RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000249504.6

HOXD11-201, Transcript of homeobox D11, humanhuman

APPRIS P1 TSL 3 BASIC

Gene HOXD11, Length 1,533 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11-201ENST00000249504 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
HOXD11-201ENST00000249504 NRBP1Q9UHY1 535 aa22.22■■□□□ 1.15
HOXD11-201ENST00000249504 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
HOXD11-201ENST00000249504 LRRC37A2A6NM11 1700 aa22.22■■□□□ 1.15
HOXD11-201ENST00000249504 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
HOXD11-201ENST00000249504 CYBAP13498 195 aa22.21■■□□□ 1.15
HOXD11-201ENST00000249504 CNGA1P29973 690 aa22.21■■□□□ 1.15
HOXD11-201ENST00000249504 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
HOXD11-201ENST00000249504 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa22.21■■□□□ 1.15
HOXD11-201ENST00000249504 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
HOXD11-201ENST00000249504 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
HOXD11-201ENST00000249504 IWS1Q96ST2 819 aa22.21■■□□□ 1.15
HOXD11-201ENST00000249504 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa22.21■■□□□ 1.15
HOXD11-201ENST00000249504 EHMT1Q9H9B1 1298 aa22.21■■□□□ 1.15
HOXD11-201ENST00000249504 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
HOXD11-201ENST00000249504 CCL5P13501 91 aa22.21■■□□□ 1.15
HOXD11-201ENST00000249504 EDNRBP24530 442 aa22.21■■□□□ 1.15
HOXD11-201ENST00000249504 BRAPQ7Z569 592 aa22.21■■□□□ 1.15
HOXD11-201ENST00000249504 MORC4Q8TE76 937 aa22.21■■□□□ 1.15
HOXD11-201ENST00000249504 PDCD2LQ9BRP1 358 aa22.21■■□□□ 1.15
HOXD11-201ENST00000249504 ANO3Q9BYT9 981 aa22.21■■□□□ 1.15
HOXD11-201ENST00000249504 RNF208Q9H0X6 261 aa22.21■■□□□ 1.15
HOXD11-201ENST00000249504 UNC93B1Q9H1C4 597 aa22.21■■□□□ 1.15
HOXD11-201ENST00000249504 TCHHQ07283 1943 aa22.2■■□□□ 1.14
HOXD11-201ENST00000249504 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa22.2■■□□□ 1.14
HOXD11-201ENST00000249504 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
HOXD11-201ENST00000249504 ACVR2BQ13705 512 aa22.2■■□□□ 1.14
HOXD11-201ENST00000249504 PGM5Q15124 567 aa22.2■■□□□ 1.14
HOXD11-201ENST00000249504 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa22.2■■□□□ 1.14
HOXD11-201ENST00000249504 EEPD1Q7L9B9 569 aa22.2■■□□□ 1.14
HOXD11-201ENST00000249504 PGBD1Q96JS3 809 aa22.2■■□□□ 1.14
HOXD11-201ENST00000249504 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP22.2■■□□□ 1.142e-70■■■■■ 389.3
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HOXD11-201ENST00000249504 NR3C2P08235 984 aa22.19■■□□□ 1.14
HOXD11-201ENST00000249504 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
HOXD11-201ENST00000249504 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP22.19■■□□□ 1.14
HOXD11-201ENST00000249504 STXBP2Q15833 593 aa22.19■■□□□ 1.14
HOXD11-201ENST00000249504 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
HOXD11-201ENST00000249504 TRPV1Q8NER1 839 aa22.19■■□□□ 1.14
HOXD11-201ENST00000249504 TMEM106CQ9BVX2 250 aa22.19■■□□□ 1.14
HOXD11-201ENST00000249504 VTA1Q9NP79 307 aa22.19■■□□□ 1.14
HOXD11-201ENST00000249504 CCND2P30279 289 aa22.18■■□□□ 1.14
HOXD11-201ENST00000249504 FRMPD4Q14CM0 1322 aa22.18■■□□□ 1.14
HOXD11-201ENST00000249504 CENPFP49454 3210 aa22.18■■□□□ 1.14
HOXD11-201ENST00000249504 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
HOXD11-201ENST00000249504 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
