RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296026.4

CXCL3-201, Transcript of C-X-C motif chemokine ligand 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CXCL3, Length 1,075 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL3-201ENST00000296026 ZBTB5O15062 677 aa22.81■■□□□ 1.24
CXCL3-201ENST00000296026 CYP21A2P08686 494 aa22.81■■□□□ 1.24
CXCL3-201ENST00000296026 CASTP20810 708 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
CXCL3-201ENST00000296026 PTH1RQ03431 593 aa22.81■■□□□ 1.24
CXCL3-201ENST00000296026 PTGISQ16647 500 aa22.81■■□□□ 1.24
CXCL3-201ENST00000296026 PPP2R2DQ66LE6 453 aa22.81■■□□□ 1.24
CXCL3-201ENST00000296026 PRDM6Q9NQX0 595 aa22.81■■□□□ 1.24
CXCL3-201ENST00000296026 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa22.81■■□□□ 1.24
CXCL3-201ENST00000296026 MRVI1Q9Y6F6 885 aa22.81■■□□□ 1.24
CXCL3-201ENST00000296026 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP22.81■■□□□ 1.24
CXCL3-201ENST00000296026 TANC1Q9C0D5 1861 aa22.81■■□□□ 1.24
CXCL3-201ENST00000296026 IGFBP4P22692 258 aa22.8■■□□□ 1.24
CXCL3-201ENST00000296026 CHMLP26374 656 aa22.8■■□□□ 1.24
CXCL3-201ENST00000296026 GHRHRQ02643 423 aa22.8■■□□□ 1.24
CXCL3-201ENST00000296026 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
CXCL3-201ENST00000296026 KAT2BQ92831 832 aa22.8■■□□□ 1.24
CXCL3-201ENST00000296026 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
CXCL3-201ENST00000296026 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
CXCL3-201ENST00000296026 DGKDQ16760 1214 aa22.79■■□□□ 1.24
CXCL3-201ENST00000296026 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP22.79■■□□□ 1.24
CXCL3-201ENST00000296026 SESTD1Q86VW0 696 aa22.79■■□□□ 1.24
CXCL3-201ENST00000296026 HOMER1Q86YM7 354 aa22.79■■□□□ 1.24
CXCL3-201ENST00000296026 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP22.79■■□□□ 1.24
CXCL3-201ENST00000296026 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP22.79■■□□□ 1.24
CXCL3-201ENST00000296026 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa22.79■■□□□ 1.24
CXCL3-201ENST00000296026 ERICH2A1L162 156 aa22.78■■□□□ 1.24
CXCL3-201ENST00000296026 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
CXCL3-201ENST00000296026 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
CXCL3-201ENST00000296026 LAMC2Q13753 1193 aa22.78■■□□□ 1.24
CXCL3-201ENST00000296026 GRM4Q14833 912 aa22.78■■□□□ 1.24
CXCL3-201ENST00000296026 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
CXCL3-201ENST00000296026 SLC35G1Q2M3R5 365 aa22.78■■□□□ 1.24
CXCL3-201ENST00000296026 STOX1Q6ZVD7 989 aa22.78■■□□□ 1.24
CXCL3-201ENST00000296026 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
CXCL3-201ENST00000296026 CCDC155Q8N6L0 562 aa22.78■■□□□ 1.24
CXCL3-201ENST00000296026 CTAGE1Q96RT6 745 aa22.78■■□□□ 1.24
CXCL3-201ENST00000296026 PIGSQ96S52 555 aa22.78■■□□□ 1.24
CXCL3-201ENST00000296026 PDCD2LQ9BRP1 358 aa22.78■■□□□ 1.24
CXCL3-201ENST00000296026 SENP2Q9HC62 589 aa22.78■■□□□ 1.24
CXCL3-201ENST00000296026 CHD9Q3L8U1 2897 aa22.78■■□□□ 1.24
CXCL3-201ENST00000296026 TMEM67Q5HYA8 995 aa22.77■■□□□ 1.24
CXCL3-201ENST00000296026 TJAP1Q5JTD0 557 aa22.77■■□□□ 1.24
CXCL3-201ENST00000296026 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
CXCL3-201ENST00000296026 SAMD3Q8N6K7 520 aa22.77■■□□□ 1.24
CXCL3-201ENST00000296026 CAGE1Q8TC20 777 aa22.77■■□□□ 1.24
CXCL3-201ENST00000296026 SLC9A7Q96T83 725 aa22.77■■□□□ 1.24
CXCL3-201ENST00000296026 RIOX1Q9H6W3 641 aa22.77■■□□□ 1.24
CXCL3-201ENST00000296026 TAF6LQ9Y6J9 622 aa22.77■■□□□ 1.24
