RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000307180.4

TSNARE1-201, Transcript of t-SNARE domain containing 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene TSNARE1, Length 1,907 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1-201ENST00000307180 IFNKQ9P0W0 207 aa17.92■□□□□ 0.46
TSNARE1-201ENST00000307180 KLRF2D3W0D1 207 aa17.91■□□□□ 0.46
TSNARE1-201ENST00000307180 PLA2G6O60733 806 aa17.91■□□□□ 0.46
TSNARE1-201ENST00000307180 GNAQP50148 359 aa17.91■□□□□ 0.46
TSNARE1-201ENST00000307180 POSTNQ15063 836 aa17.91■□□□□ 0.46
TSNARE1-201ENST00000307180 TTC38Q5R3I4 469 aa17.91■□□□□ 0.46
TSNARE1-201ENST00000307180 BTNL9Q6UXG8 535 aa17.91■□□□□ 0.46
TSNARE1-201ENST00000307180 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP17.91■□□□□ 0.46
TSNARE1-201ENST00000307180 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa17.91■□□□□ 0.46
TSNARE1-201ENST00000307180 FERMT2Q96AC1 680 aa17.91■□□□□ 0.46
TSNARE1-201ENST00000307180 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP17.91■□□□□ 0.46
TSNARE1-201ENST00000307180 SPATC1LQ9H0A9 340 aa17.91■□□□□ 0.46
TSNARE1-201ENST00000307180 EFCC1Q9HA90 598 aa17.91■□□□□ 0.46
TSNARE1-201ENST00000307180 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa17.91■□□□□ 0.46
TSNARE1-201ENST00000307180 UQCRHLA0A096LP55 91 aa17.9■□□□□ 0.46
TSNARE1-201ENST00000307180 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP17.9■□□□□ 0.46
TSNARE1-201ENST00000307180 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP17.9■□□□□ 0.46
TSNARE1-201ENST00000307180 UQCRHP07919 91 aa17.9■□□□□ 0.46
TSNARE1-201ENST00000307180 ARID5BQ14865 1188 aa17.9■□□□□ 0.46
TSNARE1-201ENST00000307180 PDILTQ8N807 584 aa17.9■□□□□ 0.46
TSNARE1-201ENST00000307180 REPS2Q8NFH8 660 aa17.9■□□□□ 0.46
TSNARE1-201ENST00000307180 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP17.9■□□□□ 0.46
TSNARE1-201ENST00000307180 IMPACTQ9P2X3 320 aa17.9■□□□□ 0.46
TSNARE1-201ENST00000307180 A0A0G2JMZ2 1700 aa17.9■□□□□ 0.46
TSNARE1-201ENST00000307180 WNT7AO00755 349 aa17.9■□□□□ 0.46
TSNARE1-201ENST00000307180 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP17.9■□□□□ 0.46
TSNARE1-201ENST00000307180 SMC2O95347 1197 aa17.9■□□□□ 0.46
TSNARE1-201ENST00000307180 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP17.9■□□□□ 0.46
TSNARE1-201ENST00000307180 SARSP49591 514 aaKnown RBP17.9■□□□□ 0.46
TSNARE1-201ENST00000307180 MYL5Q02045 173 aa17.9■□□□□ 0.46
TSNARE1-201ENST00000307180 NT5DC1Q5TFE4 455 aa17.9■□□□□ 0.46
TSNARE1-201ENST00000307180 ADGRF4Q8IZF3 695 aa17.9■□□□□ 0.46
TSNARE1-201ENST00000307180 TRIM47Q96LD4 638 aa17.9■□□□□ 0.46
TSNARE1-201ENST00000307180 PRIMPOLQ96LW4 560 aa17.9■□□□□ 0.46
TSNARE1-201ENST00000307180 HSD3B7Q9H2F3 369 aa17.9■□□□□ 0.46
TSNARE1-201ENST00000307180 SH3GLB2Q9NR46 395 aa17.9■□□□□ 0.46
TSNARE1-201ENST00000307180 MAN1B1Q9UKM7 699 aa17.9■□□□□ 0.46
TSNARE1-201ENST00000307180 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP17.9■□□□□ 0.46
TSNARE1-201ENST00000307180 BMP6P22004 513 aa17.89■□□□□ 0.45
TSNARE1-201ENST00000307180 CALML3P27482 149 aa17.89■□□□□ 0.45
TSNARE1-201ENST00000307180 STAT3P40763 770 aa17.89■□□□□ 0.45
TSNARE1-201ENST00000307180 TRAPPC10P48553 1259 aa17.89■□□□□ 0.45
TSNARE1-201ENST00000307180 CCNA1P78396 465 aa17.89■□□□□ 0.45
TSNARE1-201ENST00000307180 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP17.89■□□□□ 0.45
TSNARE1-201ENST00000307180 NCAPG2Q86XI2 1143 aa17.89■□□□□ 0.45
TSNARE1-201ENST00000307180 SMARCE1Q969G3 411 aa17.89■□□□□ 0.45
TSNARE1-201ENST00000307180 EPSTI1Q96J88 318 aa17.89■□□□□ 0.45
TSNARE1-201ENST00000307180 AGBL1Q96MI9 1066 aa17.89■□□□□ 0.45