HOXD11-201ENST00000249504 IL31RAQ8NI17 732 aa22.17■■□□□ 1.14
HOXD11-201ENST00000249504 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa22.17■■□□□ 1.14
HOXD11-201ENST00000249504 SEPT4O43236 478 aa22.16■■□□□ 1.14
HOXD11-201ENST00000249504 SREBF1P36956 1147 aa22.16■■□□□ 1.14
HOXD11-201ENST00000249504 INF2Q27J81 1249 aa22.16■■□□□ 1.14
HOXD11-201ENST00000249504 MYSM1Q5VVJ2 828 aa22.16■■□□□ 1.14
HOXD11-201ENST00000249504 TBCKQ8TEA7 893 aa22.16■■□□□ 1.14
HOXD11-201ENST00000249504 CRYGNQ8WXF5 182 aa22.16■■□□□ 1.14
HOXD11-201ENST00000249504 KATNBL1Q9H079 304 aa22.16■■□□□ 1.14
HOXD11-201ENST00000249504 AKR1A1P14550 325 aa22.16■■□□□ 1.14
HOXD11-201ENST00000249504 FAM173BQ6P4H8 233 aa22.16■■□□□ 1.14
HOXD11-201ENST00000249504 VSIG10LQ86VR7 867 aa22.16■■□□□ 1.14
HOXD11-201ENST00000249504 GBP4Q96PP9 640 aa22.16■■□□□ 1.14
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HOXD11-201ENST00000249504 CCDC85CA6NKD9 419 aa22.15■■□□□ 1.14
HOXD11-201ENST00000249504 MSCO60682 206 aa22.15■■□□□ 1.14
HOXD11-201ENST00000249504 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
HOXD11-201ENST00000249504 NFKBIBQ15653 356 aa22.15■■□□□ 1.14
HOXD11-201ENST00000249504 CCDC144BQ3MJ40 725 aa22.15■■□□□ 1.14
HOXD11-201ENST00000249504 RILPL1Q5EBL4 403 aa22.15■■□□□ 1.14
HOXD11-201ENST00000249504 PCNX4Q63HM2 1172 aa22.15■■□□□ 1.14
HOXD11-201ENST00000249504 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
HOXD11-201ENST00000249504 DEFB118Q96PH6 123 aa22.15■■□□□ 1.14
HOXD11-201ENST00000249504 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
HOXD11-201ENST00000249504 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
HOXD11-201ENST00000249504 FRMPD3Q5JV73 1810 aa22.14■■□□□ 1.14
HOXD11-201ENST00000249504 EDIL3O43854 480 aa22.14■■□□□ 1.13
HOXD11-201ENST00000249504 TRAPPC10P48553 1259 aa22.14■■□□□ 1.13
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HOXD11-201ENST00000249504 ARHGAP4P98171 946 aa22.14■■□□□ 1.13
HOXD11-201ENST00000249504 XRRA1Q6P2D8 792 aa22.14■■□□□ 1.13
HOXD11-201ENST00000249504 SEPT14Q6ZU15 432 aa22.14■■□□□ 1.13
HOXD11-201ENST00000249504 NEK8Q86SG6 692 aa22.14■■□□□ 1.13
HOXD11-201ENST00000249504 PDGFCQ9NRA1 345 aa22.14■■□□□ 1.13
HOXD11-201ENST00000249504 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa22.14■■□□□ 1.13
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HOXD11-201ENST00000249504 GJB1P08034 283 aa22.13■■□□□ 1.13
HOXD11-201ENST00000249504 CYP3A4P08684 503 aa22.13■■□□□ 1.13
HOXD11-201ENST00000249504 ADCYAP1R1P41586 468 aa22.13■■□□□ 1.13
HOXD11-201ENST00000249504 USP11P51784 963 aa22.13■■□□□ 1.13
HOXD11-201ENST00000249504 ANO1Q5XXA6 986 aa22.13■■□□□ 1.13
HOXD11-201ENST00000249504 TAPT1Q6NXT6 567 aa22.13■■□□□ 1.13
HOXD11-201ENST00000249504 SCFD2Q8WU76 684 aa22.13■■□□□ 1.13
HOXD11-201ENST00000249504 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
HOXD11-201ENST00000249504 RARBP10826 455 aa22.12■■□□□ 1.13
HOXD11-201ENST00000249504 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
HOXD11-201ENST00000249504 GNPTABQ3T906 1256 aa22.12■■□□□ 1.13
HOXD11-201ENST00000249504 TNFAIP2Q03169 654 aa22.11■■□□□ 1.13
HOXD11-201ENST00000249504 TTLL4Q14679 1199 aa22.11■■□□□ 1.13
HOXD11-201ENST00000249504 IQSEC1Q6DN90 963 aa22.11■■□□□ 1.13
HOXD11-201ENST00000249504 CLEC17AQ6ZS10 378 aa22.11■■□□□ 1.13
HOXD11-201ENST00000249504 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
HOXD11-201ENST00000249504 WDR11Q9BZH6 1224 aa22.11■■□□□ 1.13
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