CXCL3-201ENST00000296026 E7EWF7 191 aa22.76■■□□□ 1.23
CXCL3-201ENST00000296026 RGS20O76081 388 aa22.76■■□□□ 1.23
CXCL3-201ENST00000296026 PSEN2P49810 448 aa22.76■■□□□ 1.23
CXCL3-201ENST00000296026 TRAF1Q13077 416 aa22.76■■□□□ 1.23
CXCL3-201ENST00000296026 WTAPQ15007 396 aa22.76■■□□□ 1.23
CXCL3-201ENST00000296026 PGM5Q15124 567 aa22.76■■□□□ 1.23
CXCL3-201ENST00000296026 C7orf31Q8N865 590 aa22.76■■□□□ 1.23
CXCL3-201ENST00000296026 NCOA7Q8NI08 942 aa22.76■■□□□ 1.23
CXCL3-201ENST00000296026 PPTC7Q8NI37 304 aa22.76■■□□□ 1.23
CXCL3-201ENST00000296026 AFAP1L1Q8TED9 768 aa22.76■■□□□ 1.23
CXCL3-201ENST00000296026 ALG1Q9BT22 464 aa22.76■■□□□ 1.23
CXCL3-201ENST00000296026 KATNAL1Q9BW62 490 aa22.76■■□□□ 1.23
CXCL3-201ENST00000296026 HDAC6Q9UBN7 1215 aa22.76■■□□□ 1.23
CXCL3-201ENST00000296026 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa22.76■■□□□ 1.23
CXCL3-201ENST00000296026 MYO9BQ13459 2157 aa22.75■■□□□ 1.23
CXCL3-201ENST00000296026 SGSM2O43147 1006 aa22.75■■□□□ 1.23
CXCL3-201ENST00000296026 CA3P07451 260 aa22.75■■□□□ 1.23
CXCL3-201ENST00000296026 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP22.75■■□□□ 1.23
CXCL3-201ENST00000296026 SART3Q15020 963 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
CXCL3-201ENST00000296026 VSIG10LQ86VR7 867 aa22.75■■□□□ 1.23
CXCL3-201ENST00000296026 IL31RAQ8NI17 732 aa22.75■■□□□ 1.23
CXCL3-201ENST00000296026 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa22.75■■□□□ 1.23
CXCL3-201ENST00000296026 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
CXCL3-201ENST00000296026 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP22.75■■□□□ 1.23
CXCL3-201ENST00000296026 MYH7BA7E2Y1 1941 aa22.74■■□□□ 1.23
CXCL3-201ENST00000296026 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP22.74■■□□□ 1.23
CXCL3-201ENST00000296026 CYTH3O43739 400 aa22.74■■□□□ 1.23
CXCL3-201ENST00000296026 SORBS3O60504 671 aa22.74■■□□□ 1.23
CXCL3-201ENST00000296026 F2P00734 622 aa22.74■■□□□ 1.23
CXCL3-201ENST00000296026 POLR2MP0CAP2 368 aa22.74■■□□□ 1.23
CXCL3-201ENST00000296026 ZNF286BP0CG31 522 aa22.74■■□□□ 1.23
CXCL3-201ENST00000296026 TROAPQ12815 778 aa22.74■■□□□ 1.23
CXCL3-201ENST00000296026 MFSD10Q14728 455 aa22.74■■□□□ 1.23
CXCL3-201ENST00000296026 MYSM1Q5VVJ2 828 aa22.74■■□□□ 1.23
CXCL3-201ENST00000296026 KCNV1Q6PIU1 500 aa22.74■■□□□ 1.23
CXCL3-201ENST00000296026 FCHSD1Q86WN1 690 aa22.74■■□□□ 1.23
CXCL3-201ENST00000296026 THEGQ9P2T0 379 aa22.74■■□□□ 1.23
CXCL3-201ENST00000296026 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa22.73■■□□□ 1.23
CXCL3-201ENST00000296026 HAS3O00219 553 aa22.73■■□□□ 1.23
CXCL3-201ENST00000296026 BAIAP3O94812 1187 aa22.73■■□□□ 1.23
CXCL3-201ENST00000296026 SELPP16109 830 aa22.73■■□□□ 1.23
CXCL3-201ENST00000296026 KIAA0753Q2KHM9 967 aa22.73■■□□□ 1.23
CXCL3-201ENST00000296026 LRRC8DQ7L1W4 858 aa22.73■■□□□ 1.23
CXCL3-201ENST00000296026 HERC6Q8IVU3 1022 aa22.73■■□□□ 1.23
CXCL3-201ENST00000296026 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
CXCL3-201ENST00000296026 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP22.73■■□□□ 1.23
CXCL3-201ENST00000296026 TET1Q8NFU7 2136 aa22.72■■□□□ 1.23
CXCL3-201ENST00000296026 PPFIA4O75335 1185 aa22.72■■□□□ 1.23
CXCL3-201ENST00000296026 GGPS1O95749 300 aa22.72■■□□□ 1.23
CXCL3-201ENST00000296026 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP22.72■■□□□ 1.23
CXCL3-201ENST00000296026 CCND2P30279 289 aa22.72■■□□□ 1.23
CXCL3-201ENST00000296026 ANTXR2P58335 489 aa22.72■■□□□ 1.23
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