RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000049272.4

Hoxb5-201, Transcript of Homeobox protein Hox-B5, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Hoxb5, Length 1,895 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb5-201ENSMUST00000049272 Pdzrn4E9PUZ9 1014 aa17.69■□□□□ 0.42
Hoxb5-201ENSMUST00000049272 Pdia4P08003 638 aaKnown RBP17.69■□□□□ 0.42
Hoxb5-201ENSMUST00000049272 Lrrc14bQ3UJB3 510 aa17.69■□□□□ 0.42
Hoxb5-201ENSMUST00000049272 Grik5Q61626 979 aa17.69■□□□□ 0.42
Hoxb5-201ENSMUST00000049272 P2ry10Q8BFU7 328 aa17.69■□□□□ 0.42
Hoxb5-201ENSMUST00000049272 Nod2Q8K3Z0 1020 aa17.69■□□□□ 0.42
Hoxb5-201ENSMUST00000049272 Pqbp1Q91VJ5 263 aaKnown RBP17.69■□□□□ 0.42
Hoxb5-201ENSMUST00000049272 Ccdc78D3Z5T1 437 aa17.69■□□□□ 0.42
Hoxb5-201ENSMUST00000049272 Meis1Q60954 390 aa17.69■□□□□ 0.42
Hoxb5-201ENSMUST00000049272 Fam205cQ80YD3 371 aa17.69■□□□□ 0.42
Hoxb5-201ENSMUST00000049272 CnstQ8CBC4 711 aa17.69■□□□□ 0.42
Hoxb5-201ENSMUST00000049272 Ppp2r5dQ91V89 594 aa17.69■□□□□ 0.42
Hoxb5-201ENSMUST00000049272 Krt34Q9D646 392 aa17.69■□□□□ 0.42
Hoxb5-201ENSMUST00000049272 Cd274Q9EP73 290 aa17.69■□□□□ 0.42
Hoxb5-201ENSMUST00000049272 Kcnh7Q9ER47 1195 aa17.69■□□□□ 0.42
Hoxb5-201ENSMUST00000049272 Tfr2Q9JKX3 798 aa17.69■□□□□ 0.42
Hoxb5-201ENSMUST00000049272 Mtmr9Q9Z2D0 545 aa17.69■□□□□ 0.42
Hoxb5-201ENSMUST00000049272 Ktn1Q61595 1327 aaKnown RBP17.68■□□□□ 0.42
Hoxb5-201ENSMUST00000049272 Ampd3O08739 766 aa17.68■□□□□ 0.42
Hoxb5-201ENSMUST00000049272 ArP19091 899 aa17.68■□□□□ 0.42
Hoxb5-201ENSMUST00000049272 Ly6dP35459 127 aa17.68■□□□□ 0.42
Hoxb5-201ENSMUST00000049272 Irs1P35569 1233 aa17.68■□□□□ 0.42
Hoxb5-201ENSMUST00000049272 Syt2P46097 422 aa17.68■□□□□ 0.42
Hoxb5-201ENSMUST00000049272 Rbp3P49194 1234 aa17.68■□□□□ 0.42
Hoxb5-201ENSMUST00000049272 Trappc10Q3TLI0 1259 aa17.68■□□□□ 0.42
Hoxb5-201ENSMUST00000049272 R3hcc1Q8BSI6 488 aa17.68■□□□□ 0.42
Hoxb5-201ENSMUST00000049272 Snx17Q8BVL3 470 aa17.68■□□□□ 0.42
Hoxb5-201ENSMUST00000049272 DpydQ8CHR6 1025 aa17.68■□□□□ 0.42
Hoxb5-201ENSMUST00000049272 NenfQ9CQ45 171 aa17.68■□□□□ 0.42
Hoxb5-201ENSMUST00000049272 Pabpc6Q9D4E6 643 aaKnown RBP17.68■□□□□ 0.42
Hoxb5-201ENSMUST00000049272 Extl2Q9ES89 330 aa17.68■□□□□ 0.42
