RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000288616.7

CABP1-201, Transcript of calcium binding protein 1, humanhuman

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene CABP1, Length 1,369 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABP1-201ENST00000288616 IQCA1Q86XH1 822 aa20.65■□□□□ 0.9
CABP1-201ENST00000288616 KAT2BQ92831 832 aa20.65■□□□□ 0.9
CABP1-201ENST00000288616 RMDN3Q96TC7 470 aa20.65■□□□□ 0.9
CABP1-201ENST00000288616 ALG1Q9BT22 464 aa20.65■□□□□ 0.9
CABP1-201ENST00000288616 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa20.64■□□□□ 0.9
CABP1-201ENST00000288616 TLL1O43897 1013 aa20.64■□□□□ 0.89
CABP1-201ENST00000288616 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP20.64■□□□□ 0.89
CABP1-201ENST00000288616 CASTP20810 708 aaKnown RBP20.64■□□□□ 0.89
CABP1-201ENST00000288616 AAK1Q2M2I8 961 aa20.64■□□□□ 0.89
CABP1-201ENST00000288616 ARHGEF16Q5VV41 709 aa20.64■□□□□ 0.89
CABP1-201ENST00000288616 TICAM2Q86XR7 235 aa20.64■□□□□ 0.89
CABP1-201ENST00000288616 CCDC155Q8N6L0 562 aa20.64■□□□□ 0.89
CABP1-201ENST00000288616 CTAGE1Q96RT6 745 aa20.64■□□□□ 0.89
CABP1-201ENST00000288616 MYH7BA7E2Y1 1941 aa20.64■□□□□ 0.89
CABP1-201ENST00000288616 CCDC178Q5BJE1 867 aa20.63■□□□□ 0.89
CABP1-201ENST00000288616 FBXO11Q86XK2 927 aa20.63■□□□□ 0.89
CABP1-201ENST00000288616 MCF2L2Q86YR7 1114 aa20.63■□□□□ 0.89
CABP1-201ENST00000288616 CAGE1Q8TC20 777 aa20.63■□□□□ 0.89
CABP1-201ENST00000288616 AFAP1L1Q8TED9 768 aa20.63■□□□□ 0.89
CABP1-201ENST00000288616 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP20.63■□□□□ 0.89
CABP1-201ENST00000288616 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP20.63■□□□□ 0.89
CABP1-201ENST00000288616 ZBED2Q9BTP6 218 aa20.63■□□□□ 0.89
CABP1-201ENST00000288616 HDAC6Q9UBN7 1215 aa20.63■□□□□ 0.89
CABP1-201ENST00000288616 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP20.63■□□□□ 0.89
CABP1-201ENST00000288616 TRANK1O15050 2925 aa20.63■□□□□ 0.89
CABP1-201ENST00000288616 PTPRSQ13332 1948 aa20.62■□□□□ 0.89
CABP1-201ENST00000288616 LCHNA4D1U4 455 aa20.62■□□□□ 0.89
CABP1-201ENST00000288616 SORBS3O60504 671 aa20.62■□□□□ 0.89
CABP1-201ENST00000288616 BAIAP3O94812 1187 aa20.62■□□□□ 0.89
CABP1-201ENST00000288616 CFBP00751 764 aa20.62■□□□□ 0.89
CABP1-201ENST00000288616 SELPP16109 830 aa20.62■□□□□ 0.89
CABP1-201ENST00000288616 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
CABP1-201ENST00000288616 GRB10Q13322 594 aa20.62■□□□□ 0.89
CABP1-201ENST00000288616 GPNMBQ14956 572 aa20.62■□□□□ 0.89
CABP1-201ENST00000288616 ASPRV1Q53RT3 343 aa20.62■□□□□ 0.89
CABP1-201ENST00000288616 LRRC8DQ7L1W4 858 aa20.62■□□□□ 0.89
CABP1-201ENST00000288616 IWS1Q96ST2 819 aa20.62■□□□□ 0.89
CABP1-201ENST00000288616 JMJD4Q9H9V9 463 aa20.62■□□□□ 0.89
CABP1-201ENST00000288616 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa20.62■□□□□ 0.89
CABP1-201ENST00000288616 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
CABP1-201ENST00000288616 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
CABP1-201ENST00000288616 PSEN2P49810 448 aa20.61■□□□□ 0.89
CABP1-201ENST00000288616 WDR5P61964 334 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
CABP1-201ENST00000288616 DEFB103AP81534 67 aa20.61■□□□□ 0.89
CABP1-201ENST00000288616 DGKDQ16760 1214 aa20.61■□□□□ 0.89
CABP1-201ENST00000288616 SESTD1Q86VW0 696 aa20.61■□□□□ 0.89
CABP1-201ENST00000288616 C7orf31Q8N865 590 aa20.61■□□□□ 0.89
CABP1-201ENST00000288616 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