TSNARE1-201ENST00000307180 PRDM10Q9NQV6 1147 aa17.89■□□□□ 0.45
TSNARE1-201ENST00000307180 RIPK3Q9Y572 518 aa17.89■□□□□ 0.45
TSNARE1-201ENST00000307180 TRIM17Q9Y577 477 aa17.89■□□□□ 0.45
TSNARE1-201ENST00000307180 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP17.88■□□□□ 0.45
TSNARE1-201ENST00000307180 PRR29P0C7W0 189 aa17.88■□□□□ 0.45
TSNARE1-201ENST00000307180 FCGRTP55899 365 aa17.88■□□□□ 0.45
TSNARE1-201ENST00000307180 GSDMDP57764 484 aa17.88■□□□□ 0.45
TSNARE1-201ENST00000307180 FANCCQ00597 558 aa17.88■□□□□ 0.45
TSNARE1-201ENST00000307180 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa17.88■□□□□ 0.45
TSNARE1-201ENST00000307180 ERCC3P19447 782 aa17.88■□□□□ 0.45
TSNARE1-201ENST00000307180 PTGDRQ13258 359 aa17.88■□□□□ 0.45
TSNARE1-201ENST00000307180 SLC35G1Q2M3R5 365 aa17.88■□□□□ 0.45
TSNARE1-201ENST00000307180 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa17.88■□□□□ 0.45
TSNARE1-201ENST00000307180 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP17.88■□□□□ 0.45
TSNARE1-201ENST00000307180 JMJD4Q9H9V9 463 aa17.88■□□□□ 0.45
TSNARE1-201ENST00000307180 HOMER2Q9NSB8 354 aa17.88■□□□□ 0.45
TSNARE1-201ENST00000307180 ZNF536O15090 1300 aa17.87■□□□□ 0.45
TSNARE1-201ENST00000307180 ADAMTS3O15072 1205 aa17.87■□□□□ 0.45
TSNARE1-201ENST00000307180 SKILP12757 684 aa17.87■□□□□ 0.45
TSNARE1-201ENST00000307180 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP17.87■□□□□ 0.45
TSNARE1-201ENST00000307180 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP17.87■□□□□ 0.45
TSNARE1-201ENST00000307180 HOMER1Q86YM7 354 aa17.87■□□□□ 0.45
TSNARE1-201ENST00000307180 BLIDQ8IZY5 108 aa17.87■□□□□ 0.45
TSNARE1-201ENST00000307180 MLKLQ8NB16 471 aa17.87■□□□□ 0.45
TSNARE1-201ENST00000307180 TEX13BQ9BXU2 312 aa17.87■□□□□ 0.45
TSNARE1-201ENST00000307180 MGAMO43451 1857 aa17.87■□□□□ 0.45
TSNARE1-201ENST00000307180 CYTH3O43739 400 aa17.86■□□□□ 0.45
TSNARE1-201ENST00000307180 SLFN14P0C7P3 912 aa17.86■□□□□ 0.45
TSNARE1-201ENST00000307180 FDX1P10109 184 aa17.86■□□□□ 0.45
TSNARE1-201ENST00000307180 ATP1A3P13637 1013 aa17.86■□□□□ 0.45
TSNARE1-201ENST00000307180 PDE4CQ08493 712 aa17.86■□□□□ 0.45
TSNARE1-201ENST00000307180 MORC3Q14149 939 aa17.86■□□□□ 0.45
TSNARE1-201ENST00000307180 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP17.86■□□□□ 0.45
TSNARE1-201ENST00000307180 OTOP1Q7RTM1 612 aa17.86■□□□□ 0.45
TSNARE1-201ENST00000307180 GPR142Q7Z601 462 aa17.86■□□□□ 0.45
TSNARE1-201ENST00000307180 RIOX2Q8IUF8 465 aa17.86■□□□□ 0.45
TSNARE1-201ENST00000307180 TRIML1Q8N9V2 468 aa17.86■□□□□ 0.45
TSNARE1-201ENST00000307180 MYRIPQ8NFW9 859 aa17.86■□□□□ 0.45
TSNARE1-201ENST00000307180 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP17.86■□□□□ 0.45
TSNARE1-201ENST00000307180 DHX58Q96C10 678 aa17.86■□□□□ 0.45
TSNARE1-201ENST00000307180 CCDC34Q96HJ3 373 aa17.86■□□□□ 0.45
TSNARE1-201ENST00000307180 A0A087X0B3 334 aa17.86■□□□□ 0.45
TSNARE1-201ENST00000307180 ALAS1P13196 640 aa17.86■□□□□ 0.45
TSNARE1-201ENST00000307180 MAPK4P31152 587 aa17.86■□□□□ 0.45
TSNARE1-201ENST00000307180 TMC6Q7Z403 805 aa17.86■□□□□ 0.45
TSNARE1-201ENST00000307180 SPATA20Q8TB22 786 aa17.86■□□□□ 0.45
TSNARE1-201ENST00000307180 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP17.86■□□□□ 0.45
TSNARE1-201ENST00000307180 COA7Q96BR5 231 aa17.86■□□□□ 0.45
TSNARE1-201ENST00000307180 LZTS2Q9BRK4 669 aa17.86■□□□□ 0.45
TSNARE1-201ENST00000307180 FANCLQ9NW38 375 aa17.86■□□□□ 0.45
TSNARE1-201ENST00000307180 CCPG1Q9ULG6 757 aa17.86■□□□□ 0.45
TSNARE1-201ENST00000307180 PCDHA4Q9UN74 947 aa17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.8 ms