202ENST00000328839 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP29.09■■■□□ 2.25
PPP4R4-202ENST00000328839 PDCD2LQ9BRP1 358 aa29.09■■■□□ 2.25
PPP4R4-202ENST00000328839 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa29.09■■■□□ 2.25
PPP4R4-202ENST00000328839 ERICH2A1L162 156 aa29.08■■■□□ 2.25
PPP4R4-202ENST00000328839 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP29.08■■■□□ 2.25
PPP4R4-202ENST00000328839 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP29.08■■■□□ 2.25
PPP4R4-202ENST00000328839 BAIAP3O94812 1187 aa29.08■■■□□ 2.25
PPP4R4-202ENST00000328839 SELPP16109 830 aa29.08■■■□□ 2.25
PPP4R4-202ENST00000328839 MFSD10Q14728 455 aa29.08■■■□□ 2.25
PPP4R4-202ENST00000328839 RUFY2Q8WXA3 655 aa29.08■■■□□ 2.25
PPP4R4-202ENST00000328839 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP29.08■■■□□ 2.25
PPP4R4-202ENST00000328839 MTMR8Q96EF0 704 aa29.08■■■□□ 2.25
PPP4R4-202ENST00000328839 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP29.08■■■□□ 2.25
PPP4R4-202ENST00000328839 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP29.07■■■□□ 2.24
PPP4R4-202ENST00000328839 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP29.07■■■□□ 2.24
PPP4R4-202ENST00000328839 KIAA0753Q2KHM9 967 aa29.07■■■□□ 2.24
PPP4R4-202ENST00000328839 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP29.07■■■□□ 2.24
PPP4R4-202ENST00000328839 PIGSQ96S52 555 aa29.07■■■□□ 2.24
PPP4R4-202ENST00000328839 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP29.07■■■□□ 2.24
PPP4R4-202ENST00000328839 CYP21A2P08686 494 aa29.06■■■□□ 2.24
PPP4R4-202ENST00000328839 GHRHRQ02643 423 aa29.06■■■□□ 2.24
PPP4R4-202ENST00000328839 GRM4Q14833 912 aa29.06■■■□□ 2.24
PPP4R4-202ENST00000328839 PGM5Q15124 567 aa29.06■■■□□ 2.24
PPP4R4-202ENST00000328839 STOX1Q6ZVD7 989 aa29.06■■■□□ 2.24
PPP4R4-202ENST00000328839 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa29.06■■■□□ 2.24
PPP4R4-202ENST00000328839 ARNTL2Q8WYA1 636 aa29.06■■■□□ 2.24
PPP4R4-202ENST00000328839 TCF20Q9UGU0 1960 aaKnown RBP29.06■■■□□ 2.24
PPP4R4-202ENST00000328839 TLL1O43897 1013 aa29.05■■■□□ 2.24
PPP4R4-202ENST00000328839 F2P00734 622 aa29.05■■■□□ 2.24
PPP4R4-202ENST00000328839 CKBP12277 381 aa29.05■■■□□ 2.24
PPP4R4-202ENST00000328839 PTH1RQ03431 593 aa29.05■■■□□ 2.24
PPP4R4-202ENST00000328839 KCNV1Q6PIU1 500 aa29.05■■■□□ 2.24
PPP4R4-202ENST00000328839 FCHSD1Q86WN1 690 aa29.05■■■□□ 2.24
PPP4R4-202ENST00000328839 IL31RAQ8NI17 732 aa29.05■■■□□ 2.24
PPP4R4-202ENST00000328839 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP29.05■■■□□ 2.24
PPP4R4-202ENST00000328839 SPATA33Q96N06 139 aa29.05■■■□□ 2.24
PPP4R4-202ENST00000328839 REV3LO60673 3130 aa29.05■■■□□ 2.24
PPP4R4-202ENST00000328839 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP29.04■■■□□ 2.24
PPP4R4-202ENST00000328839 EPOPA6NHQ4 379 aa29.04■■■□□ 2.24
PPP4R4-202ENST00000328839 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP29.04■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.1 ms