RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000239461.10

PRRX1-201, Transcript of paired related homeobox 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PRRX1, Length 4,284 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRX1-201ENST00000239461 KIAA1328Q86T90 577 aa11.82□□□□□ -0.52
PRRX1-201ENST00000239461 CCDC51Q96ER9 411 aa11.82□□□□□ -0.52
PRRX1-201ENST00000239461 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP11.82□□□□□ -0.52
PRRX1-201ENST00000239461 PNMA2Q9UL42 364 aa11.82□□□□□ -0.52
PRRX1-201ENST00000239461 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP11.82□□□□□ -0.52
PRRX1-201ENST00000239461 CYTH3O43739 400 aa11.81□□□□□ -0.52
PRRX1-201ENST00000239461 NPM3O75607 178 aaKnown RBP11.81□□□□□ -0.52
PRRX1-201ENST00000239461 URI1O94763 535 aaPredicted RBP11.81□□□□□ -0.52
PRRX1-201ENST00000239461 KRT26Q7Z3Y9 468 aa11.81□□□□□ -0.52
PRRX1-201ENST00000239461 WDR90Q96KV7 1748 aa11.81□□□□□ -0.52
PRRX1-201ENST00000239461 AP5Z1O43299 807 aa11.81□□□□□ -0.52
PRRX1-201ENST00000239461 MAP3K9P80192 1104 aa11.81□□□□□ -0.52
PRRX1-201ENST00000239461 SPA17Q15506 151 aa11.81□□□□□ -0.52
PRRX1-201ENST00000239461 CCDC144BQ3MJ40 725 aa11.81□□□□□ -0.52
PRRX1-201ENST00000239461 ZBTB9Q96C00 473 aa11.81□□□□□ -0.52
PRRX1-201ENST00000239461 HOMER2Q9NSB8 354 aa11.81□□□□□ -0.52
PRRX1-201ENST00000239461 PSMD14O00487 310 aa11.81□□□□□ -0.52
PRRX1-201ENST00000239461 CASP1P29466 404 aa11.81□□□□□ -0.52
PRRX1-201ENST00000239461 GNG11P61952 73 aa11.81□□□□□ -0.52
PRRX1-201ENST00000239461 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa11.81□□□□□ -0.52
PRRX1-201ENST00000239461 POTEDQ86YR6 584 aa11.81□□□□□ -0.52
PRRX1-201ENST00000239461 GMLQ99445 158 aa11.81□□□□□ -0.52
PRRX1-201ENST00000239461 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP11.81□□□□□ -0.52
PRRX1-201ENST00000239461 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP11.81□□□□□ -0.52
PRRX1-201ENST00000239461 KMT5BQ4FZB7 885 aa11.8□□□□□ -0.52
PRRX1-201ENST00000239461 C9orf131Q5VYM1 1079 aa11.8□□□□□ -0.52
PRRX1-201ENST00000239461 CCDC70Q6NSX1 233 aa11.8□□□□□ -0.52
PRRX1-201ENST00000239461 AGBL3Q8NEM8 1001 aa11.8□□□□□ -0.52
PRRX1-201ENST00000239461 MYRIPQ8NFW9 859 aa11.8□□□□□ -0.52
PRRX1-201ENST00000239461 YDJCA8MPS7 323 aa11.8□□□□□ -0.52
PRRX1-201ENST00000239461 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP11.8□□□□□ -0.52
PRRX1-201ENST00000239461 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP11.8□□□□□ -0.52
PRRX1-201ENST00000239461 ARMC9Q7Z3E5 817 aa11.8□□□□□ -0.52
PRRX1-201ENST00000239461 NUP58Q9BVL2 599 aa11.8□□□□□ -0.52
PRRX1-201ENST00000239461 SPTLC3Q9NUV7 552 aa11.8□□□□□ -0.52
PRRX1-201ENST00000239461 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa11.8□□□□□ -0.52
PRRX1-201ENST00000239461 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa11.8□□□□□ -0.52
PRRX1-201ENST00000239461 DNAI1Q9UI46 699 aa11.8□□□□□ -0.52
PRRX1-201ENST00000239461 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP11.8□□□□□ -0.52
PRRX1-201ENST00000239461 CYLC1P35663 651 aaPredicted RBP11.8□□□□□ -0.52
PRRX1-201ENST00000239461 USP11P51784 963 aa11.8□□□□□ -0.52
PRRX1-201ENST00000239461 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP11.8□□□□□ -0.52
PRRX1-201ENST00000239461 PDIA5Q14554 519 aa11.8□□□□□ -0.52
PRRX1-201ENST00000239461 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP11.8□□□□□ -0.52
PRRX1-201ENST00000239461 TMEM60Q9H2L4 133 aa11.8□□□□□ -0.52
PRRX1-201ENST00000239461 PP2D1A8MPX8 630 aa11.8□□□□□ -0.52