Hoxb5-201ENSMUST00000049272 Sertad1Q9JL10 236 aa17.68■□□□□ 0.42
Hoxb5-201ENSMUST00000049272 Lypla2Q9WTL7 231 aa17.68■□□□□ 0.42
Hoxb5-201ENSMUST00000049272 SktA2AQ25 1946 aaKnown RBP17.67■□□□□ 0.42
Hoxb5-201ENSMUST00000049272 Tbc1d2B1AVH7 922 aa17.67■□□□□ 0.42
Hoxb5-201ENSMUST00000049272 Gm10436L7N1Y3 520 aa17.67■□□□□ 0.42
Hoxb5-201ENSMUST00000049272 StamP70297 548 aa17.67■□□□□ 0.42
Hoxb5-201ENSMUST00000049272 Gtf2f1Q3THK3 508 aaKnown RBP17.67■□□□□ 0.42
Hoxb5-201ENSMUST00000049272 Lrrc36Q3V0M2 755 aa17.67■□□□□ 0.42
Hoxb5-201ENSMUST00000049272 Nt5c2Q3V1L4 560 aa17.67■□□□□ 0.42
Hoxb5-201ENSMUST00000049272 Rnf207Q3V3A7 635 aa17.67■□□□□ 0.42
Hoxb5-201ENSMUST00000049272 PhkbQ7TSH2 1085 aa17.67■□□□□ 0.42
Hoxb5-201ENSMUST00000049272 Ece2Q80Z60 881 aa17.67■□□□□ 0.42
Hoxb5-201ENSMUST00000049272 Samm50Q8BGH2 469 aa17.67■□□□□ 0.42
Hoxb5-201ENSMUST00000049272 Srek1Q8BZX4 494 aaKnown RBP17.67■□□□□ 0.42
Hoxb5-201ENSMUST00000049272 Mettl5Q8K1A0 209 aa17.67■□□□□ 0.42
Hoxb5-201ENSMUST00000049272 Trim29Q8R2Q0 587 aa17.67■□□□□ 0.42
Hoxb5-201ENSMUST00000049272 Fgd4Q91ZT5 766 aa17.67■□□□□ 0.42
Hoxb5-201ENSMUST00000049272 Ush1cQ9ES64 910 aa17.67■□□□□ 0.42
Hoxb5-201ENSMUST00000049272 Gm43951A0A0N4SUT6 962 aa17.67■□□□□ 0.42
Hoxb5-201ENSMUST00000049272 Gm38392E9Q2A2 434 aa17.67■□□□□ 0.42
Hoxb5-201ENSMUST00000049272 Mt-CybP00158 381 aa17.67■□□□□ 0.42
Hoxb5-201ENSMUST00000049272 Cdc25aP48964 514 aa17.67■□□□□ 0.42
Hoxb5-201ENSMUST00000049272 4933427I04RikQ3V053 235 aa17.67■□□□□ 0.42
Hoxb5-201ENSMUST00000049272 Znf652Q5DU09 608 aa17.67■□□□□ 0.42
Hoxb5-201ENSMUST00000049272 Gpd2Q64521 727 aa17.67■□□□□ 0.42
Hoxb5-201ENSMUST00000049272 Nap1l4Q78ZA7 375 aaKnown RBP17.67■□□□□ 0.42
Hoxb5-201ENSMUST00000049272 Nup88Q8CEC0 753 aaKnown RBP17.67■□□□□ 0.42
Hoxb5-201ENSMUST00000049272 GlyctkQ8QZY2 523 aa17.67■□□□□ 0.42
Hoxb5-201ENSMUST00000049272 Gm43738A0A0G2JEA5 862 aa17.66■□□□□ 0.42
Hoxb5-201ENSMUST00000049272 Rsbn1lD3Z0K6 821 aa17.66■□□□□ 0.42
Hoxb5-201ENSMUST00000049272 Slc39a2G3X943 309 aa17.66■□□□□ 0.42
Hoxb5-201ENSMUST00000049272 Atp9aO70228 1047 aa17.66■□□□□ 0.42
Hoxb5-201ENSMUST00000049272 Tnnt2P50752 301 aa17.66■□□□□ 0.42
Hoxb5-201ENSMUST00000049272 KhsrpQ3U0V1 748 aaKnown RBP17.66■□□□□ 0.42
Hoxb5-201ENSMUST00000049272 Gm28047Q3US59 414 aa17.66■□□□□ 0.42