CABP1-201ENST00000288616 ZSWIM5Q9P217 1185 aa20.61■□□□□ 0.89
CABP1-201ENST00000288616 MRVI1Q9Y6F6 885 aa20.61■□□□□ 0.89
CABP1-201ENST00000288616 NR3C2P08235 984 aa20.6■□□□□ 0.89
CABP1-201ENST00000288616 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa20.6■□□□□ 0.89
CABP1-201ENST00000288616 ANKS1AQ92625 1134 aa20.6■□□□□ 0.89
CABP1-201ENST00000288616 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa20.6■□□□□ 0.89
CABP1-201ENST00000288616 MTUS1Q9ULD2 1270 aa20.6■□□□□ 0.89
CABP1-201ENST00000288616 NBNO60934 754 aa20.59■□□□□ 0.89
CABP1-201ENST00000288616 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
CABP1-201ENST00000288616 ZNF286BP0CG31 522 aa20.59■□□□□ 0.89
CABP1-201ENST00000288616 CKBP12277 381 aa20.59■□□□□ 0.89
CABP1-201ENST00000288616 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
CABP1-201ENST00000288616 MFSD10Q14728 455 aa20.59■□□□□ 0.89
CABP1-201ENST00000288616 TCTN1Q2MV58 587 aa20.59■□□□□ 0.89
CABP1-201ENST00000288616 FAM117BQ6P1L5 589 aa20.59■□□□□ 0.89
CABP1-201ENST00000288616 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
CABP1-201ENST00000288616 PXMP2Q9NR77 195 aa20.59■□□□□ 0.89
CABP1-201ENST00000288616 COG5Q9UP83 839 aa20.59■□□□□ 0.89
CABP1-201ENST00000288616 LAMA4Q16363 1823 aa20.59■□□□□ 0.89
CABP1-201ENST00000288616 LPXNO60711 386 aa20.59■□□□□ 0.89
CABP1-201ENST00000288616 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
CABP1-201ENST00000288616 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
CABP1-201ENST00000288616 KIAA0753Q2KHM9 967 aa20.59■□□□□ 0.89
CABP1-201ENST00000288616 CNKSR3Q6P9H4 555 aa20.59■□□□□ 0.89
CABP1-201ENST00000288616 CHD1LQ86WJ1 897 aa20.59■□□□□ 0.89
CABP1-201ENST00000288616 STAG2Q8N3U4 1231 aa20.59■□□□□ 0.89
CABP1-201ENST00000288616 GDPD5Q8WTR4 605 aa20.59■□□□□ 0.89
CABP1-201ENST00000288616 MAF1Q9H063 256 aa20.59■□□□□ 0.89
CABP1-201ENST00000288616 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
CABP1-201ENST00000288616 XIRP2A4UGR9 3374 aa20.58■□□□□ 0.89
CABP1-201ENST00000288616 LAMC2Q13753 1193 aa20.58■□□□□ 0.88
CABP1-201ENST00000288616 SMC5Q8IY18 1101 aa20.58■□□□□ 0.88
CABP1-201ENST00000288616 HLA-CQ95604 372 aa20.58■□□□□ 0.88
CABP1-201ENST00000288616 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.88
CABP1-201ENST00000288616 UBAC1Q9BSL1 405 aa20.58■□□□□ 0.88
CABP1-201ENST00000288616 BRWD1Q9NSI6 2320 aa20.57■□□□□ 0.88
CABP1-201ENST00000288616 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
CABP1-201ENST00000288616 ZNF618Q5T7W0 954 aa20.57■□□□□ 0.88
CABP1-201ENST00000288616 WNT8BQ93098 351 aa20.57■□□□□ 0.88
CABP1-201ENST00000288616 KATNAL1Q9BW62 490 aa20.57■□□□□ 0.88
CABP1-201ENST00000288616 AMNQ9BXJ7 453 aa20.57■□□□□ 0.88
CABP1-201ENST00000288616 KRT23Q9C075 422 aa20.57■□□□□ 0.88
CABP1-201ENST00000288616 OPLAHO14841 1288 aa20.56■□□□□ 0.88
CABP1-201ENST00000288616 IGHDP01880 384 aa20.56■□□□□ 0.88
CABP1-201ENST00000288616 CXCL10P02778 98 aa20.56■□□□□ 0.88
CABP1-201ENST00000288616 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
CABP1-201ENST00000288616 NT5C2P49902 561 aa20.56■□□□□ 0.88
CABP1-201ENST00000288616 PTK7Q13308 1070 aa20.56■□□□□ 0.88
CABP1-201ENST00000288616 PPTC7Q8NI37 304 aa20.56■□□□□ 0.88
CABP1-201ENST00000288616 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
CABP1-201ENST00000288616 DSCC1Q9BVC3 393 aa20.56■□□□□ 0.88
CABP1-201ENST00000288616 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.3 ms