PRRX1-201ENST00000239461 ZBED4O75132 1171 aa11.8□□□□□ -0.52
PRRX1-201ENST00000239461 NDUFB10O96000 172 aa11.8□□□□□ -0.52
PRRX1-201ENST00000239461 COPB1P53618 953 aaKnown RBP11.8□□□□□ -0.52
PRRX1-201ENST00000239461 GABPAQ06546 454 aa11.8□□□□□ -0.52
PRRX1-201ENST00000239461 KCNB1Q14721 858 aa11.8□□□□□ -0.52
PRRX1-201ENST00000239461 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP11.8□□□□□ -0.52
PRRX1-201ENST00000239461 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP11.8□□□□□ -0.52
PRRX1-201ENST00000239461 AS3MTQ9HBK9 375 aa11.8□□□□□ -0.52
PRRX1-201ENST00000239461 KCNQ5Q9NR82 932 aa11.8□□□□□ -0.52
PRRX1-201ENST00000239461 USP17L15C9J2P7 530 aa11.79□□□□□ -0.52
PRRX1-201ENST00000239461 USP17L13C9JLJ4 530 aa11.79□□□□□ -0.52
PRRX1-201ENST00000239461 USP17L11C9JVI0 530 aa11.79□□□□□ -0.52
PRRX1-201ENST00000239461 USP17L18D6R9N7 530 aa11.79□□□□□ -0.52
PRRX1-201ENST00000239461 USP17L22D6RA61 530 aa11.79□□□□□ -0.52
PRRX1-201ENST00000239461 USP17L17D6RBQ6 530 aa11.79□□□□□ -0.52
PRRX1-201ENST00000239461 USP17L19D6RCP7 530 aa11.79□□□□□ -0.52
PRRX1-201ENST00000239461 USP17L20D6RJB6 530 aa11.79□□□□□ -0.52
PRRX1-201ENST00000239461 STX10O60499 249 aa11.79□□□□□ -0.52
PRRX1-201ENST00000239461 USP17L24Q0WX57 530 aa11.79□□□□□ -0.52
PRRX1-201ENST00000239461 USP17L6PQ6QN14 398 aa11.79□□□□□ -0.52
PRRX1-201ENST00000239461 NSMFQ6X4W1 530 aa11.79□□□□□ -0.52
PRRX1-201ENST00000239461 MIGA2Q7L4E1 593 aa11.79□□□□□ -0.52
PRRX1-201ENST00000239461 TMTC1Q8IUR5 882 aa11.79□□□□□ -0.52
PRRX1-201ENST00000239461 TNFRSF25Q93038 417 aa11.79□□□□□ -0.52
PRRX1-201ENST00000239461 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP11.79□□□□□ -0.52
PRRX1-201ENST00000239461 KCNF1Q9H3M0 494 aa11.79□□□□□ -0.52
PRRX1-201ENST00000239461 DOCK1Q14185 1865 aa11.79□□□□□ -0.52
PRRX1-201ENST00000239461 TRAF5O00463 557 aa11.79□□□□□ -0.52
PRRX1-201ENST00000239461 FAM13AO94988 1023 aa11.79□□□□□ -0.52
PRRX1-201ENST00000239461 TDP2O95551 362 aa11.79□□□□□ -0.52
PRRX1-201ENST00000239461 SETQ01105 290 aaPredicted RBP11.79□□□□□ -0.52
PRRX1-201ENST00000239461 NT5DC1Q5TFE4 455 aa11.79□□□□□ -0.52
PRRX1-201ENST00000239461 UBXN4Q92575 508 aa11.79□□□□□ -0.52
PRRX1-201ENST00000239461 P2RX5Q93086 422 aa11.79□□□□□ -0.52
PRRX1-201ENST00000239461 IQCDQ96DY2 449 aa11.79□□□□□ -0.52
PRRX1-201ENST00000239461 OTOFQ9HC10 1997 aa11.79□□□□□ -0.52
PRRX1-201ENST00000239461 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP11.79□□□□□ -0.52
PRRX1-201ENST00000239461 ATRNL1Q5VV63 1379 aa11.79□□□□□ -0.52
PRRX1-201ENST00000239461 PPM1FP49593 454 aaPredicted RBP11.79□□□□□ -0.52
PRRX1-201ENST00000239461 DNM2P50570 870 aa11.79□□□□□ -0.52
PRRX1-201ENST00000239461 ADKP55263 362 aaKnown RBP11.79□□□□□ -0.52
PRRX1-201ENST00000239461 GPBP1Q86WP2 473 aa11.79□□□□□ -0.52
PRRX1-201ENST00000239461 MCF2L2Q86YR7 1114 aa11.79□□□□□ -0.52
PRRX1-201ENST00000239461 SPDYE2BA6NHP3 402 aa11.78□□□□□ -0.52
PRRX1-201ENST00000239461 SPDYE6P0CI01 402 aa11.78□□□□□ -0.52
PRRX1-201ENST00000239461 CCNE1P24864 410 aa11.78□□□□□ -0.52
PRRX1-201ENST00000239461 CYP26C1Q6V0L0 522 aa11.78□□□□□ -0.52
PRRX1-201ENST00000239461 MYOCDQ8IZQ8 938 aa11.78□□□□□ -0.52
PRRX1-201ENST00000239461 KIAA1024Q9UPX6 916 aa11.78□□□□□ -0.52
PRRX1-201ENST00000239461 PSMD2Q13200 908 aa11.78□□□□□ -0.52
PRRX1-201ENST00000239461 MCM6Q14566 821 aa11.78□□□□□ -0.52
PRRX1-201ENST00000239461 SYT10Q6XYQ8 523 aa11.78□□□□□ -0.52
PRRX1-201ENST00000239461 THAP9Q9H5L6 903 aa11.78□□□□□ -0.52
PRRX1-201ENST00000239461 SLC39A2Q9NP94 309 aa11.78□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.5 ms