Hoxb5-201ENSMUST00000049272 Zfp943Q6NZP4 507 aa17.66■□□□□ 0.42
Hoxb5-201ENSMUST00000049272 Ccdc189Q6NZQ0 333 aa17.66■□□□□ 0.42
Hoxb5-201ENSMUST00000049272 Pramel7Q810Y8 479 aa17.66■□□□□ 0.42
Hoxb5-201ENSMUST00000049272 Coa7Q921H9 231 aa17.66■□□□□ 0.42
Hoxb5-201ENSMUST00000049272 FibpQ9JI19 357 aa17.66■□□□□ 0.42
Hoxb5-201ENSMUST00000049272 Mpp3O88910 568 aa17.65■□□□□ 0.42
Hoxb5-201ENSMUST00000049272 Erbb2P70424 1256 aa17.65■□□□□ 0.42
Hoxb5-201ENSMUST00000049272 Lrrfip1Q3UZ39 729 aaKnown RBP17.65■□□□□ 0.42
Hoxb5-201ENSMUST00000049272 Antxr2Q6DFX2 487 aa17.65■□□□□ 0.42
Hoxb5-201ENSMUST00000049272 Kcnk18Q6VV64 394 aa17.65■□□□□ 0.42
Hoxb5-201ENSMUST00000049272 Prpf40bQ80W14 870 aa17.65■□□□□ 0.42
Hoxb5-201ENSMUST00000049272 Bcas3Q8CCN5 928 aa17.65■□□□□ 0.42
Hoxb5-201ENSMUST00000049272 SetQ9EQU5 289 aaKnown RBP17.65■□□□□ 0.42
Hoxb5-201ENSMUST00000049272 PolkQ9QUG2 852 aa17.65■□□□□ 0.42
Hoxb5-201ENSMUST00000049272 Clic4Q9QYB1 253 aa17.65■□□□□ 0.42
Hoxb5-201ENSMUST00000049272 Map7d1A2AJI0 846 aa17.65■□□□□ 0.42
Hoxb5-201ENSMUST00000049272 Cops5O35864 334 aa17.65■□□□□ 0.42
Hoxb5-201ENSMUST00000049272 Pcdha4O88689 947 aa17.65■□□□□ 0.42
Hoxb5-201ENSMUST00000049272 PtpreP49446 699 aa17.65■□□□□ 0.42
Hoxb5-201ENSMUST00000049272 Nlrp2Q4PLS0 1046 aaKnown RBP17.65■□□□□ 0.42
Hoxb5-201ENSMUST00000049272 Mybpc2Q5XKE0 1136 aa17.65■□□□□ 0.42
Hoxb5-201ENSMUST00000049272 Tfe3Q64092 572 aaKnown RBP17.65■□□□□ 0.42
Hoxb5-201ENSMUST00000049272 Bbs9Q811G0 885 aa17.65■□□□□ 0.42
Hoxb5-201ENSMUST00000049272 Nipa1Q8BHK1 323 aa17.65■□□□□ 0.42
Hoxb5-201ENSMUST00000049272 Ddx41Q91VN6 622 aaKnown RBP17.65■□□□□ 0.42
Hoxb5-201ENSMUST00000049272 Cep72Q9D3R3 646 aa17.65■□□□□ 0.42
Hoxb5-201ENSMUST00000049272 Rbp7Q9EPC5 134 aa17.65■□□□□ 0.42
Hoxb5-201ENSMUST00000049272 Limd1Q9QXD8 668 aa17.65■□□□□ 0.42
Hoxb5-201ENSMUST00000049272 Fkbp1bQ9Z2I2 108 aa17.65■□□□□ 0.42
Hoxb5-201ENSMUST00000049272 RptorQ8K4Q0 1335 aa17.64■□□□□ 0.41
Hoxb5-201ENSMUST00000049272 Magea4F2Z493 315 aa17.64■□□□□ 0.41
Hoxb5-201ENSMUST00000049272 Olfr67F8VPJ8 320 aa17.64■□□□□ 0.41
Hoxb5-201ENSMUST00000049272 SlkO54988 1233 aa17.64■□□□□ 0.41
Hoxb5-201ENSMUST00000049272 Fdxacb1Q3UY23 622 aa17.64■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 13.6 ms